logo

Genes within 1Mb (chr1:70188580:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 7.38e-01 0.0445 0.133 0.09 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 7.22e-03 0.275 0.101 0.09 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 6.25e-01 0.0587 0.12 0.09 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.67e-01 0.112 0.101 0.09 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.74e-02 -0.313 0.131 0.09 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.65e-01 0.065 0.113 0.09 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 6.93e-02 0.161 0.088 0.09 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0515 0.0899 0.09 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0605 0.0822 0.09 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.44e-01 0.0318 0.0973 0.09 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 3.71e-04 -0.401 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 4.83e-02 -0.249 0.125 0.09 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.74e-01 0.115 0.105 0.09 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 3.28e-01 -0.101 0.103 0.09 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.73e-01 -0.016 0.0995 0.09 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.36e-01 0.0548 0.116 0.09 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.99e-03 -0.322 0.116 0.09 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 1.95e-01 0.207 0.159 0.09 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 4.77e-02 0.211 0.106 0.09 DC L1
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 5.77e-01 0.0769 0.138 0.09 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0412 0.146 0.09 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0556 0.127 0.09 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 3.44e-01 -0.137 0.144 0.09 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 8.07e-01 0.0357 0.146 0.09 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.93e-02 0.197 0.0836 0.09 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0377 0.116 0.09 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00724 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.78e-03 0.353 0.117 0.09 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 3.44e-01 -0.123 0.129 0.088 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 8.30e-02 0.197 0.113 0.088 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.19e-01 0.141 0.114 0.088 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.87e-01 0.126 0.118 0.088 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.48e-02 -0.276 0.143 0.088 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 2.39e-02 0.333 0.146 0.09 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 6.64e-01 0.0506 0.116 0.09 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.09 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 5.90e-01 0.0757 0.14 0.09 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0494 0.131 0.09 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 4.04e-01 -0.124 0.148 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.28e-02 0.324 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 4.30e-01 -0.14 0.177 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.32e-01 0.0615 0.179 0.084 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.90e-01 0.236 0.18 0.084 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 4.86e-01 -0.104 0.15 0.084 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 4.54e-01 0.116 0.154 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.80e-02 0.287 0.13 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00656 0.15 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.45e-01 0.216 0.148 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 3.25e-01 -0.154 0.156 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 6.29e-01 0.0776 0.16 0.091 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 6.30e-01 0.0685 0.142 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 4.99e-01 -0.089 0.131 0.091 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 9.32e-01 0.0131 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.36e-01 -0.225 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0996 0.149 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 7.00e-02 0.214 0.118 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.69e-01 0.14 0.126 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.49e-01 0.184 0.127 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 3.15e-02 -0.31 0.143 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 7.92e-01 0.0416 0.157 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 5.83e-03 0.38 0.136 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 6.36e-01 0.0771 0.163 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 3.46e-01 -0.119 0.126 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0929 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.33e-01 -0.096 0.154 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00635 0.16 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 4.57e-01 0.0997 0.134 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.94e-01 0.0197 0.148 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.34e-01 0.19 0.159 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.78e-01 0.201 0.149 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 7.78e-01 0.036 0.128 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.49e-01 0.133 0.0921 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0285 0.0981 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.43e-01 -0.007 0.0976 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 9.38e-01 0.00822 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 8.38e-03 -0.32 0.12 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 7.03e-02 0.272 0.149 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.22e-01 0.136 0.111 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 5.17e-01 -0.079 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0351 0.116 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0328 0.125 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 6.13e-03 -0.412 0.149 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0666 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.41e-01 0.192 0.13 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 8.31e-01 0.0284 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0167 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.04e-01 0.0555 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 2.60e-01 -0.169 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 2.86e-01 -0.149 0.139 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.04e-01 0.168 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0635 0.129 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.83e-01 -0.162 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 8.19e-01 0.0328 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 8.07e-02 -0.262 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 4.74e-01 -0.11 0.154 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.62e-01 0.128 0.114 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.119 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 6.55e-01 0.0501 0.112 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.51e-01 0.171 0.119 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 7.91e-02 -0.224 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0106 0.162 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 4.10e-01 0.123 0.149 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0361 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.20e-01 0.0157 0.155 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 5.06e-01 0.106 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 6.85e-01 -0.064 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 2.25e-02 -0.362 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0191 0.149 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 5.72e-01 0.0811 0.143 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 4.54e-02 -0.33 0.164 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.12e-01 0.0867 0.171 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.39e-01 0.0968 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 1.71e-02 0.362 0.151 0.091 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 9.19e-02 0.252 0.149 0.091 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 3.88e-02 -0.261 0.125 0.091 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.82e-01 0.0208 0.141 0.091 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0652 0.152 0.091 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0425 0.136 0.091 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0673 0.174 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.82e-01 0.165 0.153 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.08e-01 0.0419 0.172 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 4.64e-01 0.114 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 4.48e-01 -0.126 0.165 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0833 0.139 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 3.38e-01 0.129 0.135 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.69e-01 0.15 0.135 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.52e-01 0.152 0.132 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0538 0.159 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 4.38e-01 0.126 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 3.16e-01 0.147 0.147 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0367 0.167 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 5.02e-01 0.109 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 4.53e-03 -0.459 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0143 0.155 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 9.68e-02 0.22 0.132 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.75e-01 0.162 0.148 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.42e-01 0.0641 0.138 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.74e-01 -0.196 0.144 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 4.29e-01 -0.17 0.214 0.078 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 5.89e-01 -0.104 0.193 0.078 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0625 0.218 0.078 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0335 0.153 0.078 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0878 0.206 0.078 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 3.69e-01 0.139 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 9.14e-01 0.0144 0.134 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0912 0.122 0.089 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 8.41e-01 0.0313 0.156 0.089 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0906 0.155 0.089 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 8.16e-01 -0.038 0.163 0.09 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0532 0.137 0.09 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000974 0.109 0.09 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 6.65e-01 0.0622 0.143 0.09 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0388 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.90e-01 -0.207 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 3.39e-01 0.146 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.47e-01 0.166 0.114 0.09 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 9.67e-01 0.00578 0.139 0.09 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0485 0.163 0.09 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0665 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 5.87e-02 -0.28 0.147 0.09 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 1.83e-01 0.196 0.147 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.79e-01 0.131 0.0971 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 8.36e-01 0.0252 0.121 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 4.64e-01 0.105 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 9.22e-04 0.423 0.126 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 2.54e-01 -0.183 0.16 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 3.94e-01 0.0978 0.114 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 5.00e-01 -0.094 0.139 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.38e-01 -0.193 0.163 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 5.95e-02 0.262 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0128 0.193 0.1 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 2.48e-01 -0.213 0.183 0.1 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0251 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.44e-01 -0.223 0.191 0.1 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.16e-01 0.231 0.186 0.1 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.62e-01 -0.251 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 3.13e-01 0.155 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 9.90e-02 0.221 0.133 0.089 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 6.67e-01 0.0516 0.12 0.089 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 7.46e-01 0.0506 0.156 0.089 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 3.56e-01 -0.145 0.157 0.089 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0209 0.157 0.088 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 7.84e-03 0.319 0.119 0.088 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 1.73e-01 -0.164 0.12 0.088 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.088 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.83e-01 0.191 0.143 0.088 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0102 0.169 0.09 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 3.46e-02 0.301 0.141 0.09 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 1.11e-01 0.207 0.129 0.09 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.57e-01 0.00928 0.172 0.09 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.143 0.09 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0676 0.151 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 2.39e-01 0.174 0.147 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 5.02e-02 0.253 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.139 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 1.34e-01 0.211 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 1.05e-01 -0.247 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 8.98e-01 0.0184 0.144 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 3.85e-03 0.351 0.12 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 5.86e-01 0.0629 0.115 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 3.75e-02 -0.288 0.138 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 8.30e-01 0.0318 0.148 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.74e-01 0.12 0.0881 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0227 0.116 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0161 0.148 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 5.27e-04 0.41 0.116 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 7.21e-01 0.054 0.151 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 7.10e-03 0.312 0.115 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -222638 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0315 0.114 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.141 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 7.25e-01 0.0476 0.135 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -16999 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0835 0.136 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 sc-eQTL 1.13e-01 0.187 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -166154 sc-eQTL 1.20e-01 0.187 0.119 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -892709 sc-eQTL 2.65e-01 0.136 0.122 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 sc-eQTL 7.16e-02 -0.263 0.145 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116754 SRSF11 -17102 eQTL 0.018 0.047 0.0198 0.001 0.0 0.0667
ENSG00000197568 HHLA3 -166225 eQTL 0.000331 -0.181 0.0503 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina