Genes within 1Mb (chr1:64447275:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0296 0.134 0.083 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 4.95e-01 0.105 0.154 0.083 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.41e-01 0.0443 0.0947 0.083 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.89e-01 0.0631 0.158 0.083 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00262 0.121 0.083 B L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0381 0.116 0.083 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0629 0.149 0.083 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 5.05e-01 0.0593 0.0888 0.083 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.44e-01 0.0566 0.0931 0.083 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0286 0.134 0.083 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.58e-01 0.0645 0.146 0.083 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0409 0.127 0.083 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 3.85e-01 0.135 0.155 0.083 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.34e-01 0.0126 0.151 0.083 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 1.03e-01 0.125 0.076 0.083 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.06e-01 -0.123 0.12 0.083 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 4.93e-01 -0.103 0.15 0.083 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0822 0.16 0.083 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.78e-01 -0.189 0.14 0.086 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 8.91e-01 -0.021 0.153 0.086 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 6.18e-01 0.0812 0.162 0.086 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0464 0.129 0.086 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0903 0.107 0.086 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00208 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 5.72e-01 0.0799 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.78e-01 0.165 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.73e-01 0.0403 0.14 0.083 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.155 0.083 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0261 0.151 0.083 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0881 0.142 0.083 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.74e-01 -0.09 0.101 0.083 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 5.33e-01 0.0625 0.1 0.083 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.42e-01 0.0393 0.119 0.084 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 9.53e-01 0.00893 0.152 0.084 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0331 0.154 0.084 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.00e-01 0.0742 0.0714 0.084 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 4.45e-01 -0.128 0.167 0.084 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 3.97e-02 -0.335 0.162 0.084 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 3.24e-01 0.131 0.133 0.083 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0348 0.105 0.083 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.61e-01 -0.059 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0413 0.147 0.083 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 3.19e-01 0.161 0.161 0.083 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.43e-01 0.074 0.159 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.30e-01 -0.136 0.172 0.089 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.07e-02 0.307 0.156 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.64e-01 0.0685 0.157 0.089 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 4.82e-01 -0.105 0.149 0.089 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 4.68e-01 -0.12 0.164 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 5.52e-01 0.0943 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.79e-01 0.0862 0.155 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 1.20e-01 -0.208 0.133 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 2.80e-01 0.166 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 7.69e-01 0.0461 0.157 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 2.39e-02 -0.349 0.153 0.084 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0981 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.134 0.084 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 7.08e-01 -0.06 0.16 0.084 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 8.21e-01 0.0352 0.156 0.084 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 3.81e-01 0.14 0.16 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 3.02e-01 0.163 0.157 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.05e-01 0.0629 0.122 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0681 0.168 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00879 0.159 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 2.62e-01 -0.176 0.157 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0174 0.164 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.127 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0859 0.164 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0126 0.154 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 6.56e-01 0.0715 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.164 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 6.76e-01 -0.025 0.0596 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.34e-02 0.312 0.145 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 4.53e-01 0.117 0.156 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 4.79e-01 0.12 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.80e-01 0.0921 0.13 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0554 0.15 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 3.01e-01 0.092 0.0887 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.88e-01 0.0785 0.0906 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 2.14e-01 -0.185 0.149 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 5.65e-01 0.0848 0.147 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.59e-01 -0.193 0.137 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.15e-01 0.0174 0.162 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 2.16e-01 -0.159 0.128 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 9.72e-01 0.00367 0.105 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 8.17e-01 0.0363 0.157 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.47e-01 0.0102 0.153 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.98e-01 0.0407 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 2.70e-01 0.172 0.156 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0296 0.0966 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.137 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 3.40e-01 0.155 0.162 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0142 0.163 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 6.43e-01 0.0668 0.144 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0964 0.151 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0483 0.161 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00625 0.0682 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 1.51e-01 -0.182 0.127 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 1.22e-01 0.255 0.164 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 7.03e-02 -0.281 0.154 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 3.49e-01 -0.139 0.148 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 2.22e-01 0.188 0.154 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 3.01e-01 -0.159 0.154 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 1.03e-01 0.174 0.106 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0612 0.128 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 2.18e-01 -0.179 0.145 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 9.21e-01 0.0156 0.157 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 5.29e-02 -0.329 0.169 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 9.84e-01 0.00335 0.163 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0179 0.167 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 3.69e-01 0.079 0.0877 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0621 0.141 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.14e-01 0.0861 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.40e-01 0.0827 0.176 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.27e-01 -0.247 0.161 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 5.80e-01 0.0774 0.14 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 3.36e-01 0.158 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0133 0.0334 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 2.77e-01 -0.172 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 1.87e-01 -0.21 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0419 0.163 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.38e-01 0.226 0.152 0.082 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 1.18e-01 -0.238 0.152 0.082 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 7.41e-01 0.0457 0.138 0.082 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.082 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 5.59e-01 0.0921 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.25e-01 0.0777 0.159 0.082 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.69e-01 0.217 0.157 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0834 0.15 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.19e-02 0.274 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.57e-01 0.0605 0.103 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 7.59e-03 -0.426 0.158 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 4.92e-01 -0.116 0.169 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0225 0.123 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 7.45e-01 0.0516 0.158 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0046 0.157 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 4.87e-01 0.0574 0.0826 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 2.34e-02 -0.381 0.167 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 7.20e-02 -0.3 0.166 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.18e-03 0.493 0.17 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 4.22e-01 -0.116 0.144 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 2.59e-01 -0.19 0.168 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 1.23e-02 -0.28 0.111 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 2.48e-01 0.185 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.10e-02 -0.4 0.172 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.139 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 4.85e-01 -0.11 0.158 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.76e-01 0.00469 0.154 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 9.19e-01 0.00932 0.0918 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0304 0.164 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.33e-01 -0.199 0.166 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.54e-01 0.0591 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.31e-01 -0.115 0.183 0.085 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0929 0.138 0.085 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0865 0.202 0.085 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0911 0.194 0.085 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 1.68e-01 0.199 0.144 0.083 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0282 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 6.16e-01 0.0513 0.102 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 4.07e-01 -0.112 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0512 0.151 0.083 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 1.29e-01 0.241 0.158 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 2.93e-01 -0.161 0.153 0.083 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.083 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -22854 sc-eQTL 6.75e-01 0.0511 0.122 0.083 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 1.54e-01 -0.184 0.129 0.083 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 5.20e-01 0.099 0.154 0.083 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 5.86e-01 0.0916 0.168 0.083 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.53e-01 -0.113 0.15 0.09 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 3.98e-01 -0.131 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 4.44e-01 0.126 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 3.02e-01 -0.141 0.137 0.09 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0786 0.128 0.09 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 9.06e-01 0.0167 0.141 0.09 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0254 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.62e-01 0.175 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 8.06e-02 0.253 0.144 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 3.51e-01 0.145 0.156 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 9.21e-01 0.0152 0.152 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 4.28e-01 -0.114 0.143 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0322 0.13 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 8.94e-01 -0.014 0.105 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 2.88e-01 -0.171 0.16 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 6.45e-01 0.0709 0.153 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 2.71e-01 -0.162 0.147 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0298 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.39e-02 -0.284 0.133 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 3.19e-01 0.125 0.125 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0653 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 8.31e-02 0.323 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 5.82e-02 0.355 0.186 0.082 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 3.08e-01 0.169 0.165 0.082 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 5.86e-01 0.1 0.184 0.082 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0827 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0585 0.159 0.087 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 1.24e-01 0.229 0.148 0.087 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 4.98e-01 0.108 0.159 0.087 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 7.11e-03 -0.375 0.138 0.087 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00509 0.13 0.087 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.17e-01 0.155 0.125 0.087 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 8.91e-01 0.02 0.145 0.086 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 9.24e-01 0.0144 0.15 0.086 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 3.86e-01 0.133 0.153 0.086 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 1.45e-01 0.195 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.086 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0824 0.154 0.086 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 9.51e-01 0.0106 0.174 0.079 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 9.09e-02 0.272 0.16 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0537 0.174 0.079 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0948 0.105 0.079 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 7.22e-02 -0.251 0.139 0.079 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -297820 sc-eQTL 6.93e-01 0.0625 0.158 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 1.84e-01 0.205 0.153 0.079 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.43e-01 0.203 0.173 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 3.84e-01 -0.128 0.147 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 8.62e-01 0.0261 0.15 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 2.63e-01 -0.133 0.118 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.75e-01 0.0657 0.157 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0435 0.152 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 9.11e-01 0.0174 0.156 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 3.50e-01 0.152 0.162 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 9.63e-01 0.0054 0.118 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0985 0.163 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0346 0.149 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.40e-01 0.115 0.149 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 2.49e-01 0.177 0.153 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0788 0.148 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0784 0.146 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 6.00e-01 0.0539 0.103 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0956 0.141 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 2.27e-01 0.185 0.153 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 4.94e-01 0.107 0.156 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -700274 sc-eQTL 9.64e-02 -0.23 0.138 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 4.92e-01 0.0642 0.0932 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 5.92e-01 0.0698 0.13 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853864 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0113 0.122 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973377 sc-eQTL 8.30e-01 0.0338 0.157 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853554 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0924 0.155 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620479 sc-eQTL 2.90e-01 0.0778 0.0734 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923903 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0754 0.171 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973312 sc-eQTL 2.14e-02 -0.372 0.161 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 900193 eQTL 0.0321 0.102 0.0475 0.00137 0.0 0.0726


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina