logo

Genes within 1Mb (chr1:64462279:G:GTGTTT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 3.56e-02 -0.242 0.114 0.132 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 2.26e-02 -0.301 0.131 0.132 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 6.80e-01 0.0337 0.0815 0.132 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.51e-02 -0.25 0.135 0.132 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 5.42e-01 0.0636 0.104 0.132 B L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.71e-01 0.0426 0.1 0.132 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 6.66e-01 0.0555 0.128 0.132 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 5.86e-01 0.0417 0.0766 0.132 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 2.67e-01 0.0891 0.0801 0.132 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.63e-01 0.0503 0.115 0.132 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0135 0.126 0.132 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 2.89e-01 0.115 0.108 0.132 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 3.70e-01 0.118 0.132 0.132 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 5.22e-02 -0.248 0.127 0.132 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0499 0.0648 0.132 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.83e-03 0.28 0.1 0.132 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.46e-01 -0.121 0.128 0.132 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.84e-01 0.0949 0.135 0.132 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 4.93e-01 0.0862 0.126 0.135 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0762 0.137 0.135 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.81e-02 -0.255 0.144 0.135 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0838 0.115 0.135 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 8.03e-01 0.024 0.0958 0.135 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00129 0.123 0.135 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.96e-01 0.0495 0.126 0.135 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0373 0.136 0.135 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.71e-01 0.0345 0.119 0.132 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 4.27e-01 0.105 0.132 0.132 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.04e-01 -0.107 0.128 0.132 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0758 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 6.09e-01 0.0441 0.0859 0.132 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 2.91e-02 -0.185 0.0842 0.132 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00657 0.102 0.133 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 7.34e-02 0.232 0.129 0.133 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 8.85e-01 0.0191 0.132 0.133 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.55e-01 0.0035 0.0614 0.133 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 2.10e-01 -0.179 0.143 0.133 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.133 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0725 0.114 0.132 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 1.86e-02 -0.211 0.0888 0.132 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 3.47e-01 0.0821 0.087 0.132 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 1.48e-01 -0.183 0.126 0.132 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0664 0.139 0.132 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 2.16e-01 0.169 0.136 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0223 0.163 0.117 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.41e-01 0.0493 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0283 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 2.84e-01 0.151 0.141 0.117 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.23e-01 0.0151 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 3.65e-01 0.126 0.139 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 2.93e-02 -0.296 0.135 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.09e-01 0.0777 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0803 0.135 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 3.99e-02 0.282 0.137 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0279 0.139 0.131 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.24e-01 -0.142 0.144 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.33e-01 0.179 0.119 0.131 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.13e-01 0.0723 0.143 0.131 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.83e-01 0.0977 0.139 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 1.62e-01 -0.191 0.136 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 1.05e-01 -0.217 0.133 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.41e-02 0.173 0.103 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.04e-02 -0.309 0.142 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0654 0.135 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0637 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.44e-01 0.0469 0.143 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.111 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 5.69e-01 0.0813 0.143 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.39e-01 0.0447 0.134 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 2.47e-01 0.157 0.135 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 6.12e-01 0.0703 0.139 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 1.06e-01 0.0812 0.05 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 2.02e-01 0.158 0.124 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0403 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 1.91e-01 0.186 0.142 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.56e-01 0.0502 0.113 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.89e-01 0.112 0.13 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 3.78e-01 0.0678 0.0768 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.24e-01 0.121 0.0781 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.08e-01 0.131 0.129 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.96e-01 0.000696 0.127 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0298 0.117 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0115 0.139 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 4.83e-01 -0.077 0.11 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.10e-01 0.0592 0.0897 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.33e-01 -0.13 0.134 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0903 0.13 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.30e-01 0.0663 0.137 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0933 0.135 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 5.15e-01 0.0544 0.0834 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.70e-02 0.282 0.117 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 7.48e-01 0.045 0.14 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.66e-01 0.0421 0.141 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 4.57e-01 0.0929 0.125 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 2.54e-01 0.15 0.131 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 1.83e-01 -0.185 0.139 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 6.07e-02 0.11 0.0585 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 6.46e-02 0.203 0.109 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 1.45e-01 -0.208 0.142 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.67e-03 0.378 0.132 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.08e-01 0.0474 0.126 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 6.11e-01 0.0669 0.131 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 2.56e-01 -0.149 0.131 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 9.19e-01 0.00924 0.0911 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 4.56e-02 0.218 0.109 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.07e-01 -0.127 0.124 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 6.68e-01 0.0577 0.134 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 1.73e-01 0.194 0.142 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0692 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.90e-02 -0.275 0.139 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0785 0.0734 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 3.95e-01 0.101 0.118 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 7.76e-02 0.252 0.142 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0406 0.148 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 1.29e-01 0.219 0.144 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00376 0.125 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 1.79e-01 -0.197 0.146 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 2.98e-01 0.031 0.0298 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.93e-03 0.361 0.139 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.80e-01 -0.125 0.142 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.26e-01 0.0134 0.145 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.93e-01 0.018 0.133 0.134 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.88e-01 -0.036 0.134 0.134 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.22e-02 0.3 0.119 0.134 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 2.42e-01 -0.15 0.128 0.134 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 8.00e-01 -0.035 0.138 0.134 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.48e-01 0.105 0.139 0.134 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 5.05e-02 -0.258 0.131 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 2.49e-02 0.281 0.124 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0474 0.137 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 7.81e-01 0.0239 0.0862 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.55e-01 0.125 0.135 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 2.35e-01 -0.168 0.141 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0986 0.106 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 1.40e-01 0.203 0.137 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0391 0.136 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00813 0.0719 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 1.09e-01 -0.235 0.146 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.70e-01 -0.105 0.145 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0697 0.142 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 7.96e-03 0.311 0.116 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 6.47e-02 0.253 0.136 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 4.68e-01 0.0667 0.0918 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0357 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.59e-01 0.00728 0.143 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.91e-03 0.301 0.112 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 6.42e-01 0.0603 0.129 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 9.60e-01 0.00643 0.127 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 3.55e-01 0.0697 0.0752 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 9.70e-01 0.00515 0.135 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 6.99e-01 0.053 0.137 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 1.10e-01 -0.246 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.56e-01 -0.139 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.83e-01 0.0626 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 4.32e-01 0.13 0.165 0.133 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.43e-01 0.0524 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 3.29e-01 -0.121 0.124 0.135 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 2.49e-01 -0.128 0.111 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0858 0.0874 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 9.75e-01 0.00358 0.116 0.135 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0719 0.129 0.135 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0239 0.136 0.135 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 9.05e-01 0.0156 0.13 0.132 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0826 0.136 0.132 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -7850 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0366 0.103 0.132 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.59e-02 0.183 0.109 0.132 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 8.41e-02 -0.225 0.13 0.132 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.66e-01 0.104 0.142 0.132 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.28e-01 0.0478 0.137 0.129 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0591 0.142 0.129 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0212 0.15 0.129 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0557 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.117 0.129 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0777 0.129 0.129 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 1.33e-01 0.181 0.12 0.129 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 4.67e-01 -0.104 0.143 0.129 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 9.31e-01 0.0106 0.122 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0378 0.131 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0199 0.129 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0425 0.121 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.38e-01 0.163 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 3.09e-02 -0.191 0.0879 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0918 0.136 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 6.93e-01 0.0513 0.13 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.09e-01 -0.127 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0941 0.123 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0315 0.114 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0203 0.106 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0539 0.152 0.133 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.38e-02 -0.324 0.159 0.133 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.26e-01 0.0151 0.162 0.133 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 2.52e-02 -0.318 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 3.49e-01 -0.149 0.158 0.133 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.38e-01 0.0132 0.171 0.133 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.83e-02 0.258 0.146 0.138 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 2.29e-02 -0.312 0.136 0.138 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.43e-01 -0.139 0.147 0.138 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0242 0.13 0.138 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 6.07e-01 0.0618 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0977 0.115 0.138 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0021 0.125 0.133 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 1.41e-01 0.19 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 5.55e-01 0.078 0.132 0.133 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0161 0.115 0.133 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 2.98e-01 0.0969 0.0928 0.133 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 6.99e-01 0.0512 0.132 0.133 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0769 0.162 0.116 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 9.26e-01 0.014 0.15 0.116 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 3.16e-02 -0.347 0.16 0.116 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 7.95e-02 0.171 0.0969 0.116 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.61e-01 -0.076 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0592 0.147 0.116 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0622 0.144 0.116 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 3.89e-01 -0.14 0.162 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.80e-01 0.0198 0.131 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.54e-02 -0.265 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 6.07e-01 0.0541 0.105 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0311 0.139 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 2.33e-02 0.305 0.133 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 1.31e-01 -0.202 0.134 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 1.23e-01 -0.214 0.139 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 1.08e-01 0.162 0.1 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 8.19e-02 -0.243 0.139 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0595 0.128 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0275 0.125 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 8.12e-01 0.0307 0.129 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0988 0.125 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0517 0.124 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 4.03e-01 0.0865 0.103 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 7.72e-02 -0.153 0.0861 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 2.98e-01 0.126 0.121 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 8.48e-01 0.0252 0.131 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000704 0.134 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -685270 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0374 0.119 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 5.68e-01 0.0458 0.08 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 9.20e-01 0.0112 0.112 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 868868 sc-eQTL 7.12e-01 0.0384 0.104 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -958373 sc-eQTL 1.65e-01 0.186 0.133 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 868558 sc-eQTL 9.81e-01 0.00319 0.132 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -605475 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00706 0.0628 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 938907 sc-eQTL 1.46e-01 -0.212 0.145 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -958308 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0906 0.139 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 eQTL 0.0292 -0.0849 0.0388 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000213625 LEPROT -958308 eQTL 0.0377 0.07 0.0336 0.0 0.0 0.0903

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162437 RAVER2 -282816 1.61e-06 1.66e-06 1.31e-07 7.35e-07 1.08e-07 4.77e-07 1.38e-06 5.78e-08 8.39e-07 2.26e-07 1.86e-06 3.91e-07 1.98e-06 3e-07 3.9e-07 3.4e-07 7.22e-07 5.27e-07 8e-08 5.35e-08 2.41e-07 1.05e-06 5.21e-07 4.15e-08 1.47e-06 2.74e-07 1.78e-07 2.83e-07 8.81e-07 6.03e-07 5.26e-07 3.52e-08 3.96e-08 1.4e-07 3.01e-07 2.95e-08 5.03e-08 9.56e-08 6.43e-08 3.37e-08 3.35e-08 1.52e-06 4.12e-08 1.26e-08 2.82e-08 1.81e-08 1.19e-07 4.6e-09 4.61e-08