logo

Genes within 1Mb (chr1:64468452:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.72e-01 -0.139 0.126 0.096 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 3.43e-01 0.138 0.145 0.096 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0552 0.0891 0.096 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.28e-01 0.0517 0.148 0.096 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 4.54e-01 0.0854 0.114 0.096 B L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0858 0.108 0.096 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.40e-01 0.0461 0.139 0.096 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0843 0.0828 0.096 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00224 0.087 0.096 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00139 0.125 0.096 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 4.07e-02 0.277 0.135 0.096 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00123 0.122 0.096 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 3.04e-02 0.32 0.147 0.096 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0403 0.144 0.096 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 7.12e-01 -0.027 0.0731 0.096 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0861 0.115 0.096 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0508 0.144 0.096 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.06e-02 0.258 0.152 0.096 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.15e-01 -0.163 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 4.75e-01 -0.103 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0611 0.152 0.099 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 8.89e-01 0.0168 0.121 0.099 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.15e-01 -0.101 0.1 0.099 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 5.61e-01 0.0747 0.128 0.099 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 4.42e-01 0.102 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0118 0.142 0.099 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 1.27e-01 -0.201 0.131 0.096 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 4.01e-01 0.123 0.146 0.096 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 8.38e-01 0.0291 0.142 0.096 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 7.78e-01 0.0379 0.134 0.096 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 2.85e-01 -0.102 0.0955 0.096 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.08e-01 0.0355 0.0948 0.096 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0885 0.111 0.097 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0168 0.142 0.097 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.097 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0985 0.0665 0.097 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.83e-01 -0.043 0.156 0.097 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 1.23e-01 0.235 0.152 0.097 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 7.42e-01 0.0424 0.128 0.096 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0758 0.101 0.096 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 8.38e-01 -0.02 0.0979 0.096 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 4.06e-01 0.118 0.142 0.096 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0523 0.156 0.096 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00293 0.154 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.28e-02 -0.346 0.185 0.087 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0426 0.171 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 4.46e-01 -0.13 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 8.66e-02 -0.277 0.161 0.087 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 1.95e-01 -0.231 0.178 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0551 0.15 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 2.96e-01 0.153 0.146 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.65e-01 0.115 0.126 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00658 0.145 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0471 0.149 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.57e-02 -0.271 0.147 0.097 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.44e-01 0.117 0.153 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.92e-01 -0.109 0.127 0.097 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0545 0.152 0.097 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.05e-01 0.0561 0.148 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0286 0.149 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 6.65e-01 0.0637 0.147 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.113 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 4.14e-01 0.128 0.157 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.74e-01 0.132 0.148 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 8.05e-01 0.0373 0.151 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.85e-01 0.043 0.158 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.60e-01 -0.112 0.122 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.09e-01 0.0587 0.157 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 1.27e-01 0.225 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 1.06e-01 0.247 0.152 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 6.00e-01 -0.082 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0678 0.0566 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0971 0.14 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 3.55e-01 0.138 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0388 0.161 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.40e-01 -0.142 0.121 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 8.19e-01 0.0321 0.14 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0515 0.0827 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0354 0.0844 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0044 0.139 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 5.16e-02 0.266 0.136 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 5.31e-01 0.0793 0.126 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 9.58e-02 0.248 0.148 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0229 0.118 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0422 0.0967 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0301 0.144 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 4.93e-01 0.0963 0.14 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0894 0.15 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 9.27e-01 0.0136 0.147 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0938 0.0907 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 2.43e-01 -0.151 0.129 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0514 0.152 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.77e-01 0.136 0.153 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0668 0.138 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.73e-01 0.0613 0.145 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 1.92e-01 -0.201 0.153 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0369 0.0653 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0415 0.122 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 4.15e-01 -0.129 0.158 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.53e-01 0.139 0.149 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.71e-01 0.152 0.138 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 3.98e-01 0.121 0.144 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 5.18e-01 0.0929 0.144 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00598 0.0996 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0544 0.12 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.05e-01 0.0513 0.135 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 2.34e-01 0.175 0.146 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 3.17e-01 -0.15 0.149 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 3.49e-01 0.134 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 1.74e-01 0.2 0.146 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 1.28e-01 0.118 0.0768 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 5.88e-02 -0.234 0.123 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 1.05e-01 -0.242 0.149 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0986 0.155 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 1.37e-01 -0.242 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0603 0.14 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 9.83e-01 0.00362 0.165 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0244 0.0335 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.81e-01 -0.212 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0326 0.16 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 2.72e-02 0.36 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00607 0.146 0.095 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0269 0.146 0.095 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 8.01e-01 0.0333 0.132 0.095 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 1.37e-01 0.209 0.14 0.095 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0313 0.151 0.095 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.48e-01 -0.143 0.152 0.095 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 4.44e-01 0.109 0.143 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 8.44e-01 0.0268 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 5.52e-01 0.0878 0.147 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 6.60e-01 0.041 0.0929 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 1.46e-01 0.211 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.78e-02 0.252 0.152 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0489 0.116 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 5.91e-01 0.0806 0.15 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 2.93e-01 -0.156 0.148 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0936 0.0781 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 8.17e-01 0.0372 0.16 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 5.11e-02 0.308 0.157 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.35e-01 -0.189 0.158 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00449 0.132 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 5.17e-02 -0.298 0.152 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000551 0.103 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0454 0.146 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 4.29e-01 -0.126 0.159 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0165 0.128 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0627 0.145 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0529 0.142 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0842 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 2.47e-02 -0.338 0.149 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 5.74e-01 0.0865 0.154 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00607 0.183 0.085 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.58e-01 -0.133 0.178 0.085 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 7.23e-01 0.0479 0.135 0.085 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 4.61e-01 -0.145 0.196 0.085 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 8.69e-01 0.0313 0.189 0.085 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 3.15e-01 -0.137 0.136 0.098 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 1.53e-01 0.174 0.122 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0746 0.0962 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00592 0.127 0.098 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 1.52e-01 -0.203 0.141 0.098 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0393 0.15 0.098 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 4.20e-04 -0.502 0.14 0.096 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.97e-01 -0.039 0.151 0.096 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -1677 sc-eQTL 1.53e-01 -0.163 0.114 0.096 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 5.28e-01 0.077 0.122 0.096 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 2.73e-01 -0.159 0.145 0.096 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 2.96e-01 -0.165 0.158 0.096 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.11e-02 -0.266 0.141 0.098 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 2.36e-01 -0.175 0.147 0.098 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 6.38e-01 0.0736 0.156 0.098 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 6.01e-01 0.0683 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.76e-02 -0.252 0.12 0.098 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 8.17e-01 -0.031 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 6.77e-02 0.229 0.124 0.098 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 4.22e-01 0.119 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 1.93e-01 -0.177 0.136 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 4.19e-01 0.118 0.146 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.73e-01 -0.103 0.143 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00354 0.135 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0593 0.122 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.24e-01 0.035 0.099 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 2.43e-01 -0.176 0.151 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.94e-01 0.0569 0.145 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 1.27e-01 -0.209 0.136 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.40e-02 -0.267 0.125 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0581 0.118 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0607 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0195 0.167 0.106 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.85e-01 0.00318 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 8.04e-02 -0.258 0.146 0.106 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0715 0.165 0.106 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.106 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0472 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 8.83e-01 0.0212 0.144 0.096 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 8.87e-01 0.0218 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0271 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0151 0.125 0.096 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 5.33e-01 0.0754 0.121 0.096 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0691 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 1.82e-01 0.191 0.143 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 2.92e-01 0.154 0.146 0.1 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 8.50e-04 0.421 0.124 0.1 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0249 0.103 0.1 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.85e-01 0.127 0.146 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 9.53e-01 0.00905 0.155 0.107 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0404 0.144 0.107 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 7.96e-01 0.0402 0.155 0.107 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 9.74e-01 0.00302 0.0936 0.107 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.96e-01 0.162 0.124 0.107 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -276643 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.107 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 6.54e-01 0.0617 0.137 0.107 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.00e-01 0.0195 0.155 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.40e-02 -0.261 0.14 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 3.00e-01 0.149 0.144 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00488 0.114 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 3.83e-01 -0.131 0.15 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 8.76e-01 0.0228 0.146 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0155 0.148 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.57e-01 0.114 0.154 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.111 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 6.31e-01 0.0744 0.155 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 3.48e-01 0.132 0.141 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 1.28e-01 -0.213 0.14 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.31e-01 0.0696 0.145 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0134 0.14 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0481 0.138 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.96e-01 -0.15 0.115 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 9.99e-01 6.91e-05 0.0971 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0627 0.133 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 6.30e-01 0.0695 0.144 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 4.70e-01 0.107 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -679097 sc-eQTL 6.42e-02 0.241 0.13 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00106 0.0879 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 1.56e-01 0.173 0.122 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 875041 sc-eQTL 3.24e-01 -0.112 0.113 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -952200 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0315 0.146 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 874731 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -599302 sc-eQTL 1.24e-01 -0.105 0.068 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 945080 sc-eQTL 2.34e-01 -0.189 0.159 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -952135 sc-eQTL 1.87e-01 0.2 0.151 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116678 LEPR -952200 eQTL 0.0473 0.0778 0.0392 0.0 0.0 0.0883

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina