Genes within 1Mb (chr1:69443791:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.10e-01 0.116 0.0923 0.22 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0151 0.0718 0.22 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 8.23e-01 0.0187 0.0837 0.22 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.79e-01 0.0024 0.0923 0.22 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 4.89e-01 0.0539 0.0777 0.22 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 4.05e-02 -0.125 0.0605 0.22 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00527 0.062 0.22 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.00e-02 0.123 0.0561 0.22 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 1.17e-01 0.123 0.0782 0.22 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 1.11e-02 0.221 0.0863 0.22 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0184 0.0731 0.22 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.44e-01 0.00505 0.0715 0.22 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 2.68e-01 0.0763 0.0688 0.22 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 4.71e-01 -0.059 0.0817 0.22 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 9.95e-01 0.000669 0.108 0.23 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.37e-01 0.0149 0.0724 0.23 DC L1
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0549 0.0933 0.23 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000592 0.0988 0.23 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 6.29e-01 0.0474 0.0979 0.23 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.1 0.22 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 2.32e-01 0.0694 0.0579 0.22 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.01e-01 0.00992 0.0797 0.22 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0685 0.0942 0.22 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 1.80e-01 0.118 0.0875 0.221 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0106 0.0775 0.221 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 8.13e-01 0.0185 0.0778 0.221 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 5.49e-01 0.0586 0.0977 0.221 NK L1
ENSG00000024526 DEPDC1 946570 sc-eQTL 8.66e-01 0.00815 0.0483 0.22 Other_T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0553 0.101 0.22 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.92e-01 0.000795 0.0795 0.22 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.84e-02 -0.149 0.0899 0.22 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.20e-01 0.00961 0.0959 0.22 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.101 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 8.81e-01 0.0162 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.11e-01 0.0274 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 6.43e-01 0.0535 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00221 0.0966 0.23 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 6.86e-01 0.0421 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0091 0.0887 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.29e-01 0.0985 0.101 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 6.87e-01 0.0427 0.106 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0675 0.109 0.222 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0644 0.0967 0.222 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0625 0.0896 0.222 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.49e-01 0.00663 0.103 0.222 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 7.91e-01 0.0274 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 7.36e-01 0.0276 0.082 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0697 0.0873 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0517 0.1 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.00e-01 0.138 0.108 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.34e-01 -0.02 0.0954 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.05e-01 0.0134 0.112 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 8.90e-01 0.0142 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 6.55e-01 -0.047 0.105 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0408 0.109 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 2.22e-01 0.111 0.091 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.57e-01 0.0927 0.1 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 3.52e-01 0.0949 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 9.63e-01 0.00404 0.0876 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0873 0.0633 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0185 0.0674 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.80e-01 0.0589 0.0669 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000419 0.0839 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0215 0.103 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0707 0.0757 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 1.83e-01 0.111 0.0828 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 2.74e-01 0.0863 0.0786 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 7.77e-02 0.182 0.103 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.67e-01 0.115 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 5.05e-01 -0.06 0.09 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 5.66e-01 0.0527 0.0917 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0562 0.0909 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00678 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.78e-01 0.0859 0.0972 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 2.87e-01 0.0982 0.092 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 1.81e-01 -0.12 0.0894 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.24e-01 -0.104 0.105 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0501 0.105 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.48e-01 0.123 0.106 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 7.97e-01 0.0203 0.079 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 5.95e-01 0.0439 0.0826 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 1.75e-01 0.105 0.077 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 7.69e-01 0.026 0.0884 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 1.94e-01 0.149 0.114 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0266 0.106 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 8.32e-01 0.0224 0.106 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.54e-01 -0.102 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0256 0.112 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 8.86e-02 0.191 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 1.23e-01 0.162 0.104 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0183 0.101 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 6.45e-01 0.0537 0.116 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 2.46e-01 0.128 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000024526 DEPDC1 946570 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0404 0.0385 0.216 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0947 0.107 0.216 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 2.77e-01 -0.115 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0654 0.089 0.216 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.63e-02 0.206 0.0977 0.216 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0763 0.0957 0.216 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0974 0.11 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0555 0.0968 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 2.60e-01 -0.123 0.109 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.38e-01 0.00813 0.105 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0242 0.0954 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00449 0.0927 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0249 0.093 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 4.82e-02 0.216 0.109 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 1.96e-01 0.138 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 3.61e-01 0.0878 0.0959 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 7.57e-01 0.0338 0.109 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 3.84e-01 -0.093 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 5.99e-01 0.0562 0.107 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.49e-01 0.00579 0.0912 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 1.62e-01 0.143 0.102 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 5.27e-01 -0.063 0.0994 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.81e-02 0.28 0.134 0.226 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 2.37e-02 0.275 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 1.86e-01 0.183 0.137 0.226 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 1.83e-01 0.174 0.13 0.226 PB L2
ENSG00000024526 DEPDC1 946570 sc-eQTL 2.28e-01 0.0785 0.0649 0.22 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 1.78e-01 0.123 0.0912 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0133 0.0835 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 4.68e-01 0.0778 0.107 0.22 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 1.10e-01 0.169 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 1.34e-01 0.161 0.107 0.22 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 1.09e-02 0.228 0.0888 0.22 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0717 0.22 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0418 0.0946 0.22 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 1.56e-02 0.251 0.103 0.22 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0174 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 8.26e-01 0.0173 0.0785 0.227 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 2.24e-01 -0.116 0.0949 0.227 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 7.84e-01 0.0306 0.111 0.227 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0138 0.102 0.227 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 5.90e-01 0.0548 0.102 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 1.39e-01 0.0995 0.067 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 6.77e-01 0.0349 0.0836 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 8.75e-01 0.0157 0.0991 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.23e-01 0.133 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.42e-01 0.00565 0.0778 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 5.14e-01 0.0616 0.0944 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 2.54e-01 -0.127 0.111 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.18e-01 0.131 0.131 0.215 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.87e-01 0.0021 0.125 0.215 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.215 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00086 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 4.20e-01 0.0981 0.121 0.215 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 7.24e-01 0.0371 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 7.42e-01 0.0301 0.0915 0.22 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0421 0.0818 0.22 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.35e-02 0.178 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.37e-01 0.132 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 5.03e-01 0.0577 0.086 0.215 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 8.42e-01 0.0171 0.086 0.215 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0863 0.0967 0.215 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 7.00e-01 0.0462 0.12 0.232 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0662 0.101 0.232 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.58e-01 0.00485 0.0923 0.232 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0309 0.122 0.232 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 6.08e-02 0.2 0.106 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0274 0.102 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0639 0.089 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0039 0.0959 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 5.59e-01 0.0615 0.105 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.79e-01 0.109 0.1 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 9.63e-01 0.00394 0.0851 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0375 0.0859 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00925 0.0966 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 3.06e-01 0.104 0.101 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 2.58e-01 0.069 0.0608 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 5.53e-01 0.0477 0.0802 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0648 0.102 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.40e-01 0.121 0.103 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 4.16e-01 0.065 0.0798 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -967427 sc-eQTL 9.75e-01 0.00243 0.0781 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 6.54e-01 0.0434 0.0966 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 sc-eQTL 2.36e-01 0.109 0.0919 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -761891 sc-eQTL 6.28e-01 0.0389 0.0802 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -910943 sc-eQTL 4.43e-01 0.0625 0.0813 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -911014 sc-eQTL 5.06e-01 0.0662 0.0992 0.22 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000033122 LRRC7 -124470 eQTL 0.000612 0.17 0.0494 0.0 0.0 0.213
ENSG00000066557 LRRC40 -761788 eQTL 0.0185 0.0439 0.0186 0.00109 0.0 0.213


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000033122 LRRC7 -124470 4.36e-06 4.68e-06 8.35e-07 2.42e-06 1.64e-06 1.33e-06 3.59e-06 9.98e-07 4.7e-06 2.26e-06 4.52e-06 3.5e-06 7.58e-06 2.04e-06 1.35e-06 3.4e-06 2.07e-06 3.18e-06 1.43e-06 1.15e-06 2.89e-06 4.47e-06 3.78e-06 1.35e-06 5.08e-06 1.81e-06 2.59e-06 1.65e-06 4.17e-06 4.19e-06 2.19e-06 4.88e-07 5.21e-07 1.59e-06 2.03e-06 1.02e-06 1e-06 4.07e-07 8.5e-07 4.55e-07 7.64e-07 5.14e-06 3.82e-07 1.54e-07 5.77e-07 6.92e-07 1.02e-06 5.51e-07 4.38e-07