logo

Genes within 1Mb (chr1:64520887:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0322 0.122 0.111 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.21e-01 0.05 0.14 0.111 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0919 0.086 0.111 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.57e-01 0.00778 0.144 0.111 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 5.84e-02 0.208 0.109 0.111 B L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0549 0.105 0.111 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 9.26e-01 0.0125 0.135 0.111 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 1.56e-01 -0.114 0.0799 0.111 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.86e-01 0.0015 0.0842 0.111 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0747 0.121 0.111 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.05e-01 0.213 0.131 0.111 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 6.95e-01 0.046 0.117 0.111 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 4.87e-01 0.0995 0.143 0.111 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.93e-01 0.0366 0.139 0.111 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 4.78e-01 -0.05 0.0704 0.111 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0829 0.111 0.111 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0849 0.139 0.111 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.43e-01 0.215 0.146 0.111 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 1.98e-01 -0.163 0.126 0.115 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0646 0.138 0.115 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 4.95e-01 -0.1 0.147 0.115 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0491 0.116 0.115 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.29e-02 -0.162 0.096 0.115 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 9.10e-01 0.014 0.124 0.115 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 4.66e-01 0.0932 0.128 0.115 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.68e-01 0.0228 0.137 0.115 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0819 0.127 0.111 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 3.63e-01 0.129 0.141 0.111 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.83e-01 0.0379 0.137 0.111 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0801 0.129 0.111 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0673 0.0922 0.111 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0214 0.0915 0.111 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0315 0.109 0.112 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0156 0.138 0.112 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.03e-01 -0.145 0.14 0.112 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0208 0.0654 0.112 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0112 0.152 0.112 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.92e-02 0.261 0.148 0.112 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 6.45e-01 0.0567 0.123 0.111 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0968 0.111 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0705 0.0936 0.111 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 5.63e-01 0.0788 0.136 0.111 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0334 0.149 0.111 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.41e-01 0.0486 0.147 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 3.53e-01 -0.164 0.176 0.099 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.75e-01 0.0461 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 3.54e-01 -0.149 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 4.87e-01 -0.106 0.153 0.099 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 3.76e-01 -0.149 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00853 0.148 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.18e-01 0.0523 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.23e-01 -0.012 0.125 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0311 0.143 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.95e-01 0.0379 0.146 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0135 0.144 0.112 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.79e-01 0.201 0.149 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0842 0.124 0.112 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 2.29e-01 0.179 0.148 0.112 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.25e-02 0.251 0.144 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0767 0.145 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 9.16e-01 -0.015 0.143 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 1.16e-01 -0.173 0.11 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 6.46e-01 -0.07 0.152 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 3.71e-01 0.129 0.144 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 2.20e-01 0.177 0.144 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0313 0.151 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 1.93e-01 -0.152 0.117 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 7.00e-01 0.058 0.15 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.01e-01 0.18 0.141 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 5.12e-01 0.0964 0.147 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 5.36e-01 -0.093 0.15 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0734 0.0544 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 2.13e-01 -0.168 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 7.35e-01 0.0484 0.143 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0827 0.155 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 2.67e-01 -0.13 0.117 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0206 0.136 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0843 0.0801 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0091 0.0819 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0789 0.134 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.55e-01 0.189 0.132 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 5.26e-01 0.0775 0.122 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.85e-01 0.191 0.144 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0649 0.114 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0276 0.0936 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0699 0.14 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.49e-01 0.00924 0.146 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.44e-01 0.0662 0.143 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0662 0.0884 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0946 0.126 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0184 0.148 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.21e-01 0.231 0.149 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 8.09e-01 0.032 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 9.58e-01 0.00742 0.139 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0442 0.148 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0352 0.0627 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0662 0.117 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00459 0.152 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.07e-02 0.249 0.142 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 1.62e-01 0.186 0.132 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 4.84e-01 0.0968 0.138 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.74e-01 0.123 0.138 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0211 0.0958 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0602 0.115 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00116 0.13 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 9.01e-01 0.0176 0.141 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 4.25e-01 -0.115 0.144 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0328 0.138 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.79e-02 0.258 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 2.71e-01 0.0817 0.0741 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 2.55e-02 -0.266 0.118 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 2.09e-01 -0.181 0.144 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 5.60e-01 -0.087 0.149 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 1.68e-01 -0.21 0.152 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00451 0.131 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 5.60e-01 0.0899 0.154 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0352 0.0313 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0922 0.148 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 4.71e-01 -0.108 0.149 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.67e-03 0.455 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.93e-01 0.0367 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.58e-01 0.062 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0726 0.126 0.11 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 3.41e-01 0.128 0.134 0.11 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.38e-01 0.0112 0.144 0.11 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0201 0.146 0.11 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.139 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 6.51e-01 0.06 0.132 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.35e-01 0.215 0.143 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 6.42e-01 0.0423 0.0907 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 3.20e-01 0.141 0.142 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.79e-02 0.254 0.148 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 8.31e-01 0.0243 0.114 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.146 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.08e-01 -0.148 0.145 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.03e-01 0.00931 0.0765 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 7.93e-01 0.041 0.157 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.71e-02 0.34 0.153 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 1.62e-01 -0.215 0.153 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0812 0.128 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.50e-01 -0.214 0.148 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.43e-01 0.0764 0.0994 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 9.52e-01 0.00859 0.142 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 4.99e-01 -0.104 0.154 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.15e-01 0.0133 0.124 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0759 0.141 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.53e-01 -0.128 0.138 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 8.26e-01 0.0181 0.082 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 1.51e-01 -0.211 0.146 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 5.57e-01 0.0878 0.149 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.06e-01 0.0205 0.174 0.1 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0707 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 2.79e-01 0.139 0.128 0.1 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 2.91e-01 -0.197 0.186 0.1 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.32e-01 0.0382 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 2.22e-01 -0.161 0.131 0.113 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 5.34e-01 0.0736 0.118 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.09e-01 -0.077 0.0931 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 8.18e-01 0.0283 0.123 0.113 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0801 0.137 0.113 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0127 0.145 0.113 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 1.82e-03 -0.432 0.137 0.111 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 7.96e-01 0.038 0.147 0.111 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 50758 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0961 0.111 0.111 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0253 0.118 0.111 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 3.13e-01 -0.142 0.14 0.111 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0258 0.153 0.111 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 5.41e-02 -0.269 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 2.85e-01 -0.155 0.145 0.112 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 5.36e-01 0.0952 0.154 0.112 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 6.04e-01 0.0667 0.128 0.112 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 1.25e-01 -0.184 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0857 0.132 0.112 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 1.60e-01 0.173 0.123 0.112 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.93e-01 0.19 0.145 0.112 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 4.39e-01 -0.102 0.132 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 4.67e-01 0.103 0.141 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.78e-01 -0.122 0.138 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0907 0.13 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0129 0.118 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0108 0.0957 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.52e-01 -0.046 0.146 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0796 0.139 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 8.52e-01 0.0249 0.134 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 5.07e-02 -0.257 0.131 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 7.68e-02 -0.215 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0792 0.114 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0579 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.68e-01 0.0724 0.168 0.121 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.00e-01 0.0213 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 7.06e-02 -0.268 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 8.34e-01 0.0347 0.166 0.121 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.25e-01 0.0628 0.178 0.121 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.96e-01 0.000719 0.149 0.111 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 5.51e-01 0.0833 0.139 0.111 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.87e-01 0.06 0.149 0.111 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 7.77e-01 0.0372 0.131 0.111 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.08e-01 0.0141 0.122 0.111 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.53e-01 0.0369 0.117 0.111 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0345 0.133 0.115 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 2.41e-01 0.161 0.137 0.115 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.76e-01 0.19 0.14 0.115 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 2.39e-02 0.275 0.121 0.115 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0635 0.0989 0.115 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.73e-01 0.154 0.14 0.115 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0785 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 6.40e-01 -0.065 0.139 0.124 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 9.90e-02 -0.247 0.149 0.124 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 5.16e-01 0.0588 0.0903 0.124 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 6.63e-01 0.0527 0.121 0.124 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -224208 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00412 0.136 0.124 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 6.88e-01 0.0533 0.133 0.124 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 7.61e-01 0.0456 0.15 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0154 0.138 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 3.19e-01 0.14 0.141 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 7.26e-01 -0.039 0.111 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 8.35e-01 0.0307 0.147 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.08e-01 0.18 0.142 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 7.22e-01 0.0508 0.143 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0134 0.148 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 1.43e-01 -0.157 0.107 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0654 0.149 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 3.48e-01 0.128 0.136 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 4.25e-01 -0.108 0.136 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 9.34e-01 0.0115 0.14 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0636 0.135 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 2.18e-01 -0.164 0.133 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0913 0.112 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0668 0.0937 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 9.62e-01 0.00606 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 3.00e-01 0.144 0.139 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 1.36e-01 0.211 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -626662 sc-eQTL 9.35e-02 0.211 0.125 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0239 0.0847 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 2.58e-01 0.134 0.118 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 927476 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0504 0.111 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -899765 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0472 0.142 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 927166 sc-eQTL 2.64e-01 -0.157 0.14 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -546867 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00618 0.0668 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 997515 sc-eQTL 4.57e-01 -0.116 0.155 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -899700 sc-eQTL 1.22e-01 0.228 0.147 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 -727332 eQTL 0.0696 0.0864 0.0476 0.00102 0.0 0.104
ENSG00000158966 CACHD1 50758 eQTL 0.0157 -0.113 0.0467 0.0 0.0 0.104
ENSG00000185483 ROR1 746870 pQTL 0.0195 0.0501 0.0214 0.001 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina