logo

Genes within 1Mb (chr1:65755198:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.07e-01 0.0105 0.0896 0.1 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0624 0.0934 0.1 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.05e-01 0.185 0.114 0.1 B L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000499 0.0879 0.1 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0965 0.105 0.1 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.22e-01 0.088 0.137 0.1 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 9.62e-01 0.00704 0.146 0.1 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0457 0.113 0.1 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.32e-01 -0.115 0.0961 0.1 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.13e-01 0.0164 0.15 0.1 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 9.52e-01 0.00877 0.145 0.101 DC L1
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 6.77e-01 0.0507 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0654 0.101 0.101 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 9.23e-01 0.00756 0.0785 0.101 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 6.13e-03 0.391 0.141 0.101 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 51236 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0907 0.0771 0.101 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 2.28e-01 -0.176 0.145 0.1 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 1.94e-01 -0.173 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 1.53e-01 -0.136 0.0948 0.1 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0332 0.0527 0.1 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 3.23e-01 0.0932 0.0941 0.1 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00371 0.14 0.101 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 7.51e-01 0.021 0.0661 0.101 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.65e-01 -0.125 0.0898 0.101 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.96e-01 0.000703 0.151 0.101 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 1.15e-01 0.153 0.0969 0.1 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 7.76e-01 0.0302 0.106 0.1 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.63e-01 0.00717 0.153 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 4.43e-01 0.116 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 6.99e-01 0.0464 0.12 0.11 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 4.10e-01 -0.13 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 1.24e-02 -0.319 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0809 0.104 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.50e-01 0.0899 0.15 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.04e-01 0.0154 0.128 0.099 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.67e-01 0.118 0.13 0.099 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0137 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0235 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.49e-01 -0.158 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.63e-01 0.207 0.148 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 1.31e-01 -0.178 0.117 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0613 0.0932 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00408 0.142 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 3.31e-01 0.134 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0307 0.122 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0354 0.159 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.13e-01 0.00931 0.0854 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.17e-01 -0.132 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 7.38e-01 0.0463 0.138 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0739 0.0975 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.111 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 2.99e-02 0.306 0.14 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0833 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.39e-02 -0.268 0.118 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 8.55e-01 -0.028 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 4.95e-01 -0.098 0.143 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00646 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.67e-01 -0.154 0.111 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.147 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 4.80e-01 0.102 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 7.02e-02 -0.217 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0576 0.101 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 6.62e-01 0.0645 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 7.72e-01 0.0443 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0875 0.133 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.92e-01 -0.191 0.146 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 7.09e-01 0.0621 0.166 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0317 0.132 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 7.07e-02 -0.269 0.148 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0302 0.127 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 8.00e-01 -0.039 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 3.91e-01 -0.113 0.132 0.102 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0952 0.113 0.102 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 4.47e-01 0.116 0.152 0.102 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0843 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.41e-01 0.058 0.0948 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.00e-02 -0.291 0.112 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.57e-01 0.0916 0.156 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 2.35e-01 -0.176 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0301 0.0776 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0857 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 4.17e-01 -0.128 0.157 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 1.97e-01 -0.17 0.131 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0765 0.102 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.95e-01 -0.106 0.125 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.46e-01 0.096 0.159 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 3.29e-01 0.138 0.141 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 4.70e-01 0.0596 0.0824 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 7.20e-02 -0.232 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.11e-01 0.239 0.149 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0335 0.125 0.115 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 6.03e-02 0.296 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.69e-01 0.24 0.173 0.115 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 6.80e-01 0.0406 0.0982 0.1 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.46e-01 0.114 0.12 0.1 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 2.97e-01 -0.159 0.152 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00699 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 5.06e-01 0.0743 0.111 0.1 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.16e-01 0.249 0.158 0.1 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0164 0.147 0.102 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0368 0.13 0.102 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0505 0.121 0.102 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 7.54e-01 0.0256 0.0815 0.102 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.95e-02 0.278 0.147 0.102 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 51236 sc-eQTL 4.48e-01 0.0403 0.0531 0.102 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0514 0.148 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 4.46e-01 -0.104 0.136 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0712 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00846 0.0686 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.07e-01 0.0663 0.0998 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0736 0.146 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 4.65e-01 -0.101 0.139 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 2.36e-01 -0.152 0.128 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00216 0.0724 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 3.25e-01 0.118 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 6.01e-02 0.357 0.189 0.088 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0813 0.111 0.088 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.94e-01 0.00142 0.201 0.088 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0291 0.144 0.098 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 3.07e-03 -0.398 0.133 0.098 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 7.73e-01 0.0363 0.126 0.098 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0997 0.0723 0.098 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0789 0.121 0.098 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 1.92e-01 -0.186 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0884 0.127 0.095 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0688 0.103 0.095 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.18e-01 -0.128 0.0815 0.095 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 4.50e-01 0.111 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 8.60e-01 0.0265 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 1.58e-01 -0.137 0.0968 0.105 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 8.28e-02 -0.225 0.129 0.105 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.06e-01 -0.144 0.113 0.105 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 3.64e-02 0.336 0.159 0.105 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 51236 sc-eQTL 3.51e-01 -0.114 0.122 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 3.05e-01 -0.115 0.112 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00485 0.0924 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 7.41e-01 0.0478 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 3.20e-01 -0.109 0.11 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0974 0.0986 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 1.96e-01 0.18 0.139 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 3.67e-01 -0.13 0.144 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 3.17e-01 -0.139 0.138 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 2.86e-01 -0.124 0.116 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0269 0.0591 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 2.76e-01 0.106 0.0968 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0659 0.145 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 607649 sc-eQTL 1.98e-03 -0.403 0.129 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0634 0.0885 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 1.07e-02 -0.172 0.0666 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.26e-01 0.0115 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 334546 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0573 0.144 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 687444 sc-eQTL 8.49e-01 0.0129 0.0677 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -37316 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.105 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 334611 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0147 0.15 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 506979 pQTL 0.0435 -0.0458 0.0227 0.0 0.0 0.0878
ENSG00000162433 AK4 607649 eQTL 0.000261 -0.147 0.04 0.00268 0.00113 0.0844

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina