logo

Genes within 1Mb (chr1:70358133:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0224 0.0913 0.212 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.11e-02 0.152 0.07 0.212 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.77e-01 -0.046 0.0825 0.212 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.40e-01 0.00522 0.0695 0.212 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.34e-04 -0.33 0.0881 0.212 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.46e-02 -0.187 0.0759 0.212 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.33e-01 0.0908 0.0602 0.212 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.87e-01 0.0334 0.0613 0.212 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0375 0.0561 0.212 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0106 0.0664 0.212 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 5.51e-08 -0.41 0.0727 0.212 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.79e-01 -0.116 0.0858 0.212 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.47e-01 0.104 0.0714 0.212 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0787 0.07 0.212 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0598 0.0677 0.212 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0823 0.0786 0.212 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.38e-09 -0.461 0.0739 0.212 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.76e-01 0.0314 0.11 0.212 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.79e-01 0.0649 0.0736 0.212 DC L1
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 3.08e-01 0.0968 0.0948 0.212 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0809 0.1 0.212 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0117 0.0879 0.212 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 5.37e-02 -0.192 0.0988 0.212 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 5.99e-01 0.0526 0.0998 0.212 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.38e-01 0.0857 0.0576 0.212 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 1.12e-01 -0.126 0.0789 0.212 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 1.03e-01 -0.153 0.0933 0.212 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 1.37e-01 0.121 0.081 0.212 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.15e-01 0.0202 0.0863 0.21 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 2.56e-01 0.0866 0.0759 0.21 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 1.68e-01 -0.105 0.0761 0.21 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0357 0.0788 0.21 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 3.37e-05 -0.391 0.0922 0.21 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 2.97e-02 0.22 0.1 0.212 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 8.90e-01 -0.011 0.0797 0.212 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.67e-01 0.052 0.0906 0.212 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0189 0.0961 0.212 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0571 0.0897 0.212 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0829 0.102 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 5.25e-01 0.0743 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0613 0.123 0.204 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0526 0.124 0.204 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 1.68e-01 0.173 0.125 0.204 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0174 0.104 0.204 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 3.79e-01 0.0934 0.106 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 6.06e-02 0.169 0.0896 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.69e-02 -0.195 0.102 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.57e-03 -0.337 0.105 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.00e-01 0.043 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 2.16e-01 0.122 0.0985 0.213 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 1.77e-01 -0.124 0.0912 0.213 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 3.05e-01 -0.109 0.106 0.213 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.20e-01 -0.163 0.104 0.213 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0958 0.104 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 4.42e-01 0.0636 0.0825 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 7.05e-01 0.0334 0.088 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00563 0.089 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.30e-02 -0.228 0.0995 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0447 0.108 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 9.89e-02 0.157 0.0949 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 8.83e-01 0.0165 0.112 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0781 0.0866 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.65e-01 -0.142 0.102 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 4.71e-02 -0.207 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.60e-02 -0.26 0.107 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.33e-01 0.0567 0.0909 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0326 0.1 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.41e-01 0.00806 0.109 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 6.30e-02 0.188 0.101 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 6.45e-02 -0.16 0.0863 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 6.10e-02 0.118 0.0626 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 1.64e-01 0.093 0.0666 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0379 0.0665 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0155 0.0718 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.98e-07 -0.414 0.0783 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0908 0.103 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 9.82e-01 0.00176 0.0762 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.11e-01 -0.055 0.0835 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 4.06e-01 0.0659 0.0791 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0328 0.0856 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 7.17e-02 -0.186 0.103 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0726 0.104 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0265 0.0907 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0341 0.0924 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0914 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 3.13e-01 -0.102 0.101 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.66e-01 -0.144 0.104 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0428 0.0966 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.35e-01 0.0568 0.0914 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 2.32e-01 -0.106 0.0888 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 6.52e-02 -0.192 0.104 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.10e-02 -0.168 0.0987 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 9.56e-05 -0.399 0.1 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 2.76e-01 -0.115 0.106 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 9.63e-02 0.131 0.0782 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0457 0.0823 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 6.28e-01 0.0373 0.077 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0337 0.0821 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 6.43e-06 -0.389 0.084 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0903 0.109 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 4.73e-01 0.0723 0.101 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0723 0.1 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0581 0.108 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.50e-02 -0.238 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.25e-01 -0.169 0.11 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 7.46e-01 0.0333 0.103 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 1.56e-01 0.14 0.0985 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 2.50e-01 -0.131 0.114 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 6.38e-01 0.0555 0.118 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0455 0.108 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 9.23e-02 0.177 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.95e-01 0.0551 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0785 0.0874 0.214 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 9.77e-01 0.00278 0.0971 0.214 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.00e-01 -0.135 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0763 0.0941 0.214 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 4.73e-01 0.0808 0.112 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00909 0.0992 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0986 0.111 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.21e-01 -0.023 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.92e-01 -0.14 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0216 0.0911 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.63e-01 0.0805 0.0884 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 6.84e-01 0.0361 0.0888 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0924 0.087 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.94e-02 -0.227 0.104 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 9.08e-01 0.0126 0.109 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 4.26e-01 0.078 0.0978 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 1.87e-01 -0.147 0.111 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0454 0.108 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 6.17e-04 -0.368 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 5.47e-01 0.0628 0.104 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.78e-01 0.0786 0.0889 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 2.24e-01 -0.121 0.0996 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.68e-01 0.0037 0.0926 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 4.26e-03 -0.275 0.0952 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.82e-01 0.0203 0.136 0.215 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.58e-01 0.072 0.122 0.215 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 9.32e-01 0.0119 0.138 0.215 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 7.85e-03 -0.256 0.0945 0.215 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.30e-01 -0.157 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.29e-02 0.187 0.104 0.213 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.81e-01 -0.05 0.0903 0.213 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 6.29e-01 0.0398 0.0823 0.213 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.09e-01 -0.108 0.105 0.213 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0988 0.102 0.213 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 3.17e-01 -0.105 0.104 0.213 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.35e-01 -0.037 0.109 0.212 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 4.60e-01 0.0674 0.0911 0.212 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0883 0.0727 0.212 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 6.80e-01 0.0395 0.0957 0.212 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.04e-01 0.0246 0.099 0.212 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.09e-01 -0.133 0.105 0.212 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00782 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 8.43e-01 0.0155 0.0782 0.21 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 2.89e-01 0.101 0.0945 0.21 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 2.97e-01 -0.116 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0617 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.87e-02 -0.22 0.1 0.21 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.44e-01 0.148 0.101 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 6.58e-01 0.0298 0.0672 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0589 0.0835 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 9.07e-01 0.0116 0.0989 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 9.93e-02 0.147 0.0885 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.23e-01 0.0245 0.109 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 2.11e-01 0.0977 0.0778 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 1.19e-01 -0.148 0.0944 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.45e-02 -0.214 0.111 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 8.09e-01 0.023 0.0949 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0261 0.135 0.227 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.56e-01 -0.182 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 3.46e-01 0.117 0.124 0.227 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0765 0.134 0.227 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 1.20e-01 -0.203 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0707 0.125 0.227 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.86e-01 0.0283 0.104 0.213 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.78e-01 0.123 0.0907 0.213 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0517 0.0814 0.213 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 8.88e-01 0.0149 0.106 0.213 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0839 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.33e-01 -0.161 0.107 0.208 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.36e-02 0.175 0.0818 0.208 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 4.61e-01 -0.061 0.0826 0.208 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0787 0.0931 0.208 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 3.52e-01 0.0918 0.0983 0.208 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 4.69e-01 0.0836 0.115 0.223 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.41e-01 0.0598 0.0976 0.223 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 3.42e-01 0.0846 0.0887 0.223 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0365 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.07e-01 0.123 0.0971 0.223 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0939 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 8.24e-01 0.0228 0.102 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 7.76e-02 0.158 0.0891 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 5.51e-03 -0.266 0.0949 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 5.72e-01 0.0553 0.0976 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 2.09e-03 -0.323 0.104 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 6.60e-01 -0.044 0.0999 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 3.06e-01 0.0868 0.0846 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.83e-01 0.0748 0.0856 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0648 0.0797 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.62e-02 -0.23 0.095 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 1.96e-01 0.131 0.101 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 5.52e-01 0.0363 0.0609 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 1.73e-01 -0.109 0.0799 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 3.27e-01 -0.1 0.102 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 2.25e-01 0.1 0.0823 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.63e-02 0.19 0.0786 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -53085 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0596 0.0777 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00126 0.0964 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 6.38e-01 0.0433 0.0921 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 152554 sc-eQTL 7.12e-01 0.0335 0.0906 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 152451 sc-eQTL 1.78e-01 0.106 0.0785 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0554 0.0799 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -723156 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0517 0.0812 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 3328 sc-eQTL 1.49e-05 -0.414 0.0933 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 152554 eQTL 0.00558 -0.0566 0.0204 0.0 0.0 0.159
ENSG00000116754 SRSF11 152451 eQTL 0.0248 0.0302 0.0134 0.0 0.0 0.159
ENSG00000116761 CTH -53085 eQTL 0.101 -0.0678 0.0413 0.301 0.117 0.159
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 eQTL 0.0138 -0.0401 0.0162 0.0 0.0 0.159
ENSG00000197568 HHLA3 3328 eQTL 5.17e-18 -0.291 0.0329 0.0274 0.065 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -689675 3.1e-07 1.51e-07 6.28e-08 2.22e-07 9.82e-08 8.37e-08 2.16e-07 6.12e-08 1.71e-07 9.35e-08 1.63e-07 1.22e-07 2.24e-07 8e-08 5.43e-08 9.01e-08 4.25e-08 1.77e-07 7.16e-08 5.87e-08 1.26e-07 1.65e-07 1.64e-07 3.51e-08 2.02e-07 1.39e-07 1.22e-07 1.04e-07 1.32e-07 1.17e-07 1.09e-07 3.68e-08 3.29e-08 9.52e-08 3.51e-08 3.11e-08 4.47e-08 7.61e-08 6.5e-08 4.41e-08 5.71e-08 1.59e-07 3.25e-08 1.09e-08 3.36e-08 1.01e-08 7.83e-08 2.02e-09 4.83e-08
ENSG00000066557 LRRC40 152554 3.58e-06 3.65e-06 5.8e-07 1.94e-06 8.3e-07 8.37e-07 2.49e-06 9.96e-07 2.42e-06 1.37e-06 3.09e-06 1.72e-06 5e-06 1.42e-06 9.02e-07 2e-06 1.55e-06 2.12e-06 1.57e-06 1.22e-06 1.53e-06 3.49e-06 3.4e-06 1.8e-06 4.32e-06 1.22e-06 1.73e-06 1.81e-06 3.18e-06 2.81e-06 1.93e-06 5.08e-07 6.01e-07 1.68e-06 1.69e-06 9.36e-07 9.39e-07 3.61e-07 1.24e-06 3.65e-07 2.22e-07 3.99e-06 5.27e-07 1.81e-07 3.82e-07 3.51e-07 8.72e-07 2.07e-07 1.74e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C 3399 4.47e-05 3.92e-05 9.36e-06 2.08e-05 9.1e-06 2.02e-05 6.08e-05 7.24e-06 4.58e-05 2.21e-05 5.53e-05 2.48e-05 7.04e-05 1.91e-05 1.03e-05 2.99e-05 2.62e-05 3.71e-05 1.34e-05 1.31e-05 2.64e-05 4.96e-05 3.98e-05 1.78e-05 6.25e-05 1.42e-05 2.12e-05 1.83e-05 4.39e-05 5.46e-05 2.98e-05 4.24e-06 5.96e-06 1.26e-05 1.76e-05 1.03e-05 6.09e-06 6.18e-06 8.83e-06 5.41e-06 2.7e-06 4.74e-05 4.97e-06 1.02e-06 5.09e-06 6.66e-06 6.16e-06 3.4e-06 3.08e-06
ENSG00000197568 HHLA3 3328 4.47e-05 3.92e-05 9.38e-06 2.08e-05 9.12e-06 2.03e-05 6.08e-05 7.32e-06 4.62e-05 2.22e-05 5.53e-05 2.47e-05 7.04e-05 1.91e-05 1.05e-05 3.03e-05 2.66e-05 3.74e-05 1.34e-05 1.32e-05 2.66e-05 5.03e-05 4.04e-05 1.79e-05 6.31e-05 1.42e-05 2.14e-05 1.84e-05 4.39e-05 5.56e-05 2.98e-05 4.37e-06 5.88e-06 1.26e-05 1.76e-05 1.06e-05 6.03e-06 6.22e-06 8.98e-06 5.5e-06 2.71e-06 4.78e-05 5.03e-06 1.03e-06 5.13e-06 6.69e-06 6.16e-06 3.43e-06 3.13e-06