logo

Genes within 1Mb (chr1:65803628:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 3.19e-01 0.0656 0.0656 0.239 B L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 1.54e-01 0.0977 0.0684 0.239 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 5.93e-01 0.0449 0.084 0.239 B L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.97e-01 0.0665 0.0636 0.239 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 8.84e-01 0.0111 0.076 0.239 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.96e-01 0.039 0.0996 0.239 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 4.07e-02 -0.222 0.108 0.239 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.50e-01 0.122 0.0841 0.239 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.60e-01 0.0533 0.072 0.239 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.34e-01 0.0876 0.112 0.239 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 1.20e-01 0.168 0.108 0.241 DC L1
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0223 0.091 0.241 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.32e-01 0.0474 0.0757 0.241 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 5.25e-01 0.0373 0.0586 0.241 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.94e-02 0.194 0.107 0.241 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 99666 sc-eQTL 8.06e-01 0.0142 0.0578 0.241 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 2.15e-01 0.131 0.106 0.239 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 7.45e-01 0.0316 0.097 0.239 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.38e-01 0.103 0.0688 0.239 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.82e-01 0.0412 0.0382 0.239 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.88e-01 0.0476 0.0684 0.239 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.78e-01 0.0932 0.105 0.24 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.10e-01 0.0796 0.0496 0.24 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 5.66e-01 0.0391 0.068 0.24 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.32e-01 0.0895 0.114 0.24 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.07e-01 0.0266 0.0707 0.239 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 8.66e-01 -0.013 0.0768 0.239 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.85e-01 -0.147 0.111 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.65e-01 0.0661 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 3.47e-01 0.0857 0.0908 0.235 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.70e-01 0.0512 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.57e-01 0.133 0.0937 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.10e-01 0.0961 0.0764 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 7.84e-01 0.0303 0.11 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 3.81e-01 0.0822 0.0936 0.241 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.13e-01 0.0785 0.0957 0.241 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 9.51e-01 0.00673 0.109 0.241 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.11e-01 0.0562 0.0853 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.34e-01 0.0644 0.0822 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0767 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.48e-01 0.0285 0.0885 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 7.13e-02 0.126 0.0694 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 9.45e-03 0.275 0.105 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 8.98e-02 0.172 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0901 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.31e-01 0.177 0.116 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 4.85e-01 0.0436 0.0623 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 6.88e-01 0.0314 0.0781 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 5.61e-01 0.0589 0.101 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.83e-01 0.0765 0.0711 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00413 0.0816 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.94e-01 -0.134 0.103 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0943 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.91e-01 0.0603 0.0874 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.18e-01 0.0562 0.112 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.18e-02 -0.228 0.106 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.85e-01 0.119 0.0894 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.30e-01 0.0655 0.0829 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0802 0.11 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.15e-01 0.11 0.0881 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 6.03e-01 0.0387 0.0743 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 2.49e-01 0.125 0.108 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 9.38e-01 0.00837 0.107 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.41e-02 0.166 0.0922 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.38e-01 0.0793 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0602 0.116 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 4.67e-01 -0.071 0.0976 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.37e-01 0.131 0.11 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.75e-01 -0.103 0.0937 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 2.33e-01 0.136 0.113 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.98e-01 0.0514 0.0973 0.24 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0288 0.0832 0.24 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.34e-03 -0.356 0.109 0.24 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 7.41e-01 0.0344 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 3.09e-01 0.0723 0.071 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 3.49e-01 0.0801 0.0852 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.85e-01 0.155 0.116 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00503 0.112 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.32e-01 0.0877 0.058 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 1.65e-01 0.118 0.0848 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 7.14e-01 0.0433 0.118 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 6.31e-01 0.0469 0.0976 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.08e-01 0.0285 0.076 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 9.83e-02 -0.153 0.0919 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0944 0.118 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.69e-01 0.0862 0.0624 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.098 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.08e-02 0.213 0.113 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 6.21e-01 0.0504 0.102 0.241 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.241 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0371 0.143 0.241 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0219 0.0735 0.235 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 1.96e-01 0.117 0.0898 0.235 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 3.81e-01 0.1 0.114 0.235 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.28e-02 0.173 0.089 0.239 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 8.36e-01 -0.017 0.0819 0.239 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0629 0.116 0.239 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 2.47e-01 0.126 0.108 0.249 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0538 0.096 0.249 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 5.32e-01 0.0562 0.0896 0.249 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0193 0.0602 0.249 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 3.87e-01 0.0947 0.109 0.249 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 99666 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0572 0.0391 0.249 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 7.45e-01 0.0348 0.107 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 4.57e-01 0.0732 0.0984 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.04e-01 0.145 0.089 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 5.61e-01 0.0289 0.0496 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 7.23e-01 0.0257 0.0724 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.65e-01 0.0955 0.105 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0152 0.0999 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.27e-01 0.111 0.0919 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0085 0.0522 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 2.26e-01 0.104 0.086 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0497 0.131 0.252 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.59e-01 0.0564 0.076 0.252 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 9.46e-01 0.00943 0.138 0.252 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0114 0.105 0.244 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 9.37e-01 0.00784 0.0985 0.244 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 9.17e-01 0.00948 0.0911 0.244 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.70e-01 0.058 0.0524 0.244 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0139 0.0878 0.244 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.60e-01 0.0952 0.104 0.233 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 6.54e-01 0.0416 0.0927 0.233 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 8.89e-01 0.0104 0.075 0.233 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00753 0.0596 0.233 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 7.03e-01 0.0406 0.106 0.233 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 7.36e-01 0.0377 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 8.85e-01 0.0105 0.0727 0.243 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 2.89e-01 0.103 0.0967 0.243 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 3.08e-01 0.0864 0.0844 0.243 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 1.83e-01 0.16 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 99666 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00343 0.091 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.77e-01 0.113 0.0833 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.00e-02 0.141 0.068 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 6.95e-01 0.0422 0.107 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 3.27e-01 0.0807 0.0821 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 2.77e-01 0.0804 0.0737 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 5.08e-01 0.069 0.104 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.44e-01 0.099 0.104 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 8.91e-01 0.0137 0.1 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.64e-01 0.117 0.0834 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 7.19e-01 0.0154 0.0427 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 3.25e-01 0.0692 0.0701 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 9.17e-01 -0.011 0.106 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 656079 sc-eQTL 8.52e-01 0.0179 0.0955 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 9.33e-01 0.00538 0.0643 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 6.72e-01 0.0208 0.0491 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0652 0.0895 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 382976 sc-eQTL 3.95e-01 0.0936 0.11 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 735874 sc-eQTL 1.14e-01 0.0815 0.0513 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B 11114 sc-eQTL 4.44e-01 0.0613 0.0799 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 383041 sc-eQTL 2.22e-01 0.139 0.114 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 555409 eQTL 0.0355 0.0723 0.0343 0.00131 0.0 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 \N 656079 4.37e-07 2.5e-07 6.86e-08 3.48e-07 9.94e-08 1.32e-07 3.25e-07 5.82e-08 1.85e-07 1.03e-07 2.18e-07 1.31e-07 3.48e-07 8.26e-08 6.53e-08 8.08e-08 6.17e-08 2.33e-07 7.76e-08 5.61e-08 1.18e-07 1.76e-07 1.81e-07 3.68e-08 2.74e-07 1.39e-07 1.31e-07 1.26e-07 1.4e-07 1.89e-07 1.39e-07 5.4e-08 3.21e-08 9.08e-08 1.07e-07 2.79e-08 4.28e-08 8.57e-08 6.29e-08 8.2e-08 5.42e-08 2.5e-07 4.7e-08 7.28e-09 3.48e-08 6.39e-09 8.46e-08 1.89e-09 4.69e-08