logo

Genes within 1Mb (chr1:65670655:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0833 0.13 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 7.15e-01 -0.032 0.0873 0.13 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.13 B L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0859 0.0786 0.13 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 8.03e-01 0.0235 0.094 0.13 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.26e-03 -0.393 0.12 0.13 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 1.52e-01 -0.189 0.132 0.13 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.22e-01 -0.102 0.102 0.13 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 9.88e-01 0.00127 0.0875 0.13 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 5.92e-02 -0.256 0.135 0.13 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00443 0.137 0.133 DC L1
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 2.95e-01 0.121 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.87e-01 -0.102 0.0956 0.133 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 5.87e-02 0.231 0.122 0.133 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 9.93e-01 0.000634 0.0743 0.133 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 7.98e-02 -0.238 0.135 0.133 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -33307 sc-eQTL 4.43e-01 0.0562 0.0731 0.133 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 1.77e-02 -0.314 0.132 0.13 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0212 0.122 0.13 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00426 0.087 0.13 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.64e-01 0.0437 0.0481 0.13 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.33e-02 -0.16 0.0855 0.13 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 2.79e-01 0.14 0.129 0.129 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0907 0.0608 0.129 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0312 0.0834 0.129 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 8.65e-02 -0.239 0.139 0.129 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 4.73e-02 -0.175 0.0878 0.13 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0907 0.129 0.13 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0762 0.0962 0.13 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 9.42e-01 0.0101 0.139 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 5.37e-01 -0.094 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 4.67e-02 -0.239 0.119 0.112 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 8.85e-01 -0.023 0.159 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 5.50e-01 0.0561 0.0936 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0667 0.135 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 9.65e-01 0.00512 0.115 0.131 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0232 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0514 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.18e-01 -0.024 0.104 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 8.70e-01 0.0165 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0471 0.136 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0265 0.109 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0411 0.0864 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0556 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 1.05e-01 -0.203 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 1.56e-01 -0.157 0.11 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0206 0.144 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0774 0.0767 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.97e-01 0.0815 0.0961 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 3.47e-02 -0.262 0.123 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0216 0.087 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00787 0.0997 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.58e-04 -0.469 0.122 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.78e-01 -0.104 0.118 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 9.66e-01 0.00469 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.92e-02 -0.327 0.139 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 7.56e-01 0.0404 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 1.94e-01 -0.141 0.109 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 2.71e-01 -0.111 0.101 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 2.29e-02 -0.302 0.132 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 2.06e-01 -0.165 0.13 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 1.56e-01 -0.155 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 8.32e-01 0.0194 0.0916 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0936 0.133 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 7.82e-01 0.0321 0.116 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 9.40e-01 0.00965 0.127 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 8.62e-01 0.0251 0.144 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 8.29e-01 0.0268 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0318 0.14 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0482 0.119 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 3.89e-01 -0.125 0.144 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0977 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0475 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0885 0.102 0.128 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.24e-01 0.0677 0.138 0.128 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 6.74e-01 0.0542 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.27e-01 0.0193 0.0881 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 7.03e-01 0.0403 0.106 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0758 0.145 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 8.38e-02 0.235 0.135 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 1.15e-01 -0.112 0.0707 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 5.49e-01 0.0623 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 2.12e-01 -0.18 0.143 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 6.65e-02 -0.223 0.121 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 7.66e-01 0.0282 0.0948 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 1.56e-01 -0.164 0.115 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 3.98e-01 -0.124 0.147 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 9.33e-01 0.0111 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0734 0.076 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.98e-01 -0.101 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 2.66e-01 -0.154 0.138 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.68e-01 -0.152 0.137 0.104 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.89e-01 -0.15 0.174 0.104 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 3.49e-01 -0.181 0.192 0.104 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.94e-01 0.0944 0.0898 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0784 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.78e-01 0.0459 0.11 0.13 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0888 0.14 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 8.76e-01 0.0172 0.11 0.13 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 2.40e-01 -0.118 0.1 0.13 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0219 0.143 0.13 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 9.74e-01 0.00483 0.146 0.124 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 6.23e-02 0.239 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.34e-01 -0.116 0.12 0.124 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 1.40e-01 0.195 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 3.50e-01 0.0754 0.0805 0.124 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 2.63e-01 -0.164 0.146 0.124 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -33307 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0447 0.0526 0.124 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 8.79e-03 -0.347 0.131 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 1.82e-01 -0.164 0.122 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0681 0.111 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 1.75e-01 0.0839 0.0616 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0446 0.0901 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 3.98e-01 0.11 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 5.69e-01 0.0704 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00685 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 2.27e-01 0.078 0.0643 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 4.89e-03 -0.298 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 7.23e-02 -0.296 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 6.52e-02 -0.267 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 5.47e-01 0.0581 0.0962 0.127 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0571 0.174 0.127 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0371 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 6.69e-02 0.226 0.123 0.131 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 5.08e-01 0.0756 0.114 0.131 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 4.33e-01 0.0518 0.0659 0.131 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.11 0.131 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 1.28e-01 -0.204 0.134 0.127 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 1.04e-01 0.195 0.119 0.127 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 6.76e-03 -0.26 0.0952 0.127 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 7.19e-01 0.0277 0.077 0.127 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.90e-01 -0.18 0.137 0.127 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00991 0.147 0.121 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 9.86e-01 0.00168 0.0957 0.121 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 3.99e-01 -0.108 0.127 0.121 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 925560 sc-eQTL 3.11e-01 0.146 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0585 0.111 0.121 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.12e-01 -0.251 0.157 0.121 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -33307 sc-eQTL 5.49e-01 0.0718 0.12 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00708 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0371 0.0847 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0664 0.101 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0125 0.0912 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0615 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 5.76e-02 -0.248 0.13 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0576 0.125 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00877 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 2.84e-01 0.0572 0.0533 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 9.30e-02 -0.147 0.0872 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 7.05e-02 -0.242 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 523106 sc-eQTL 1.99e-01 0.156 0.121 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0905 0.0814 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 6.91e-01 0.0249 0.0624 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 6.58e-02 -0.209 0.113 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 250003 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 602901 sc-eQTL 7.33e-02 -0.112 0.0622 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -121859 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0703 0.0971 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 250068 sc-eQTL 1.04e-01 -0.225 0.138 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 422436 pQTL 0.00898 0.0473 0.0181 0.0 0.0 0.137
ENSG00000116678 LEPR 250003 pQTL 0.047 -0.0809 0.0407 0.0 0.0 0.137
ENSG00000213625 LEPROT 250068 eQTL 0.00303 -0.0793 0.0267 0.0 0.0 0.14

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina