logo

Genes within 1Mb (chr1:69415386:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.128 0.1 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 9.15e-02 0.168 0.099 0.1 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.03e-01 0.0604 0.116 0.1 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0955 0.128 0.1 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0966 0.106 0.1 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.80e-01 0.112 0.083 0.1 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 5.00e-02 -0.165 0.0838 0.1 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 5.33e-02 0.149 0.0767 0.1 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.10e-01 -0.109 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00997 0.122 0.1 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.05e-01 -0.129 0.101 0.1 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0846 0.0991 0.1 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 8.35e-01 0.02 0.0959 0.1 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.37e-01 0.109 0.113 0.1 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 2.40e-02 0.346 0.152 0.099 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 7.81e-01 0.0287 0.103 0.099 DC L1
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 9.75e-01 0.00415 0.133 0.099 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 2.91e-01 0.148 0.14 0.099 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.30e-01 0.136 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.96e-01 0.18 0.139 0.1 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 9.32e-01 0.00693 0.0808 0.1 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0526 0.111 0.1 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 3.37e-01 0.126 0.131 0.1 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 6.10e-01 -0.063 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.61e-01 0.122 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 9.82e-01 0.00241 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 2.17e-01 0.17 0.137 0.099 NK L1
ENSG00000024526 DEPDC1 918165 sc-eQTL 1.11e-01 0.109 0.0682 0.1 Other_T L1
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.56e-01 0.133 0.144 0.1 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.17e-01 -0.177 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0918 0.128 0.1 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0544 0.136 0.1 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.73e-02 -0.273 0.143 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.20e-01 0.151 0.151 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 9.81e-02 0.265 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.29e-01 0.128 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 1.21e-03 -0.434 0.132 0.102 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0569 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.14e-01 0.157 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0264 0.144 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0958 0.151 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 4.09e-01 -0.125 0.152 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.93e-02 0.292 0.133 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 3.12e-01 -0.126 0.124 0.101 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 9.39e-01 -0.011 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.39e-01 0.139 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.18e-01 0.115 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0329 0.123 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.24e-01 -0.139 0.14 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 7.89e-01 0.0404 0.15 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 8.22e-01 0.0299 0.133 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0815 0.156 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 9.11e-01 0.016 0.143 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 8.50e-01 0.0295 0.156 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.84e-01 0.141 0.162 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0218 0.136 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 7.70e-02 0.264 0.148 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.75e-01 0.085 0.151 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 8.02e-01 -0.03 0.12 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.47e-01 0.126 0.0864 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 7.63e-02 -0.163 0.0914 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 1.04e-01 0.148 0.091 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.36e-02 -0.221 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 5.77e-01 -0.079 0.142 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 5.76e-02 0.198 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0161 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 8.04e-02 0.19 0.108 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0813 0.142 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0583 0.146 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.64e-01 0.177 0.127 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0785 0.13 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 2.66e-01 0.144 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 8.92e-01 0.0199 0.147 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.66e-02 0.315 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.19e-01 -0.125 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 1.95e-01 -0.158 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 7.32e-01 0.0491 0.143 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0334 0.143 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 2.91e-01 0.161 0.152 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.26e-02 0.242 0.112 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0574 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 1.05e-01 0.18 0.11 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0181 0.164 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.08e-01 0.242 0.15 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 9.80e-01 0.00379 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.81e-01 -0.111 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 2.01e-01 0.204 0.159 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0939 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 5.06e-02 -0.273 0.139 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0559 0.135 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0651 0.155 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0914 0.148 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024526 DEPDC1 918165 sc-eQTL 3.47e-01 0.0503 0.0534 0.1 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.04e-02 -0.321 0.147 0.1 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.1 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0596 0.123 0.1 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.53e-01 