logo

Genes within 1Mb (chr1:65550522:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0697 0.0856 0.118 B L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 6.27e-01 0.0436 0.0895 0.118 B L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.118 B L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0641 0.0822 0.118 CD4T L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 2.46e-01 0.114 0.0979 0.118 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 8.14e-04 -0.426 0.125 0.118 CD4T L1
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 3.97e-02 -0.283 0.137 0.118 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 3.18e-01 -0.107 0.107 0.118 CD8T L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 2.05e-01 0.116 0.0909 0.118 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 1.85e-02 -0.332 0.14 0.118 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 9.91e-01 0.00149 0.14 0.122 DC L1
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 3.52e-01 -0.109 0.117 0.122 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.98e-01 -0.025 0.0976 0.122 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 1.90e-02 0.292 0.123 0.122 DC L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 2.31e-01 0.0906 0.0754 0.122 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 1.24e-01 -0.213 0.138 0.122 DC L1
ENSG00000285079 AL513493.1 -153440 sc-eQTL 3.26e-01 0.0732 0.0743 0.122 DC L1
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 3.12e-02 -0.299 0.138 0.118 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0072 0.127 0.118 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0403 0.0908 0.118 Mono L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0124 0.0503 0.118 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0803 0.0898 0.118 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 7.19e-02 -0.247 0.136 0.116 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0244 0.0649 0.116 NK L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00397 0.0886 0.116 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.06e-02 -0.341 0.146 0.116 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0334 0.0922 0.118 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0325 0.134 0.118 Other_T L1
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.24e-01 0.0223 0.1 0.118 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0393 0.145 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0769 0.163 0.102 B_Activated L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 2.24e-01 -0.157 0.129 0.102 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0568 0.17 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.71e-01 0.0864 0.12 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.23e-02 0.169 0.097 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.33e-01 -0.168 0.14 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 9.08e-01 0.014 0.121 0.119 B_Memory L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0885 0.124 0.119 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 8.37e-01 -0.029 0.141 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.108 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.54e-01 0.0192 0.104 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0355 0.141 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0779 0.114 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 2.98e-01 -0.094 0.0902 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00638 0.138 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0366 0.133 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.63e-01 0.068 0.117 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.86e-01 0.106 0.152 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0213 0.0807 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 1.39e-01 0.149 0.101 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 6.10e-03 -0.356 0.129 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 8.58e-01 0.0166 0.0926 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 7.05e-01 0.0401 0.106 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 9.19e-03 -0.347 0.132 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 5.69e-01 -0.071 0.125 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 6.96e-01 0.0451 0.115 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 6.39e-02 -0.274 0.147 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 4.24e-01 -0.108 0.135 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 3.34e-01 -0.11 0.114 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0658 0.105 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 1.88e-03 -0.428 0.136 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0748 0.137 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 8.47e-01 -0.022 0.114 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0955 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 3.24e-01 -0.138 0.139 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 2.08e-01 -0.171 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.12e-01 0.0969 0.118 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 6.18e-01 0.0648 0.13 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00745 0.147 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 2.87e-02 -0.279 0.127 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0646 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0913 0.149 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 3.97e-01 -0.106 0.125 0.115 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0582 0.134 0.115 MAIT L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 4.98e-01 0.0728 0.107 0.115 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 7.67e-01 0.0429 0.145 0.115 MAIT L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0271 0.133 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 6.63e-01 0.0399 0.0912 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0352 0.109 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0996 0.15 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 2.74e-01 -0.159 0.145 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 1.72e-01 -0.104 0.0755 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 1.73e-01 0.151 0.11 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.38e-02 -0.308 0.152 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 2.26e-01 -0.153 0.126 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 3.90e-01 0.0848 0.0984 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0556 0.12 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 3.49e-01 -0.143 0.153 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0492 0.138 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.64e-01 0.059 0.0805 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 1.63e-01 -0.176 0.126 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.00e-01 -0.188 0.146 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 1.62e-01 -0.197 0.14 0.096 PB L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 9.89e-01 0.00249 0.179 0.096 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.17e-01 -0.16 0.197 0.096 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 1.79e-01 0.124 0.0918 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 8.86e-01 0.0174 0.122 0.117 Pro_T L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0303 0.113 0.117 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.01e-01 -0.121 0.143 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0419 0.115 0.118 Treg L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 7.50e-01 0.0336 0.105 0.118 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 6.41e-01 -0.07 0.15 0.118 Treg L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00293 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 8.01e-01 0.0323 0.128 0.12 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0944 0.119 0.12 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 7.86e-03 0.346 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 3.83e-01 0.07 0.0801 0.12 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 9.21e-01 0.0145 0.146 0.12 cDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -153440 sc-eQTL 4.85e-01 0.0366 0.0523 0.12 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 4.11e-02 -0.285 0.139 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0101 0.129 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0663 0.117 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0066 0.0651 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0885 0.0946 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 7.67e-01 0.041 0.138 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 4.04e-01 -0.11 0.131 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0901 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.07e-01 0.0168 0.0684 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 8.67e-01 -0.019 0.113 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 1.34e-01 -0.241 0.16 0.13 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 4.64e-02 -0.281 0.14 0.13 gdT L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0217 0.0938 0.13 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.56e-01 -0.193 0.169 0.13 gdT L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0969 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 9.87e-01 0.00188 0.12 0.12 intMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0368 0.0691 0.12 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 8.02e-01 -0.029 0.115 0.12 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0832 0.135 0.118 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 7.86e-02 0.212 0.12 0.118 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 8.41e-02 -0.168 0.0969 0.118 ncMono L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 7.09e-01 0.0289 0.0775 0.118 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.40e-01 -0.107 0.138 0.118 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 4.86e-01 0.0954 0.137 0.124 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0837 0.0889 0.124 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 1.73e-01 -0.162 0.118 0.124 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 805427 sc-eQTL 9.72e-02 0.222 0.133 0.124 pDC L2
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.13e-01 0.068 0.104 0.124 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.78e-02 -0.291 0.146 0.124 pDC L2
ENSG00000285079 AL513493.1 -153440 sc-eQTL 4.13e-01 0.0913 0.111 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 8.53e-01 0.0199 0.108 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.72e-01 0.05 0.0884 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 9.16e-02 -0.233 0.137 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0393 0.105 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0185 0.0943 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0457 0.133 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 7.31e-02 -0.246 0.136 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0364 0.131 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0708 0.11 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0121 0.0561 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0711 0.0921 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 3.68e-01 -0.126 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 402973 sc-eQTL 1.96e-01 0.164 0.126 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0845 0.0851 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0386 0.0651 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.23e-01 -0.145 0.118 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR 129870 sc-eQTL 1.14e-01 -0.224 0.141 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 482768 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0444 0.0665 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184588 PDE4B -241992 sc-eQTL 9.80e-01 0.00263 0.103 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT 129935 sc-eQTL 2.85e-02 -0.321 0.146 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 302303 pQTL 0.00922 0.0513 0.0197 0.0 0.0 0.117
ENSG00000162433 AK4 402973 eQTL 0.0164 -0.0789 0.0328 0.0 0.0 0.12
ENSG00000213625 LEPROT 129935 eQTL 0.00232 -0.0868 0.0284 0.0 0.0 0.12

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina