logo

Genes within 1Mb (chr1:65552876:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0814 0.0836 0.12 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.50e-01 0.0165 0.0874 0.12 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 1.13e-01 -0.169 0.106 0.12 B L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0643 0.0802 0.12 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 2.59e-01 0.108 0.0955 0.12 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 1.11e-03 -0.405 0.123 0.12 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 4.93e-02 -0.264 0.134 0.12 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 2.84e-01 -0.112 0.104 0.12 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 3.21e-01 0.0886 0.089 0.12 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 2.66e-02 -0.306 0.137 0.12 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 9.97e-01 0.000437 0.136 0.124 DC L1
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.124 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.85e-01 -0.026 0.0953 0.124 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 2.24e-02 0.277 0.121 0.124 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 2.69e-01 0.0816 0.0736 0.124 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 1.14e-01 -0.213 0.134 0.124 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -151086 sc-eQTL 2.64e-01 0.0813 0.0725 0.124 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 3.63e-02 -0.284 0.135 0.12 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00832 0.124 0.12 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0247 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.40e-01 -0.00994 0.0491 0.12 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0771 0.0878 0.12 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 7.32e-02 -0.24 0.133 0.118 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0205 0.0634 0.118 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0132 0.0865 0.118 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.46e-02 -0.304 0.143 0.118 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0267 0.0898 0.12 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0446 0.131 0.12 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 9.60e-01 0.00486 0.0976 0.12 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0613 0.141 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0291 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.80e-01 -0.168 0.124 0.105 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0446 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 5.66e-01 0.0674 0.117 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.32e-01 0.144 0.095 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 2.41e-01 -0.161 0.137 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 9.53e-01 0.00695 0.118 0.121 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 4.18e-01 -0.098 0.121 0.121 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0544 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0377 0.106 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.98e-01 -0.013 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.138 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0839 0.112 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 2.06e-01 -0.112 0.088 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00329 0.135 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0375 0.132 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 6.57e-01 0.0519 0.117 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 5.69e-01 0.0865 0.152 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0275 0.0787 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.43e-01 0.144 0.098 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.20e-03 -0.33 0.126 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 9.07e-01 0.0105 0.0902 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 9.21e-01 0.0103 0.103 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 1.25e-02 -0.325 0.129 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0661 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 7.07e-01 0.0423 0.113 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.22e-02 -0.293 0.143 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 4.29e-01 -0.105 0.132 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0763 0.103 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 2.97e-03 -0.399 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0625 0.133 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0458 0.111 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.71e-01 0.128 0.0932 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.21e-01 -0.135 0.136 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 3.14e-01 -0.133 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.61e-01 0.0848 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.02e-01 0.0317 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.27e-01 0.0132 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 2.87e-02 -0.279 0.127 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0646 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0913 0.149 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0869 0.122 0.117 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0571 0.13 0.117 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 6.47e-01 0.048 0.105 0.117 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.12e-01 0.0156 0.141 0.117 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0371 0.13 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.31e-01 0.0427 0.0889 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0384 0.107 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0706 0.146 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 3.00e-01 -0.147 0.141 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 1.94e-01 -0.096 0.0737 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.98e-01 0.139 0.108 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.46e-02 -0.3 0.148 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 2.83e-01 -0.132 0.123 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 2.90e-01 0.102 0.0957 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0547 0.117 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.96e-01 -0.127 0.149 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0437 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.42e-01 0.0605 0.0786 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 1.10e-01 -0.197 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.36e-01 -0.138 0.143 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 1.37e-01 -0.198 0.132 0.1 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0331 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.04e-01 -0.156 0.186 0.1 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 9.65e-02 0.149 0.0894 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 8.78e-01 0.0182 0.119 0.12 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.11 0.12 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0878 0.14 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.33e-01 -0.054 0.113 0.12 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 6.57e-01 0.0457 0.103 0.12 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0634 0.146 0.12 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0189 0.141 0.122 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 9.16e-01 0.0131 0.124 0.122 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 4.97e-01 -0.079 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 1.21e-02 0.318 0.125 0.122 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 4.44e-01 0.0597 0.0779 0.122 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00296 0.142 0.122 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -151086 sc-eQTL 5.50e-01 0.0304 0.0508 0.122 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 4.21e-02 -0.277 0.136 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 9.67e-01 0.00529 0.126 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0595 0.115 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00397 0.0636 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 3.48e-01 -0.087 0.0925 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 7.21e-01 0.0482 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 3.30e-01 -0.125 0.128 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0572 0.118 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.11e-01 0.016 0.0668 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0104 0.11 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 1.32e-01 -0.234 0.154 0.133 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 4.24e-02 -0.276 0.135 0.133 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0311 0.0906 0.133 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 2.65e-01 -0.183 0.163 0.133 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0737 0.134 0.122 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 3.34e-01 0.122 0.126 0.122 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 8.54e-01 0.0216 0.117 0.122 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0372 0.0675 0.122 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0158 0.113 0.122 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0807 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 1.02e-01 0.191 0.116 0.12 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 8.96e-02 -0.161 0.0942 0.12 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 7.94e-01 0.0197 0.0754 0.12 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.27e-01 -0.107 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0758 0.0864 0.127 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 1.57e-01 -0.163 0.115 0.127 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 807781 sc-eQTL 7.88e-02 0.228 0.129 0.127 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 5.83e-01 0.0555 0.101 0.127 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.44e-02 -0.287 0.142 0.127 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -151086 sc-eQTL 3.60e-01 0.0993 0.108 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 9.37e-01 0.0083 0.105 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 7.07e-01 0.0325 0.0864 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 6.77e-02 -0.246 0.134 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0531 0.102 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0504 0.0919 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0366 0.129 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 7.99e-02 -0.234 0.133 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0359 0.128 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0469 0.107 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00801 0.0548 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0682 0.09 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 4.29e-01 -0.108 0.136 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 405327 sc-eQTL 1.98e-01 0.159 0.123 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0742 0.083 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0387 0.0635 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 2.32e-01 -0.138 0.116 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 132224 sc-eQTL 1.24e-01 -0.213 0.138 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 485122 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0411 0.065 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -239638 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00577 0.101 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 132289 sc-eQTL 4.68e-02 -0.285 0.142 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 304657 pQTL 0.00933 0.0512 0.0197 0.0 0.0 0.117
ENSG00000162433 AK4 405327 eQTL 0.0164 -0.0789 0.0328 0.0 0.0 0.12
ENSG00000213625 LEPROT 132289 eQTL 0.00232 -0.0868 0.0284 0.0 0.0 0.12

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina