logo

Genes within 1Mb (chr1:70109960:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.77e-01 0.0608 0.109 0.139 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0232 0.0845 0.139 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0518 0.0985 0.139 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 7.23e-01 0.0295 0.083 0.139 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.01e-01 -0.139 0.108 0.139 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.45e-01 -0.107 0.0918 0.139 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0924 0.0721 0.139 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 7.34e-01 0.0249 0.0734 0.139 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 7.74e-01 0.0193 0.0671 0.139 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 8.68e-01 0.0132 0.0793 0.139 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 1.83e-01 -0.124 0.0928 0.139 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.40e-01 0.0077 0.103 0.139 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0554 0.0858 0.139 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.41e-01 -0.123 0.0836 0.139 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0576 0.081 0.139 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0613 0.0942 0.139 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.79e-02 -0.21 0.0951 0.139 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.73e-01 0.00446 0.133 0.133 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.35e-01 -0.106 0.0888 0.133 DC L1
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 7.37e-01 0.0387 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.87e-01 0.066 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.99e-01 0.0719 0.106 0.133 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0827 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 1.05e-01 0.193 0.119 0.139 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0131 0.0692 0.139 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 7.90e-01 0.0253 0.0949 0.139 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 2.23e-03 -0.34 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00959 0.0974 0.139 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0347 0.09 0.139 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 6.91e-02 -0.164 0.0897 0.139 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 8.30e-01 -0.02 0.0931 0.139 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0732 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 3.12e-01 0.122 0.121 0.139 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.56e-01 -0.108 0.0946 0.139 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 2.20e-01 0.132 0.108 0.139 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 2.74e-01 -0.125 0.114 0.139 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 7.94e-01 -0.028 0.107 0.139 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 9.72e-01 0.00429 0.121 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 7.64e-01 0.0391 0.13 0.143 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 9.24e-01 0.0133 0.139 0.143 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 8.94e-02 0.237 0.139 0.143 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 3.41e-01 -0.111 0.116 0.143 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.27e-01 0.0794 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 9.41e-01 0.00787 0.107 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 8.60e-02 -0.208 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 5.61e-01 0.0702 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 8.99e-02 -0.216 0.127 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.14 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.93e-01 0.124 0.118 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.03e-01 -0.178 0.109 0.14 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 1.11e-01 -0.203 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0624 0.125 0.14 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 8.96e-01 0.0157 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0603 0.0952 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0577 0.101 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 2.10e-01 0.129 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0362 0.116 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0766 0.127 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.67e-01 -0.124 0.112 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.76e-01 -0.117 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 6.50e-01 0.0463 0.102 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 7.47e-01 -0.039 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 3.46e-01 -0.119 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0711 0.13 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.14e-01 0.173 0.109 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 6.53e-01 0.0542 0.12 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.37e-01 -0.101 0.13 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.74e-01 0.133 0.122 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0963 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0626 0.0748 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 4.34e-01 0.0621 0.0793 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0121 0.079 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0114 0.0852 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0946 0.0987 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0994 0.121 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0737 0.0895 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0802 0.0982 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.53e-01 0.0865 0.093 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.85e-01 0.0704 0.101 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0153 0.122 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0771 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 1.56e-01 -0.151 0.106 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0462 0.109 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0612 0.108 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0742 0.119 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.55e-01 -0.14 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.85e-01 0.123 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 1.71e-01 -0.15 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.06e-01 -0.201 0.124 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0819 0.119 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.18e-01 -0.153 0.124 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.128 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 9.92e-01 0.000931 0.0953 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 2.40e-01 -0.117 0.0993 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 9.65e-01 0.00408 0.0932 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.099 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 4.15e-02 -0.217 0.106 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.64e-01 -0.152 0.136 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.63e-01 0.141 0.125 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.56e-01 0.177 0.125 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.70e-01 -0.117 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.10e-02 -0.273 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0278 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.16e-01 -0.162 0.131 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 3.98e-01 -0.103 0.122 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 3.67e-01 0.106 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0133 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 6.11e-01 0.0716 0.14 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 6.36e-01 0.0613 0.129 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.76e-01 -0.07 0.125 0.136 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.04e-02 -0.239 0.122 0.136 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 6.46e-01 0.0477 0.104 0.136 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 8.27e-01 0.0251 0.115 0.136 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 3.80e-01 0.109 0.124 0.136 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 2.72e-01 -0.123 0.111 0.136 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.14e-01 0.159 0.128 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.88e-02 -0.192 