Genes within 1Mb (chr1:70118385:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 5.79e-01 0.0588 0.106 0.143 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0219 0.0822 0.143 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.24e-01 -0.047 0.0958 0.143 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 6.13e-01 0.0409 0.0807 0.143 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.143 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 1.81e-01 -0.119 0.0889 0.143 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0791 0.07 0.143 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 8.06e-01 0.0175 0.0712 0.143 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00181 0.0651 0.143 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.93e-01 0.0104 0.0769 0.143 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 1.59e-01 -0.127 0.0899 0.143 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 8.69e-01 0.0166 0.1 0.143 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0493 0.0835 0.143 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 1.67e-01 -0.113 0.0813 0.143 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 4.25e-01 -0.063 0.0788 0.143 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0574 0.0916 0.143 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 1.72e-02 -0.222 0.0923 0.143 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 9.44e-01 0.00906 0.13 0.137 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 1.62e-01 -0.121 0.0861 0.137 DC L1
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 5.45e-01 0.0676 0.112 0.137 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.30e-01 0.0569 0.118 0.137 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.64e-01 0.0596 0.103 0.137 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0983 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 1.04e-01 0.189 0.115 0.143 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0195 0.0672 0.143 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 7.86e-01 0.025 0.0922 0.143 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 1.84e-03 -0.336 0.107 0.143 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0267 0.0946 0.143 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 9.54e-01 0.00571 0.0994 0.144 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0446 0.0877 0.144 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 4.99e-02 -0.172 0.0873 0.144 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 9.42e-01 0.00657 0.0908 0.144 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0848 0.111 0.144 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.94e-01 0.0803 0.117 0.143 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0905 0.0921 0.143 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 1.98e-01 0.135 0.105 0.143 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0925 0.111 0.143 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0162 0.104 0.143 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0281 0.118 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 6.81e-01 0.0525 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.35e-01 -0.16 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 9.48e-01 0.00895 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 1.13e-01 0.217 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.114 0.145 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 8.64e-01 0.021 0.122 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0155 0.104 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.53e-02 -0.217 0.117 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 2.82e-01 0.126 0.117 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 6.77e-02 -0.226 0.123 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.46e-01 0.151 0.129 0.144 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 3.64e-01 0.105 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 7.05e-02 -0.192 0.106 0.144 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 9.40e-02 -0.207 0.123 0.144 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 5.51e-01 -0.073 0.122 0.144 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 9.49e-01 0.00753 0.117 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0636 0.0927 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0424 0.0989 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 2.72e-01 0.11 0.0997 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0311 0.113 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0505 0.123 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.24e-01 -0.132 0.109 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.56e-01 -0.118 0.127 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.12e-01 0.065 0.0989 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0256 0.117 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.34e-01 -0.145 0.122 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 5.08e-01 -0.084 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 1.20e-01 0.165 0.106 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 9.01e-01 0.0146 0.117 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0669 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.12e-01 0.148 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0555 0.0727 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 4.79e-01 0.0547 0.0771 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0367 0.0767 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0189 0.0828 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0901 0.0959 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0802 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0611 0.0868 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0835 0.0952 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.60e-01 0.0828 0.0902 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 4.48e-01 0.0742 0.0976 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0323 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0557 0.119 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 6.32e-02 -0.192 0.103 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 8.42e-01 -0.021 0.106 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0559 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0591 0.116 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.90e-01 -0.126 0.119 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.97e-01 0.117 0.112 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 1.92e-01 -0.138 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 1.96e-01 -0.134 0.103 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 7.83e-02 -0.213 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0657 0.115 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.02e-01 -0.154 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0412 0.124 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0111 0.0927 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 2.59e-01 -0.109 0.0966 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00112 0.0907 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 1.49e-01 -0.139 0.0961 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.11e-02 -0.211 0.103 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 1.21e-01 -0.206 0.132 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.86e-01 0.13 0.122 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 2.70e-01 0.134 0.122 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 4.10e-02 -0.266 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0862 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.73e-01 -0.14 0.127 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0755 0.119 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 3.93e-01 0.0981 0.115 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 8.86e-01 -0.019 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.25e-01 0.0871 0.137 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 6.83e-01 0.0514 0.126 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0806 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 8.33e-02 -0.206 0.119 0.141 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 6.04e-01 0.0525 0.101 0.141 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.72e-01 0.0475 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 4.39e-01 0.0939 0.121 0.141 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.29e-01 0.15 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 8.15e-02 -0.191 0.109 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0949 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.94e-01 -0.015 0.113 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0964 0.119 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.65e-01 -0.118 0.105 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 7.15e-01 0.0375 0.103 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0236 0.103 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 1.84e-01 -0.134 0.101 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0498 0.121 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.64e-01 0.00522 0.115 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.39e-02 -0.275 0.129 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0454 0.126 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0929 0.127 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 8.79e-02 0.206 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0688 0.103 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 2.71e-01 -0.127 0.115 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 3.50e-01 0.1 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0138 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.74e-01 0.103 0.144 0.185 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 1.04e-01 0.21 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 1.97e-01 0.188 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.62e-01 0.0179 0.103 0.185 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 6.94e-01 0.0546 0.138 0.185 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.30e-01 0.147 0.122 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00892 0.106 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 3.89e-01 0.0832 0.0963 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 7.90e-01 -0.033 0.124 0.141 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0694 0.119 0.141 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00432 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0463 0.126 0.143 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 1.43e-01 0.154 0.105 0.143 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0838 0.0841 0.143 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 2.94e-01 0.116 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0544 0.114 0.143 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 3.61e-01 -0.112 0.122 0.143 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0742 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0841 0.0959 0.132 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 4.86e-01 0.0813 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.35e-01 0.0649 0.136 0.132 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.66e-01 0.0769 0.134 0.132 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 9.21e-01 0.0123 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.91e-01 0.0807 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.02e-01 0.00957 0.0775 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0596 0.0962 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 1.52e-02 -0.275 0.112 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 5.93e-01 0.0549 0.103 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 1.15e-01 0.198 0.125 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00391 0.0902 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 3.99e-02 0.224 0.109 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.01e-01 -0.133 0.128 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 9.45e-02 -0.183 0.109 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.83e-01 -0.11 0.156 0.133 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 6.70e-02 -0.271 0.147 0.133 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 2.35e-01 0.17 0.143 0.133 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 9.64e-02 -0.257 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 3.88e-02 -0.311 0.149 0.133 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 3.54e-01 0.134 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 4.87e-01 -0.085 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0826 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 9.42e-01 0.00694 0.0954 0.14 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.61e-01 -0.113 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.09e-01 0.0302 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0467 0.124 0.14 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 6.27e-01 0.0465 0.0956 0.14 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 1.94e-01 -0.124 0.0952 0.14 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 2.67e-02 -0.238 0.106 0.14 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 1.14e-01 0.179 0.113 0.14 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.28e-01 0.172 0.142 0.136 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.08e-01 -0.152 0.12 0.136 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0142 0.11 0.136 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 4.60e-01 0.107 0.145 0.136 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00337 0.12 0.136 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 7.10e-02 -0.229 0.126 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 2.49e-01 0.138 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.39e-01 0.00809 0.105 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 6.61e-03 -0.305 0.111 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0386 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 3.96e-02 -0.254 0.123 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 9.67e-01 0.0047 0.114 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 2.60e-01 -0.109 0.0965 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0311 0.0978 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 3.44e-01 0.0862 0.0909 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 9.38e-01 0.00857 0.11 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 9.17e-02 0.196 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0128 0.0699 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 9.02e-01 0.0114 0.092 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 3.05e-02 -0.252 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0876 0.0945 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0435 0.118 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0349 0.0913 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -292833 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0604 0.0891 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 1.14e-01 -0.174 0.11 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 1.11e-01 0.168 0.105 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 sc-eQTL 7.93e-01 0.0273 0.104 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -87297 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00711 0.0905 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 sc-eQTL 1.58e-01 -0.13 0.0914 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -962904 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0159 0.0933 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0921 0.112 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 eQTL 3.68e-06 -0.0925 0.0199 0.0 0.0 0.153
ENSG00000116761 CTH -292833 eQTL 1.46e-05 -0.175 0.0402 0.0 0.0 0.153
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 eQTL 4.86e-06 -0.0728 0.0158 0.0 0.0 0.153
ENSG00000197568 HHLA3 -236420 eQTL 0.0123 -0.0842 0.0336 0.0 0.0 0.153


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 -87194 4.99e-06 5.52e-06 6.63e-07 3.57e-06 1.65e-06 1.53e-06 7.23e-06 1.15e-06 4.83e-06 2.8e-06 6.86e-06 3.27e-06 8.51e-06 1.77e-06 9.59e-07 3.98e-06 1.93e-06 3.87e-06 1.43e-06 1.48e-06 2.77e-06 5.36e-06 4.73e-06 1.88e-06 8.52e-06 2.16e-06 2.28e-06 1.84e-06 5.11e-06 5.28e-06 2.58e-06 4.43e-07 7.26e-07 2.26e-06 1.99e-06 1.31e-06 1.06e-06 5.14e-07 9.08e-07 5.94e-07 7.83e-07 7.11e-06 5.26e-07 1.46e-07 7.74e-07 1.07e-06 1.02e-06 6.71e-07 5.44e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C -236349 1.34e-06 1.25e-06 2.77e-07 1.28e-06 3.67e-07 6.09e-07 1.47e-06 4.06e-07 1.68e-06 6.36e-07 2.03e-06 9.12e-07 2.53e-06 2.77e-07 4.89e-07 9.97e-07 9.31e-07 9.52e-07 8.04e-07 4.77e-07 7.61e-07 1.93e-06 1.09e-06 6.27e-07 2.28e-06 7.59e-07 1.03e-06 8.98e-07 1.63e-06 1.2e-06 7.79e-07 2.54e-07 2.86e-07 5.82e-07 5.52e-07 5.15e-07 6.91e-07 3.37e-07 4.63e-07 2.94e-07 3.57e-07 1.64e-06 2.19e-07 6.55e-08 3.15e-07 2.13e-07 2.79e-07 1.41e-07 1.98e-07