Genes within 1Mb (chr1:70458692:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 9.34e-02 0.141 0.0834 0.28 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.63e-02 -0.119 0.0646 0.28 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0302 0.0758 0.28 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0241 0.0639 0.28 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 4.92e-01 0.0575 0.0836 0.28 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 1.36e-01 0.103 0.0687 0.28 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 3.41e-02 -0.114 0.0537 0.28 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0609 0.0549 0.28 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.08e-03 -0.143 0.0494 0.28 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0268 0.0595 0.28 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 2.21e-02 0.159 0.069 0.28 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.91e-01 0.031 0.0779 0.28 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 4.09e-01 0.0536 0.0648 0.28 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 6.16e-02 -0.118 0.063 0.28 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0934 0.061 0.28 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.67e-01 0.0518 0.0712 0.28 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0279 0.0727 0.28 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.76e-01 -0.043 0.103 0.275 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0597 0.0684 0.275 DC L1
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 5.26e-01 0.0561 0.0883 0.275 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 7.33e-01 0.0319 0.0935 0.275 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0677 0.0817 0.275 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0458 0.0927 0.275 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.20e-02 0.193 0.0893 0.28 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 2.67e-01 -0.058 0.0522 0.28 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00273 0.0717 0.28 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0716 0.0848 0.28 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 2.14e-03 -0.224 0.072 0.28 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 9.16e-01 0.00813 0.0771 0.281 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.94e-01 0.0268 0.068 0.281 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0498 0.0683 0.281 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00916 0.0704 0.281 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 4.08e-01 0.071 0.0857 0.281 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0476 0.0934 0.28 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0498 0.0734 0.28 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0863 0.0833 0.28 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0407 0.0885 0.28 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 1.52e-01 -0.118 0.0823 0.28 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.64e-01 0.054 0.0936 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0916 0.0984 0.286 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.80e-01 0.0431 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.94e-01 0.0721 0.105 0.286 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.27e-01 0.0371 0.106 0.286 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 6.43e-01 -0.041 0.0882 0.286 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0943 0.0983 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0517 0.0839 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 9.60e-01 0.00482 0.0955 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0444 0.0947 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0455 0.1 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 9.04e-01 0.0123 0.101 0.276 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 2.57e-01 -0.101 0.0892 0.276 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 6.10e-01 0.0423 0.0829 0.276 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 8.91e-02 -0.164 0.0958 0.276 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 1.91e-01 0.124 0.0947 0.276 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.67e-01 0.0401 0.0932 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0898 0.0738 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 1.32e-01 -0.119 0.0785 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.15e-01 0.0651 0.0797 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 9.22e-01 0.00881 0.0903 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.37e-01 0.0944 0.098 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 2.30e-01 -0.104 0.0864 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 5.66e-01 0.0583 0.102 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0345 0.0788 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 2.69e-02 0.205 0.0921 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0406 0.0986 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0379 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0457 0.0857 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0435 0.0945 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0729 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 3.09e-01 0.0973 0.0954 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.0771 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.87e-02 -0.102 0.0557 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0634 0.0594 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 1.55e-03 -0.186 0.0579 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0504 0.0638 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 3.98e-02 0.152 0.0734 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.81e-01 0.0384 0.0932 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.18e-01 -0.107 0.0684 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 1.53e-01 -0.108 0.0751 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0104 0.0715 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.04e-01 0.0401 0.0773 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 7.45e-01 0.0305 0.0937 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 7.15e-01 0.0348 0.0955 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.77e-01 -0.112 0.083 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 1.46e-01 -0.123 0.0845 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 9.89e-01 0.00119 0.0842 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 8.72e-01 0.015 0.0932 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.32e-01 0.0598 0.0956 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 5.17e-01 0.0567 0.0874 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0136 0.0829 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 2.63e-02 -0.178 0.0797 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 7.84e-01 -0.026 0.0945 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.46e-01 0.0292 0.09 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0948 0.094 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 7.77e-01 0.0275 0.0967 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0175 0.0719 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 6.68e-01 0.0323 0.0752 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0802 0.0702 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0805 0.0748 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.13e-01 0.0527 0.0805 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 1.64e-01 -0.141 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.94e-01 0.0499 0.0935 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 1.99e-01 -0.12 0.093 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0895 0.0974 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 8.37e-02 -0.172 0.0992 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0212 0.0991 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0936 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0578 0.0942 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 3.38e-02 -0.192 0.0898 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0208 0.105 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.108 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 7.59e-01 0.0306 0.0995 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 4.44e-01 0.0737 0.0961 0.275 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.32e-01 -0.142 0.0939 0.275 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 1.30e-01 -0.121 0.0794 0.275 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.70e-01 0.0639 0.0884 0.275 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 2.29e-01 -0.115 0.0956 0.275 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0435 0.0858 0.275 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0944 0.1 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0505 0.0884 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.09e-01 -0.101 0.0992 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.25e-02 -0.168 0.0896 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 8.61e-01 0.0168 0.0956 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 4.24e-01 0.0659 0.0822 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.33e-01 0.0383 0.08 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0821 0.0801 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0287 0.0788 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 3.38e-01 0.0907 0.0944 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 7.63e-02 0.171 0.0962 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.11e-01 0.0575 0.0874 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 7.84e-01 0.0272 0.0992 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 3.49e-01 0.0903 0.0961 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 3.62e-01 0.0886 0.097 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0408 0.0942 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 7.26e-01 0.0283 0.0805 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0683 0.0902 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.59e-01 0.0257 0.0837 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 4.72e-01 0.0632 0.0877 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0671 0.119 0.289 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0572 0.107 0.289 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.289 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.06e-01 0.0442 0.0854 0.289 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0849 0.115 0.289 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0979 0.0937 0.278 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0455 0.0811 0.278 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 3.88e-01 0.0638 0.0738 0.278 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0678 0.0948 0.278 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.97e-01 0.0236 0.0916 0.278 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.08e-01 0.0623 0.0939 0.278 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0028 0.101 0.28 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0129 0.0841 0.28 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0927 0.0669 0.28 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 2.78e-02 0.193 0.0873 0.28 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 5.68e-01 0.0522 0.0912 0.28 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 1.70e-01 0.134 0.0971 0.28 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0421 0.101 0.271 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.49e-01 0.0453 0.0754 0.271 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 2.75e-01 0.0999 0.0912 0.271 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.271 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0754 0.105 0.271 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0666 0.0977 0.271 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0532 0.0916 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.69e-02 -0.144 0.0598 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0265 0.0754 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0722 0.0892 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 3.18e-02 -0.172 0.0795 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 1.27e-03 0.314 0.096 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 2.65e-01 0.0785 0.0702 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 5.65e-01 0.0493 0.0855 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.1 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 2.42e-02 -0.192 0.0845 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0859 0.122 0.276 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.00e+00 -4.11e-05 0.116 0.276 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0119 0.112 0.276 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 4.75e-01 0.0867 0.121 0.276 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 7.67e-01 0.0351 0.118 0.276 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.13e-01 0.0742 0.113 0.276 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 3.22e-01 0.0939 0.0945 0.287 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.41e-01 0.0507 0.0826 0.287 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00482 0.074 0.287 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.08e-01 -0.098 0.096 0.287 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0578 0.0968 0.287 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 8.20e-01 0.0227 0.0996 0.283 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0117 0.0768 0.283 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 3.30e-01 0.0748 0.0765 0.283 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0772 0.0863 0.283 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0507 0.0913 0.283 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 2.16e-01 0.141 0.114 0.277 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.42e-01 -0.142 0.0962 0.277 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 8.56e-01 -0.016 0.0882 0.277 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 7.92e-01 0.0308 0.116 0.277 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.10e-02 0.181 0.0956 0.277 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 5.07e-01 0.068 0.102 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 9.56e-01 0.0051 0.093 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0781 0.0814 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 3.24e-01 0.0866 0.0876 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 1.93e-01 -0.116 0.0884 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 7.04e-01 0.0367 0.0963 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 2.01e-01 0.115 0.0898 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.71e-01 -0.105 0.0762 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0922 0.077 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 6.74e-01 0.0303 0.0719 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 1.70e-01 0.119 0.0865 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 1.57e-01 0.13 0.0911 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0708 0.0547 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0274 0.0722 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0146 0.0919 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 1.68e-03 -0.231 0.0726 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 4.17e-02 0.189 0.0925 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 6.31e-01 0.0347 0.0722 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 47474 sc-eQTL 5.97e-01 0.0373 0.0706 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0944 0.0872 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 1.46e-01 -0.121 0.0832 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 253113 sc-eQTL 7.43e-01 0.0266 0.0811 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 253010 sc-eQTL 5.61e-01 0.0411 0.0706 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 103958 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0972 0.0714 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -622597 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00126 0.0728 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 103887 sc-eQTL 2.03e-01 0.111 0.0871 0.28 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 47474 eQTL 2.59e-16 -0.269 0.0322 0.0 0.0 0.29
ENSG00000197568 HHLA3 103887 eQTL 0.0276 0.0608 0.0276 0.0 0.0 0.29


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 47474 1.09e-05 1.38e-05 2.41e-06 1.27e-05 2.38e-06 5.81e-06 1.68e-05 2.14e-06 1.41e-05 5.41e-06 1.38e-05 6.8e-06 4.02e-05 7.98e-06 3.67e-06 7.79e-06 7.86e-06 9.66e-06 3.53e-06 4.75e-06 6.01e-06 9.86e-06 1.19e-05 5.39e-06 2.52e-05 4.45e-06 5.97e-06 5.51e-06 1.33e-05 1.2e-05 1.12e-05 1.47e-06 1.23e-06 6.68e-06 8.83e-06 3.35e-06 2.83e-06 2.51e-06 5.18e-06 3.88e-06 1.77e-06 1.6e-05 2.34e-06 1.64e-07 1.02e-06 1.71e-06 1.72e-06 7.2e-07 4.74e-07
ENSG00000197568 HHLA3 103887 6.57e-06 9.3e-06 8.81e-07 5.99e-06 1.76e-06 2.67e-06 9.71e-06 1.46e-06 7.29e-06 3.42e-06 8.47e-06 4.76e-06 1.81e-05 3.74e-06 1.2e-06 5.1e-06 3.76e-06 3.84e-06 2.18e-06 2.84e-06 2.72e-06 5.98e-06 5.99e-06 3.36e-06 1.27e-05 2.3e-06 3.22e-06 2.51e-06 6.69e-06 7.61e-06 5.04e-06 1.05e-06 6.44e-07 3.43e-06 4.55e-06 2.04e-06 1.79e-06 1.6e-06 2.14e-06 1.65e-06 9.91e-07 8.54e-06 1.28e-06 1.8e-07 6.94e-07 9.54e-07 1.17e-06 6.81e-07 3.26e-07