Genes within 1Mb (chr1:70119047:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.115 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0302 0.0872 0.115 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0223 0.102 0.115 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0251 0.0856 0.115 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.115 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.18e-02 -0.161 0.0948 0.115 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 2.43e-02 -0.168 0.0741 0.115 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 8.13e-01 -0.018 0.0761 0.115 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0213 0.0696 0.115 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0519 0.0822 0.115 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0362 0.0965 0.115 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00193 0.106 0.115 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0314 0.0879 0.115 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0668 0.0859 0.115 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0716 0.0829 0.115 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0504 0.0965 0.115 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 1.50e-01 -0.141 0.098 0.115 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0256 0.137 0.117 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 4.72e-01 -0.066 0.0916 0.117 DC L1
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0052 0.118 0.117 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 9.49e-01 0.00794 0.125 0.117 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 5.82e-01 0.0602 0.109 0.117 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0957 0.124 0.117 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 1.21e-01 0.189 0.122 0.115 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0127 0.0709 0.115 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.20e-01 0.0482 0.0971 0.115 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 5.53e-04 -0.392 0.112 0.115 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 6.96e-01 -0.039 0.0997 0.115 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 3.92e-01 0.0899 0.105 0.116 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0437 0.0927 0.116 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.32e-02 -0.21 0.092 0.116 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0742 0.0959 0.116 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0321 0.117 0.116 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00102 0.125 0.115 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.92e-01 -0.129 0.0981 0.115 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 3.93e-01 0.0957 0.112 0.115 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 5.62e-01 -0.069 0.119 0.115 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00891 0.111 0.115 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0248 0.126 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0983 0.135 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 4.21e-01 -0.115 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 7.28e-01 0.0501 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.77e-01 0.158 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 2.57e-01 -0.137 0.12 0.12 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0318 0.129 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 9.51e-01 0.00675 0.11 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 7.55e-02 -0.222 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 5.35e-01 0.0772 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 7.33e-02 -0.235 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.84e-01 0.147 0.137 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.44e-01 0.0397 0.121 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.63e-01 -0.157 0.112 0.116 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 1.10e-01 -0.209 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00122 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 6.22e-01 0.0613 0.124 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 2.68e-01 -0.109 0.0986 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0266 0.105 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.59e-01 0.019 0.107 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00674 0.121 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.66e-01 0.00554 0.132 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.97e-02 -0.197 0.115 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 5.05e-01 -0.091 0.136 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.60e-01 0.0186 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00111 0.125 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.133 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.32e-02 -0.246 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 1.95e-01 0.15 0.115 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0933 0.127 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0316 0.138 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 2.64e-02 0.285 0.127 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 4.03e-02 -0.221 0.107 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.16e-01 -0.123 0.078 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 7.58e-01 0.0257 0.0832 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0655 0.0827 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.26e-01 -0.108 0.089 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0404 0.104 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.65e-01 0.00544 0.126 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.95e-01 -0.12 0.0923 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 1.05e-01 -0.164 0.101 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.62e-01 0.108 0.0961 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 9.09e-01 0.012 0.104 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0401 0.126 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0589 0.126 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 2.85e-03 -0.325 0.108 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.57e-01 0.0499 0.112 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0282 0.111 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0548 0.123 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00411 0.126 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 4.93e-01 0.0823 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0962 0.113 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 1.62e-01 -0.154 0.11 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.129 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 4.91e-01 -0.085 0.123 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0746 0.129 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.65e-01 0.0229 0.134 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0523 0.0999 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0468 0.104 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0678 0.0977 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 1.17e-01 -0.163 0.104 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.112 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 1.49e-01 -0.205 0.142 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.95e-02 0.229 0.13 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 4.73e-01 0.0939 0.131 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.53e-01 -0.156 0.136 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 3.96e-01 -0.119 0.14 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 3.22e-01 -0.138 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0572 0.137 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 3.50e-01 -0.119 0.127 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 1.49e-01 0.177 0.122 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 8.35e-01 0.0295 0.142 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 6.87e-01 0.0591 0.146 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 4.60e-01 0.0995 0.135 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 1.74e-01 -0.179 0.131 0.113 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 6.02e-02 -0.241 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 8.28e-01 0.0237 0.109 0.113 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.54e-01 0.138 0.12 0.113 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 9.93e-01 0.00118 0.131 0.113 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 3.02e-01 -0.121 0.117 0.113 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.28e-01 0.16 0.133 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.25e-01 -0.18 0.117 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 3.97e-01 -0.112 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.80e-01 -0.129 0.119 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.65e-01 0.00564 0.127 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0703 0.111 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.48e-01 0.0207 0.108 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0609 0.109 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 1.37e-01 -0.159 0.106 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0686 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.68e-02 0.3 0.135 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0263 0.123 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 3.12e-01 -0.141 0.139 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.43e-01 -0.158 0.135 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0642 0.137 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.05e-02 0.216 0.127 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0902 0.109 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.63e-01 -0.137 0.122 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 6.68e-01 0.0487 0.114 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 6.87e-01 0.048 0.119 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.12e-01 0.191 0.152 0.148 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.98e-01 0.178 0.137 0.148 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.40e-01 0.183 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 7.77e-01 0.0312 0.11 0.148 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 2.43e-01 0.172 0.146 0.148 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 3.63e-01 0.118 0.129 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.22e-01 0.0252 0.112 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 3.14e-01 0.103 0.102 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0382 0.131 0.115 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0141 0.126 0.115 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.13 0.115 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0339 0.134 0.115 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 4.80e-01 0.0791 0.112 0.115 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0952 0.0892 0.115 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.98e-01 0.122 0.117 0.115 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0958 0.121 0.115 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 9.93e-01 0.00121 0.13 0.115 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0885 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0888 0.104 0.11 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 7.01e-01 0.0486 0.127 0.11 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 7.14e-01 0.0542 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 3.96e-01 0.124 0.145 0.11 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 8.64e-01 0.0231 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 5.60e-01 0.0724 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.50e-01 0.0262 0.0821 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0261 0.102 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.85e-02 -0.283 0.119 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.76e-01 0.017 0.109 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 3.34e-01 0.129 0.133 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00553 0.0951 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.78e-02 0.21 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 3.12e-01 -0.137 0.135 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 4.43e-02 -0.231 0.114 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 9.85e-01 0.0033 0.17 0.106 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.53e-02 -0.389 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 3.47e-01 0.147 0.156 0.106 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 4.59e-01 -0.125 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.05e-02 -0.378 0.161 0.106 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 4.69e-01 0.114 0.157 0.106 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0255 0.129 0.116 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.112 0.116 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.75e-01 0.0423 0.101 0.116 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.39e-01 -0.194 0.131 0.116 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.14e-01 0.031 0.132 0.116 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 4.73e-01 0.0939 0.131 0.118 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 7.53e-01 0.0317 0.101 0.118 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 2.47e-01 -0.117 0.1 0.118 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.73e-02 -0.269 0.112 0.118 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 5.65e-02 0.228 0.119 0.118 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 1.19e-01 0.244 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 3.91e-01 -0.114 0.132 0.11 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0588 0.121 0.11 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 5.69e-01 0.0909 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 9.08e-01 0.0154 0.132 0.11 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 5.40e-02 -0.269 0.138 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 8.08e-01 0.0307 0.126 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 9.80e-01 0.00283 0.11 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.21e-02 -0.296 0.117 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 3.69e-01 -0.108 0.12 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 1.15e-01 -0.205 0.13 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 4.91e-01 0.0834 0.121 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 1.18e-01 -0.16 0.102 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0467 0.104 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 8.03e-01 0.0241 0.0966 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 8.25e-01 0.0258 0.117 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 2.06e-01 0.156 0.123 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 9.89e-01 0.00101 0.0742 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 5.97e-01 0.0517 0.0976 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.98e-02 -0.269 0.123 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 2.38e-01 -0.119 0.1 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 1.89e-01 0.165 0.125 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0557 0.0971 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -292171 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0284 0.0949 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 2.23e-02 -0.267 0.116 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 1.02e-01 0.184 0.112 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 sc-eQTL 3.37e-01 0.106 0.11 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0138 0.0957 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 sc-eQTL 1.07e-01 -0.156 0.0965 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962242 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0722 0.0986 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -235758 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0599 0.118 0.116 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -86532 eQTL 1.72e-05 -0.0943 0.0218 0.0 0.0 0.118
ENSG00000116754 SRSF11 -86635 eQTL 0.0342 0.0307 0.0145 0.0 0.0 0.118
ENSG00000116761 CTH -292171 eQTL 0.00136 -0.143 0.0444 0.0 0.0 0.118
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 eQTL 5.92e-08 -0.0946 0.0173 0.0 0.0 0.118


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -928761 7.76e-07 5.67e-07 3.31e-07 3.96e-07 1.08e-07 1.77e-07 7.32e-07 5.85e-08 3.32e-07 9.72e-08 4.88e-07 1.96e-07 5.39e-07 9.48e-08 6.18e-08 1.14e-07 1.01e-07 3.44e-07 2.57e-07 4.92e-08 1.76e-07 2.96e-07 4e-07 2.93e-08 1.2e-06 1.86e-07 1.74e-07 1.69e-07 1.6e-07 1.08e-06 2.73e-07 3.41e-08 3.56e-08 1.02e-07 3e-07 4.77e-08 5.7e-08 8.71e-08 6.71e-08 3.8e-08 4e-08 3.43e-07 3.14e-08 7.24e-09 8.79e-08 9.44e-09 1.24e-07 4.6e-09 4.74e-08
ENSG00000118454 ANKRD13C -235687 4.63e-06 5.07e-06 2.65e-06 2.59e-06 1.32e-06 1.57e-06 9.67e-06 8.51e-07 4.96e-06 2.06e-06 4.46e-06 3.56e-06 6.55e-06 1.24e-06 8.88e-07 2.3e-06 1.87e-06 3.09e-06 1.47e-06 1.23e-06 2.8e-06 4.14e-06 4.68e-06 9.89e-07 8.92e-06 1.95e-06 2.35e-06 1.69e-06 4.43e-06 6.2e-06 1.89e-06 7.6e-08 3.47e-07 1.87e-06 2.13e-06 1.61e-06 9.22e-07 4.71e-07 5.16e-07 1.86e-07 1.97e-07 6.65e-06 8.3e-07 2.91e-07 3.07e-07 3.67e-07 4.27e-07 8.18e-08 5.32e-08