Genes within 1Mb (chr1:69481941:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0253 0.0989 0.169 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0383 0.0767 0.169 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 4.94e-01 0.0612 0.0893 0.169 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 3.03e-02 0.213 0.0975 0.169 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 1.20e-01 -0.131 0.0839 0.169 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.20e-01 -0.066 0.0662 0.169 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 3.39e-01 0.0643 0.0671 0.169 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 4.81e-01 0.0434 0.0615 0.169 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 6.69e-01 0.0365 0.0854 0.169 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 3.78e-01 0.0835 0.0944 0.169 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0183 0.0788 0.169 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0771 0.169 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0367 0.0744 0.169 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0765 0.0881 0.169 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 6.07e-01 -0.06 0.117 0.176 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0696 0.0778 0.176 DC L1
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0399 0.1 0.176 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 8.65e-01 0.0181 0.106 0.176 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.94e-01 0.0722 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00528 0.109 0.169 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.30e-01 0.0305 0.0632 0.169 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 6.40e-01 0.0406 0.0867 0.169 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 8.84e-01 0.015 0.103 0.169 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0234 0.0948 0.17 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.46e-01 0.0272 0.0837 0.17 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.31e-01 -0.127 0.0836 0.17 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.83e-01 0.0742 0.106 0.17 NK L1
ENSG00000024526 DEPDC1 984720 sc-eQTL 5.03e-01 0.0354 0.0528 0.169 Other_T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 1.13e-01 0.175 0.11 0.169 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0901 0.0868 0.169 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 3.62e-01 0.0903 0.0988 0.169 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00684 0.105 0.169 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0861 0.111 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 5.96e-01 0.063 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.53e-01 0.0396 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 8.57e-01 0.0229 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00835 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 3.75e-01 0.102 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.31e-01 0.0338 0.098 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.63e-01 0.156 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 7.46e-02 0.208 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0933 0.12 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.105 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 6.45e-01 0.0453 0.0983 0.17 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0581 0.111 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0845 0.0883 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 6.76e-01 0.0394 0.0943 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.78e-01 0.00317 0.117 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0439 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 2.58e-01 -0.137 0.121 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 6.28e-01 0.0538 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 7.46e-01 0.0378 0.117 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 9.73e-01 0.00415 0.121 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 5.36e-01 0.0627 0.101 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 7.01e-01 0.0429 0.112 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0377 0.113 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 2.67e-01 -0.106 0.095 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0539 0.069 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 6.53e-01 0.0329 0.0732 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00345 0.0729 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 9.76e-01 0.00278 0.0912 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0608 0.11 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0265 0.0814 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 6.62e-03 0.241 0.0878 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 4.71e-01 0.0611 0.0846 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.36e-01 0.0865 0.111 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 3.28e-01 -0.109 0.112 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 8.60e-03 -0.255 0.096 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 3.52e-01 0.0924 0.0992 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 6.40e-01 0.0462 0.0985 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 3.71e-01 0.1 0.112 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0778 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 4.80e-01 0.0711 0.1 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 2.75e-01 -0.107 0.0976 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0756 0.115 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0878 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 2.46e-01 0.135 0.116 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0594 0.0865 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 8.40e-01 0.0183 0.0905 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0793 0.0845 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0593 0.0968 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 3.29e-01 0.117 0.12 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0499 0.111 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 4.67e-01 0.0804 0.11 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0431 0.115 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00215 0.117 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.34e-01 0.0103 0.124 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 9.74e-01 0.00377 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.111 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.95e-01 0.109 0.128 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 2.64e-01 0.136 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000024526 DEPDC1 984720 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0525 0.0417 0.171 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 4.26e-01 0.0927 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 1.21e-01 -0.177 0.114 0.171 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 5.99e-01 0.0508 0.0965 