logo

Genes within 1Mb (chr1:65645288:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.09e-01 -0.106 0.0842 0.126 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00905 0.0883 0.126 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 8.67e-02 -0.185 0.107 0.126 B L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.08e-01 -0.101 0.0797 0.126 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.43e-01 0.0189 0.0953 0.126 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 6.36e-04 -0.422 0.122 0.126 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.00e-01 -0.219 0.133 0.126 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 1.66e-01 -0.143 0.103 0.126 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 9.48e-01 0.00576 0.0883 0.126 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 6.36e-02 -0.254 0.136 0.126 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0331 0.139 0.128 DC L1
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 2.44e-01 0.136 0.117 0.128 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0818 0.0972 0.128 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 9.52e-02 0.208 0.124 0.128 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.10e-01 0.0181 0.0755 0.128 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 9.79e-02 -0.228 0.137 0.128 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -58674 sc-eQTL 2.81e-01 0.0802 0.0741 0.128 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.09e-02 -0.343 0.133 0.126 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 8.85e-01 -0.018 0.124 0.126 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0164 0.0884 0.126 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 3.94e-01 0.0418 0.0488 0.126 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 3.16e-02 -0.187 0.0866 0.126 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 4.39e-01 0.102 0.131 0.124 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.69e-02 -0.123 0.0616 0.124 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0333 0.0848 0.124 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.17e-02 -0.288 0.14 0.124 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 7.08e-02 -0.162 0.089 0.126 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 3.27e-01 -0.128 0.13 0.126 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0938 0.0973 0.126 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00315 0.141 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0978 0.153 0.11 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.44e-02 -0.272 0.12 0.11 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0423 0.16 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.88e-01 0.124 0.116 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 3.36e-01 0.0913 0.0946 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0943 0.136 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 8.93e-01 0.0157 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0264 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.94e-01 -0.093 0.136 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0288 0.105 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.44e-01 0.02 0.102 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0586 0.137 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0547 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0325 0.0877 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0835 0.134 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 6.91e-02 -0.23 0.126 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.95e-01 -0.118 0.112 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 9.92e-01 0.00145 0.146 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0766 0.0778 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 3.72e-01 0.0871 0.0974 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.67e-02 -0.301 0.125 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0396 0.0881 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00337 0.101 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.46e-04 -0.478 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 3.67e-01 -0.108 0.12 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0202 0.111 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 2.28e-02 -0.322 0.141 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 9.37e-01 0.0103 0.131 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 1.02e-01 -0.18 0.11 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.96e-02 -0.313 0.133 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 3.04e-01 -0.136 0.132 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 1.86e-01 -0.146 0.11 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 7.95e-01 0.0242 0.0928 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0728 0.135 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.92e-01 -0.176 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 9.56e-01 0.00644 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.55e-01 0.0236 0.129 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 9.38e-01 0.0114 0.147 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00831 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0705 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0267 0.121 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.05e-01 -0.122 0.146 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.06e-01 -0.1 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0999 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.57e-01 -0.117 0.103 0.123 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 6.48e-01 0.0636 0.139 0.123 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 7.20e-01 0.0467 0.13 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0124 0.0891 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 6.54e-01 0.048 0.107 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0965 0.146 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.10e-01 0.221 0.137 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 3.98e-02 -0.148 0.0714 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 4.28e-01 0.0835 0.105 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.77e-01 -0.197 0.145 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 8.11e-02 -0.215 0.123 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 5.22e-01 0.0616 0.0962 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.20e-01 -0.144 0.117 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 2.59e-01 -0.169 0.149 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0141 0.133 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0919 0.0771 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 4.48e-01 -0.092 0.121 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.43e-01 -0.206 0.14 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.21e-01 -0.17 0.138 0.1 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0871 0.176 0.1 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 2.88e-01 -0.207 0.194 0.1 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.48e-01 0.0687 0.0904 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0825 0.119 0.126 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.49e-01 0.0212 0.111 0.126 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.73e-01 -0.101 0.141 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0137 0.112 0.126 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.83e-01 -0.11 0.102 0.126 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0197 0.145 0.126 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00701 0.148 0.12 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 3.74e-02 0.271 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 3.15e-01 -0.122 0.122 0.12 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 1.90e-01 0.175 0.133 0.12 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.32e-01 0.0978 0.0815 0.12 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 3.34e-01 -0.143 0.148 0.12 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -58674 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0454 0.0533 0.12 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 5.53e-03 -0.371 0.132 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.124 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 3.44e-01 -0.107 0.113 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 1.79e-01 0.084 0.0623 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0765 0.0911 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 5.01e-01 0.0891 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 6.20e-01 0.0624 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00573 0.116 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.12e-01 0.0817 0.0653 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 2.46e-03 -0.325 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 7.23e-02 -0.296 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 6.52e-02 -0.267 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 5.47e-01 0.0581 0.0962 0.127 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0571 0.174 0.127 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 7.93e-01 -0.035 0.133 0.127 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 1.28e-01 0.191 0.125 0.127 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.31e-01 0.0913 0.116 0.127 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 4.17e-01 0.0543 0.0669 0.127 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.39e-01 -0.165 0.111 0.127 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.73e-01 -0.185 0.136 0.122 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 1.14e-01 0.192 0.121 0.122 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 5.00e-03 -0.273 0.0963 0.122 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 4.45e-01 0.0597 0.0779 0.122 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 2.02e-01 -0.178 0.139 0.122 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0325 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 7.63e-01 0.0295 0.0974 0.116 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0566 0.13 0.116 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 900193 sc-eQTL 5.40e-01 0.0899 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0204 0.113 0.116 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.06e-01 -0.26 0.16 0.116 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -58674 sc-eQTL 3.96e-01 0.104 0.122 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00401 0.104 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0243 0.0856 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 1.79e-01 -0.18 0.133 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0769 0.103 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00638 0.0922 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 5.54e-01 -0.077 0.13 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 3.72e-02 -0.275 0.131 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0503 0.127 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0395 0.106 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 2.78e-01 0.0587 0.054 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 4.10e-02 -0.181 0.088 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 1.04e-01 -0.221 0.135 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 497739 sc-eQTL 2.65e-01 0.137 0.123 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.76e-01 -0.09 0.0825 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 5.43e-01 0.0385 0.0632 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 6.58e-02 -0.212 0.114 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 224636 sc-eQTL 3.46e-01 0.128 0.136 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 577534 sc-eQTL 2.77e-02 -0.14 0.0629 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -147226 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0513 0.0987 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 224701 sc-eQTL 5.04e-02 -0.275 0.14 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 397069 pQTL 0.0132 0.0452 0.0182 0.0 0.0 0.136
ENSG00000116678 LEPR 224636 pQTL 0.0382 -0.0849 0.0409 0.0 0.0 0.136
ENSG00000213625 LEPROT 224701 eQTL 0.00619 -0.0738 0.0269 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina