Genes within 1Mb (chr1:70123186:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.111 0.126 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0431 0.0863 0.126 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0453 0.101 0.126 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0687 0.0847 0.126 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 2.46e-01 -0.129 0.111 0.126 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 2.71e-02 -0.205 0.0923 0.126 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 9.91e-02 -0.121 0.0729 0.126 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0148 0.0744 0.126 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0786 0.0679 0.126 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.33e-01 -0.096 0.0802 0.126 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.54e-01 0.0174 0.0945 0.126 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.68e-01 0.0174 0.104 0.126 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 9.08e-01 -0.01 0.0869 0.126 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0728 0.0848 0.126 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0498 0.082 0.126 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 6.68e-01 -0.041 0.0954 0.126 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 1.00e-01 -0.16 0.0967 0.126 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0231 0.132 0.131 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0511 0.088 0.131 DC L1
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00923 0.114 0.131 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.71e-01 -0.035 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.09e-01 0.012 0.105 0.131 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 3.71e-01 -0.107 0.119 0.131 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.68e-01 0.166 0.12 0.126 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 9.02e-01 0.00862 0.0697 0.126 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0315 0.0955 0.126 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 9.26e-05 -0.435 0.109 0.126 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0154 0.0981 0.126 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 7.46e-01 0.0335 0.103 0.127 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0715 0.0911 0.127 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 1.82e-02 -0.215 0.0904 0.127 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.24e-01 -0.115 0.0941 0.127 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0908 0.115 0.127 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0167 0.124 0.126 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.91e-01 -0.127 0.0971 0.126 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 7.63e-01 0.0335 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.65e-01 -0.051 0.117 0.126 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0196 0.11 0.126 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0292 0.124 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 2.27e-01 -0.16 0.132 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 3.79e-01 -0.124 0.14 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 4.14e-01 -0.116 0.141 0.128 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 3.20e-01 0.142 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 3.71e-01 -0.106 0.118 0.128 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.08e-01 -0.031 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.92e-01 0.0147 0.108 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.30e-02 -0.262 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.27e-01 0.0113 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 1.84e-02 -0.304 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 2.38e-01 0.16 0.135 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.89e-01 0.0167 0.12 0.127 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 2.41e-01 -0.13 0.111 0.127 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 5.55e-02 -0.247 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0444 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 5.33e-01 0.0768 0.123 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.25e-01 -0.118 0.0973 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0702 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0347 0.105 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.47e-01 0.023 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0175 0.129 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.15e-01 -0.18 0.114 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.92e-01 -0.053 0.134 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00867 0.104 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.54e-01 0.0227 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 7.38e-02 -0.228 0.127 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.78e-03 -0.411 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 6.62e-01 0.0486 0.111 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.80e-01 -0.108 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.49e-01 0.00845 0.133 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 5.42e-02 0.238 0.123 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.72e-02 -0.248 0.103 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0518 0.0759 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 9.68e-01 0.00322 0.0806 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 1.54e-01 -0.114 0.0798 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.07e-01 -0.139 0.086 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0441 0.1 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.38e-01 -0.118 0.123 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.41e-01 -0.133 0.0903 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 1.28e-01 -0.151 0.099 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.41e-01 0.0312 0.0944 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0686 0.102 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 3.87e-01 0.107 0.123 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 6.21e-01 0.0615 0.124 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.54e-03 -0.283 0.107 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 5.78e-01 0.0615 0.11 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0994 0.121 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 9.82e-01 0.00288 0.125 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.79e-01 0.104 0.118 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 7.58e-02 -0.199 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 2.06e-01 -0.138 0.109 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.128 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.75e-01 -0.133 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 3.37e-01 -0.123 0.127 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.46e-01 0.0252 0.13 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 7.81e-01 0.0269 0.0967 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0182 0.101 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0447 0.0946 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.42e-01 -0.148 0.1 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 2.54e-01 -0.123 0.108 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0657 0.138 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.58e-01 0.143 0.126 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.127 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 2.89e-01 -0.14 0.132 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 3.43e-01 -0.129 0.135 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0373 0.134 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0727 0.135 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0792 0.126 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 3.63e-01 0.111 0.121 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0446 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0521 0.145 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.95e-01 0.0176 0.133 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.22e-01 -0.197 0.127 0.123 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.90e-02 -0.213 0.125 0.123 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 9.39e-01 0.00818 0.106 0.123 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 4.86e-01 0.0819 0.117 0.123 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0155 0.127 0.123 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0734 0.114 0.123 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.56e-01 -0.164 0.115 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.60e-01 -0.119 0.13 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.35e-01 -0.176 0.117 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0313 0.125 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0366 