logo

Genes within 1Mb (chr1:70365625:CAA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.60e-01 -0.158 0.112 0.132 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.19e-02 0.163 0.0867 0.132 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.102 0.132 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00812 0.0858 0.132 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 3.14e-03 -0.329 0.11 0.132 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 4.48e-02 -0.186 0.0922 0.132 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.67e-02 0.134 0.0726 0.132 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 7.80e-01 0.0207 0.0742 0.132 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0701 0.0677 0.132 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0355 0.0802 0.132 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 6.92e-08 -0.492 0.0879 0.132 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0734 0.105 0.132 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.57e-01 0.124 0.0871 0.132 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.64e-01 -0.119 0.0852 0.132 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.54e-01 -0.118 0.0822 0.132 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.66e-01 -0.107 0.0958 0.132 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.15e-09 -0.563 0.09 0.132 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 7.07e-01 0.0502 0.133 0.131 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 4.69e-01 0.0645 0.0889 0.131 DC L1
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 7.85e-01 0.0313 0.115 0.131 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.12e-01 -0.193 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.07e-01 0.0704 0.106 0.131 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.28e-03 -0.383 0.117 0.131 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0094 0.121 0.132 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.14e-01 0.111 0.0699 0.132 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.78e-02 -0.211 0.0953 0.132 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.53e-01 0.00675 0.114 0.132 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 1.12e-01 0.157 0.0983 0.132 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 5.40e-01 0.0646 0.105 0.133 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 2.23e-01 0.113 0.0927 0.133 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 7.47e-01 0.0301 0.0934 0.133 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 9.05e-01 0.0114 0.0962 0.133 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.30e-06 -0.541 0.111 0.133 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.90e-02 0.269 0.122 0.132 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 8.73e-01 0.0156 0.0971 0.132 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 5.44e-01 0.0671 0.11 0.132 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 6.30e-01 0.0564 0.117 0.132 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0596 0.109 0.132 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 7.14e-02 -0.223 0.123 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 7.63e-02 0.241 0.135 0.13 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0721 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0401 0.146 0.13 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.77e-01 0.0822 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0153 0.122 0.13 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 3.74e-01 0.115 0.129 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 8.37e-02 0.19 0.109 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 2.00e-01 -0.161 0.125 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.26e-02 0.282 0.123 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.48e-02 -0.318 0.13 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 8.03e-01 0.0337 0.135 0.134 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.73e-01 0.163 0.119 0.134 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0425 0.111 0.134 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 3.15e-01 -0.13 0.129 0.134 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 5.40e-02 -0.244 0.126 0.134 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.12e-01 -0.199 0.125 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0996 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 5.25e-01 0.0677 0.106 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0245 0.108 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.90e-01 -0.16 0.121 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.45e-01 -0.151 0.13 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 4.01e-02 0.235 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0109 0.135 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0818 0.104 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.25e-02 -0.24 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 2.26e-01 -0.163 0.134 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 8.56e-01 0.0204 0.113 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00582 0.134 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.125 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.104 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 4.54e-02 0.151 0.0752 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.82e-01 0.0867 0.0803 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0574 0.08 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0243 0.0864 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 6.73e-06 -0.441 0.0956 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0337 0.126 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 5.55e-01 0.0549 0.0927 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0328 0.102 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.09e-01 0.0111 0.0965 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.26e-01 0.0663 0.104 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 7.54e-02 -0.224 0.125 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.97e-01 -0.161 0.125 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 9.22e-01 0.0108 0.109 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00791 0.111 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0728 0.11 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0451 0.122 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 5.45e-02 -0.241 0.124 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000316 0.119 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.95e-02 0.204 0.112 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.03e-01 -0.139 0.109 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 3.28e-02 -0.273 0.127 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 4.51e-01 -0.092 0.122 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 7.40e-04 -0.426 0.124 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0858 0.128 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 2.44e-01 0.111 0.0952 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0891 0.0997 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 6.25e-01 0.0458 0.0934 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0763 0.0994 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 6.44e-08 -0.559 0.0998 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 3.97e-01 -0.113 0.134 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 3.46e-01 0.116 0.123 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00117 0.123 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 2.75e-01 -0.14 0.128 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 1.48e-01 -0.19 0.131 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 4.01e-02 -0.267 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.98e-01 -0.14 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 3.99e-01 0.106 0.125 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.48e-01 0.175 0.12 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0653 0.139 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.22e-01 0.0712 0.144 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00478 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.85e-02 0.303 0.128 0.134 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 5.58e-01 0.0743 0.127 0.134 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 8.96e-01 -0.014 0.107 0.134 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 8.80e-01 0.018 0.119 0.134 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0732 0.129 0.134 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.97e-01 -0.12 0.115 0.134 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.92e-01 0.0532 0.134 