Genes within 1Mb (chr1:70470366:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.111 0.135 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.61e-01 0.0264 0.0867 0.135 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 7.70e-01 0.0295 0.101 0.135 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.78e-02 0.155 0.0844 0.135 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.43e-01 -0.13 0.111 0.135 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 3.07e-01 0.0953 0.093 0.135 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 2.19e-01 0.0899 0.073 0.135 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.10e-01 -0.093 0.074 0.135 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0347 0.0679 0.135 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.78e-02 0.176 0.0794 0.135 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.31e-02 -0.213 0.0932 0.135 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0764 0.105 0.135 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.21e-01 0.0313 0.0875 0.135 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 3.62e-01 -0.078 0.0854 0.135 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 2.10e-01 0.104 0.0823 0.135 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.41e-01 0.141 0.0956 0.135 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0303 0.098 0.135 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.09e-01 0.0344 0.142 0.128 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 9.39e-01 0.0073 0.095 0.128 DC L1
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0226 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 1.34e-01 0.194 0.129 0.128 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0454 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 3.88e-01 0.111 0.128 0.128 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0967 0.124 0.135 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.22e-01 0.0255 0.0718 0.135 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0452 0.0984 0.135 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 7.81e-01 0.0324 0.116 0.135 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.64e-01 0.113 0.101 0.135 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.65e-01 0.0611 0.106 0.133 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0693 0.0934 0.133 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0077 0.0939 0.133 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.70e-01 0.133 0.0963 0.133 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0237 0.118 0.133 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 9.00e-01 0.016 0.127 0.135 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 4.15e-01 0.0814 0.0998 0.135 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.75e-01 -0.124 0.113 0.135 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.55e-01 0.09 0.12 0.135 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 5.65e-01 0.0648 0.112 0.135 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 8.40e-01 0.0258 0.128 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 2.57e-01 -0.16 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0327 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0622 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 1.00e+00 2.77e-05 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0741 0.132 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 4.35e-01 0.0877 0.112 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 8.24e-01 0.0284 0.128 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.62e-01 0.177 0.126 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 7.37e-01 0.045 0.134 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.46e-01 0.0265 0.137 0.136 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0599 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.11e-01 0.0126 0.112 0.136 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 4.93e-01 0.0894 0.13 0.136 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0601 0.128 0.136 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0261 0.124 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 2.70e-01 0.109 0.0986 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.36e-01 0.00842 0.105 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 3.46e-01 0.101 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 1.69e-01 -0.166 0.12 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 3.75e-01 -0.117 0.132 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0602 0.117 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.43e-01 0.105 0.137 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 4.30e-01 0.0838 0.106 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0925 0.125 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.66e-01 0.0224 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 1.60e-01 0.193 0.136 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.20e-01 0.0571 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00224 0.127 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.55e-01 0.0612 0.137 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 7.27e-01 0.0448 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.35e-01 0.0822 0.105 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 3.12e-01 0.0772 0.0762 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0961 0.0807 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 6.17e-01 0.0403 0.0805 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 5.76e-02 0.165 0.0862 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 9.55e-02 -0.168 0.1 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 2.11e-01 0.155 0.124 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 4.13e-01 0.0751 0.0915 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 5.21e-02 -0.195 0.0996 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0738 0.0951 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.94e-02 0.223 0.102 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.29e-01 -0.15 0.124 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.84e-01 0.0185 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 8.09e-01 0.0272 0.112 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 3.62e-01 0.102 0.111 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.64e-01 0.138 0.123 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 4.25e-01 -0.101 0.127 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0518 0.116 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.04e-01 0.0419 0.11 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0517 0.107 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 5.14e-01 0.0821 0.125 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 7.03e-01 0.0456 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.65e-01 0.14 0.125 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 2.97e-01 -0.135 0.129 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 9.71e-01 0.00347 0.0961 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.27e-01 -0.121 0.1 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 5.99e-01 0.0495 0.0939 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 4.07e-02 0.204 0.0991 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.11e-01 -0.134 0.107 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0973 0.138 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 3.50e-01 -0.119 0.127 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0567 0.127 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.47e-01 0.101 0.132 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.36e-02 0.333 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.62e-01 -0.151 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.42e-01 0.0258 0.129 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.45e-01 0.0393 0.121 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 4.12e-01 0.0955 0.116 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0036 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 4.31e-01 0.109 0.138 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 8.34e-01 0.0268 0.128 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0192 0.131 0.134 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 8.63e-01 0.0221 0.128 0.134 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0723 0.108 0.134 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.12 