logo

Genes within 1Mb (chr1:70152306:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 4.85e-01 0.0861 0.123 0.109 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 9.82e-01 0.00219 0.0954 0.109 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0897 0.111 0.109 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0952 0.0934 0.109 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 1.73e-01 -0.167 0.122 0.109 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 4.66e-03 -0.29 0.101 0.109 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.16e-01 -0.066 0.081 0.109 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00768 0.0823 0.109 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0653 0.0752 0.109 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.32e-01 -0.134 0.0885 0.109 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 7.55e-01 0.0327 0.104 0.109 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 7.11e-01 0.0427 0.115 0.109 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 6.58e-01 0.0426 0.096 0.109 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 2.01e-01 -0.12 0.0935 0.109 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0279 0.0907 0.109 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0823 0.105 0.109 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 8.16e-02 -0.187 0.107 0.109 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0133 0.143 0.115 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00476 0.0955 0.115 DC L1
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0595 0.123 0.115 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0444 0.13 0.115 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 9.33e-01 0.00957 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 2.35e-01 -0.153 0.129 0.115 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 4.95e-01 0.0908 0.133 0.109 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.89e-01 0.0107 0.077 0.109 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0646 0.105 0.109 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.15e-05 -0.502 0.12 0.109 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0438 0.108 0.109 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 8.45e-01 0.0225 0.115 0.109 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0367 0.102 0.109 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.68e-03 -0.286 0.1 0.109 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.80e-01 -0.141 0.105 0.109 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 4.26e-01 -0.102 0.128 0.109 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0186 0.138 0.109 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0704 0.108 0.109 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 6.49e-01 0.0561 0.123 0.109 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0808 0.13 0.109 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00882 0.122 0.109 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 8.55e-01 0.0252 0.138 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 4.96e-01 -0.101 0.148 0.11 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 3.95e-01 -0.133 0.156 0.11 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.09e-01 -0.198 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.52e-01 0.0505 0.159 0.11 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 4.44e-01 -0.101 0.132 0.11 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 2.27e-01 -0.169 0.14 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00719 0.119 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 8.59e-03 -0.355 0.134 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0452 0.135 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 6.78e-03 -0.383 0.14 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 1.54e-01 0.214 0.149 0.11 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 7.15e-01 0.0486 0.133 0.11 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.13e-01 -0.101 0.123 0.11 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 9.20e-02 -0.241 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.46e-01 0.00965 0.141 0.11 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 3.29e-01 0.133 0.135 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0961 0.108 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0824 0.115 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0442 0.116 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.84e-01 0.00258 0.132 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0769 0.143 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0949 0.126 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.78e-01 -0.161 0.148 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0597 0.115 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0496 0.136 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.98e-02 -0.234 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 1.42e-03 -0.467 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 2.56e-01 0.141 0.124 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0816 0.136 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 8.36e-01 0.0306 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.07e-02 0.233 0.137 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 8.61e-03 -0.302 0.114 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00284 0.0839 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 9.17e-01 0.00925 0.089 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.93e-01 -0.115 0.0882 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 8.78e-02 -0.163 0.0948 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000863 0.111 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 1.75e-01 -0.185 0.136 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0666 0.1 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 2.17e-01 -0.136 0.11 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 7.25e-01 0.0369 0.105 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 3.08e-01 -0.115 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 6.50e-01 0.0623 0.137 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 7.22e-01 -0.049 0.137 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 3.18e-02 -0.256 0.119 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 4.20e-01 0.0985 0.122 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.121 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.30e-01 -0.203 0.133 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0277 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.78e-02 0.22 0.133 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.75e-02 -0.216 0.126 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 1.52e-01 -0.176 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0605 0.144 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.18e-01 -0.214 0.136 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 3.94e-01 -0.122 0.144 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0241 0.143 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.32e-01 0.0838 0.106 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0765 0.111 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0366 0.104 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.65e-02 -0.196 0.11 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 1.59e-01 -0.168 0.119 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 2.57e-01 0.16 0.141 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 1.00e+00 -4.4e-05 0.141 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 3.34e-01 -0.146 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0734 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0722 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0524 0.142 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 5.68e-01 0.0782 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0745 0.157 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 6.99e-01 0.063 0.163 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00186 0.15 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 2.51e-01 -0.162 0.141 0.106 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 1.10e-01 -0.221 0.138 0.106 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 9.96e-01 0.000592 0.117 0.106 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 6.22e-01 0.0641 0.13 0.106 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.55e-01 -0.044 0.141 0.106 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 7.88e-01 -0.034 0.126 0.106 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 5.03e-01 0.0976 0.145 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0926 0.128 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.86e-01 -0.1 0.144 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.94e-01 -0.17 0.13 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.51e-01 0.00855 0.139 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0344 0.122 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.39e-01 0.0918 0.118 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.59e-01 -0.167 0.118 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 5.51e-02 -0.224 0.116 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0483 0.14 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 1.97e-01 0.198 0.152 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 2.68e-01 -0.153 0.138 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.91e-02 -0.34 0.155 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 4.11e-01 -0.125 0.152 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0856 0.153 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 6.68e-01 0.0603 0.14 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.19e-01 -0.165 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00478 0.125 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0564 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 3.73e-01 0.145 0.162 0.137 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.07e-01 0.0359 0.147 0.137 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.08e-01 0.265 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.116 0.137 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 1.77e-01 0.211 0.155 0.137 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 4.99e-01 0.0966 0.143 0.109 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0483 0.123 0.109 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 6.99e-01 0.0435 0.112 0.109 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 8.98e-01 0.0185 0.144 0.109 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0266 0.139 0.109 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0102 0.143 0.109 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 3.30e-01 -0.144 0.147 0.109 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 3.08e-01 0.126 0.123 0.109 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0925 0.0984 0.109 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00799 0.13 0.109 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0778 0.134 0.109 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 8.29e-01 0.0309 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0488 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 6.35e-01 0.0509 0.107 0.11 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 9.78e-01 0.00364 0.13 0.11 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.24e-01 -0.121 0.152 0.11 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 4.73e-01 0.107 0.149 0.11 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0464 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 5.03e-01 0.0911 0.136 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 3.57e-01 0.0829 0.0898 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 4.47e-01 -0.085 0.112 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 6.73e-03 -0.356 0.13 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0948 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 6.91e-01 0.0576 0.145 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.104 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 5.73e-01 0.0709 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 6.89e-02 -0.268 0.147 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 9.09e-02 -0.212 0.125 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.22e-01 0.0184 0.188 0.103 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.09e-02 -0.363 0.176 0.103 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 7.42e-01 0.0567 0.172 0.103 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00554 0.186 0.103 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.37e-02 -0.443 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 3.04e-01 0.179 0.173 0.103 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00854 0.14 0.111 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 1.51e-01 -0.175 0.122 0.111 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 9.08e-01 0.0127 0.109 0.111 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.94e-01 -0.149 0.142 0.111 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0198 0.143 0.111 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00482 0.143 0.113 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0898 0.11 0.113 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.109 0.113 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.09e-01 -0.198 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 2.24e-02 0.298 0.129 0.113 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 1.29e-01 0.25 0.164 0.116 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 2.11e-01 -0.175 0.139 0.116 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 3.59e-01 -0.117 0.127 0.116 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 4.49e-01 0.127 0.168 0.116 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0515 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 8.35e-02 -0.255 0.146 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 6.74e-01 -0.057 0.136 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0156 0.119 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.38e-03 -0.405 0.125 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 5.20e-02 -0.251 0.128 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 2.98e-02 -0.303 0.139 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 5.80e-01 0.0727 0.131 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 2.12e-01 -0.139 0.111 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.95e-01 -0.118 0.112 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 4.99e-01 -0.071 0.105 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00738 0.127 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 3.63e-01 0.124 0.136 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 5.90e-01 0.044 0.0815 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0231 0.107 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 2.58e-03 -0.407 0.134 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.14e-01 -0.174 0.11 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 8.54e-01 0.025 0.136 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.105 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -258912 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0821 0.102 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 3.99e-02 -0.26 0.126 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 5.78e-02 0.23 0.12 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 sc-eQTL 7.07e-01 0.0454 0.12 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 sc-eQTL 1.29e-02 -0.263 0.105 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -928983 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.108 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 sc-eQTL 3.88e-01 -0.112 0.13 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 eQTL 2.64e-07 -0.119 0.0229 0.002 0.00176 0.11
ENSG00000116754 SRSF11 -53376 eQTL 0.0314 0.0329 0.0153 0.0 0.0 0.11
ENSG00000116761 CTH -258912 eQTL 0.00463 -0.133 0.0469 0.0 0.0 0.11
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 eQTL 2.6e-11 -0.122 0.0181 0.0 0.00469 0.11
ENSG00000197568 HHLA3 -202499 eQTL 0.0141 -0.0956 0.0389 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 -53273 1.36e-05 1.62e-05 2.63e-06 9.71e-06 2.45e-06 6.19e-06 2.24e-05 2.78e-06 1.41e-05 7.59e-06 1.96e-05 7.33e-06 2.79e-05 6.95e-06 5.23e-06 9.24e-06 8.15e-06 1.18e-05 4.02e-06 4.17e-06 7.56e-06 1.5e-05 1.59e-05 4.69e-06 2.34e-05 5e-06 7.72e-06 6.91e-06 1.66e-05 1.25e-05 9.59e-06 1.05e-06 1.51e-06 4.05e-06 6.28e-06 3.17e-06 1.8e-06 2.4e-06 2.06e-06 1.72e-06 9.91e-07 2.15e-05 2.25e-06 1.59e-07 9.84e-07 2.79e-06 2.74e-06 6.45e-07 6.16e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C -202428 4e-06 3.49e-06 8.29e-07 1.89e-06 1.2e-06 1.19e-06 3e-06 9.96e-07 2.17e-06 1.97e-06 3.34e-06 2.13e-06 4.58e-06 1.47e-06 1.33e-06 2e-06 1.55e-06 2.26e-06 1.36e-06 9.17e-07 1.8e-06 3.7e-06 3.32e-06 1.64e-06 4.32e-06 1.13e-06 1.88e-06 1.63e-06 3.88e-06 2.55e-06 2.05e-06 4.56e-07 7.33e-07 1.75e-06 1.75e-06 9.34e-07 9.23e-07 4.24e-07 1.18e-06 3.28e-07 1.98e-07 4.1e-06 6.36e-07 1.67e-07 3.44e-07 1.13e-06 7.28e-07 2.4e-07 3.35e-07