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 5.10e-01 0.0779 0.118 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 3.68e-01 -0.12 0.133 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 3.94e-01 -0.103 0.12 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 4.71e-02 -0.253 0.127 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0254 0.112 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 5.34e-01 0.0676 0.108 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.98e-01 0.14 0.108 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 3.09e-01 -0.109 0.107 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 5.76e-03 -0.352 0.126 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0701 0.133 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 7.53e-02 0.214 0.12 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 6.89e-01 0.0547 0.137 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 7.25e-01 0.0468 0.133 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.13e-03 -0.407 0.131 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.49e-01 0.183 0.127 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 3.10e-01 0.11 0.108 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0857 0.122 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.65e-01 0.126 0.113 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 2.15e-02 -0.271 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 9.23e-01 0.0165 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.21e-01 0.236 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.64e-01 0.00787 0.173 0.119 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 3.69e-02 -0.252 0.119 0.119 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 3.49e-01 -0.153 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.61e-01 0.145 0.128 0.135 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 8.08e-01 -0.027 0.111 0.135 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000481 0.101 0.135 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 3.34e-01 -0.125 0.129 0.135 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0573 0.125 0.135 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 4.07e-01 -0.107 0.128 0.135 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 1.60e-01 -0.186 0.132 0.132 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 4.12e-01 0.0908 0.111 0.132 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 4.73e-02 -0.175 0.0877 0.132 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 7.54e-01 0.0365 0.116 0.132 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.64e-01 0.0522 0.12 0.132 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 4.57e-02 -0.256 0.127 0.132 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 8.06e-01 0.0315 0.128 0.134 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.31e-01 0.0461 0.0957 0.134 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 9.38e-01 0.00904 0.116 0.134 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.13e-01 -0.215 0.135 0.134 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0801 0.133 0.134 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.11e-03 -0.399 0.12 0.134 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.75e-01 0.0518 0.124 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 5.63e-01 0.0473 0.0817 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.46e-01 -0.147 0.101 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.67e-01 0.166 0.12 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.81e-02 0.197 0.108 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 5.19e-01 0.0862 0.133 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.11e-01 0.152 0.095 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.24e-01 -0.141 0.116 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0733 0.136 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 9.46e-01 0.00792 0.116 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.93e-01 0.0621 0.157 0.155 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0608 0.15 0.155 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.65e-01 0.161 0.144 0.155 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 9.13e-01 -0.017 0.156 0.155 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 8.71e-02 -0.259 0.151 0.155 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.82e-01 -0.194 0.145 0.155 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 9.96e-01 0.000632 0.127 0.133 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 7.79e-02 0.195 0.11 0.133 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.55e-01 -0.141 0.0986 0.133 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0567 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0946 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 2.28e-01 -0.158 0.131 0.129 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 2.26e-02 0.229 0.0998 0.129 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.70e-01 -0.138 0.101 0.129 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 8.38e-01 0.0233 0.114 0.129 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.10e-01 0.151 0.12 0.129 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.34e-01 0.0689 0.145 0.141 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 7.43e-01 0.0402 0.122 0.141 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 2.54e-01 0.127 0.111 0.141 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0479 0.147 0.141 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 1.11e-01 0.194 0.121 0.141 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 3.22e-01 -0.128 0.129 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 3.41e-01 0.118 0.124 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 6.16e-02 0.203 0.108 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 8.85e-02 -0.2 0.117 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.40e-01 0.139 0.118 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.46e-02 -0.312 0.127 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 6.54e-02 -0.224 0.121 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.48e-01 0.149 0.103 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 1.92e-01 0.136 0.104 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0982 0.097 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 1.59e-01 -0.165 0.117 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 4.66e-01 0.0903 0.124 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 4.31e-01 0.0586 0.0742 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 5.50e-02 -0.187 0.097 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 5.10e-01 0.0821 0.124 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 2.83e-01 0.108 0.1 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 4.25e-01 -0.1 0.126 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.17e-02 0.244 0.0958 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -45593 sc-eQTL 1.81e-01 -0.127 0.0947 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 8.04e-01 0.0292 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 6.76e-01 0.047 0.112 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 160046 sc-eQTL 4.73e-01 0.0794 0.11 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 159943 sc-eQTL 1.94e-01 0.125 0.0958 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 10891 sc-eQTL 4.08e-01 0.0808 0.0975 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -715664 sc-eQTL 7.90e-01 0.0265 0.0992 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 10820 sc-eQTL 3.48e-06 -0.539 0.113 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH -45593 eQTL 0.2 -0.0665 0.0519 0.0163 0.0173 0.1
ENSG00000197568 HHLA3 10820 eQTL 7.9e-13 -0.304 0.0419 0.00587 0.00322 0.1

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 \N 160046 5.59e-06 9.59e-06 5.06e-06 4.37e-06 1.64e-06 1.92e-06 7.49e-06 9.03e-07 4.91e-06 1.91e-06 5.75e-06 3.21e-06 1.11e-05 1.97e-06 1.46e-06 3.9e-06 3.84e-06 3.93e-06 1.65e-06 1.69e-06 2.89e-06 6.41e-06 5.83e-06 1.92e-06 9.06e-06 1.76e-06 2.72e-06 1.49e-06 6.75e-06 4.39e-06 2.83e-06 1e-06 7.91e-07 1.74e-06 1.95e-06 1.12e-06 1.4e-06 1.08e-06 9.04e-07 1e-06 1.52e-07 9.84e-06 1.82e-06 2.86e-07 6.96e-07 1.1e-06 1.32e-06 5.67e-07 4.55e-07
ENSG00000197568 HHLA3 10820 7.74e-05 5.25e-05 6.99e-06 1.65e-05 6.55e-06 1.94e-05 5.94e-05 4.84e-06 3.88e-05 1.58e-05 5.04e-05 2.06e-05 6.43e-05 1.82e-05 7.4e-06 2.6e-05 2.39e-05 3.13e-05 9.6e-06 7.07e-06 1.9e-05 4.48e-05 4.68e-05 9.89e-06 5.4e-05 8.89e-06 1.78e-05 1.39e-05 4.7e-05 3.32e-05 2.56e-05 1.6e-06 2.45e-06 6.79e-06 1.33e-05 5.99e-06 2.83e-06 3.18e-06 4.25e-06 3.3e-06 1.64e-06 6.03e-05 4.97e-06 2.62e-07 2.81e-06 4.28e-06 4.52e-06 1.49e-06 1.52e-06