logo

Genes within 1Mb (chr1:65758439:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.95e-02 -0.168 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0835 0.0855 0.12 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0296 0.105 0.12 B L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.46e-01 -0.115 0.079 0.12 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 7.05e-01 0.0359 0.0946 0.12 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.02e-01 -0.202 0.123 0.12 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 3.26e-01 -0.133 0.135 0.12 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0848 0.105 0.12 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 3.90e-01 0.0771 0.0896 0.12 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.13e-02 -0.242 0.138 0.12 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 6.08e-02 0.255 0.135 0.122 DC L1
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 6.73e-01 0.0484 0.115 0.122 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 8.19e-01 0.0219 0.0954 0.122 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 4.04e-01 0.0616 0.0738 0.122 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.00e-01 -0.114 0.135 0.122 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 54477 sc-eQTL 4.10e-01 0.0601 0.0727 0.122 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0949 0.131 0.12 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 6.71e-01 -0.051 0.12 0.12 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.97e-02 -0.175 0.0847 0.12 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 8.53e-01 0.00881 0.0473 0.12 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 3.17e-02 -0.181 0.0838 0.12 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 3.68e-01 0.116 0.128 0.118 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0799 0.0605 0.118 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 4.32e-03 0.234 0.0813 0.118 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.09e-01 -0.222 0.138 0.118 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.27e-01 -0.134 0.0874 0.12 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 2.61e-01 0.107 0.0952 0.12 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 9.98e-01 0.0004 0.138 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.17e-01 -0.116 0.142 0.115 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 8.52e-02 -0.194 0.112 0.115 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.46e-01 -0.217 0.148 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0805 0.113 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000776 0.0921 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.73e-02 -0.262 0.131 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.76e-02 -0.237 0.113 0.121 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.35e-01 -0.175 0.116 0.121 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 5.39e-01 0.0819 0.133 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0599 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 7.68e-01 0.0301 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0186 0.137 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.47e-01 -0.126 0.109 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0351 0.086 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.54e-01 0.0241 0.131 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 5.57e-02 -0.241 0.125 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0487 0.112 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.34e-01 0.217 0.144 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0504 0.0779 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 2.67e-01 0.108 0.0973 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0926 0.126 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0524 0.0885 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0552 0.101 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.58e-02 -0.308 0.127 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.91e-01 -0.123 0.117 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0135 0.108 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 2.47e-01 -0.161 0.139 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0291 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.32e-01 -0.133 0.111 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 2.46e-01 0.119 0.103 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 7.32e-02 -0.243 0.135 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0808 0.131 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.21e-01 0.00915 0.0916 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.19e-01 -0.208 0.133 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 5.23e-03 -0.369 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0993 0.116 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0388 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 9.25e-01 0.0136 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0271 0.124 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.10e-01 -0.115 0.14 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 2.40e-01 0.14 0.119 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0662 0.144 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.03e-01 -0.127 0.123 0.115 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.24e-01 0.162 0.105 0.115 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0232 0.142 0.115 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 5.32e-01 0.0787 0.126 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0865 0.0859 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.10e-01 0.165 0.103 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.53e-01 -0.106 0.141 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 2.69e-01 0.15 0.135 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.02e-01 -0.116 0.0704 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.33e-03 0.267 0.102 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 2.24e-01 -0.174 0.143 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 9.96e-01 0.000565 0.117 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0187 0.0908 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.00e-01 0.181 0.11 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 6.04e-01 -0.073 0.141 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 9.28e-01 0.0117 0.13 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.29e-01 -0.091 0.0753 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.56e-02 0.285 0.117 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 5.91e-02 -0.259 0.136 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 8.33e-01 0.0291 0.137 0.085 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 5.23e-01 -0.112 0.174 0.085 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 5.40e-01 0.118 0.192 0.085 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0484 0.0904 0.122 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 6.86e-01 -0.045 0.111 0.122 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 6.22e-01 0.0695 0.141 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0766 0.109 0.12 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 5.81e-01 0.0552 0.0999 0.12 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 2.05e-01 -0.18 0.142 0.12 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 8.17e-02 0.254 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 3.99e-01 0.109 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 4.39e-02 -0.242 0.119 0.12 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 7.63e-01 0.0244 0.0808 0.12 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 9.35e-01 0.012 0.147 0.12 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 54477 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0401 0.0527 0.12 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 3.75e-01 -0.117 0.132 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 7.38e-01 0.0408 0.122 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.11e-02 -0.254 0.109 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 5.38e-01 0.0378 0.0614 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0149 0.0895 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 5.09e-01 0.0866 0.131 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 3.40e-01 -0.119 0.124 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.07e-01 -0.117 0.114 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 4.64e-01 0.0475 0.0648 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 2.16e-03 -0.326 0.105 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.91e-01 -0.138 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 4.20e-02 0.19 0.0925 0.121 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 6.57e-01 0.0756 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0463 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 7.34e-01 0.0414 0.122 0.12 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.79e-01 -0.099 0.112 0.12 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 3.41e-01 0.0618 0.0648 0.12 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 8.12e-03 -0.285 0.107 0.12 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0602 0.127 0.124 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0598 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0908 0.124 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 3.03e-01 0.0749 0.0724 0.124 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0952 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 7.40e-01 0.0441 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0256 0.0866 0.127 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.86e-01 0.153 0.115 0.127 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 1.37e-01 0.15 0.1 0.127 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 2.50e-01 -0.165 0.143 0.127 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 54477 sc-eQTL 7.04e-01 0.0412 0.108 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.15e-01 -0.16 0.101 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0893 0.0834 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 4.36e-01 -0.102 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.23e-01 0.00883 0.0915 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 5.78e-01 0.0716 0.129 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0825 0.129 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0509 0.124 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 3.46e-02 -0.218 0.103 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 9.90e-01 0.000674 0.0529 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 5.55e-02 -0.166 0.0861 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 4.31e-01 -0.103 0.131 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 610890 sc-eQTL 4.74e-01 0.0853 0.119 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0832 0.0798 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 4.07e-01 0.0507 0.0611 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 6.03e-02 -0.209 0.111 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 337787 sc-eQTL 3.13e-01 0.134 0.132 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 690685 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0953 0.0618 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -34075 sc-eQTL 6.34e-03 0.261 0.0946 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 337852 sc-eQTL 1.25e-01 -0.21 0.137 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 510220 pQTL 0.0263 0.045 0.0202 0.0 0.0 0.111
ENSG00000213625 LEPROT 337852 eQTL 0.00157 -0.0951 0.03 0.0 0.0 0.114

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 \N 610890 1.26e-06 9.23e-07 3.48e-07 1.21e-06 1.18e-07 4.12e-07 7.54e-07 2.03e-07 8.66e-07 3.13e-07 1.37e-06 5.01e-07 2.02e-06 2.68e-07 4.01e-07 4.79e-07 7.73e-07 5.26e-07 4e-07 4.36e-07 3.91e-07 9.14e-07 7.39e-07 3.29e-07 1.93e-06 2.64e-07 6.16e-07 4.96e-07 8e-07 9.3e-07 5.43e-07 3.9e-08 5.63e-08 4.51e-07 4.91e-07 3.98e-07 2.59e-07 1.21e-07 1.13e-07 4.2e-08 8.55e-08 1.56e-06 5.58e-08 2.62e-08 1.99e-07 1.46e-07 1.83e-07 7.69e-08 5.94e-08