logo

Genes within 1Mb (chr1:70079139:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 7.02e-01 0.0378 0.0987 0.169 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.74e-01 0.0322 0.0765 0.169 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.93e-01 0.0478 0.0892 0.169 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.098 0.169 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0411 0.0829 0.169 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0135 0.0652 0.169 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0319 0.0661 0.169 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0324 0.0605 0.169 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 4.78e-03 -0.235 0.0824 0.169 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00806 0.0936 0.169 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0122 0.078 0.169 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 1.10e-01 -0.122 0.0758 0.169 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0947 0.0734 0.169 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.27e-04 -0.292 0.085 0.169 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.69e-01 0.0685 0.12 0.162 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0556 0.0802 0.162 DC L1
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 9.00e-01 0.013 0.103 0.162 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.56e-01 -0.101 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.08e-02 -0.196 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.72e-01 0.147 0.108 0.169 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.76e-01 0.0447 0.0625 0.169 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0912 0.0856 0.169 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 1.16e-01 -0.159 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0289 0.0927 0.17 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 9.87e-01 0.00136 0.0819 0.17 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0822 0.17 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.18e-01 -0.127 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.20e-01 0.171 0.11 0.169 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.32e-01 0.0298 0.0867 0.169 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 3.43e-01 0.0935 0.0984 0.169 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 7.19e-01 0.0376 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 1.96e-01 -0.143 0.11 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.73e-01 0.163 0.119 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.168 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 9.54e-01 0.00739 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 5.73e-02 -0.203 0.106 0.168 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.17e-01 0.0748 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.36e-01 0.0466 0.0983 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 8.69e-02 -0.191 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 8.51e-02 -0.202 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.85e-01 0.0746 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0554 0.0989 0.17 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0564 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0161 0.11 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 5.98e-01 0.0461 0.0872 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.61e-01 0.085 0.0929 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0107 0.107 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 5.82e-01 0.0567 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0926 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 9.78e-01 0.00307 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0285 0.121 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.45e-01 0.118 0.101 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0385 0.111 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 5.84e-01 0.0619 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 6.82e-01 -0.038 0.0926 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00855 0.0672 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00934 0.0712 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0293 0.0708 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0882 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 7.60e-01 0.0337 0.11 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0317 0.081 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0699 0.0888 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0417 0.0842 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 6.07e-02 -0.206 0.109 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 9.67e-01 0.00467 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0385 0.0971 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 9.84e-01 0.00201 0.0989 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0981 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 5.24e-02 -0.216 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 2.04e-01 0.133 0.105 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.09e-01 0.0821 0.0992 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 1.81e-01 -0.129 0.0963 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 4.24e-03 -0.322 0.111 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 6.69e-02 -0.207 0.112 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 9.08e-01 0.0133 0.115 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00189 0.0855 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.55e-01 -0.102 0.0891 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.23e-01 0.0534 0.0835 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.72e-03 -0.253 0.0941 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.98e-01 -0.158 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 2.35e-01 0.134 0.113 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 1.76e-01 0.153 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0829 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0997 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.85e-02 -0.227 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0295 0.112 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 8.08e-01 0.0263 0.108 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0799 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 8.74e-01 0.0188 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 3.88e-01 0.0979 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0403 0.111 0.167 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 8.45e-01 0.0185 0.0941 0.167 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.21e-01 0.0517 0.104 0.167 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.03e-01 -0.129 0.101 0.167 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.07e-01 0.0776 0.117 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0684 0.103 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0702 0.116 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 1.89e-01 -0.146 0.111 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0985 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.54e-01 0.043 0.096 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 8.15e-01 0.0225 0.0963 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0376 0.114 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 4.05e-01 0.0979 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 1.66e-01 0.147 0.105 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 9.88e-01 0.00187 0.12 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 4.10e-02 -0.24 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.08e-01 0.181 0.112 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0251 0.0962 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.46e-01 0.0497 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0337 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 3.86e-01 0.117 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 6.49e-02 0.224 0.12 0.196 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 9.17e-02 0.231 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0499 0.13 0.196 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.47e-01 0.0687 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0982 0.167 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 8.61e-01 0.0157 0.0897 0.167 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.75e-01 0.0646 0.115 0.167 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0623 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0984 0.169 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 1.23e-01 -0.121 0.0785 0.169 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 2.87e-01 0.11 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 1.29e-01 -0.174 0.114 0.169 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 5.46e-01 -0.07 0.116 0.161 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0075 0.0865 0.161 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0142 0.105 0.161 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0713 0.123 0.161 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 9.78e-02 -0.185 0.111 0.161 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 3.53e-01 0.102 0.109 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 3.46e-01 0.0683 0.0724 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.15e-01 -0.112 0.0898 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 2.25e-01 -0.13 0.106 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.57e-01 0.168 0.118 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.59e-01 0.0261 0.0848 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 6.07e-01 0.053 0.103 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0267 0.121 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 9.97e-01 0.000515 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 1.25e-01 -0.208 0.135 0.176 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 1.69e-01 0.18 0.13 0.176 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.37e-01 -0.136 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.74e-01 -0.145 0.132 0.176 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0294 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0269 0.0996 0.164 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.36e-01 -0.106 0.0888 0.164 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 2.67e-01 -0.129 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.165 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.84e-01 0.0637 0.0908 0.165 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0905 0.165 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0973 0.102 0.165 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 3.33e-01 0.127 0.131 0.167 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0297 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 6.73e-01 0.0427 0.101 0.167 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 6.65e-01 0.0579 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 2.43e-02 0.25 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 4.30e-01 0.0771 0.0976 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.80e-02 -0.217 0.104 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 9.72e-02 -0.191 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0467 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 5.07e-01 0.0603 0.0907 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 2.85e-01 0.0981 0.0915 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 7.47e-01 0.0333 0.103 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 1.43e-01 0.16 0.109 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 5.52e-01 0.0391 0.0656 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0929 0.0861 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0958 0.11 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0574 0.111 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 7.96e-01 0.0224 0.0861 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -332079 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0958 0.0839 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0646 0.104 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00569 0.0972 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -126543 sc-eQTL 8.48e-01 0.0162 0.0846 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -275595 sc-eQTL 5.79e-01 0.0477 0.0858 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 sc-eQTL 2.47e-01 -0.121 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -126440 eQTL 0.000804 -0.0679 0.0202 0.0 0.0 0.156
ENSG00000116761 CTH -332079 eQTL 0.0023 -0.125 0.0409 0.0 0.0 0.156
ENSG00000197568 HHLA3 -275666 eQTL 0.00717 -0.0914 0.0339 0.0 0.0 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina