Genes within 1Mb (chr1:70155332:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 3.11e-01 0.0834 0.0821 0.269 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.25e-10 -0.384 0.0581 0.269 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.18e-01 0.00768 0.0744 0.269 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.95e-01 0.0163 0.0627 0.269 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.65e-01 0.0914 0.0818 0.269 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 8.78e-02 0.118 0.0686 0.269 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.84e-13 -0.371 0.0479 0.269 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 7.40e-03 -0.146 0.0541 0.269 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000697 0.0504 0.269 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.75e-01 0.025 0.0595 0.269 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.89e-03 0.215 0.0683 0.269 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.31e-01 0.117 0.0773 0.269 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.68e-04 -0.24 0.0626 0.269 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 7.37e-02 -0.113 0.0629 0.269 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 2.10e-01 0.0766 0.0609 0.269 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0354 0.0711 0.269 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 8.20e-03 0.19 0.0713 0.269 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 9.25e-01 0.00994 0.105 0.268 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0582 0.0702 0.268 DC L1
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 6.44e-01 0.0419 0.0906 0.268 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 1.86e-01 0.127 0.0954 0.268 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 2.69e-01 0.0927 0.0836 0.268 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 4.25e-01 0.0758 0.0949 0.268 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 4.89e-01 0.0624 0.09 0.269 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 7.07e-02 -0.0941 0.0518 0.269 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0548 0.0715 0.269 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 3.88e-01 0.0731 0.0846 0.269 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 1.23e-01 -0.113 0.0731 0.269 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 6.93e-01 0.0307 0.0777 0.27 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 6.51e-05 -0.269 0.066 0.27 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00172 0.0689 0.27 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.87e-01 0.0192 0.0709 0.27 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 5.13e-02 0.168 0.0857 0.27 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 8.58e-01 0.0166 0.0926 0.269 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 2.54e-02 -0.162 0.0719 0.269 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 3.05e-01 -0.085 0.0826 0.269 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0672 0.0876 0.269 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0721 0.0818 0.269 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 8.92e-01 0.0127 0.0929 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 9.46e-01 -0.007 0.103 0.268 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.66e-01 -0.152 0.109 0.268 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0367 0.11 0.268 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 4.50e-01 0.0842 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.43e-01 0.108 0.0921 0.268 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0306 0.0963 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.95e-02 -0.191 0.081 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00444 0.0934 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0853 0.0924 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00212 0.0979 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 9.28e-01 0.00907 0.101 0.267 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 4.08e-03 -0.254 0.0874 0.267 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.38e-01 0.0276 0.0826 0.267 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 1.91e-01 0.125 0.0956 0.267 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.40e-01 0.111 0.0943 0.267 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 2.98e-01 0.0978 0.0937 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 6.38e-04 -0.252 0.0726 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 5.28e-01 0.0502 0.0795 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.88e-01 0.0436 0.0804 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 5.72e-02 0.173 0.0903 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 5.28e-01 0.0618 0.0978 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.17e-06 -0.409 0.0817 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000587 0.101 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 4.56e-01 0.0586 0.0785 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 4.49e-01 0.0704 0.0928 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0724 0.0958 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 6.22e-01 0.0491 0.0995 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 2.25e-01 -0.101 0.0831 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 6.30e-03 -0.249 0.0902 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 2.44e-01 -0.116 0.0992 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 6.76e-01 0.0389 0.093 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.06e-01 0.126 0.0779 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.36e-13 -0.395 0.0499 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 5.27e-03 -0.167 0.0591 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 8.63e-01 0.0104 0.0599 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 3.72e-01 0.0577 0.0645 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 7.22e-02 