logo

Genes within 1Mb (chr1:65699049:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0231 0.0842 0.12 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 8.21e-02 -0.153 0.0873 0.12 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.107 0.12 B L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0125 0.0826 0.12 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 8.63e-02 -0.169 0.0978 0.12 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 4.88e-01 0.0896 0.129 0.12 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 2.95e-01 -0.146 0.139 0.12 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 3.66e-01 0.0975 0.108 0.12 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.39e-02 -0.225 0.0907 0.12 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 3.29e-01 0.14 0.143 0.12 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 4.40e-01 0.108 0.139 0.119 DC L1
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 8.19e-01 0.0268 0.117 0.119 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.87e-01 0.104 0.0972 0.119 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 6.07e-02 -0.234 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 9.67e-02 -0.125 0.075 0.119 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.83e-01 0.184 0.138 0.119 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -4913 sc-eQTL 1.81e-04 0.274 0.0719 0.119 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 1.49e-01 0.199 0.137 0.12 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0338 0.126 0.12 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.16e-01 0.0328 0.0901 0.12 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0458 0.0498 0.12 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.32e-01 0.134 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0256 0.134 0.12 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.94e-01 0.0663 0.063 0.12 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 8.39e-04 -0.285 0.084 0.12 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 4.78e-02 0.284 0.143 0.12 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.13e-03 0.242 0.0891 0.12 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 3.93e-02 0.27 0.13 0.12 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.98e-01 -0.103 0.0983 0.12 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 6.09e-01 0.0729 0.142 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.53e-01 0.217 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0252 0.12 0.11 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.93e-01 -0.207 0.158 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.58e-01 -0.137 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.82e-01 -0.106 0.0987 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 6.08e-01 0.0732 0.142 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.34e-01 0.0418 0.123 0.121 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.42e-01 -0.119 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 4.48e-01 0.108 0.143 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 8.91e-01 0.0147 0.107 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 7.67e-03 -0.274 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0415 0.14 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0999 0.113 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.97e-02 -0.194 0.0888 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.68e-01 0.179 0.129 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 5.91e-02 -0.216 0.114 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0112 0.149 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0419 0.0807 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 8.48e-02 -0.174 0.1 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 5.34e-01 0.0814 0.131 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0561 0.0927 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 5.24e-03 -0.294 0.104 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 5.41e-01 0.0823 0.134 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.12e-01 0.195 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.08e-01 -0.182 0.113 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 7.73e-01 0.0421 0.146 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 1.98e-02 -0.319 0.136 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.54e-01 0.165 0.115 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.68e-02 -0.254 0.106 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 9.49e-01 0.00901 0.141 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0235 0.137 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 3.77e-01 0.1 0.114 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.46e-01 -0.139 0.0952 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 8.28e-02 0.241 0.138 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 6.54e-01 0.0622 0.138 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0553 0.12 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0135 0.132 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 9.21e-01 0.0149 0.15 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0024 0.126 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 8.36e-02 -0.246 0.142 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 4.82e-02 -0.239 0.12 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 8.44e-02 0.253 0.146 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.66e-01 0.137 0.123 0.119 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 2.94e-01 0.138 0.131 0.119 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.39e-01 -0.101 0.105 0.119 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 9.79e-01 0.00378 0.142 0.119 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 7.87e-03 0.35 0.13 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 4.21e-01 0.0732 0.0908 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 4.64e-04 -0.377 0.106 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 4.25e-01 0.119 0.149 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0964 0.141 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 4.74e-01 0.0527 0.0735 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 9.04e-03 -0.279 0.106 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 5.63e-01 0.0861 0.149 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0336 0.123 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.25e-01 0.116 0.0952 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.92e-01 -0.123 0.116 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0607 0.148 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0496 0.136 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.38e-01 0.0936 0.0791 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.46e-02 -0.302 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.48e-04 0.539 0.139 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 6.78e-01 0.0526 0.126 0.133 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 4.72e-01 0.116 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 5.67e-02 0.335 0.174 0.133 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.79e-01 0.026 0.0923 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 5.11e-01 0.0802 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0129 0.113 0.12 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 8.85e-01 0.0209 0.144 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 9.16e-02 0.194 0.115 0.12 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 7.72e-01 0.0306 0.105 0.12 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 5.27e-01 0.0947 0.149 0.12 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 4.78e-01 0.103 0.145 0.117 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 3.10e-01 -0.131 0.128 0.117 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.62e-01 0.167 0.119 0.117 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 1.32e-01 -0.198 0.131 0.117 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.58e-01 -0.091 0.0802 0.117 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 6.03e-01 0.0762 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -4913 sc-eQTL 5.95e-01 0.0279 0.0525 0.117 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 2.64e-01 0.156 0.139 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0555 0.128 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.05e-01 0.0443 0.117 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0952 0.0644 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.32e-01 0.142 0.0938 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0281 0.137 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 4.28e-01 -0.103 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0412 0.12 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 6.64e-02 -0.124 0.0671 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 2.04e-01 0.142 0.111 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 6.61e-02 0.313 0.169 0.112 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 2.36e-01 0.178 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 6.85e-02 -0.18 0.0983 0.112 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0374 0.18 0.112 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0204 0.14 0.113 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0805 0.132 0.113 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.44e-02 0.274 0.121 0.113 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.38e-01 -0.105 0.0702 0.113 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.113 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 7.78e-01 0.0385 0.136 0.115 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 3.59e-01 0.111 0.121 0.115 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 6.46e-01 0.0451 0.0981 0.115 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0876 0.0778 0.115 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0288 0.139 0.115 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 7.52e-02 0.245 0.137 0.127 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0384 0.0901 0.127 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000957 0.12 0.127 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 953954 sc-eQTL 3.45e-01 -0.128 0.135 0.127 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.105 0.127 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 2.03e-01 -0.19 0.149 0.127 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -4913 sc-eQTL 7.13e-05 0.437 0.107 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0647 0.108 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0787 0.0888 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 3.59e-01 0.128 0.139 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00022 0.103 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 7.51e-03 -0.247 0.0914 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00645 0.131 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 4.05e-01 0.113 0.135 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0628 0.129 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 7.79e-01 0.0304 0.108 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 9.48e-02 -0.0922 0.0549 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 3.96e-02 0.186 0.09 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 6.72e-01 0.0594 0.14 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 551500 sc-eQTL 6.65e-01 -0.055 0.127 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 1.22e-01 0.132 0.0849 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0591 0.0651 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 7.18e-01 -0.043 0.119 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 278397 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0938 0.137 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 631295 sc-eQTL 2.56e-01 0.0732 0.0643 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -93465 sc-eQTL 1.38e-02 -0.245 0.0986 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 278462 sc-eQTL 1.82e-02 0.335 0.141 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116678 LEPR 278397 pQTL 0.00833 0.107 0.0403 0.00204 0.0 0.142
ENSG00000116678 LEPR 278397 eQTL 0.915 -0.00338 0.0318 0.0 0.00107 0.142

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina