logo

Genes within 1Mb (chr1:64463538:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 5.16e-02 -0.223 0.114 0.135 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.00e-02 -0.284 0.13 0.135 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 7.14e-01 0.0297 0.081 0.135 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.38e-01 -0.2 0.134 0.135 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.73e-01 0.0744 0.103 0.135 B L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 4.58e-01 0.0739 0.0995 0.135 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 5.18e-01 0.0825 0.127 0.135 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 4.08e-01 0.063 0.076 0.135 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 2.98e-01 0.083 0.0796 0.135 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 5.38e-01 0.0705 0.114 0.135 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00474 0.125 0.135 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 2.12e-01 0.134 0.107 0.135 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 4.18e-01 0.106 0.131 0.135 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.78e-02 -0.217 0.127 0.135 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0476 0.0644 0.135 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.94e-03 0.277 0.0998 0.135 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0977 0.127 0.135 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.37e-01 0.105 0.134 0.135 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 5.88e-01 0.0678 0.125 0.137 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 6.55e-01 -0.061 0.136 0.137 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 6.54e-02 -0.266 0.144 0.137 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0878 0.115 0.137 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 7.79e-01 0.0269 0.0955 0.137 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 9.38e-01 0.00957 0.122 0.137 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 7.65e-01 0.0377 0.126 0.137 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 7.90e-01 -0.036 0.135 0.137 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.19e-01 0.0271 0.118 0.135 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 3.71e-01 0.118 0.131 0.135 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0967 0.127 0.135 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0718 0.12 0.135 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 7.22e-01 0.0305 0.0857 0.135 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 1.57e-02 -0.204 0.0837 0.135 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 9.56e-01 0.0056 0.102 0.135 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 5.05e-02 0.252 0.128 0.135 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 7.03e-01 0.0499 0.131 0.135 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0045 0.061 0.135 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 2.48e-01 -0.164 0.142 0.135 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 1.81e-01 -0.186 0.139 0.135 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0281 0.114 0.135 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 2.86e-02 -0.195 0.0884 0.135 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 3.95e-01 0.0736 0.0865 0.135 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 1.42e-01 -0.185 0.125 0.135 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0502 0.138 0.135 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 2.17e-01 0.168 0.136 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0477 0.161 0.12 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.88e-01 0.0209 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0294 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.55e-01 0.199 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0112 0.154 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 3.56e-01 0.128 0.138 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.31e-02 -0.272 0.134 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 4.58e-01 0.0867 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0605 0.134 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.02e-02 0.28 0.135 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00723 0.138 0.134 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 2.90e-01 -0.151 0.143 0.134 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.79e-01 0.16 0.118 0.134 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 5.87e-01 0.0771 0.142 0.134 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.14e-01 0.113 0.138 0.134 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 2.11e-01 -0.169 0.135 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 1.26e-01 -0.204 0.133 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.08e-01 0.166 0.103 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 6.38e-02 -0.263 0.141 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0328 0.135 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0332 0.136 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 6.85e-01 0.0578 0.142 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 2.21e-01 0.135 0.11 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 6.12e-01 0.0718 0.142 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.46e-01 0.00896 0.133 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 2.42e-01 0.158 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 5.58e-01 0.0808 0.138 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 1.13e-01 0.0792 0.0497 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 2.27e-01 0.149 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 8.36e-01 -0.027 0.131 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 1.47e-01 0.205 0.141 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 4.46e-01 0.0852 0.112 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 2.93e-01 0.136 0.129 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 2.22e-01 0.0933 0.0761 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.37e-01 0.116 0.0776 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 2.70e-01 0.141 0.128 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.07e-01 0.0148 0.126 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00708 0.116 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.49e-01 0.0261 0.137 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0862 0.108 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.62e-01 0.0517 0.0888 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 3.61e-01 -0.121 0.132 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0999 0.129 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.25e-01 0.0482 0.137 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0659 0.134 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 5.35e-01 0.0515 0.0829 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 3.14e-02 0.253 0.117 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 5.85e-01 0.076 0.139 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.10e-01 0.0158 0.14 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.124 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 2.71e-01 0.144 0.13 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 2.31e-01 -0.165 0.138 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 6.72e-02 0.107 0.0581 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 6.77e-02 0.199 0.109 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.66e-01 -0.196 0.141 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 3.25e-03 0.39 0.131 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.55e-01 0.0392 0.125 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 6.37e-01 0.0617 0.13 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.40e-01 -0.124 0.13 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 9.13e-01 0.00987 0.0905 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.56e-02 0.208 0.108 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0926 0.123 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 6.78e-01 0.0555 0.133 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 1.20e-01 0.22 0.141 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0933 0.135 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 9.47e-02 -0.232 0.138 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0801 0.0729 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.14e-01 0.0769 0.117 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.33e-01 0.213 0.141 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0495 0.147 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 9.34e-02 0.24 0.143 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00531 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 1.85e-01 -0.193 0.145 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 2.89e-01 0.0314 0.0295 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 6.74e-03 0.376 0.137 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 4.52e-01 -0.106 0.141 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.07e-01 0.0168 0.144 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 6.61e-01 0.0581 0.132 0.136 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0397 0.133 0.136 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.91e-02 0.279 0.118 0.136 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 2.57e-01 -0.145 0.127 0.136 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00844 0.137 0.136 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 3.93e-01 0.118 0.138 0.136 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 3.84e-02 -0.271 0.13 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 4.58e-02 0.249 0.124 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0524 0.136 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 9.33e-01 0.00724 0.0857 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 2.60e-01 0.151 0.134 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 1.21e-01 -0.218 0.14 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0811 0.106 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 1.08e-01 0.219 0.136 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000157 0.135 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0143 0.0713 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 8.98e-02 -0.247 0.145 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 3.12e-01 -0.146 0.144 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0486 0.141 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 9.45e-03 0.301 0.115 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.89e-02 0.267 0.135 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 4.49e-01 0.069 0.091 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0292 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00174 0.141 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 5.60e-03 0.311 0.111 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 5.13e-01 0.0841 0.128 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.43e-01 0.0249 0.126 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 4.16e-01 0.0608 0.0746 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 8.60e-01 0.0236 0.134 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 7.78e-01 0.0384 0.136 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 1.10e-01 -0.246 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.56e-01 -0.139 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.83e-01 0.0626 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 4.32e-01 0.13 0.165 0.133 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 7.43e-01 0.0524 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 3.40e-01 -0.118 0.123 0.137 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.03e-01 -0.114 0.11 0.137 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0712 0.0869 0.137 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.137 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0659 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0313 0.135 0.137 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.80e-01 0.0362 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0768 0.136 0.135 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -6591 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0486 0.102 0.135 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 8.07e-02 0.19 0.108 0.135 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.49e-01 -0.187 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 5.24e-01 0.0903 0.141 0.135 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.30e-01 0.0472 0.137 0.132 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0483 0.142 0.132 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.10e-01 -0.036 0.15 0.132 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0649 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 2.06e-01 0.148 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0613 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.50e-01 0.173 0.12 0.132 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.31e-01 -0.112 0.142 0.132 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.62e-01 0.0211 0.122 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 7.25e-01 -0.046 0.131 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0177 0.128 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0633 0.12 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.70e-01 0.15 0.109 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 2.22e-02 -0.201 0.0874 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 4.17e-01 -0.11 0.135 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 5.53e-01 0.0766 0.129 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.99e-01 -0.105 0.124 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0615 0.122 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0706 0.113 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0563 0.106 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0539 0.152 0.133 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.38e-02 -0.324 0.159 0.133 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 9.26e-01 0.0151 0.162 0.133 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 2.52e-02 -0.318 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 3.49e-01 -0.149 0.158 0.133 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 9.38e-01 0.0132 0.171 0.133 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 1.11e-01 0.233 0.145 0.14 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 5.02e-02 -0.268 0.136 0.14 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 3.74e-01 -0.13 0.146 0.14 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0346 0.129 0.14 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 4.14e-01 0.0978 0.119 0.14 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0944 0.115 0.14 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00782 0.124 0.136 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 1.40e-01 0.189 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 6.58e-01 0.0583 0.131 0.136 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0235 0.115 0.136 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.0923 0.136 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 6.17e-01 0.0658 0.131 0.136 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0942 0.161 0.119 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 7.54e-01 0.0467 0.149 0.119 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 2.72e-02 -0.353 0.158 0.119 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 8.93e-02 0.164 0.0962 0.119 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0626 0.13 0.119 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0568 0.146 0.119 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 6.29e-01 -0.069 0.142 0.119 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.99e-01 -0.109 0.161 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.46e-01 0.0253 0.13 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.88e-02 -0.259 0.131 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 6.23e-01 0.0514 0.104 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00477 0.138 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 2.24e-02 0.304 0.132 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 1.91e-01 -0.175 0.133 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 1.63e-01 -0.193 0.138 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 1.37e-01 0.149 0.1 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.46e-01 -0.202 0.139 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0476 0.127 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0299 0.125 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 7.71e-01 0.0375 0.129 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0848 0.125 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0458 0.123 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 5.46e-01 0.0623 0.103 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 4.12e-02 -0.176 0.0856 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 3.66e-01 0.109 0.12 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 7.41e-01 0.0433 0.131 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0155 0.134 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -684011 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0494 0.118 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 3.88e-01 0.0689 0.0796 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 8.31e-01 0.0238 0.111 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 870127 sc-eQTL 5.97e-01 0.0546 0.103 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -957114 sc-eQTL 1.13e-01 0.211 0.132 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 869817 sc-eQTL 7.78e-01 0.0371 0.131 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -604216 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0133 0.0624 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 940166 sc-eQTL 1.49e-01 -0.209 0.144 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -957049 sc-eQTL 3.53e-01 -0.128 0.138 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 eQTL 0.0296 -0.0846 0.0389 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000213625 LEPROT -957049 eQTL 0.0355 0.0708 0.0336 0.0 0.0 0.0903

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162437 RAVER2 -281557 1.19e-06 1.01e-06 2.48e-07 1.11e-06 3.73e-07 6.02e-07 1.61e-06 3.99e-07 1.44e-06 6.05e-07 1.87e-06 7.84e-07 2.33e-06 2.81e-07 5.42e-07 9.37e-07 9e-07 7.78e-07 8.83e-07 6.36e-07 8.02e-07 1.69e-06 8.94e-07 5.54e-07 2.19e-06 6.42e-07 9.13e-07 9.6e-07 1.45e-06 1.24e-06 7.1e-07 2.42e-07 2.69e-07 6.58e-07 5.3e-07 4.6e-07 7.09e-07 2.78e-07 4.99e-07 2.79e-07 3.05e-07 1.58e-06 1.23e-07 1.3e-07 2.96e-07 1.71e-07 2.29e-07 8.15e-08 1.98e-07