0.135 0.0744 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.81e-01 -0.122 0.0913 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 7.87e-07 -0.325 0.0639 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 9.87e-01 0.00117 0.0742 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 6.43e-01 0.0326 0.0703 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00493 0.0761 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 3.25e-03 0.269 0.0903 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 5.00e-03 0.26 0.0918 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.71e-02 -0.194 0.0805 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 9.10e-02 -0.14 0.0826 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0308 0.0825 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 1.58e-01 0.129 0.0908 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 4.50e-01 0.0709 0.0936 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 6.65e-02 -0.159 0.086 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 7.94e-02 -0.144 0.0815 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 9.77e-01 0.00235 0.0799 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 2.69e-01 -0.104 0.0934 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0254 0.0891 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 5.50e-02 0.179 0.0926 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.80e-01 0.13 0.0964 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 9.06e-03 -0.187 0.0709 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 1.23e-01 -0.116 0.0749 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 5.42e-02 0.135 0.0699 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.25e-01 0.0478 0.0751 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.32e-02 0.199 0.0795 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 5.96e-01 0.0535 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 2.45e-02 -0.208 0.0917 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 1.98e-01 -0.119 0.0923 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.53e-01 0.00567 0.0969 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0506 0.0991 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 4.77e-01 0.07 0.0983 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.40e-01 0.146 0.0986 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.61e-01 0.13 0.0921 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0703 0.089 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 2.16e-01 0.127 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.01e-03 -0.284 0.104 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0346 0.0976 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 4.82e-01 0.0666 0.0945 0.271 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0915 0.0926 0.271 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0411 0.0785 0.271 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0929 0.0868 0.271 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 8.77e-01 0.0146 0.0943 0.271 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 7.37e-01 0.0284 0.0845 0.271 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 2.02e-01 -0.128 0.1 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 2.95e-03 -0.261 0.0869 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 4.70e-01 0.0721 0.0997 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.01e-01 0.061 0.0906 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0497 0.096 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 3.86e-01 0.0717 0.0826 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.17e-03 -0.258 0.0784 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 2.14e-01 -0.1 0.0803 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.79e-01 0.0329 0.0792 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 3.15e-01 0.0956 0.0949 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 7.17e-01 0.0349 0.0963 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.54e-01 -0.124 0.0865 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 1.70e-01 0.135 0.0981 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.88e-01 0.0258 0.0957 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.86e-02 0.226 0.0952 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00514 0.0952 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 5.45e-02 -0.156 0.0807 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.05e-01 0.0346 0.0913 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.23e-01 0.0541 0.0845 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.31e-01 0.134 0.0882 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0313 0.12 0.259 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0526 0.108 0.259 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0821 0.121 0.259 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.86e-01 0.0234 0.0856 0.259 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.87e-01 -0.122 0.114 0.259 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0283 0.0994 0.27 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0106 0.0858 0.27 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 5.67e-01 0.0448 0.0782 0.27 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 4.07e-01 0.0832 0.1 0.27 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 2.45e-01 0.113 0.0966 0.27 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0989 0.27 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0169 0.102 0.269 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0518 0.085 0.269 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0966 0.0677 0.269 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 6.63e-01 -0.039 0.0893 0.269 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0585 0.0923 0.269 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.71e-01 0.109 0.0985 0.269 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0258 0.0984 0.263 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0367 0.0736 0.263 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 6.43e-01 0.0414 0.0892 0.263 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 1.37e-02 0.256 0.103 0.263 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.102 0.263 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 8.41e-04 0.314 0.0925 0.263 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0999 0.092 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0347 0.061 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 1.39e-01 -0.112 0.0755 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 5.27e-01 0.0569 0.0898 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0398 0.0809 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 2.36e-03 0.295 0.0958 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0694 0.0699 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 4.42e-01 0.0655 0.085 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 1.39e-01 0.148 0.0994 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.26e-01 -0.054 0.085 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 3.25e-01 0.118 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0319 0.114 0.27 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 2.61e-01 -0.124 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 6.41e-01 0.0555 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 5.71e-01 0.0657 0.116 0.27 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0326 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 1.51e-01 -0.144 0.1 0.267 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0894 0.0876 0.267 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 5.84e-01 -0.043 0.0785 0.267 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0959 0.102 0.267 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.44e-01 0.0336 0.103 0.267 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00253 0.1 0.265 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 1.26e-01 -0.118 0.077 0.265 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 5.46e-01 0.0467 0.0773 0.265 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.23e-01 -0.031 0.0872 0.265 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.72e-02 -0.162 0.0915 0.265 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0146 0.11 0.26 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0781 0.0925 0.26 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0423 0.0844 0.26 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 9.83e-01 0.00231 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.66e-01 0.0276 0.0926 0.26 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0137 0.098 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 8.28e-01 0.0197 0.0906 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 2.11e-03 -0.242 0.0777 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 7.89e-01 0.023 0.0855 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 6.52e-01 0.039 0.0865 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.71e-01 0.128 0.0934 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 4.84e-01 0.063 0.0898 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 2.46e-05 -0.316 0.0732 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 8.98e-01 0.0099 0.0771 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 3.75e-01 0.0637 0.0716 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0861 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 3.47e-01 0.0864 0.0916 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0501 0.055 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0925 0.0722 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 1.28e-01 0.14 0.0917 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0974 0.0743 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0484 0.094 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 9.61e-02 -0.121 0.0723 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -255886 sc-eQTL 9.39e-01 0.00546 0.0711 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 4.47e-01 -0.067 0.0879 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 1.74e-01 -0.114 0.0838 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -50247 sc-eQTL 6.20e-01 0.0404 0.0812 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -50350 sc-eQTL 4.24e-04 -0.246 0.0687 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0293 0.0717 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -925957 sc-eQTL 7.26e-01 0.0256 0.0729 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 sc-eQTL 2.12e-02 0.201 0.0865 0.269 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH -255886 eQTL 0.185 0.043 0.0325 0.00222 0.0 0.286
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 eQTL 0.00424 0.0366 0.0128 0.0 0.0 0.286
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 eQTL 1.24e-07 0.141 0.0265 0.0 0.0 0.286


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118454 ANKRD13C -199402 2.78e-06 2.7e-06 3.44e-07 1.76e-06 5.96e-07 8.09e-07 2.03e-06 7.33e-07 2.13e-06 1.04e-06 2.51e-06 1.48e-06 3.56e-06 1.37e-06 9.26e-07 1.77e-06 1.28e-06 2.25e-06 9.64e-07 1.41e-06 1.28e-06 3.03e-06 2.47e-06 1.17e-06 3.61e-06 1.23e-06 1.38e-06 1.79e-06 2.45e-06 1.86e-06 1.86e-06 3.78e-07 5.05e-07 1.22e-06 1.27e-06 9.91e-07 7.83e-07 4.21e-07 1.12e-06 3.97e-07 2.4e-07 3.49e-06 5.55e-07 1.99e-07 2.88e-07 3.38e-07 8.36e-07 1.82e-07 2.02e-07
ENSG00000197568 HHLA3 -199473 2.78e-06 2.7e-06 3.44e-07 1.76e-06 5.96e-07 8.09e-07 2.03e-06 7.33e-07 2.13e-06 1.04e-06 2.51e-06 1.48e-06 3.56e-06 1.37e-06 9.26e-07 1.73e-06 1.28e-06 2.25e-06 9.64e-07 1.41e-06 1.26e-06 3.03e-06 2.47e-06 1.17e-06 3.61e-06 1.23e-06 1.38e-06 1.79e-06 2.45e-06 1.86e-06 1.86e-06 3.78e-07 5.05e-07 1.22e-06 1.27e-06 1.01e-06 7.83e-07 4.21e-07 1.12e-06 3.97e-07 2.4e-07 3.49e-06 5.55e-07 1.99e-07 2.88e-07 3.38e-07 8.36e-07 1.82e-07 2.02e-07