0.134 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 5.17e-02 0.252 0.129 0.134 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 7.72e-01 0.0338 0.117 0.134 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.01e-02 0.268 0.136 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 1.75e-01 -0.164 0.12 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0555 0.136 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.63e-02 0.295 0.122 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.25e-01 0.159 0.13 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0374 0.114 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.51e-01 0.00682 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.90e-01 0.143 0.109 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0616 0.131 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0709 0.132 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 8.96e-01 0.0156 0.119 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.04e-01 -0.113 0.135 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 8.87e-01 0.0187 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 1.80e-01 -0.177 0.132 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.35e-01 0.0803 0.129 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0286 0.111 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0603 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00271 0.115 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0764 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 2.79e-01 0.168 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 1.54e-01 -0.199 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 1.04e-02 -0.399 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 9.02e-02 0.188 0.11 0.156 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 6.58e-01 0.0662 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 3.36e-01 0.126 0.13 0.137 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 1.27e-01 0.172 0.112 0.137 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 5.25e-01 0.0654 0.103 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.44e-01 0.00922 0.132 0.137 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0599 0.127 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 1.14e-02 -0.329 0.129 0.137 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 2.27e-01 0.161 0.133 0.135 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 2.36e-01 -0.132 0.111 0.135 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 1.72e-01 0.122 0.0889 0.135 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0837 0.117 0.135 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 4.06e-01 -0.101 0.121 0.135 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 3.21e-01 -0.129 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.14e-01 0.033 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0463 0.105 0.132 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.88e-01 0.135 0.127 0.132 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 1.34e-01 0.223 0.148 0.132 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.59e-01 0.0647 0.146 0.132 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 5.65e-01 0.0785 0.136 0.132 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0493 0.126 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 3.26e-01 0.082 0.0834 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0427 0.104 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00399 0.123 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0269 0.111 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 7.73e-01 -0.039 0.135 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.80e-01 -0.027 0.0967 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 5.58e-01 0.069 0.117 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0364 0.138 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.34e-02 0.218 0.117 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0883 0.182 0.115 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 9.36e-01 0.0141 0.174 0.115 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 2.27e-01 -0.202 0.167 0.115 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 2.51e-01 -0.207 0.18 0.115 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0652 0.176 0.115 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 3.15e-01 0.17 0.169 0.115 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0172 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0333 0.115 0.131 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 7.53e-01 0.0322 0.102 0.131 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 7.43e-01 0.0438 0.133 0.131 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.01e-01 0.172 0.134 0.131 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0831 0.139 0.131 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.99e-01 0.0273 0.107 0.131 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0535 0.107 0.131 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 8.28e-01 0.0262 0.121 0.131 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 6.89e-01 0.0512 0.128 0.131 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.162 0.124 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 3.47e-01 0.129 0.137 0.124 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 1.32e-01 -0.188 0.124 0.124 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0405 0.165 0.124 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 3.64e-01 -0.125 0.137 0.124 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 2.59e-01 -0.164 0.145 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0345 0.125 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0314 0.11 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 5.60e-01 0.0689 0.118 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.28e-01 0.182 0.119 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0715 0.129 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0655 0.121 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 5.78e-01 0.0572 0.103 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 7.00e-01 0.04 0.104 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 1.17e-01 0.151 0.096 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 4.97e-02 -0.228 0.116 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0922 0.125 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 6.16e-01 0.0378 0.0752 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0452 0.0989 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.48e-01 0.00817 0.126 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 3.93e-01 0.0869 0.102 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 3.58e-01 -0.118 0.129 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0496 0.0997 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 59148 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000428 0.0975 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 4.44e-01 0.0924 0.121 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 2.06e-01 0.146 0.115 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 264787 sc-eQTL 8.99e-01 0.0142 0.112 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 264684 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0583 0.0971 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00771 0.0986 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -610923 sc-eQTL 3.07e-01 0.102 0.0999 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 115561 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0987 0.12 0.134 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000050628 PTGER3 -577442 eQTL 0.0295 0.0925 0.0425 0.00154 0.0 0.141
ENSG00000116761 CTH 59148 eQTL 4.13e-09 -0.247 0.0416 0.0 0.0 0.141
ENSG00000118454 ANKRD13C 115632 eQTL 0.0203 -0.0387 0.0166 0.0 0.0 0.141
ENSG00000197568 HHLA3 115561 eQTL 0.00107 -0.114 0.0349 0.0 0.0 0.141


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 59148 9.29e-06 9.64e-06 1.31e-06 4.82e-06 2.4e-06 4.17e-06 1.03e-05 1.69e-06 7.75e-06 4.78e-06 1.05e-05 4.94e-06 1.32e-05 3.88e-06 2.36e-06 5.95e-06 4.01e-06 6.15e-06 2.58e-06 2.79e-06 4.57e-06 8.17e-06 6.98e-06 3.3e-06 1.26e-05 3.31e-06 4.54e-06 3.27e-06 8.8e-06 8.21e-06 4.53e-06 7.89e-07 1.29e-06 2.97e-06 3.58e-06 2.13e-06 1.75e-06 1.84e-06 1.68e-06 1e-06 9.82e-07 1.16e-05 1.34e-06 1.33e-07 7.89e-07 1.29e-06 8.9e-07 7.23e-07 6.14e-07