logo

Genes within 1Mb (chr1:70248330:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.06e-01 0.129 0.126 0.107 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.88e-01 0.0395 0.0981 0.107 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0813 0.114 0.107 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.86e-01 -0.103 0.0961 0.107 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.55e-01 -0.179 0.126 0.107 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.59e-03 -0.28 0.104 0.107 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0401 0.0831 0.107 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0101 0.0844 0.107 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0842 0.0769 0.107 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.00e-01 -0.117 0.0909 0.107 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 7.95e-01 0.0279 0.107 0.107 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 6.54e-01 0.0536 0.119 0.107 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.27e-01 0.0484 0.0995 0.107 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 1.03e-01 -0.158 0.0967 0.107 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0311 0.094 0.107 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0507 0.109 0.107 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.27e-01 -0.17 0.111 0.107 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0325 0.147 0.113 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0396 0.0979 0.113 DC L1
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0822 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.41e-01 0.0387 0.117 0.113 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.95e-01 -0.172 0.132 0.113 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 4.69e-01 0.0994 0.137 0.107 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 7.39e-01 0.0266 0.0795 0.107 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0776 0.109 0.107 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 2.46e-05 -0.534 0.124 0.107 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0424 0.112 0.107 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0212 0.119 0.107 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00311 0.105 0.107 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.36e-03 -0.28 0.103 0.107 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.18e-01 -0.134 0.108 0.107 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0746 0.132 0.107 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 9.61e-01 0.00704 0.142 0.107 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0355 0.112 0.107 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 9.59e-01 0.00652 0.127 0.107 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.134 0.107 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0387 0.126 0.107 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 6.89e-01 0.0571 0.142 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.65e-01 -0.138 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0536 0.162 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.71e-01 -0.223 0.162 0.107 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 6.75e-01 0.0691 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0633 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.56e-01 -0.133 0.143 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 7.16e-01 0.0445 0.122 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.06e-02 -0.354 0.137 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.51e-01 -0.104 0.138 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.84e-02 -0.342 0.144 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 1.65e-01 0.214 0.153 0.108 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.47e-01 0.0625 0.137 0.108 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0762 0.126 0.108 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.69e-01 -0.202 0.147 0.108 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 7.76e-01 0.0414 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 1.55e-01 0.199 0.139 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0516 0.111 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0798 0.119 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0188 0.12 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0324 0.136 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 6.99e-01 -0.057 0.147 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0319 0.13 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.41e-01 -0.117 0.152 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0941 0.118 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00822 0.14 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 1.75e-01 -0.199 0.146 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.83e-03 -0.47 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 2.24e-01 0.155 0.127 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 9.76e-01 0.00432 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.98e-01 -0.039 0.153 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.40e-01 0.21 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 1.84e-02 -0.277 0.117 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.64e-01 0.00392 0.0856 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 9.35e-01 0.00741 0.0908 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.09 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.40e-01 -0.143 0.0969 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00795 0.113 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.37e-02 -0.249 0.138 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 5.48e-01 -0.062 0.103 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 1.22e-01 -0.174 0.112 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.37e-01 -0.036 0.107 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0811 0.116 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 4.73e-01 0.101 0.14 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0382 0.141 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.71e-01 -0.169 0.123 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 5.11e-01 0.0827 0.126 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0943 0.125 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.13e-01 -0.218 0.137 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 3.55e-01 -0.131 0.141 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 5.60e-02 0.264 0.137 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 7.94e-02 -0.23 0.13 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 1.68e-01 -0.176 0.127 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0372 0.15 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.61e-01 -0.2 0.142 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 4.01e-01 -0.125 0.149 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 8.73e-01 0.0234 0.147 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.99e-01 0.14 0.109 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0931 0.114 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0361 0.107 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.14e-01 -0.141 0.113 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 1.92e-01 -0.159 0.122 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.79e-01 -0.138 0.157 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 2.40e-01 0.17 0.144 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00116 0.144 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.92e-01 -0.129 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.154 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0536 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0828 0.158 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0575 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 8.24e-01 0.0316 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0655 0.164 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 8.14e-01 0.04 0.17 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.69e-01 0.00606 0.156 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 2.08e-01 -0.182 0.144 0.104 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.13e-01 -0.224 0.141 0.104 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0338 0.12 0.104 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0104 0.133 0.104 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.55e-01 -0.045 0.144 0.104 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.58e-01 0.00683 0.129 0.104 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 8.59e-01 0.0266 0.15 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 4.41e-01 -0.102 0.132 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0761 0.149 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.49e-01 -0.155 0.135 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00577 0.143 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0822 0.126 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.27e-01 -0.187 0.122 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 6.42e-02 -0.223 0.12 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000943 0.145 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.53e-02 0.28 0.157 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0985 0.142 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.05e-02 -0.291 0.16 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0736 0.157 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0321 0.158 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 6.58e-01 0.064 0.144 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 3.97e-01 -0.105 0.123 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.62e-01 0.039 0.128 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0786 0.135 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 2.78e-01 0.183 0.168 0.133 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.28e-01 0.0137 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 6.22e-02 0.317 0.168 0.133 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.62e-01 -0.169 0.12 0.133 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 3.11e-01 0.164 0.161 0.133 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.97e-01 0.124 0.147 0.107 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0155 0.127 0.107 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 7.40e-01 0.0385 0.116 0.107 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00358 0.148 0.107 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0251 0.143 0.107 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0363 0.147 0.107 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.45e-01 -0.145 0.153 0.107 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.49e-01 0.184 0.127 0.107 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 2.81e-01 -0.11 0.102 0.107 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0557 0.134 0.107 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0702 0.139 0.107 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 8.57e-01 0.0268 0.148 0.107 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0558 0.146 0.107 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 6.37e-01 0.0517 0.109 0.107 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 8.51e-01 -0.025 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.56e-01 -0.143 0.155 0.107 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.35e-01 0.181 0.152 0.107 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0753 0.142 0.107 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 4.27e-01 0.112 0.14 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 2.85e-01 0.0992 0.0927 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 3.22e-01 -0.114 0.115 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.60e-03 -0.384 0.134 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.05e-01 -0.103 0.123 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 6.60e-01 0.066 0.15 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.107 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 5.60e-01 0.0759 0.13 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 6.96e-02 -0.276 0.152 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.12e-01 -0.206 0.129 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0151 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 9.79e-02 -0.291 0.175 0.106 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 7.66e-01 0.0507 0.17 0.106 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 7.08e-01 0.0688 0.183 0.106 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.15e-02 -0.409 0.176 0.106 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 3.07e-01 0.176 0.171 0.106 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00344 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.40e-01 -0.187 0.126 0.109 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 8.76e-01 0.0177 0.114 0.109 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.56e-01 -0.11 0.148 0.109 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0499 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0431 0.148 0.111 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 3.70e-01 -0.102 0.114 0.111 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 1.91e-01 -0.149 0.113 0.111 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 9.42e-02 -0.215 0.128 0.111 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.36e-02 0.333 0.134 0.111 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 2.23e-01 0.208 0.17 0.116 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.69e-01 -0.198 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 3.98e-01 -0.111 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.55e-01 0.161 0.173 0.116 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0868 0.144 0.116 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 3.89e-02 -0.313 0.15 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 7.42e-01 -0.046 0.139 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 8.06e-01 0.03 0.122 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.39e-03 -0.382 0.129 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 5.39e-02 -0.256 0.132 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 7.46e-02 -0.257 0.143 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.11e-01 0.137 0.135 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 5.09e-01 -0.076 0.115 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0985 0.116 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0829 0.108 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00214 0.13 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 3.46e-01 0.133 0.14 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 4.97e-01 0.0573 0.0842 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0332 0.111 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.61e-03 -0.44 0.138 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 1.24e-01 -0.175 0.114 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 9.80e-01 0.0035 0.14 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 1.79e-01 -0.146 0.108 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -162888 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0863 0.106 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 4.77e-02 -0.259 0.13 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 5.90e-02 0.237 0.125 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 42751 sc-eQTL 9.24e-01 0.0118 0.124 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 42648 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 sc-eQTL 1.43e-02 -0.267 0.108 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -832959 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -106475 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0709 0.134 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 42751 eQTL 1.6e-08 -0.136 0.0239 0.0267 0.0247 0.0976
ENSG00000116754 SRSF11 42648 eQTL 0.0233 0.0363 0.016 0.00106 0.0 0.0976
ENSG00000116761 CTH -162888 eQTL 0.000175 -0.184 0.0488 0.0 0.0 0.0976
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 eQTL 5.92e-10 -0.119 0.019 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 42751 1.41e-05 2.04e-05 4.04e-06 1.13e-05 3.16e-06 8.4e-06 2.37e-05 3.73e-06 1.99e-05 1.1e-05 2.48e-05 9.37e-06 3.19e-05 7.19e-06 5.24e-06 1.07e-05 1e-05 1.59e-05 4.95e-06 5.26e-06 9.57e-06 2.18e-05 1.77e-05 6.06e-06 2.93e-05 5.53e-06 8.33e-06 8.88e-06 1.8e-05 1.58e-05 1.29e-05 1.61e-06 1.81e-06 4.84e-06 8.76e-06 4.46e-06 2.05e-06 2.76e-06 3.25e-06 2.49e-06 1.63e-06 2.26e-05 2.7e-06 3.24e-07 1.93e-06 2.69e-06 3.33e-06 1.29e-06 1.36e-06
ENSG00000118454 ANKRD13C -106404 6.55e-06 1e-05 1.68e-06 4.71e-06 1.84e-06 3.71e-06 9.57e-06 1.92e-06 8.75e-06 5.08e-06 1.06e-05 4.77e-06 1.2e-05 4.03e-06 2.72e-06 6.52e-06 4.94e-06 6.08e-06 2.69e-06 2.83e-06 5.13e-06 9.58e-06 6.69e-06 2.85e-06 1.22e-05 3.51e-06 4.56e-06 4.45e-06 7.12e-06 7.87e-06 4.92e-06 9.74e-07 1.28e-06 2.67e-06 3.62e-06 2.22e-06 1.83e-06 1.95e-06 1.64e-06 9.76e-07 8.74e-07 1e-05 1.42e-06 1.62e-07 7.45e-07 1.48e-06 1.28e-06 6.12e-07 4.74e-07