0.171 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.62e-01 0.0976 0.107 0.171 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 1.70e-01 -0.142 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 7.66e-01 0.0356 0.119 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 5.59e-01 0.0614 0.105 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.04e-01 -0.191 0.117 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 3.25e-01 0.112 0.113 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0184 0.1 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 5.88e-01 0.0529 0.0975 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 9.38e-01 0.00765 0.0979 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 6.85e-01 0.0469 0.115 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.10e-01 0.0285 0.119 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.50e-01 0.0486 0.107 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0787 0.121 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.94e-01 0.0814 0.119 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0385 0.114 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 8.83e-01 0.0144 0.0977 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0438 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 8.88e-01 -0.015 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 1.53e-01 0.231 0.16 0.144 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 1.33e-01 0.219 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.89e-02 0.337 0.161 0.144 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 8.11e-01 0.0374 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000024526 DEPDC1 984720 sc-eQTL 1.56e-01 0.0993 0.0698 0.17 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 1.21e-01 0.177 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.80e-02 0.204 0.0976 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 7.28e-02 0.161 0.0892 0.17 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0427 0.115 0.17 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0913 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00295 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.65e-02 0.174 0.0978 0.169 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0131 0.0788 0.169 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 5.18e-01 0.067 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0793 0.114 0.169 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.53e-02 -0.192 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0651 0.0834 0.18 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0873 0.101 0.18 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0102 0.119 0.18 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.28e-01 0.0859 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.69e-01 0.0183 0.111 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 2.47e-01 0.0851 0.0732 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0186 0.0913 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.53e-01 -0.1 0.108 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0287 0.119 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0177 0.085 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 3.08e-01 0.105 0.103 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 9.80e-01 0.00308 0.121 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 2.25e-01 0.164 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 9.93e-01 0.00106 0.129 0.191 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 7.79e-01 0.0349 0.124 0.191 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.58e-01 -0.189 0.133 0.191 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.10e-01 0.104 0.125 0.191 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 1.77e-01 0.153 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0899 0.0985 0.176 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0931 0.088 0.176 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 2.57e-02 0.255 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00937 0.117 0.165 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 5.54e-01 0.0534 0.0901 0.165 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 8.19e-01 0.0206 0.0901 0.165 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.34e-01 0.152 0.101 0.165 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0322 0.125 0.178 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 2.31e-01 -0.127 0.106 0.178 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0266 0.0966 0.178 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 2.91e-01 0.135 0.127 0.178 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 4.84e-01 0.0786 0.112 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00364 0.109 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 6.28e-01 0.0466 0.096 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 1.07e-01 0.166 0.103 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 3.59e-02 0.237 0.112 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0426 0.108 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 5.55e-01 -0.054 0.0914 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0148 0.0924 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 5.71e-01 0.059 0.104 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0127 0.111 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.63e-01 0.0201 0.0668 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 5.03e-01 0.0589 0.0878 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0694 0.112 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 5.37e-01 0.0684 0.111 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 5.22e-01 0.0549 0.0856 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -929277 sc-eQTL 7.93e-01 -0.022 0.0837 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 3.73e-03 0.298 0.102 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -723638 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0437 0.099 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -723741 sc-eQTL 7.70e-01 0.0252 0.0862 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -872793 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0665 0.0873 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 sc-eQTL 5.78e-01 0.0593 0.107 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000033122 LRRC7 -86320 eQTL 1.17e-07 0.269 0.0504 0.0 0.0 0.193
ENSG00000197568 HHLA3 -872864 eQTL 0.0224 0.0733 0.0321 0.0 0.0 0.193


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000033122 LRRC7 -86320 7.14e-06 9.31e-06 8.29e-07 4.6e-06 1.74e-06 3.09e-06 9.34e-06 1.49e-06 5.33e-06 4.05e-06 9.35e-06 3.57e-06 1.12e-05 3.79e-06 1.55e-06 4.76e-06 3.69e-06 3.85e-06 1.72e-06 2.02e-06 3.45e-06 7.55e-06 5.56e-06 1.95e-06 1.01e-05 2.21e-06 3.58e-06 2.43e-06 6.75e-06 7.59e-06 4.13e-06 5.5e-07 8.41e-07 2.71e-06 3.13e-06 1.85e-06 1.35e-06 9.57e-07 1.46e-06 1.02e-06 8.05e-07 9.93e-06 1.22e-06 1.6e-07 7.17e-07 8.79e-07 1.04e-06 6.26e-07 5.83e-07