0.0616 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 2.07e-02 -0.306 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 9.72e-01 0.00561 0.16 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0395 0.141 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.07e-01 0.0819 0.159 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 6.83e-01 0.0624 0.153 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0414 0.13 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.26e-01 0.153 0.126 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.00e-01 0.0666 0.127 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.97e-01 0.127 0.15 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 7.11e-01 0.0577 0.155 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.22e-01 0.171 0.14 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 2.55e-02 -0.354 0.157 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 9.23e-01 0.015 0.156 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 3.52e-01 0.141 0.152 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.76e-01 -0.115 0.13 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.73e-01 0.105 0.146 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 7.00e-01 0.0547 0.142 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 2.60e-01 -0.182 0.161 0.126 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0922 0.145 0.126 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.22e-01 0.0811 0.164 0.126 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 1.08e-01 -0.249 0.154 0.126 PB L2
ENSG00000024526 DEPDC1 918165 sc-eQTL 4.32e-01 0.07 0.0889 0.102 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.88e-01 0.191 0.144 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 4.34e-01 0.098 0.125 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 4.91e-01 0.0786 0.114 0.102 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.31e-01 0.0705 0.146 0.102 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 8.15e-01 -0.034 0.145 0.102 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 7.78e-01 0.043 0.152 0.1 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0923 0.127 0.1 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 1.51e-01 -0.146 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 2.26e-01 0.161 0.133 0.1 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 8.57e-01 0.0266 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.88e-01 0.207 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00857 0.118 0.1 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00384 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0209 0.167 0.1 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 2.43e-01 -0.178 0.152 0.1 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 2.59e-02 0.315 0.141 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 7.65e-01 0.0282 0.0941 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0416 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.62e-01 0.102 0.138 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 4.88e-01 -0.106 0.153 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0126 0.109 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 1.70e-01 -0.182 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0164 0.156 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 5.58e-01 -0.12 0.204 0.085 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.80e-01 -0.26 0.193 0.085 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 5.73e-01 0.106 0.187 0.085 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 9.54e-02 -0.336 0.2 0.085 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 1.65e-02 -0.449 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.35e-01 0.22 0.147 0.102 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0241 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 7.68e-01 0.0341 0.115 0.102 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.99e-01 0.102 0.15 0.102 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0864 0.156 0.1 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0473 0.12 0.1 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 5.90e-01 -0.065 0.12 0.1 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 9.97e-01 0.000497 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 5.43e-01 0.102 0.168 0.102 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.32e-02 0.321 0.14 0.102 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 9.39e-01 0.01 0.129 0.102 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 4.96e-02 0.334 0.169 0.102 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 2.76e-01 0.164 0.15 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 4.09e-01 -0.117 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 1.88e-02 0.289 0.122 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0661 0.133 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.72e-01 -0.13 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.80e-01 0.192 0.143 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 2.28e-01 0.147 0.121 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 5.24e-01 0.0784 0.123 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0788 0.138 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 1.77e-01 0.192 0.142 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 8.35e-01 0.0178 0.0853 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0494 0.112 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 6.49e-01 0.065 0.143 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 9.69e-01 0.00567 0.144 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0641 0.112 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -995832 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0554 0.109 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 3.17e-01 0.135 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00745 0.13 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 -790296 sc-eQTL 3.71e-01 0.101 0.113 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -939348 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0151 0.115 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 sc-eQTL 3.13e-01 0.141 0.14 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 eQTL 0.0495 -0.049 0.0249 0.0 0.0 0.0976
ENSG00000116761 CTH -995832 eQTL 0.00772 -0.134 0.0503 0.0 0.0 0.0976
ENSG00000197568 HHLA3 -939419 eQTL 0.0218 -0.0958 0.0417 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 -790193 2.8e-07 1.33e-07 5.91e-08 2.15e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.4e-08 1.73e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.74e-08 4.31e-08 1.51e-07 7.12e-08 5.07e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.83e-08 1.68e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.06e-07 1.26e-07 1.05e-07 1.08e-07 3.68e-08 3.51e-08 8.7e-08 3.4e-08 2.85e-08 4.28e-08 8.68e-08 6.58e-08 5.24e-08 5.94e-08 1.46e-07 5.39e-08 7.78e-09 3.29e-08 1.55e-08 8.81e-08 2e-09 4.82e-08