logo

Genes within 1Mb (chr1:70467579:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.44e-01 0.0262 0.133 0.09 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 3.47e-01 0.0971 0.103 0.09 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0346 0.12 0.09 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0251 0.101 0.09 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.30e-01 0.0459 0.133 0.09 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.112 0.09 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.19e-01 0.0715 0.0884 0.09 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 1.01e-01 0.147 0.0893 0.09 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 2.57e-01 0.0931 0.0819 0.09 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 1.96e-01 -0.125 0.0967 0.09 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 1.05e-02 0.29 0.112 0.09 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0522 0.128 0.09 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.09 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 8.53e-01 0.0193 0.104 0.09 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 8.08e-01 0.0244 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0897 0.117 0.09 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 6.15e-03 0.324 0.117 0.09 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 1.77e-01 0.215 0.159 0.095 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 9.03e-01 -0.013 0.107 0.095 DC L1
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0825 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 9.34e-01 0.0121 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 9.60e-01 0.00646 0.127 0.095 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 4.13e-01 -0.118 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0907 0.149 0.09 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.69e-01 0.0254 0.0864 0.09 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 4.79e-01 0.084 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 2.62e-01 0.157 0.14 0.09 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0155 0.122 0.09 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 1.45e-01 -0.186 0.127 0.09 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 5.85e-01 0.0617 0.113 0.09 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 2.95e-01 0.119 0.113 0.09 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 3.43e-01 -0.111 0.116 0.09 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 5.93e-01 0.076 0.142 0.09 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0343 0.15 0.09 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 9.09e-01 0.0135 0.118 0.09 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 8.52e-01 0.025 0.134 0.09 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 2.06e-01 -0.18 0.142 0.09 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 3.43e-01 -0.126 0.133 0.09 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 3.37e-01 -0.145 0.15 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0592 0.177 0.082 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.53e-01 -0.141 0.187 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 2.22e-01 0.23 0.188 0.082 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.93e-01 -0.131 0.19 0.082 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 3.81e-01 -0.139 0.158 0.082 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.29e-01 0.154 0.157 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 3.55e-02 -0.281 0.133 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 5.83e-01 -0.084 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0807 0.151 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.39e-01 0.0535 0.16 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.28e-01 -0.198 0.164 0.091 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.99e-01 0.0987 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.29e-01 0.132 0.135 0.091 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0699 0.157 0.091 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 2.68e-01 -0.172 0.154 0.091 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0403 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 5.48e-01 0.0727 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0366 0.129 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0667 0.13 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 2.11e-01 0.184 0.147 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.40e-01 0.0323 0.159 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.50e-02 0.281 0.139 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 5.18e-01 -0.107 0.165 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 1.99e-01 0.164 0.128 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 6.41e-01 0.0707 0.151 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 9.89e-01 0.00209 0.158 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0775 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0406 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0275 0.151 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 9.70e-01 0.00607 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.19e-01 0.0552 0.153 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.00e-02 -0.22 0.125 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.02e-01 0.035 0.0915 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 3.11e-01 0.0983 0.0968 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 5.35e-01 0.06 0.0965 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0705 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 3.01e-01 0.125 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.28e-01 -0.18 0.149 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.34e-01 0.0863 0.11 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 4.52e-02 0.241 0.12 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.43e-01 0.109 0.114 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 2.78e-01 -0.134 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 1.65e-01 0.208 0.149 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 5.84e-01 0.083 0.151 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.08e-01 0.0495 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 1.18e-01 0.21 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 1.14e-01 -0.211 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.20e-01 0.0951 0.148 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 1.64e-01 0.211 0.151 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0787 0.141 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0342 0.134 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 5.63e-01 0.0754 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 4.04e-01 0.127 0.152 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0727 0.145 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 4.41e-01 -0.117 0.152 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 6.99e-01 0.0606 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 2.24e-01 0.142 0.116 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0527 0.122 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0293 0.114 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.15e-01 -0.099 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 3.95e-02 0.267 0.129 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0065 0.161 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.87e-02 0.259 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0749 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 4.87e-01 -0.107 0.154 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 3.93e-01 -0.135 0.158 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 6.77e-02 0.285 0.155 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 1.83e-01 -0.211 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 2.17e-01 0.183 0.148 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0638 0.143 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 6.30e-01 0.0794 0.165 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 7.30e-01 0.0588 0.17 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.78e-02 0.276 0.155 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0694 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 6.76e-01 0.064 0.153 0.091 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0805 0.129 0.091 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00866 0.143 0.091 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 1.20e-01 -0.241 0.154 0.091 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0127 0.139 0.091 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.08e-01 -0.21 0.166 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 5.33e-01 0.0918 0.147 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 6.99e-01 0.064 0.165 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 1.89e-01 -0.197 0.15 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 6.20e-02 0.296 0.158 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.11e-01 -0.173 0.138 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 8.65e-01 -0.023 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 1.80e-01 0.181 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0843 0.133 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0701 0.159 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.89e-01 -0.139 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.79e-03 0.407 0.143 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.33e-01 0.16 0.165 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 9.32e-01 0.0138 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.06e-01 -0.061 0.162 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0286 0.154 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 5.73e-01 0.0742 0.131 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 9.54e-01 0.00851 0.148 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0405 0.137 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 9.08e-01 0.0166 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.89e-02 0.445 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 9.91e-01 0.00215 0.185 0.081 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 1.72e-01 -0.285 0.207 0.081 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.97e-02 -0.287 0.145 0.081 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 4.04e-01 -0.165 0.197 0.081 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 5.37e-01 0.0954 0.154 0.091 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0171 0.133 0.091 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 1.10e-01 0.194 0.121 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 7.39e-02 -0.278 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0837 0.151 0.091 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0902 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.89e-01 0.0224 0.161 0.09 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 3.08e-01 0.137 0.134 0.09 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 5.66e-01 0.0617 0.107 0.09 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0303 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0605 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 1.37e-01 0.231 0.155 0.09 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.92e-01 0.133 0.155 0.095 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.75e-01 0.0333 0.116 0.095 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0877 0.141 0.095 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.76e-01 -0.146 0.164 0.095 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.28e-01 0.128 0.162 0.095 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0299 0.15 0.095 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 4.41e-01 0.116 0.151 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 9.21e-01 0.00987 0.1 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 3.94e-01 0.106 0.124 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.10e-01 0.15 0.147 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.92e-01 0.071 0.132 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.81e-02 -0.335 0.16 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0607 0.116 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0998 0.141 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0285 0.165 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.22e-01 -0.113 0.14 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.70e-01 0.214 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 1.79e-01 0.249 0.184 0.097 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0491 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0128 0.193 0.097 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 2.10e-01 -0.236 0.187 0.097 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 4.24e-02 0.364 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 6.31e-02 0.293 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 8.44e-01 0.0272 0.138 0.091 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 3.71e-01 0.111 0.123 0.091 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.84e-01 -0.14 0.161 0.091 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0198 0.162 0.091 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.82e-01 0.141 0.162 0.088 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0159 0.125 0.088 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 6.57e-01 0.0555 0.125 0.088 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 3.37e-01 0.135 0.14 0.088 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0642 0.149 0.088 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 6.62e-01 0.0762 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0468 0.147 0.09 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 2.88e-01 -0.142 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0554 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 4.99e-02 -0.287 0.145 0.09 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 9.64e-01 0.00704 0.156 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0821 0.149 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 1.48e-01 -0.189 0.13 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 9.67e-01 0.00578 0.141 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.142 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 3.70e-01 -0.138 0.154 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0333 0.147 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 3.27e-01 0.122 0.124 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0316 0.126 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 7.54e-01 0.0367 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 2.03e-01 0.18 0.141 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 4.64e-01 -0.11 0.151 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 8.08e-01 0.0219 0.0904 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 4.03e-01 0.0995 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 6.71e-01 0.0643 0.151 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 8.90e-01 0.017 0.122 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 3.43e-01 0.148 0.155 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 7.53e-01 0.038 0.12 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 56361 sc-eQTL 2.28e-01 0.142 0.117 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 6.31e-01 0.07 0.146 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 3.29e-01 -0.136 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 262000 sc-eQTL 2.20e-01 -0.165 0.134 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 261897 sc-eQTL 4.61e-01 0.0862 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 112845 sc-eQTL 1.80e-01 0.159 0.118 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -613710 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0656 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 112774 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0541 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 56361 eQTL 1.4e-08 0.29 0.0506 0.00109 0.0 0.0996
ENSG00000197568 HHLA3 112774 eQTL 0.00335 0.125 0.0425 0.0 0.0 0.0996

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000033122 \N 899318 3.62e-07 2.89e-07 8.67e-08 3.87e-07 1.05e-07 1.25e-07 3.94e-07 7.12e-08 2.35e-07 9.72e-08 2.62e-07 1.57e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.32e-07 1.14e-07 6.17e-08 2.33e-07 9.71e-08 8.1e-08 1.33e-07 2.3e-07 2.2e-07 3.4e-08 3.14e-07 1.31e-07 1.78e-07 1.48e-07 1.44e-07 3.15e-07 1.43e-07 3.93e-08 4.97e-08 1.39e-07 1.95e-07 1.02e-07 1.1e-07 8.76e-08 5.86e-08 2.74e-08 5.39e-08 2.65e-07 4.36e-08 7.35e-09 3.83e-08 1.25e-08 1e-07 0.0 4.83e-08
ENSG00000116761 CTH 56361 3.12e-05 3.07e-05 5.7e-06 1.51e-05 5.42e-06 1.29e-05 4.15e-05 4.5e-06 2.72e-05 1.42e-05 3.52e-05 1.63e-05 4.54e-05 1.4e-05 6.95e-06 1.67e-05 1.58e-05 2.28e-05 7.41e-06 6.6e-06 1.39e-05 3.06e-05 2.92e-05 8.13e-06 3.91e-05 7.14e-06 1.28e-05 1.16e-05 2.94e-05 2.35e-05 1.74e-05 1.54e-06 2.5e-06 6.79e-06 1.11e-05 5.11e-06 2.78e-06 3.14e-06 4.3e-06 3.2e-06 1.7e-06 3.66e-05 3.63e-06 2.52e-07 2.16e-06 3.66e-06 4.13e-06 1.4e-06 1.43e-06