logo

Genes within 1Mb (chr1:65702816:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00713 0.0849 0.113 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.61e-01 -0.124 0.0882 0.113 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 1.99e-01 0.139 0.108 0.113 B L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0081 0.0831 0.113 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.18e-01 -0.155 0.0986 0.113 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 4.46e-01 0.0991 0.13 0.113 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.11e-01 -0.115 0.14 0.113 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.113 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 2.74e-02 -0.204 0.0917 0.113 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 2.78e-01 0.156 0.144 0.113 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.79e-01 0.1 0.141 0.113 DC L1
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 6.07e-01 0.0613 0.119 0.113 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 3.13e-01 0.0998 0.0987 0.113 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 3.53e-02 -0.266 0.125 0.113 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.62e-01 -0.107 0.0763 0.113 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 1.44e-01 0.205 0.14 0.113 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -1146 sc-eQTL 3.52e-04 0.266 0.0731 0.113 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 1.46e-01 0.204 0.14 0.113 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00137 0.129 0.113 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.62e-01 0.00433 0.0918 0.113 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0382 0.0508 0.113 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 2.26e-01 0.11 0.0906 0.113 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0369 0.135 0.114 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.72e-01 0.0871 0.0636 0.114 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.88e-03 -0.268 0.0852 0.114 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 4.68e-02 0.289 0.144 0.114 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 6.46e-03 0.247 0.0899 0.113 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 1.87e-02 0.311 0.131 0.113 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0764 0.0992 0.113 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.76e-01 0.127 0.143 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.57e-01 0.217 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 9.19e-01 0.0124 0.122 0.102 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 1.63e-01 -0.223 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0876 0.123 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.06e-01 -0.083 0.0998 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 6.91e-01 0.0573 0.144 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 6.09e-01 0.0635 0.124 0.114 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0914 0.126 0.114 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.53e-01 0.134 0.144 0.114 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.84e-01 0.0022 0.108 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 2.08e-02 -0.24 0.103 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00887 0.141 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 3.15e-01 -0.115 0.114 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.39e-02 -0.192 0.0897 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 4.21e-01 0.111 0.138 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 4.31e-02 0.264 0.13 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.92e-02 -0.227 0.115 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 7.61e-01 0.0458 0.151 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0379 0.0811 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 7.73e-02 -0.179 0.101 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 5.34e-01 0.0819 0.131 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0395 0.0934 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.75e-02 -0.253 0.106 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 5.75e-01 0.0761 0.135 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.17e-01 0.193 0.123 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.25e-01 -0.175 0.113 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 6.64e-01 0.0638 0.147 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.12e-02 -0.283 0.138 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.28e-02 0.196 0.116 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.09e-02 -0.22 0.107 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 8.73e-01 0.0228 0.143 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 9.11e-01 0.0154 0.138 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 3.51e-01 0.107 0.114 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.07e-01 -0.155 0.0958 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 6.52e-02 0.258 0.139 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 5.81e-01 0.0772 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0804 0.121 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 7.24e-01 0.0472 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 8.56e-01 0.0275 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0611 0.127 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.34e-01 -0.214 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 7.72e-02 -0.215 0.121 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 7.31e-02 0.264 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.00e-01 0.16 0.124 0.113 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 1.63e-01 0.186 0.132 0.113 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0932 0.107 0.113 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 6.32e-01 0.0689 0.144 0.113 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 3.92e-03 0.383 0.131 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.69e-01 0.101 0.0914 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.74e-03 -0.341 0.107 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 5.58e-01 0.0883 0.15 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.13e-01 -0.116 0.142 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 3.54e-01 0.0688 0.0741 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.16e-02 -0.272 0.107 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.94e-01 0.128 0.15 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0209 0.124 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.60e-01 0.109 0.0961 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.58e-01 -0.108 0.117 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0649 0.149 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0803 0.137 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.15e-01 0.099 0.0797 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 5.06e-02 -0.244 0.124 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 7.63e-04 0.483 0.142 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 5.67e-01 0.0729 0.127 0.122 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.96e-01 0.137 0.161 0.122 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.40e-02 0.375 0.175 0.122 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00871 0.0933 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 5.72e-01 0.0697 0.123 0.113 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00974 0.115 0.113 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 9.63e-01 0.00669 0.145 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.42e-02 0.194 0.116 0.113 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 6.06e-01 0.0548 0.106 0.113 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.04e-01 0.155 0.15 0.113 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.50e-01 0.112 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 4.28e-01 -0.104 0.13 0.11 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.05e-01 0.154 0.121 0.11 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 7.22e-02 -0.24 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0715 0.0816 0.11 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 4.92e-01 0.102 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -1146 sc-eQTL 5.35e-01 0.0332 0.0533 0.11 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 2.76e-01 0.154 0.141 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0331 0.13 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 8.16e-01 0.0276 0.118 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0854 0.0654 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 2.15e-01 0.119 0.0954 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0215 0.138 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0699 0.131 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 4.00e-01 -0.102 0.121 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 6.76e-02 -0.125 0.0679 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.12e-01 0.115 0.113 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 5.35e-02 0.33 0.169 0.106 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 2.07e-01 0.19 0.15 0.106 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.49e-01 -0.144 0.0993 0.106 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0406 0.181 0.106 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0699 0.142 0.107 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0532 0.134 0.107 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 2.87e-02 0.27 0.123 0.107 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0984 0.0714 0.107 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 2.27e-01 0.144 0.119 0.107 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 6.08e-01 0.0712 0.139 0.109 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 5.70e-01 0.0703 0.124 0.109 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 6.56e-01 0.0446 0.1 0.109 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0802 0.0793 0.109 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0217 0.142 0.109 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 1.04e-01 0.227 0.139 0.119 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00401 0.0915 0.119 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.23e-01 0.0118 0.122 0.119 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 957721 sc-eQTL 2.66e-01 -0.153 0.137 0.119 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0701 0.107 0.119 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 2.49e-01 -0.175 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -1146 sc-eQTL 1.41e-04 0.426 0.109 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0245 0.109 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0595 0.0898 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 3.62e-01 0.128 0.14 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.105 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 2.01e-02 -0.217 0.0928 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 9.12e-01 0.0146 0.132 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.11e-01 0.113 0.137 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0283 0.131 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0117 0.11 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0879 0.0558 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 7.71e-02 0.163 0.0915 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 7.62e-01 0.0432 0.143 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 555267 sc-eQTL 6.53e-01 -0.058 0.129 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.24e-01 0.133 0.0864 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0523 0.0663 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0403 0.121 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 282164 sc-eQTL 4.02e-01 -0.116 0.139 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 635062 sc-eQTL 1.50e-01 0.0935 0.0648 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -89698 sc-eQTL 2.54e-02 -0.225 0.0998 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 282229 sc-eQTL 1.85e-02 0.337 0.142 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116678 LEPR 282164 pQTL 0.00485 0.115 0.0407 0.00278 0.00133 0.138
ENSG00000116678 LEPR 282164 eQTL 0.999 -2.61e-05 0.0322 0.0 0.00159 0.137

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina