Genes within 1Mb (chr1:70376634:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.16 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.08e-02 0.16 0.0778 0.16 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.45e-01 0.00627 0.0916 0.16 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 4.25e-01 0.0616 0.077 0.16 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.66e-03 -0.314 0.0987 0.16 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0965 0.0848 0.16 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.34e-02 0.135 0.0662 0.16 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 7.73e-01 0.0196 0.0678 0.16 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0601 0.0619 0.16 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.99e-01 -9.36e-05 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.84e-08 -0.467 0.0799 0.16 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.01e-01 -0.157 0.0953 0.16 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0795 0.16 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.42e-01 -0.115 0.0778 0.16 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.77e-01 -0.102 0.0752 0.16 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 2.32e-01 -0.105 0.0875 0.16 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.28e-09 -0.521 0.0821 0.16 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.123 0.158 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.65e-01 0.0915 0.0819 0.158 DC L1
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 4.56e-01 0.0791 0.106 0.158 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.25e-01 -0.11 0.112 0.158 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00804 0.098 0.158 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 4.29e-03 -0.314 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 5.76e-01 0.0622 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 9.12e-02 0.108 0.0639 0.16 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 7.86e-02 -0.155 0.0875 0.16 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.25e-01 0.00978 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.16e-02 0.169 0.0897 0.16 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.27e-01 0.0335 0.0958 0.159 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.20e-01 0.131 0.0841 0.159 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.39e-01 0.00652 0.0849 0.159 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.33e-01 0.0419 0.0874 0.159 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 3.08e-05 -0.436 0.102 0.159 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 4.18e-02 0.227 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 6.93e-01 0.0348 0.088 0.16 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 9.52e-01 0.00602 0.1 0.16 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.99e-01 0.0558 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.36e-01 -0.047 0.0991 0.16 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 8.31e-02 -0.194 0.112 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 8.95e-02 0.211 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 3.44e-01 -0.125 0.132 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.76e-01 0.0557 0.133 0.156 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 3.88e-01 0.116 0.134 0.156 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0923 0.111 0.156 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 6.84e-01 0.048 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 8.85e-02 0.17 0.0995 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 2.79e-01 -0.124 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.49e-03 0.312 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 8.96e-03 -0.31 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.32e-01 0.0422 0.123 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.86e-01 0.144 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 5.45e-02 -0.222 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.06e-02 -0.207 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.54e-01 0.104 0.0909 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.47e-01 0.0445 0.0972 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.78e-01 0.0409 0.0982 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.85e-02 -0.243 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0829 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 5.24e-02 0.203 0.104 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 7.49e-01 0.0396 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0406 0.0957 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.96e-01 -0.146 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.09e-01 -0.186 0.115 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.73e-01 -0.132 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 5.13e-01 0.0662 0.101 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0493 0.111 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.121 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.26e-01 0.172 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0673 0.0962 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.80e-02 0.153 0.069 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 2.71e-01 0.0815 0.0738 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0434 0.0736 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0795 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 5.90e-07 -0.448 0.0869 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 5.11e-01 0.0756 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 3.63e-01 0.0771 0.0846 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00844 0.0929 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.83e-01 0.0484 0.088 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.76e-01 0.0533 0.0952 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.76e-02 -0.272 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.49e-01 -0.165 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 9.54e-01 0.00581 0.1 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 8.43e-01 0.0203 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0523 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0502 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.28e-01 -0.138 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0643 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.58e-01 0.143 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.0981 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 2.90e-02 -0.251 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 7.77e-05 -0.448 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.27e-01 0.105 0.087 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0909 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.10e-01 0.00968 0.0854 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0749 0.0908 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.42e-06 -0.449 0.0927 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.50e-01 0.0845 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0857 0.111 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0668 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.37e-02 -0.266 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.67e-01 0.0824 0.113 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.54e-01 0.155 0.108 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.34e-01 -0.188 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.87e-01 0.0706 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.58e-02 0.28 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.59e-01 0.161 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.0965 0.162 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.70e-01 0.0458 0.107 0.162 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 4.60e-01 -0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 3.67e-01 0.114 0.126 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 6.45e-01 0.0513 0.111 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.28e-01 -0.19 0.124 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 8.40e-01 0.0229 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.81e-01 -0.161 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0357 0.101 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.23e-01 0.0791 0.0985 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.31e-01 0.149 0.0984 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0199 0.0971 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.87e-02 -0.254 0.115 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0281 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.11 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0579 0.125 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.02e-01 -0.015 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 4.70e-04 -0.422 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.116 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 2.05e-01 0.126 0.0988 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0737 0.111 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 7.72e-01 0.0299 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.52e-02 -0.261 0.107 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0538 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.77e-01 0.00436 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 1.66e-01 -0.148 0.106 0.156 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0276 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.17e-01 0.144 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0389 0.101 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 6.68e-01 0.0394 0.0917 0.163 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0847 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0596 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.47e-01 -0.169 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 5.36e-01 -0.075 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 5.93e-01 0.0542 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.31e-01 -0.122 0.0806 0.16 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 7.09e-01 0.0398 0.106 0.16 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0125 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.25e-01 -0.18 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 6.75e-01 0.0489 0.116 0.159 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 7.48e-01 0.0281 0.0871 0.159 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 3.93e-01 0.0902 0.105 0.159 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 2.01e-01 -0.158 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 2.43e-03 -0.338 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 5.04e-01 0.05 0.0747 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 4.45e-01 -0.071 0.0928 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.93e-01 0.143 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.01e-02 0.193 0.0981 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 8.39e-01 0.0249 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.95e-01 0.113 0.0869 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.60e-01 -0.114 0.124 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.24e-01 0.0675 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0202 0.154 0.176 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.94e-01 -0.101 0.146 0.176 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 4.60e-01 -0.113 0.152 0.176 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 1.31e-01 -0.224 0.148 0.176 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.89e-01 -0.188 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 4.56e-01 0.0863 0.115 0.16 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 7.41e-02 0.18 0.1 0.16 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0817 0.0901 0.16 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.98e-01 0.062 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0664 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.154 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 7.20e-03 0.246 0.0904 0.154 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 2.08e-01 -0.116 0.0916 0.154 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0356 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 5.68e-01 0.0741 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 5.37e-01 0.0616 0.0996 0.164 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0393 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 1.10e-01 0.174 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 3.38e-01 -0.111 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 6.16e-01 0.0566 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 5.92e-02 0.186 0.098 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 9.07e-02 -0.18 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 1.42e-01 0.158 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 5.44e-03 -0.322 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 1.26e-01 0.144 0.0936 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 1.34e-01 0.142 0.0946 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 7.26e-01 -0.031 0.0885 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.36e-02 -0.262 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 4.71e-01 0.049 0.0679 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0889 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 5.91e-01 0.0612 0.114 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 1.26e-01 0.141 0.0915 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0291 0.114 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 3.41e-03 0.256 0.0864 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -34584 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0841 0.0859 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 4.94e-01 0.073 0.107 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 6.05e-01 0.0528 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 171055 sc-eQTL 6.69e-01 0.0431 0.101 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 170952 sc-eQTL 9.87e-02 0.144 0.087 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 21900 sc-eQTL 3.96e-01 0.0754 0.0887 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -704655 sc-eQTL 7.05e-01 0.0342 0.0903 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 21829 sc-eQTL 1.79e-05 -0.455 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH -34584 eQTL 0.471 -0.0334 0.0463 0.0136 0.0136 0.126
ENSG00000197568 HHLA3 21829 eQTL 2.88e-16 -0.308 0.037 0.057 0.0533 0.126


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -671174 3.14e-07 1.59e-07 6.55e-08 2.24e-07 1.1e-07 8.63e-08 2.24e-07 5.78e-08 1.71e-07 9.72e-08 1.83e-07 1.31e-07 2.29e-07 8.07e-08 5.97e-08 9.01e-08 4.63e-08 1.91e-07 7.42e-08 6.16e-08 1.18e-07 1.65e-07 1.64e-07 3.59e-08 2.28e-07 1.43e-07 1.22e-07 1.36e-07 1.39e-07 1.17e-07 1.26e-07 4.69e-08 4.37e-08 9.8e-08 3.97e-08 3.18e-08 4.54e-08 8.17e-08 6.62e-08 6.92e-08 4.36e-08 1.55e-07 5.27e-08 1.54e-08 3.34e-08 8.31e-09 7.97e-08 2.05e-09 4.67e-08
ENSG00000066557 \N 171055 2.91e-06 3.13e-06 4.23e-07 1.97e-06 7.24e-07 7.74e-07 2.25e-06 8.27e-07 2.37e-06 1.23e-06 3e-06 1.69e-06 4.27e-06 1.42e-06 8.93e-07 1.79e-06 1.58e-06 2.21e-06 1.57e-06 1.3e-06 1.36e-06 3.2e-06 2.7e-06 1.17e-06 4.02e-06 1.03e-06 1.44e-06 1.69e-06 2.83e-06 2.28e-06 2e-06 3.79e-07 6.01e-07 1.24e-06 1.51e-06 1.03e-06 8.38e-07 4.24e-07 1.18e-06 3.46e-07 2.4e-07 4.08e-06 6.27e-07 1.82e-07 3.69e-07 3.72e-07 8.36e-07 2.22e-07 1.54e-07
ENSG00000197568 HHLA3 21829 1.51e-05 2.03e-05 3.15e-06 1.13e-05 3.22e-06 8.4e-06 2.48e-05 3.42e-06 1.78e-05 8.86e-06 2.37e-05 9.22e-06 3.39e-05 8.66e-06 5.26e-06 1.03e-05 1e-05 1.52e-05 5.69e-06 4.75e-06 8.58e-06 1.84e-05 1.8e-05 5.62e-06 3e-05 5.42e-06 8.01e-06 8.02e-06 2.03e-05 1.91e-05 1.27e-05 1.27e-06 1.91e-06 4.9e-06 8.09e-06 4.27e-06 2.18e-06 2.82e-06 3.46e-06 2.66e-06 1.58e-06 2.31e-05 2.64e-06 3.05e-07 1.85e-06 2.68e-06 3.02e-06 1.27e-06 1.01e-06