logo

Genes within 1Mb (chr1:65645360:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 2.29e-01 -0.1 0.0831 0.13 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0242 0.0871 0.13 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.40e-02 -0.197 0.106 0.13 B L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 1.49e-01 -0.114 0.0783 0.13 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 8.81e-01 0.0141 0.0939 0.13 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 1.29e-03 -0.392 0.12 0.13 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 1.77e-01 -0.177 0.131 0.13 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.13 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.087 0.13 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 5.53e-02 -0.258 0.134 0.13 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0402 0.136 0.133 DC L1
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 2.06e-01 0.144 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0586 0.0951 0.133 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 8.06e-01 0.0181 0.0738 0.133 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 9.52e-02 -0.225 0.134 0.133 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -58602 sc-eQTL 1.48e-01 0.105 0.0723 0.133 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 8.23e-03 -0.35 0.131 0.13 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 9.92e-01 0.00119 0.122 0.13 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 8.09e-01 0.0211 0.0872 0.13 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 4.95e-01 0.033 0.0482 0.13 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.24e-02 -0.184 0.0854 0.13 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 5.26e-01 0.0828 0.13 0.129 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.30e-02 -0.119 0.061 0.129 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0471 0.0839 0.129 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 5.20e-02 -0.272 0.139 0.129 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 9.34e-02 -0.149 0.0883 0.13 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.129 0.13 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0912 0.0963 0.13 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 8.75e-01 0.022 0.14 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0423 0.15 0.115 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 1.33e-02 -0.293 0.117 0.115 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0947 0.157 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.114 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 4.78e-01 0.0663 0.0934 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.22e-01 -0.133 0.134 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 7.45e-01 0.0375 0.115 0.131 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0475 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.00e-01 -0.113 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0337 0.104 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000563 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0608 0.136 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0472 0.109 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0672 0.0864 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0652 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.81e-02 -0.236 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.01e-01 -0.141 0.11 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 8.44e-01 0.0284 0.144 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0835 0.0765 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 3.66e-01 0.0868 0.0959 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 2.07e-02 -0.286 0.123 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0462 0.0868 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0185 0.0995 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.85e-04 -0.434 0.122 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0983 0.118 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0302 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.47e-02 -0.294 0.139 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00347 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 8.73e-02 -0.186 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.63e-01 -0.113 0.1 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 2.49e-02 -0.297 0.132 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0834 0.131 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 1.34e-01 -0.163 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 9.08e-01 0.0106 0.0916 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0634 0.133 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 3.19e-01 -0.132 0.132 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 9.45e-01 0.00795 0.115 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 9.12e-01 0.014 0.127 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0406 0.144 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0642 0.14 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0412 0.119 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.48e-01 -0.11 0.144 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 3.99e-01 -0.101 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0723 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.70e-01 -0.113 0.102 0.128 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 5.33e-01 0.0859 0.137 0.128 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 6.25e-01 0.063 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00977 0.0881 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 7.30e-01 0.0365 0.106 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.82e-01 -0.102 0.145 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 1.57e-01 0.193 0.136 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.52e-02 -0.143 0.0708 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 5.01e-01 0.0703 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 1.98e-01 -0.186 0.144 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 2.08e-01 -0.153 0.121 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.10e-01 0.0783 0.0948 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 1.60e-01 -0.162 0.115 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.46e-01 -0.139 0.147 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0372 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 2.95e-01 -0.08 0.0762 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 1.39e-01 -0.205 0.138 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0957 0.136 0.104 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 5.52e-01 -0.103 0.173 0.104 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 2.14e-01 -0.237 0.19 0.104 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.85e-01 0.0621 0.0888 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0664 0.117 0.13 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 9.11e-01 0.0122 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.138 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0627 0.111 0.13 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.46e-01 -0.117 0.101 0.13 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00201 0.144 0.13 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0377 0.144 0.124 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 2.95e-02 0.276 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0785 0.119 0.124 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 3.30e-01 0.127 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.91e-01 0.0843 0.0796 0.124 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.44e-01 -0.137 0.145 0.124 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -58602 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0477 0.052 0.124 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 6.98e-03 -0.356 0.131 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0784 0.111 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 2.19e-01 0.0759 0.0615 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.56e-01 -0.083 0.0897 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 6.51e-01 0.0592 0.131 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 5.20e-01 0.0797 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 7.76e-01 0.0325 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 3.24e-01 0.0639 0.0646 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 3.44e-03 -0.31 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 1.20e-01 -0.251 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 8.18e-02 -0.247 0.141 0.133 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 6.09e-01 0.0483 0.0942 0.133 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0365 0.171 0.133 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 8.72e-01 -0.021 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 7.39e-02 0.22 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 3.32e-01 0.111 0.114 0.131 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 5.80e-01 0.0365 0.0658 0.131 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 1.82e-01 -0.146 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 1.23e-01 -0.206 0.133 0.127 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 1.11e-01 0.19 0.119 0.127 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 3.34e-02 -0.205 0.0955 0.127 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 4.33e-01 0.0601 0.0766 0.127 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 2.01e-01 -0.175 0.137 0.127 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 9.34e-01 0.0122 0.146 0.121 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 5.79e-01 0.0529 0.0951 0.121 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0675 0.127 0.121 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 900265 sc-eQTL 3.80e-01 0.126 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00464 0.111 0.121 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 7.78e-02 -0.277 0.156 0.121 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -58602 sc-eQTL 1.68e-01 0.164 0.118 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 9.97e-01 0.000421 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 6.44e-01 -0.039 0.0843 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 8.54e-02 -0.226 0.131 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0768 0.101 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0253 0.0908 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0575 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 3.31e-02 -0.277 0.129 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0351 0.125 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00226 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 3.44e-01 0.0505 0.0532 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 4.12e-02 -0.178 0.0868 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 9.38e-02 -0.223 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 497811 sc-eQTL 2.04e-01 0.154 0.121 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0448 0.0814 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 5.91e-01 0.0334 0.0622 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 7.60e-02 -0.201 0.113 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224708 sc-eQTL 4.42e-01 0.103 0.134 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577606 sc-eQTL 3.14e-02 -0.135 0.0623 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147154 sc-eQTL 4.25e-01 -0.078 0.0976 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224773 sc-eQTL 6.81e-02 -0.254 0.138 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 397141 pQTL 0.0127 0.0453 0.0182 0.0 0.0 0.137
ENSG00000213625 LEPROT 224773 eQTL 0.00353 -0.0785 0.0268 0.0 0.0 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226891 \N 642871 9.36e-07 6.26e-07 2.1e-07 3.95e-07 9.61e-08 2.16e-07 6.09e-07 2.21e-07 7.08e-07 2.88e-07 9.92e-07 4.55e-07 9.57e-07 1.59e-07 3.08e-07 4.14e-07 5.41e-07 4.39e-07 2.88e-07 1.89e-07 2.43e-07 5.34e-07 4.13e-07 2.22e-07 9.82e-07 2.37e-07 4.25e-07 3.24e-07 4.9e-07 6.03e-07 3.77e-07 5.77e-08 5.78e-08 2.22e-07 3.48e-07 1.55e-07 1.44e-07 9.33e-08 7.54e-08 1.79e-08 1.45e-07 5.96e-07 3.55e-08 2e-08 1.67e-07 1.35e-08 1.21e-07 1.15e-08 5.47e-08