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 7.10e-01 0.0397 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0895 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.20e-01 -0.164 0.105 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0647 0.126 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.89e-02 0.23 0.134 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.88e-01 -0.13 0.122 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 1.06e-01 -0.223 0.138 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.67e-01 -0.186 0.134 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0975 0.136 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.76e-01 0.112 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.86e-01 -0.143 0.107 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.121 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.27e-01 0.0103 0.112 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0217 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 2.33e-01 0.18 0.15 0.159 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.69e-01 0.0225 0.136 0.159 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 2.11e-01 0.192 0.153 0.159 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0681 0.108 0.159 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 2.30e-01 0.174 0.145 0.159 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.54e-01 0.119 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0675 0.111 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 7.30e-01 0.035 0.101 0.126 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00709 0.13 0.126 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0876 0.125 0.126 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00936 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.76e-01 -0.118 0.133 0.126 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.111 0.126 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0648 0.0888 0.126 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.25e-01 0.0571 0.117 0.126 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 4.05e-01 -0.101 0.121 0.126 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.47e-01 0.025 0.129 0.126 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.95e-01 -0.114 0.133 0.122 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 7.26e-01 0.035 0.0999 0.122 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 8.18e-01 0.0279 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0495 0.142 0.122 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 5.54e-01 0.0824 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0208 0.129 0.122 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 4.35e-01 0.0958 0.122 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 3.61e-01 0.0742 0.081 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0637 0.101 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.54e-03 -0.317 0.117 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0234 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.91e-01 0.171 0.13 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 9.76e-01 0.00285 0.0936 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 3.62e-01 0.104 0.113 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 2.28e-01 -0.161 0.133 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 8.97e-02 -0.192 0.113 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.46e-01 0.0313 0.162 0.118 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 3.43e-02 -0.324 0.151 0.118 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 7.84e-01 0.0407 0.148 0.118 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 8.03e-01 -0.04 0.16 0.118 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.71e-02 -0.343 0.154 0.118 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 2.35e-01 0.178 0.149 0.118 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 9.88e-01 0.002 0.127 0.129 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.02e-01 -0.142 0.111 0.129 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0995 0.129 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 1.35e-01 -0.193 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 9.04e-01 0.0158 0.13 0.129 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 5.65e-01 0.0742 0.129 0.129 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0591 0.0993 0.129 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0601 0.0992 0.129 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.41e-02 -0.207 0.111 0.129 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 7.65e-02 0.209 0.117 0.129 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.38e-01 0.222 0.149 0.13 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 1.59e-01 -0.179 0.126 0.13 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 3.32e-01 -0.112 0.115 0.13 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 7.60e-01 0.0467 0.153 0.13 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0627 0.127 0.13 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 9.12e-02 -0.226 0.133 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 8.47e-01 0.024 0.124 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00867 0.109 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 5.09e-03 -0.325 0.115 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.53e-01 -0.169 0.118 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 3.39e-02 -0.271 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 4.53e-01 0.0893 0.119 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 8.40e-02 -0.174 0.1 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0743 0.102 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0345 0.095 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 6.57e-01 0.051 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 1.59e-01 0.172 0.122 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 6.14e-01 0.0371 0.0735 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00821 0.0967 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 9.50e-03 -0.317 0.121 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.33e-01 -0.119 0.0992 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 3.62e-01 0.112 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 2.36e-01 -0.113 0.0951 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -288032 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0472 0.0932 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 3.86e-02 -0.238 0.114 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 1.06e-01 0.178 0.11 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 sc-eQTL 6.04e-01 0.0561 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0407 0.0942 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 sc-eQTL 6.49e-02 -0.176 0.0948 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -958103 sc-eQTL 2.40e-01 -0.114 0.0968 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -231619 sc-eQTL 4.06e-01 -0.097 0.116 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 eQTL 9.97e-07 -0.107 0.0218 0.0 0.0 0.121
ENSG00000116754 SRSF11 -82496 eQTL 0.0128 0.0361 0.0145 0.00131 0.0 0.121
ENSG00000116761 CTH -288032 eQTL 0.000205 -0.165 0.0443 0.0 0.0 0.121
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 eQTL 2.43e-08 -0.0973 0.0173 0.0 0.0 0.121


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -924622 2.91e-07 1.36e-07 5.82e-08 1.97e-07 1.03e-07 9.48e-08 1.81e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.67e-07 1.11e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.24e-08 1.56e-07 6.32e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.17e-08 1.68e-07 1.23e-07 1.18e-07 1.06e-07 1.26e-07 9.49e-08 1.07e-07 2.99e-08 3.43e-08 8.89e-08 3.52e-08 2.69e-08 5.59e-08 8.71e-08 6.43e-08 4.24e-08 5.36e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.07e-08 3.2e-08 1.89e-08 1.2e-07 1.88e-09 4.8e-08
ENSG00000066557 LRRC40 -82393 4.83e-06 5.38e-06 5.93e-07 3.37e-06 1.82e-06 1.61e-06 8.08e-06 1.22e-06 4.59e-06 2.84e-06 7.38e-06 3.12e-06 9.47e-06 2.02e-06 9.3e-07 4.01e-06 2.24e-06 3.67e-06 1.81e-06 1.98e-06 2.79e-06 5.5e-06 4.9e-06 2.18e-06 9.05e-06 2.25e-06 2.65e-06 1.78e-06 6.26e-06 6.94e-06 2.59e-06 5.11e-07 6.72e-07 2.73e-06 2.01e-06 2.03e-06 1.35e-06 8.19e-07 1.27e-06 8.66e-07 9.78e-07 7.35e-06 5.44e-07 1.88e-07 6.98e-07 9.54e-07 1.04e-06 6.91e-07 5.79e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C -231548 1.58e-06 1.57e-06 2.2e-07 1.27e-06 4.87e-07 6.36e-07 1.26e-06 4.02e-07 1.7e-06 6.9e-07 2e-06 1.15e-06 2.59e-06 4.11e-07 3.63e-07 1e-06 9.94e-07 1.16e-06 5.36e-07 6.49e-07 6.12e-07 1.92e-06 1.54e-06 8.71e-07 2.45e-06 9.28e-07 1.02e-06 1.07e-06 1.73e-06 1.29e-06 7.86e-07 2.45e-07 3.58e-07 6.84e-07 6.86e-07 6.4e-07 7.12e-07 3.59e-07 4.82e-07 2.04e-07 1.51e-07 2.13e-06 1.66e-07 1.57e-07 3.52e-07 2.46e-07 3.01e-07 1.42e-07 2.97e-07