logo

Genes within 1Mb (chr1:66422859:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.35e-01 -0.105 0.0882 0.171 B L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00814 0.071 0.171 B L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0274 0.0777 0.171 B L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.49e-01 0.00478 0.0748 0.171 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 2.52e-02 -0.179 0.0795 0.171 CD4T L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.96e-01 0.00621 0.0476 0.171 CD4T L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00867 0.0789 0.171 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 4.95e-03 -0.207 0.0729 0.171 CD8T L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.29e-01 0.0144 0.0666 0.171 CD8T L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.98e-01 0.000317 0.111 0.176 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.84e-02 -0.139 0.0587 0.176 DC L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.67e-01 0.0173 0.103 0.176 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 718897 sc-eQTL 7.43e-01 0.0192 0.0586 0.176 DC L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 8.51e-01 0.0213 0.113 0.171 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0279 0.0402 0.171 Mono L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0547 0.0658 0.171 Mono L1
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0116 0.072 0.17 NK L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0311 0.0779 0.17 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.13e-01 -0.112 0.0702 0.17 NK L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0274 0.0672 0.17 NK L1
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 8.85e-01 0.0146 0.101 0.171 Other_T L1
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.091 0.171 Other_T L1
ENSG00000162594 IL23R -716048 sc-eQTL 3.41e-02 0.143 0.067 0.171 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.25e-02 -0.201 0.0797 0.171 Other_T L1
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 1.26e-01 -0.148 0.0963 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 1.64e-01 0.173 0.124 0.168 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.41e-01 -0.14 0.095 0.168 B_Activated L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0553 0.135 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 8.18e-02 -0.192 0.11 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.65e-01 0.00357 0.0802 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.36e-01 0.0375 0.111 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 3.69e-03 -0.316 0.108 0.172 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.41e-02 -0.166 0.0987 0.172 B_Memory L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0637 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 5.34e-01 0.0637 0.102 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 8.83e-01 0.0124 0.0844 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00829 0.093 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 3.09e-02 -0.244 0.112 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00855 0.0724 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.32e-01 0.0388 0.113 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.12e-01 0.135 0.108 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.27e-02 -0.234 0.0931 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0178 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.21e-01 -0.008 0.0801 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 5.82e-02 -0.156 0.0819 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 5.49e-01 0.0321 0.0536 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0611 0.0953 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 5.26e-03 -0.235 0.0832 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 3.18e-01 0.0722 0.0721 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.29e-01 0.0373 0.108 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.84e-02 -0.217 0.0912 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 6.43e-01 0.042 0.0904 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0044 0.0937 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 5.05e-05 -0.337 0.0814 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0789 0.0917 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0148 0.0984 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 4.47e-02 -0.155 0.0768 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0218 0.0833 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 4.86e-01 0.0768 0.11 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.78e-03 -0.33 0.104 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 4.46e-01 0.0791 0.104 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0371 0.114 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 3.06e-02 -0.211 0.0967 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.86e-02 0.189 0.11 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 9.32e-01 0.00963 0.113 0.171 MAIT L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0373 0.0968 0.171 MAIT L2
ENSG00000162594 IL23R -716048 sc-eQTL 1.63e-03 0.261 0.0817 0.171 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0991 0.0861 0.171 MAIT L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0953 0.105 0.171 MAIT L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 8.76e-01 0.0139 0.0891 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0322 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 3.53e-01 -0.082 0.0881 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.72e-02 -0.171 0.0992 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0157 0.0796 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 4.53e-01 0.0691 0.092 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.44e-02 -0.214 0.0865 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0425 0.0784 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 6.73e-02 0.144 0.0782 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.37e-01 0.0373 0.111 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.57e-01 -0.14 0.0984 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 5.96e-01 0.0559 0.105 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 4.71e-01 0.0661 0.0915 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.67e-01 -0.112 0.1 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0931 0.103 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.26e-01 0.0328 0.0934 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 3.96e-01 -0.125 0.147 0.159 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0603 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 1.24e-01 -0.25 0.161 0.159 PB L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 9.72e-01 0.00367 0.106 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 8.14e-01 0.0271 0.115 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162594 IL23R -716048 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0481 0.0738 0.174 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0926 0.174 Pro_T L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.39e-01 0.0229 0.112 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 3.98e-02 0.23 0.111 0.171 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.77e-03 -0.265 0.0836 0.171 Treg L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.05e-01 0.0353 0.0933 0.171 Treg L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.84e-01 0.121 0.113 0.18 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0837 0.0635 0.18 cDC L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0562 0.113 0.18 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 718897 sc-eQTL 3.47e-01 0.0391 0.0415 0.18 cDC L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 5.89e-01 0.0624 0.115 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.95e-01 0.000346 0.053 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0873 0.0726 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 7.86e-01 0.0152 0.056 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.78e-01 0.014 0.0915 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0564 0.0979 0.17 gdT L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.42e-01 0.155 0.132 0.17 gdT L2
ENSG00000162594 IL23R -716048 sc-eQTL 1.54e-01 -0.173 0.121 0.17 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.51e-01 -0.114 0.0788 0.17 gdT L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 3.40e-01 -0.127 0.133 0.17 gdT L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.56e-01 0.035 0.112 0.169 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.82e-01 0.0013 0.0562 0.169 intMono L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.70e-01 0.0322 0.11 0.169 intMono L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.44e-01 -0.125 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0922 0.0615 0.176 ncMono L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 5.35e-01 0.0696 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 2.58e-01 -0.143 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0994 0.0919 0.184 pDC L2
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0106 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 718897 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0418 0.099 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 3.09e-02 -0.233 0.107 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 4.49e-01 -0.054 0.0711 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 7.91e-01 -0.027 0.102 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0791 0.0975 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0038 0.0757 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0164 0.0932 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 4.22e-01 0.0959 0.119 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 8.05e-01 0.0113 0.0457 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0751 0.0697 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0343 0.112 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0408 0.0516 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0133 0.0967 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000081985 IL12RB2 -884505 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0298 0.0767 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00782 0.0822 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 630345 sc-eQTL 1.00e-02 -0.209 0.0804 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198160 MIER1 -502036 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00599 0.0717 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 eQTL 0.000519 0.0802 0.023 0.0 0.0 0.153

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116704 SLC35D1 -631289 3.27e-07 1.5e-07 6.55e-08 2.09e-07 1.03e-07 8.37e-08 1.99e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.63e-07 1.19e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.43e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.18e-08 5.75e-08 1.18e-07 1.42e-07 1.58e-07 3.49e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.2e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.07e-07 4.23e-08 3.56e-08 8.89e-08 3.12e-08 3.05e-08 5.74e-08 7.61e-08 6.76e-08 4.19e-08 5.28e-08 1.52e-07 3.08e-08 1.88e-08 3.48e-08 1.68e-08 8.67e-08 2.1e-09 4.98e-08