logo

Genes within 1Mb (chr1:70364310:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.16 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.08e-02 0.16 0.0778 0.16 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.45e-01 0.00627 0.0916 0.16 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 4.25e-01 0.0616 0.077 0.16 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.66e-03 -0.314 0.0987 0.16 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0965 0.0848 0.16 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.34e-02 0.135 0.0662 0.16 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 7.73e-01 0.0196 0.0678 0.16 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0601 0.0619 0.16 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.99e-01 -9.36e-05 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.84e-08 -0.467 0.0799 0.16 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.01e-01 -0.157 0.0953 0.16 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0795 0.16 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.42e-01 -0.115 0.0778 0.16 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.77e-01 -0.102 0.0752 0.16 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 2.32e-01 -0.105 0.0875 0.16 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.28e-09 -0.521 0.0821 0.16 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.123 0.158 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.65e-01 0.0915 0.0819 0.158 DC L1
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 4.56e-01 0.0791 0.106 0.158 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.25e-01 -0.11 0.112 0.158 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00804 0.098 0.158 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 4.29e-03 -0.314 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 5.76e-01 0.0622 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 9.12e-02 0.108 0.0639 0.16 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 7.86e-02 -0.155 0.0875 0.16 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.25e-01 0.00978 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.16e-02 0.169 0.0897 0.16 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.27e-01 0.0335 0.0958 0.159 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.20e-01 0.131 0.0841 0.159 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.39e-01 0.00652 0.0849 0.159 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.33e-01 0.0419 0.0874 0.159 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 3.08e-05 -0.436 0.102 0.159 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 4.18e-02 0.227 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 6.93e-01 0.0348 0.088 0.16 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 9.52e-01 0.00602 0.1 0.16 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.99e-01 0.0558 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.36e-01 -0.047 0.0991 0.16 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 8.31e-02 -0.194 0.112 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 8.95e-02 0.211 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 3.44e-01 -0.125 0.132 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.76e-01 0.0557 0.133 0.156 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 3.88e-01 0.116 0.134 0.156 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0923 0.111 0.156 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 6.84e-01 0.048 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 8.85e-02 0.17 0.0995 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 2.79e-01 -0.124 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.49e-03 0.312 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 8.96e-03 -0.31 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.32e-01 0.0422 0.123 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.86e-01 0.144 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 5.45e-02 -0.222 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.06e-02 -0.207 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.54e-01 0.104 0.0909 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.47e-01 0.0445 0.0972 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.78e-01 0.0409 0.0982 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.85e-02 -0.243 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0829 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 5.24e-02 0.203 0.104 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 7.49e-01 0.0396 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0406 0.0957 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.96e-01 -0.146 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.09e-01 -0.186 0.115 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.73e-01 -0.132 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 5.13e-01 0.0662 0.101 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0493 0.111 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.121 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.26e-01 0.172 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0673 0.0962 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.80e-02 0.153 0.069 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 2.71e-01 0.0815 0.0738 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0434 0.0736 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0795 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 5.90e-07 -0.448 0.0869 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 5.11e-01 0.0756 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 3.63e-01 0.0771 0.0846 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00844 0.0929 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.83e-01 0.0484 0.088 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.76e-01 0.0533 0.0952 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.76e-02 -0.272 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.49e-01 -0.165 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 9.54e-01 0.00581 0.1 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 8.43e-01 0.0203 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0523 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0502 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.28e-01 -0.138 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0643 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.58e-01 0.143 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.0981 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 2.90e-02 -0.251 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 7.77e-05 -0.448 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.27e-01 0.105 0.087 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0909 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.10e-01 0.00968 0.0854 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0749 0.0908 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.42e-06 -0.449 0.0927 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.50e-01 0.0845 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0857 0.111 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0668 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.37e-02 -0.266 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.67e-01 0.0824 0.113 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.54e-01 0.155 0.108 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.34e-01 -0.188 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.87e-01 0.0706 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.58e-02 0.28 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.59e-01 0.161 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.0965 0.162 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.70e-01 0.0458 0.107 0.162 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 4.60e-01 -0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 3.67e-01 0.114 0.126 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 6.45e-01 0.0513 0.111 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.28e-01 -0.19 0.124 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 8.40e-01 0.0229 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.81e-01 -0.161 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0357 0.101 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.23e-01 0.0791 0.0985 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.31e-01 0.149 0.0984 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0199 0.0971 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.87e-02 -0.254 0.115 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0281 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.11 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0579 0.125 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.02e-01 -0.015 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 4.70e-04 -0.422 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.116 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 2.05e-01 0.126 0.0988 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0737 0.111 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 7.72e-01 0.0299 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.52e-02 -0.261 0.107 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0538 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.77e-01 0.00436 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 1.66e-01 -0.148 0.106 0.156 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0276 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.17e-01 0.144 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0389 0.101 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 6.68e-01 0.0394 0.0917 0.163 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0847 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0596 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.47e-01 -0.169 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 5.36e-01 -0.075 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 5.93e-01 0.0542 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.31e-01 -0.122 0.0806 0.16 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 7.09e-01 0.0398 0.106 0.16 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0125 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.25e-01 -0.18 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 6.75e-01 0.0489 0.116 0.159 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 7.48e-01 0.0281 0.0871 0.159 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 3.93e-01 0.0902 0.105 0.159 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 2.01e-01 -0.158 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 2.43e-03 -0.338 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 5.04e-01 0.05 0.0747 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 4.45e-01 -0.071 0.0928 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.93e-01 0.143 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.01e-02 0.193 0.0981 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 8.39e-01 0.0249 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.95e-01 0.113 0.0869 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.60e-01 -0.114 0.124 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.24e-01 0.0675 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0202 0.154 0.176 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.94e-01 -0.101 0.146 0.176 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 4.60e-01 -0.113 0.152 0.176 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 1.31e-01 -0.224 0.148 0.176 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.89e-01 -0.188 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 4.56e-01 0.0863 0.115 0.16 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 7.41e-02 0.18 0.1 0.16 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0817 0.0901 0.16 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.98e-01 0.062 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0664 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.154 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 7.20e-03 0.246 0.0904 0.154 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 2.08e-01 -0.116 0.0916 0.154 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0356 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 5.68e-01 0.0741 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 5.37e-01 0.0616 0.0996 0.164 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0393 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 1.10e-01 0.174 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 3.38e-01 -0.111 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 6.16e-01 0.0566 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 5.92e-02 0.186 0.098 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 9.07e-02 -0.18 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 1.42e-01 0.158 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 5.44e-03 -0.322 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 1.26e-01 0.144 0.0936 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 1.34e-01 0.142 0.0946 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 7.26e-01 -0.031 0.0885 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.36e-02 -0.262 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 4.71e-01 0.049 0.0679 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0889 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 5.91e-01 0.0612 0.114 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 1.26e-01 0.141 0.0915 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0291 0.114 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 3.41e-03 0.256 0.0864 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -46908 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0841 0.0859 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 4.94e-01 0.073 0.107 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 6.05e-01 0.0528 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 158731 sc-eQTL 6.69e-01 0.0431 0.101 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 158628 sc-eQTL 9.87e-02 0.144 0.087 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 9576 sc-eQTL 3.96e-01 0.0754 0.0887 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -716979 sc-eQTL 7.05e-01 0.0342 0.0903 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 9505 sc-eQTL 1.79e-05 -0.455 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH -46908 eQTL 0.515 -0.0302 0.0463 0.0201 0.0182 0.126
ENSG00000197568 HHLA3 9505 eQTL 4.21e-16 -0.307 0.0371 0.0422 0.0375 0.126

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 \N 158731 4.11e-06 4.79e-06 9.13e-07 3.02e-06 1.43e-06 1.35e-06 3.07e-06 1.01e-06 4.99e-06 2.13e-06 4.89e-06 3.52e-06 7.25e-06 2.46e-06 1.35e-06 2.9e-06 1.98e-06 2.79e-06 1.45e-06 1.14e-06 2.9e-06 4.67e-06 3.54e-06 1.6e-06 5.26e-06 1.54e-06 2.47e-06 1.83e-06 4.3e-06 4.23e-06 2.79e-06 4.34e-07 5.38e-07 1.87e-06 2.22e-06 1.15e-06 1.1e-06 4.51e-07 8.29e-07 5.97e-07 8.4e-07 5.32e-06 3.64e-07 1.54e-07 6.09e-07 6.74e-07 8.71e-07 7.5e-07 3.91e-07
ENSG00000197568 HHLA3 9505 2.84e-05 3.08e-05 6.15e-06 1.54e-05 5.8e-06 1.41e-05 4.15e-05 4.37e-06 2.93e-05 1.52e-05 3.73e-05 1.74e-05 4.74e-05 1.4e-05 6.84e-06 1.86e-05 1.8e-05 2.41e-05 7.94e-06 6.93e-06 1.52e-05 3.17e-05 3.06e-05 8.82e-06 4.49e-05 8.34e-06 1.44e-05 1.3e-05 3.15e-05 2.71e-05 1.92e-05 1.63e-06 3.06e-06 7.33e-06 1.16e-05 6.2e-06 3.64e-06 3.42e-06 5.37e-06 3.56e-06 1.77e-06 3.42e-05 3.5e-06 4.38e-07 2.71e-06 4.25e-06 4.05e-06 1.98e-06 1.53e-06