0.112 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 4.31e-01 -0.1 0.127 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0297 0.115 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0989 0.122 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.02e-01 -0.138 0.108 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.95e-01 0.056 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0241 0.106 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 1.18e-01 -0.162 0.103 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0462 0.125 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 1.17e-01 0.205 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0124 0.118 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 4.75e-02 -0.264 0.132 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0454 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0743 0.131 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.86e-02 0.204 0.123 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0432 0.106 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.94e-01 -0.101 0.118 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.23e-01 0.088 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00593 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.51e-01 0.0885 0.148 0.181 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 1.32e-01 0.2 0.132 0.181 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 2.41e-01 0.177 0.15 0.181 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 7.82e-01 0.0295 0.106 0.181 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 7.82e-01 0.0395 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 1.76e-01 0.17 0.125 0.137 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00915 0.109 0.137 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 5.09e-01 0.0655 0.0991 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0446 0.127 0.137 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0868 0.123 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 8.52e-01 0.0235 0.126 0.137 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.68e-01 0.00531 0.131 0.139 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 1.40e-01 0.161 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0844 0.0871 0.139 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 2.16e-01 0.142 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0549 0.118 0.139 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0796 0.127 0.139 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 5.32e-01 -0.083 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0563 0.0991 0.127 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 7.05e-01 0.0455 0.12 0.127 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.39e-01 0.0864 0.141 0.127 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.62e-01 0.102 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 8.54e-01 0.0237 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 4.12e-01 0.0991 0.12 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.26e-01 0.0176 0.0799 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0691 0.0992 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.57e-02 -0.282 0.116 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.68e-01 0.0769 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 1.62e-01 0.181 0.129 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0148 0.093 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 4.70e-02 0.224 0.112 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.04e-01 -0.136 0.132 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 1.02e-01 -0.184 0.112 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 4.97e-01 -0.107 0.157 0.13 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 3.60e-02 -0.312 0.147 0.13 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.94e-01 0.187 0.143 0.13 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 7.63e-02 -0.275 0.154 0.13 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 5.30e-02 -0.293 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 4.12e-01 0.12 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0967 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 4.15e-01 -0.09 0.11 0.136 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 8.88e-01 0.0139 0.0986 0.136 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 4.13e-01 -0.105 0.128 0.136 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 5.64e-01 0.0746 0.129 0.136 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0504 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 4.59e-01 0.073 0.0984 0.136 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 1.39e-01 -0.146 0.098 0.136 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 2.76e-02 -0.243 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 1.06e-01 0.19 0.117 0.136 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 2.50e-01 0.17 0.147 0.13 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 2.59e-01 -0.141 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 9.72e-01 0.00404 0.114 0.13 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 5.06e-01 0.0998 0.15 0.13 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 9.13e-01 0.0137 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 7.44e-02 -0.235 0.131 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 1.36e-01 0.183 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 7.33e-01 0.0369 0.108 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.42e-02 -0.283 0.115 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 6.22e-01 -0.058 0.117 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 6.01e-02 -0.239 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.66e-01 0.00504 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0952 0.0995 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0381 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 3.45e-01 0.0886 0.0936 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 9.48e-01 0.00737 0.113 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 9.50e-02 0.2 0.119 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0132 0.0721 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 9.09e-01 0.0108 0.0948 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 3.05e-02 -0.26 0.119 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0737 0.0974 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 7.11e-01 -0.045 0.121 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0187 0.0939 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -301258 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0793 0.0916 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.33e-01 -0.171 0.113 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 8.46e-02 0.187 0.108 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 sc-eQTL 8.67e-01 0.0179 0.107 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -95722 sc-eQTL 9.40e-01 0.00696 0.0929 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 sc-eQTL 1.99e-01 -0.121 0.0938 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -971329 sc-eQTL 6.54e-01 -0.043 0.0957 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0806 0.115 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 eQTL 1.59e-06 -0.0963 0.0199 0.0 0.0 0.152
ENSG00000116761 CTH -301258 eQTL 1.56e-05 -0.176 0.0404 0.0 0.0 0.152
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 eQTL 7.87e-06 -0.0716 0.0159 0.0 0.0 0.152
ENSG00000197568 HHLA3 -244845 eQTL 0.0169 -0.0807 0.0337 0.0 0.0 0.152

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 -95619 6.92e-06 9.37e-06 1.32e-06 5.52e-06 2.06e-06 3.53e-06 1e-05 1.75e-06 8.03e-06 4.27e-06 1.08e-05 4.9e-06 1.55e-05 3.91e-06 2.17e-06 5.43e-06 3.77e-06 5.1e-06 2.64e-06 2.91e-06 3.57e-06 7.6e-06 6.89e-06 3.17e-06 1.24e-05 2.58e-06 4.16e-06 3.37e-06 7.82e-06 7.86e-06 5.06e-06 8.1e-07 1.1e-06 2.89e-06 4.09e-06 2.1e-06 1.71e-06 1.84e-06 1.99e-06 1.04e-06 9.82e-07 1.16e-05 9.75e-07 1.62e-07 6.85e-07 1.2e-06 9.55e-07 7.43e-07 5.83e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C -244774 2.28e-06 3.14e-06 3.08e-07 1.94e-06 4.65e-07 8.45e-07 2.24e-06 6.05e-07 2.13e-06 9.55e-07 2.52e-06 1.65e-06 5.37e-06 1.4e-06 9.3e-07 1.21e-06 1.34e-06 2.22e-06 1.38e-06 1.39e-06 8.63e-07 2.9e-06 2.44e-06 1.17e-06 4.08e-06 1.21e-06 1.21e-06 1.77e-06 2.15e-06 2.46e-06 2.02e-06 3.23e-07 5.43e-07 1.22e-06 1.54e-06 8.73e-07 8.21e-07 4.18e-07 1.35e-06 3.46e-07 1.52e-07 3.56e-06 4.13e-07 1.89e-07 3.3e-07 3.13e-07 4.12e-07 2.1e-07 2.97e-07