logo

Genes within 1Mb (chr1:70073370:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 7.02e-01 0.0378 0.0987 0.169 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.74e-01 0.0322 0.0765 0.169 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.93e-01 0.0478 0.0892 0.169 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.098 0.169 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0411 0.0829 0.169 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0135 0.0652 0.169 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0319 0.0661 0.169 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0324 0.0605 0.169 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 4.78e-03 -0.235 0.0824 0.169 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00806 0.0936 0.169 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0122 0.078 0.169 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 1.10e-01 -0.122 0.0758 0.169 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0947 0.0734 0.169 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.27e-04 -0.292 0.085 0.169 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.69e-01 0.0685 0.12 0.162 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0556 0.0802 0.162 DC L1
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 9.00e-01 0.013 0.103 0.162 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.56e-01 -0.101 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.08e-02 -0.196 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.72e-01 0.147 0.108 0.169 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.76e-01 0.0447 0.0625 0.169 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0912 0.0856 0.169 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 1.16e-01 -0.159 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0289 0.0927 0.17 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 9.87e-01 0.00136 0.0819 0.17 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0822 0.17 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.18e-01 -0.127 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.20e-01 0.171 0.11 0.169 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.32e-01 0.0298 0.0867 0.169 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 3.43e-01 0.0935 0.0984 0.169 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 7.19e-01 0.0376 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 1.96e-01 -0.143 0.11 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.73e-01 0.163 0.119 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.168 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 9.54e-01 0.00739 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 5.73e-02 -0.203 0.106 0.168 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.17e-01 0.0748 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.36e-01 0.0466 0.0983 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 8.69e-02 -0.191 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 8.51e-02 -0.202 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.85e-01 0.0746 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0554 0.0989 0.17 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0564 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0161 0.11 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 5.98e-01 0.0461 0.0872 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.61e-01 0.085 0.0929 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0107 0.107 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 5.82e-01 0.0567 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0926 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 9.78e-01 0.00307 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0285 0.121 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.45e-01 0.118 0.101 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0385 0.111 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 5.84e-01 0.0619 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 6.82e-01 -0.038 0.0926 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00855 0.0672 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00934 0.0712 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0293 0.0708 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0882 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 7.60e-01 0.0337 0.11 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0317 0.081 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0699 0.0888 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0417 0.0842 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 6.07e-02 -0.206 0.109 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 9.67e-01 0.00467 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0385 0.0971 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 9.84e-01 0.00201 0.0989 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0981 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 5.24e-02 -0.216 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 2.04e-01 0.133 0.105 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.09e-01 0.0821 0.0992 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 1.81e-01 -0.129 0.0963 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 4.24e-03 -0.322 0.111 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 6.69e-02 -0.207 0.112 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 9.08e-01 0.0133 0.115 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00189 0.0855 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.55e-01 -0.102 0.0891 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.23e-01 0.0534 0.0835 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.72e-03 -0.253 0.0941 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.98e-01 -0.158 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 2.35e-01 0.134 0.113 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 1.76e-01 0.153 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0829 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0997 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.85e-02 -0.227 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0295 0.112 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 8.08e-01 0.0263 0.108 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0799 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 8.74e-01 0.0188 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 3.88e-01 0.0979 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0403 0.111 0.167 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 8.45e-01 0.0185 0.0941 0.167 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.21e-01 0.0517 0.104 0.167 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.03e-01 -0.129 0.101 0.167 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.07e-01 0.0776 0.117 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0684 0.103 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0702 0.116 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 1.89e-01 -0.146 0.111 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0985 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.54e-01 0.043 0.096 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 8.15e-01 0.0225 0.0963 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0376 0.114 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 4.05e-01 0.0979 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 1.66e-01 0.147 0.105 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 9.88e-01 0.00187 0.12 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 4.10e-02 -0.24 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.08e-01 0.181 0.112 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0251 0.0962 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.46e-01 0.0497 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0337 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 3.86e-01 0.117 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 6.49e-02 0.224 0.12 0.196 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 9.17e-02 0.231 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0499 0.13 0.196 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.47e-01 0.0687 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0982 0.167 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 8.61e-01 0.0157 0.0897 0.167 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.75e-01 0.0646 0.115 0.167 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0623 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0984 0.169 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 1.23e-01 -0.121 0.0785 0.169 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 2.87e-01 0.11 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 1.29e-01 -0.174 0.114 0.169 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 5.46e-01 -0.07 0.116 0.161 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0075 0.0865 0.161 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0142 0.105 0.161 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0713 0.123 0.161 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 9.78e-02 -0.185 0.111 0.161 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 3.53e-01 0.102 0.109 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 3.46e-01 0.0683 0.0724 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.15e-01 -0.112 0.0898 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 2.25e-01 -0.13 0.106 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.57e-01 0.168 0.118 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.59e-01 0.0261 0.0848 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 6.07e-01 0.053 0.103 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0267 0.121 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 9.97e-01 0.000515 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 1.25e-01 -0.208 0.135 0.176 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 1.69e-01 0.18 0.13 0.176 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.37e-01 -0.136 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.74e-01 -0.145 0.132 0.176 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0294 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0269 0.0996 0.164 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.36e-01 -0.106 0.0888 0.164 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 2.67e-01 -0.129 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.165 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.84e-01 0.0637 0.0908 0.165 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0905 0.165 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0973 0.102 0.165 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 3.33e-01 0.127 0.131 0.167 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0297 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 6.73e-01 0.0427 0.101 0.167 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 6.65e-01 0.0579 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 2.43e-02 0.25 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 4.30e-01 0.0771 0.0976 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.80e-02 -0.217 0.104 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 9.72e-02 -0.191 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0467 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 5.07e-01 0.0603 0.0907 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 2.85e-01 0.0981 0.0915 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 7.47e-01 0.0333 0.103 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 1.43e-01 0.16 0.109 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 5.52e-01 0.0391 0.0656 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0929 0.0861 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0958 0.11 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0574 0.111 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 7.96e-01 0.0224 0.0861 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -337848 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0958 0.0839 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0646 0.104 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00569 0.0972 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -132312 sc-eQTL 8.48e-01 0.0162 0.0846 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -281364 sc-eQTL 5.79e-01 0.0477 0.0858 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 sc-eQTL 2.47e-01 -0.121 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -132209 eQTL 0.000795 -0.0681 0.0202 0.0 0.0 0.156
ENSG00000116761 CTH -337848 eQTL 0.00228 -0.125 0.041 0.0 0.0 0.156
ENSG00000197568 HHLA3 -281435 eQTL 0.00711 -0.0917 0.034 0.0 0.0 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina