logo

Genes within 1Mb (chr1:70439991:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00627 0.0885 0.256 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0165 0.0686 0.256 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.83e-01 0.0561 0.0799 0.256 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.40e-01 0.0136 0.0674 0.256 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 4.12e-01 0.0724 0.0881 0.256 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0227 0.0743 0.256 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0141 0.0584 0.256 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 2.52e-07 0.296 0.0556 0.256 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 3.00e-01 0.0561 0.054 0.256 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 4.69e-01 0.0464 0.0639 0.256 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 7.55e-01 0.0235 0.0752 0.256 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.93e-01 0.000716 0.0835 0.256 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0193 0.0696 0.256 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 9.56e-07 0.325 0.0643 0.256 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0337 0.0657 0.256 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0391 0.0764 0.256 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 9.96e-01 0.000344 0.078 0.256 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0366 0.105 0.259 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0249 0.0701 0.259 DC L1
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 4.26e-01 0.072 0.0902 0.259 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.67e-01 0.106 0.0953 0.259 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 3.80e-01 0.0735 0.0835 0.259 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 2.54e-01 0.108 0.0945 0.259 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.36e-01 -0.075 0.0961 0.256 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0525 0.0556 0.256 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 2.51e-03 0.229 0.0748 0.256 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.98e-02 0.153 0.0898 0.256 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.22e-01 0.00767 0.0784 0.256 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0318 0.0853 0.258 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0799 0.0751 0.258 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 5.69e-01 0.0432 0.0756 0.258 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.74e-01 0.106 0.0776 0.258 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 5.41e-01 0.0581 0.095 0.258 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.37e-01 0.0205 0.0993 0.256 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.75e-01 0.0224 0.078 0.256 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.05e-02 0.226 0.0874 0.256 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.48e-01 0.0715 0.094 0.256 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 3.02e-01 0.0908 0.0877 0.256 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00507 0.0996 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 1.87e-02 0.255 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 3.68e-01 0.104 0.115 0.247 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.07e-01 0.0285 0.117 0.247 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.67e-01 0.0197 0.118 0.247 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 1.37e-01 0.145 0.0971 0.247 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0341 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0712 0.0872 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 1.74e-01 0.135 0.0989 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.59e-01 0.00507 0.0986 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 4.27e-01 0.0828 0.104 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 6.82e-01 0.0437 0.107 0.256 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 4.83e-01 0.0663 0.0944 0.256 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.14e-01 0.0717 0.0875 0.256 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 3.73e-01 0.0907 0.102 0.256 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 2.31e-01 0.12 0.1 0.256 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0792 0.1 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00531 0.0796 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.96e-01 0.0111 0.0848 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000678 0.0857 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0864 0.0969 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.25e-01 0.00999 0.106 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.48e-01 0.018 0.0938 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.54e-01 -0.125 0.11 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 3.26e-01 0.0837 0.0851 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0392 0.101 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.104 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0288 0.108 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 2.79e-01 0.0983 0.0906 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0359 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0695 0.108 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 3.44e-02 -0.213 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00443 0.0836 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0117 0.0606 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.26e-06 0.303 0.0608 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 1.08e-01 0.103 0.0636 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 6.04e-01 0.0358 0.069 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 6.40e-01 0.0375 0.08 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 5.05e-01 0.0653 0.0978 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0146 0.0722 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.26e-05 0.339 0.0757 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0174 0.0751 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 3.89e-01 -0.07 0.0811 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0254 0.0984 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.87e-02 -0.17 0.0997 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0143 0.0875 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 3.40e-01 0.0851 0.089 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.43e-01 0.041 0.0884 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 6.37e-01 0.0462 0.0979 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 7.79e-01 0.0283 0.101 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00139 0.0927 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.45e-01 0.0286 0.0878 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 4.10e-06 0.384 0.0812 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.68e-01 0.111 0.0998 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 4.90e-01 0.0658 0.0952 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0996 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0294 0.103 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0138 0.0769 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 7.24e-03 0.214 0.0791 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00715 0.0753 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00322 0.0802 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0398 0.0861 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 5.97e-01 0.0572 0.108 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0234 0.0996 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 8.62e-02 0.17 0.0986 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0863 0.104 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.12e-01 0.0254 0.106 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 6.26e-01 0.0515 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 5.96e-01 0.0559 0.105 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0315 0.0981 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00132 0.0945 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0906 0.109 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00478 0.113 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 3.41e-02 -0.219 0.102 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 5.27e-01 0.0656 0.104 0.255 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.44e-01 -0.02 0.102 0.255 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 6.00e-03 0.234 0.0844 0.255 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.96e-01 0.0125 0.0953 0.255 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.30e-01 0.156 0.103 0.255 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0165 0.0925 0.255 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0407 0.108 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 3.86e-01 0.0823 0.0948 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.60e-01 0.0188 0.107 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.58e-01 0.137 0.0965 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 3.32e-01 0.0997 0.102 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 1.79e-01 -0.122 0.0904 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 1.38e-01 -0.131 0.0877 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000881 0.0885 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 2.20e-01 0.107 0.0866 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.104 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.91e-01 0.0725 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 2.80e-02 -0.208 0.0937 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 9.66e-01 0.0046 0.108 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 2.69e-01 0.115 0.104 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0321 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.04e-01 -0.039 0.103 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 6.91e-01 0.0349 0.0876 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 4.68e-01 0.0714 0.0982 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 7.18e-01 -0.033 0.0911 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 1.27e-01 0.146 0.095 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.22e-01 0.0464 0.13 0.23 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.116 0.23 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00502 0.132 0.23 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.31e-03 0.239 0.0903 0.23 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0208 0.125 0.23 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0496 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 1.73e-01 0.12 0.0876 0.257 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 6.79e-02 -0.146 0.0795 0.257 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 1.66e-01 0.142 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.65e-01 -0.138 0.0988 0.257 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 8.70e-01 0.0167 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 6.18e-01 0.0526 0.105 0.256 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0951 0.0878 0.256 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.39e-02 0.172 0.0694 0.256 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 7.72e-01 0.0268 0.0924 0.256 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.10e-03 0.251 0.094 0.256 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 4.88e-01 0.0708 0.102 0.256 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0356 0.102 0.259 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0286 0.0763 0.259 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0535 0.0924 0.259 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.25e-01 0.131 0.108 0.259 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 6.31e-01 0.0511 0.106 0.259 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 5.64e-01 0.057 0.0988 0.259 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0142 0.0981 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0303 0.0649 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.07e-02 0.204 0.0794 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 3.43e-01 0.0906 0.0953 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 5.21e-01 0.0552 0.0859 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 6.07e-02 -0.195 0.104 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0171 0.0747 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 8.10e-01 0.0218 0.0907 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.46e-01 0.124 0.106 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 6.58e-01 0.0402 0.0907 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.28e-01 -0.1 0.126 0.264 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0273 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 2.87e-03 0.341 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0607 0.125 0.264 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 2.64e-02 0.27 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 2.55e-01 -0.134 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0727 0.101 0.258 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 7.39e-02 -0.158 0.0877 0.258 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 5.11e-01 0.052 0.079 0.258 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.103 0.258 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.90e-01 0.136 0.103 0.258 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0218 0.105 0.258 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0105 0.0808 0.258 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0802 0.258 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0166 0.091 0.258 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 2.47e-01 -0.111 0.0959 0.258 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 9.34e-01 0.0094 0.113 0.26 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00305 0.0958 0.26 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.66e-01 0.121 0.0867 0.26 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 5.96e-01 0.0612 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 1.97e-01 0.123 0.0952 0.26 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 7.23e-01 0.0359 0.101 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 5.42e-01 0.0592 0.097 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0365 0.0851 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 5.63e-02 0.174 0.0908 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.32e-01 0.0197 0.0926 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 1.08e-01 0.161 0.0998 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0682 0.097 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00871 0.0824 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0426 0.0832 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 8.83e-01 0.0114 0.0775 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0547 0.0935 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0914 0.0974 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0354 0.0585 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.08e-02 0.195 0.0759 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 1.01e-01 0.16 0.0974 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 5.97e-01 0.042 0.0792 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0157 0.0987 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0993 0.0761 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 28773 sc-eQTL 1.69e-01 0.103 0.0743 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.54e-01 0.0415 0.0924 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00689 0.0884 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 234412 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0416 0.0894 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 234309 sc-eQTL 1.37e-01 -0.115 0.0774 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 sc-eQTL 6.85e-01 0.032 0.0789 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -641298 sc-eQTL 2.81e-01 0.0865 0.08 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 85186 sc-eQTL 6.39e-01 0.0452 0.0963 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 234412 eQTL 0.0397 0.0362 0.0176 0.0 0.0 0.24
ENSG00000116761 CTH 28773 eQTL 3.46e-78 0.61 0.0296 0.0 0.0 0.24
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 eQTL 0.00447 0.0398 0.014 0.0 0.0 0.24

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 28773 3.92e-05 3.7e-05 7.06e-06 1.72e-05 7.7e-06 1.8e-05 5.11e-05 7.07e-06 4e-05 2.13e-05 4.86e-05 2.2e-05 6.07e-05 1.75e-05 9.24e-06 2.63e-05 2.12e-05 3.22e-05 1.01e-05 9.02e-06 2.11e-05 4.19e-05 3.6e-05 1.07e-05 5.22e-05 1.12e-05 1.98e-05 1.69e-05 3.86e-05 2.64e-05 2.56e-05 2.13e-06 4.65e-06 8.68e-06 1.37e-05 7.48e-06 4.25e-06 4.16e-06 6.16e-06 4.07e-06 1.92e-06 4.38e-05 4.65e-06 4.31e-07 3.13e-06 5.27e-06 5.87e-06 2.48e-06 1.69e-06
ENSG00000118454 ANKRD13C 85257 1.18e-05 1.33e-05 2.73e-06 8.75e-06 2.7e-06 6.21e-06 1.75e-05 3.5e-06 1.5e-05 7.59e-06 1.85e-05 7.67e-06 2.38e-05 5.36e-06 4.47e-06 9.28e-06 7.86e-06 1.21e-05 3.59e-06 4.27e-06 7.79e-06 1.32e-05 1.2e-05 4.71e-06 2.14e-05 5.22e-06 7.94e-06 7.73e-06 1.48e-05 9.8e-06 9.55e-06 1.25e-06 1.74e-06 4.04e-06 6.5e-06 3.78e-06 2.04e-06 2.71e-06 2.68e-06 2.18e-06 1.63e-06 1.67e-05 2.64e-06 3.24e-07 1.83e-06 2.58e-06 3.33e-06 1.5e-06 1.04e-06