logo

Genes within 1Mb (chr1:64509926:CAT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0208 0.119 0.113 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.54e-01 0.081 0.137 0.113 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0668 0.0841 0.113 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 7.66e-01 0.0417 0.14 0.113 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.12e-01 0.171 0.107 0.113 B L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.61e-01 -0.045 0.102 0.113 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 7.07e-01 0.0493 0.131 0.113 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 1.79e-01 -0.105 0.078 0.113 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 7.93e-01 0.0216 0.0821 0.113 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0574 0.118 0.113 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.24e-01 0.197 0.128 0.113 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.91e-01 0.0454 0.114 0.113 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 5.88e-01 0.0754 0.139 0.113 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.28e-01 0.0656 0.135 0.113 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0414 0.0685 0.113 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0683 0.108 0.113 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0703 0.135 0.113 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.92e-01 0.186 0.143 0.113 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 2.16e-01 -0.152 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0685 0.134 0.117 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0794 0.143 0.117 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0572 0.113 0.117 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.01e-02 -0.164 0.0933 0.117 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 9.27e-01 0.011 0.12 0.117 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 4.45e-01 0.0949 0.124 0.117 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 9.30e-01 0.0117 0.133 0.117 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0601 0.124 0.113 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 3.13e-01 0.139 0.137 0.113 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.93e-01 0.0715 0.134 0.113 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0793 0.126 0.113 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0779 0.0897 0.113 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.22e-01 -0.02 0.089 0.113 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0294 0.106 0.114 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0344 0.134 0.114 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 4.35e-01 -0.107 0.136 0.114 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0148 0.0635 0.114 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00595 0.148 0.114 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.12e-01 0.23 0.144 0.114 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.06e-01 0.0618 0.12 0.113 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0269 0.0943 0.113 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0787 0.0912 0.113 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.133 0.113 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0102 0.145 0.113 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 7.20e-01 0.0515 0.143 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 2.37e-01 -0.2 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.23e-01 0.0765 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0876 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 4.54e-01 -0.11 0.147 0.102 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 4.57e-01 -0.121 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0244 0.143 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.97e-01 0.0742 0.14 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 9.91e-01 0.00144 0.121 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.74e-01 0.00454 0.139 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.91e-01 0.0195 0.142 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.74e-01 0.0222 0.141 0.114 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.83e-01 0.194 0.145 0.114 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0601 0.121 0.114 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 1.84e-01 0.192 0.144 0.114 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 5.83e-02 0.266 0.14 0.114 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0695 0.141 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 8.07e-01 0.034 0.139 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 1.47e-01 -0.156 0.107 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0797 0.148 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 5.28e-01 0.0887 0.14 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 1.68e-01 0.194 0.141 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0278 0.148 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 2.07e-01 -0.145 0.114 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.47e-01 0.0674 0.147 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 3.20e-01 0.138 0.138 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 5.79e-01 0.079 0.142 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0696 0.146 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0696 0.0527 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.13 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 7.57e-01 0.0428 0.138 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0594 0.15 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 3.17e-01 -0.115 0.114 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 9.25e-01 0.0125 0.132 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0787 0.0781 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 9.25e-01 0.00752 0.0799 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0686 0.131 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 2.04e-01 0.164 0.129 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 4.91e-01 0.0821 0.119 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.04e-01 0.228 0.14 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0743 0.111 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000626 0.0912 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0311 0.136 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 6.89e-01 0.0531 0.132 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0129 0.142 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.35e-01 0.0662 0.139 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0691 0.0859 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 4.01e-01 -0.103 0.122 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00733 0.144 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.51e-01 0.209 0.145 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.23e-01 0.0289 0.129 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 9.83e-01 0.00281 0.136 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0239 0.144 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0355 0.061 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0653 0.114 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.33e-01 0.0123 0.148 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.17e-01 0.218 0.138 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 1.44e-01 0.189 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 5.69e-01 0.0768 0.135 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 2.91e-01 0.142 0.134 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0175 0.0933 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0398 0.112 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00456 0.127 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00229 0.137 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 3.24e-01 -0.138 0.14 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0522 0.134 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.77e-02 0.25 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 8.52e-02 0.124 0.0716 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 3.20e-02 -0.248 0.115 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 1.61e-01 -0.196 0.139 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 4.39e-01 -0.112 0.145 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 1.29e-01 -0.224 0.147 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0287 0.128 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 4.42e-01 0.115 0.15 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0343 0.0304 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0866 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0827 0.145 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 3.60e-03 0.429 0.145 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.67e-01 0.0228 0.136 0.113 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.54e-01 0.0612 0.136 0.113 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0874 0.123 0.113 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.131 0.113 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 7.76e-01 0.04 0.14 0.113 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0153 0.142 0.113 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 3.06e-01 0.139 0.135 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 7.84e-01 0.0353 0.129 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 9.65e-02 0.232 0.139 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 6.33e-01 0.0422 0.0881 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 2.72e-01 0.152 0.138 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 7.05e-02 0.261 0.144 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 7.96e-01 0.0285 0.11 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 8.01e-01 0.0359 0.142 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 4.37e-01 -0.109 0.141 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.37e-01 0.0153 0.0743 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 8.81e-01 0.0227 0.152 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 4.62e-02 0.299 0.149 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 1.77e-01 -0.201 0.148 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 5.29e-01 -0.078 0.124 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.69e-01 -0.198 0.144 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 3.95e-01 0.0821 0.0963 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 9.12e-01 0.0152 0.137 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 4.75e-01 -0.107 0.149 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.76e-01 0.00363 0.121 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0787 0.137 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 4.19e-01 -0.108 0.134 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.08e-01 0.0194 0.0797 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 1.68e-01 -0.197 0.142 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 6.08e-01 0.0744 0.145 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.06e-01 0.0205 0.174 0.1 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0707 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 2.79e-01 0.139 0.128 0.1 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 2.91e-01 -0.197 0.186 0.1 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.32e-01 0.0382 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 2.76e-01 -0.14 0.128 0.115 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.62e-01 0.0503 0.115 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0879 0.0905 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 9.38e-01 0.00932 0.12 0.115 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0956 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0233 0.141 0.115 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 2.20e-03 -0.413 0.133 0.113 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.90e-01 0.077 0.143 0.113 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 39797 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0661 0.108 0.113 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 9.27e-01 0.0106 0.115 0.113 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 3.20e-01 -0.136 0.137 0.113 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00972 0.149 0.113 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.03e-02 -0.254 0.135 0.115 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 2.38e-01 -0.166 0.14 0.115 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.149 0.115 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 7.16e-01 0.0454 0.124 0.115 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 1.02e-01 -0.189 0.115 0.115 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.127 0.115 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 2.16e-01 0.148 0.119 0.115 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 2.39e-01 0.166 0.141 0.115 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0861 0.128 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 4.18e-01 0.112 0.137 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 5.48e-01 -0.081 0.135 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0912 0.127 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0296 0.115 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0147 0.0931 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0238 0.142 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0535 0.135 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.35e-01 0.0618 0.13 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 6.17e-02 -0.239 0.127 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 4.46e-02 -0.237 0.117 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0573 0.111 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0496 0.153 0.124 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 7.72e-01 0.0471 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.91e-01 0.0223 0.163 0.124 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 5.43e-02 -0.275 0.142 0.124 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 7.46e-01 0.0519 0.16 0.124 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 6.72e-01 0.0729 0.172 0.124 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00404 0.145 0.113 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 6.66e-01 0.0586 0.136 0.113 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 6.55e-01 0.0648 0.145 0.113 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 9.04e-01 0.0154 0.128 0.113 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.35e-01 0.0246 0.118 0.113 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.46e-01 0.0222 0.114 0.113 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0112 0.129 0.118 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 2.34e-01 0.159 0.133 0.118 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.42e-01 0.2 0.136 0.118 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 1.92e-02 0.277 0.117 0.118 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0504 0.0962 0.118 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 3.01e-01 0.141 0.136 0.118 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0618 0.145 0.127 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0482 0.134 0.127 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.27e-01 -0.221 0.144 0.127 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 5.53e-01 0.052 0.0876 0.127 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 7.03e-01 0.0447 0.117 0.127 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -235169 sc-eQTL 8.36e-01 0.0274 0.132 0.127 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.19e-01 0.064 0.129 0.127 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 8.25e-01 0.0322 0.145 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0143 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 2.65e-01 0.153 0.137 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0149 0.108 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.10e-01 0.0728 0.143 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 2.01e-01 0.178 0.138 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.47e-01 0.0638 0.139 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 8.51e-01 0.0272 0.144 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 1.82e-01 -0.139 0.104 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0629 0.145 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 5.65e-01 0.0763 0.132 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0843 0.132 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 8.23e-01 0.0305 0.136 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0208 0.132 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 2.22e-01 -0.159 0.13 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 2.94e-01 -0.114 0.109 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0614 0.0911 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 8.61e-01 0.0217 0.124 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.135 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 1.13e-01 0.219 0.138 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -637623 sc-eQTL 1.09e-01 0.196 0.122 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0148 0.0825 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 3.06e-01 0.118 0.115 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 916515 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0493 0.107 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -910726 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0571 0.138 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 916205 sc-eQTL 3.57e-01 -0.126 0.136 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -557828 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00163 0.0648 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 986554 sc-eQTL 4.60e-01 -0.112 0.151 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -910661 sc-eQTL 1.80e-01 0.192 0.143 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 -738293 eQTL 0.0694 0.0868 0.0478 0.00102 0.0 0.102
ENSG00000158966 CACHD1 39797 eQTL 0.018 -0.111 0.0469 0.0 0.0 0.102
ENSG00000185483 ROR1 735909 pQTL 0.017 0.0513 0.0215 0.00112 0.0 0.1

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina