logo

Genes within 1Mb (chr1:64446883:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0296 0.134 0.083 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 4.95e-01 0.105 0.154 0.083 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.41e-01 0.0443 0.0947 0.083 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.89e-01 0.0631 0.158 0.083 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00262 0.121 0.083 B L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0381 0.116 0.083 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0629 0.149 0.083 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 5.05e-01 0.0593 0.0888 0.083 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.44e-01 0.0566 0.0931 0.083 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0286 0.134 0.083 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.58e-01 0.0645 0.146 0.083 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0409 0.127 0.083 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 3.85e-01 0.135 0.155 0.083 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.34e-01 0.0126 0.151 0.083 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 1.03e-01 0.125 0.076 0.083 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.06e-01 -0.123 0.12 0.083 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 4.93e-01 -0.103 0.15 0.083 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0822 0.16 0.083 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.78e-01 -0.189 0.14 0.086 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 8.91e-01 -0.021 0.153 0.086 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 6.18e-01 0.0812 0.162 0.086 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0464 0.129 0.086 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0903 0.107 0.086 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00208 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 5.72e-01 0.0799 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.78e-01 0.165 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.73e-01 0.0403 0.14 0.083 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.155 0.083 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0261 0.151 0.083 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0881 0.142 0.083 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.74e-01 -0.09 0.101 0.083 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 5.33e-01 0.0625 0.1 0.083 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.42e-01 0.0393 0.119 0.084 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 9.53e-01 0.00893 0.152 0.084 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0331 0.154 0.084 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.00e-01 0.0742 0.0714 0.084 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 4.45e-01 -0.128 0.167 0.084 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 3.97e-02 -0.335 0.162 0.084 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 3.24e-01 0.131 0.133 0.083 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0348 0.105 0.083 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.61e-01 -0.059 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0413 0.147 0.083 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 3.19e-01 0.161 0.161 0.083 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.43e-01 0.074 0.159 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.30e-01 -0.136 0.172 0.089 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.07e-02 0.307 0.156 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.64e-01 0.0685 0.157 0.089 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 4.82e-01 -0.105 0.149 0.089 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 4.68e-01 -0.12 0.164 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 5.52e-01 0.0943 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.79e-01 0.0862 0.155 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 1.20e-01 -0.208 0.133 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 2.80e-01 0.166 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 7.69e-01 0.0461 0.157 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 2.39e-02 -0.349 0.153 0.084 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0981 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.134 0.084 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 7.08e-01 -0.06 0.16 0.084 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 8.21e-01 0.0352 0.156 0.084 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 3.81e-01 0.14 0.16 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 3.02e-01 0.163 0.157 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.05e-01 0.0629 0.122 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0681 0.168 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00879 0.159 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 2.62e-01 -0.176 0.157 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0174 0.164 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.127 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0859 0.164 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0126 0.154 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 6.56e-01 0.0715 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.164 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 6.76e-01 -0.025 0.0596 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.34e-02 0.312 0.145 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 4.53e-01 0.117 0.156 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 4.79e-01 0.12 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.80e-01 0.0921 0.13 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0554 0.15 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 3.01e-01 0.092 0.0887 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.88e-01 0.0785 0.0906 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 2.14e-01 -0.185 0.149 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 5.65e-01 0.0848 0.147 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.59e-01 -0.193 0.137 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.15e-01 0.0174 0.162 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 2.16e-01 -0.159 0.128 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 9.72e-01 0.00367 0.105 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 8.17e-01 0.0363 0.157 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.47e-01 0.0102 0.153 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.98e-01 0.0407 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 2.70e-01 0.172 0.156 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0296 0.0966 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.137 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 3.40e-01 0.155 0.162 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0142 0.163 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 6.43e-01 0.0668 0.144 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0964 0.151 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0483 0.161 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00625 0.0682 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 1.51e-01 -0.182 0.127 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 1.22e-01 0.255 0.164 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 7.03e-02 -0.281 0.154 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 3.49e-01 -0.139 0.148 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 2.22e-01 0.188 0.154 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 3.01e-01 -0.159 0.154 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 1.03e-01 0.174 0.106 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0612 0.128 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 2.18e-01 -0.179 0.145 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 9.21e-01 0.0156 0.157 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 5.29e-02 -0.329 0.169 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 9.84e-01 0.00335 0.163 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0179 0.167 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 3.69e-01 0.079 0.0877 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0621 0.141 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.14e-01 0.0861 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.40e-01 0.0827 0.176 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.27e-01 -0.247 0.161 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 5.80e-01 0.0774 0.14 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 3.36e-01 0.158 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0133 0.0334 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 2.77e-01 -0.172 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 1.87e-01 -0.21 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0419 0.163 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.38e-01 0.226 0.152 0.082 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 1.18e-01 -0.238 0.152 0.082 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 7.41e-01 0.0457 0.138 0.082 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.082 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 5.59e-01 0.0921 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.25e-01 0.0777 0.159 0.082 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.69e-01 0.217 0.157 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0834 0.15 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.19e-02 0.274 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.57e-01 0.0605 0.103 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 7.59e-03 -0.426 0.158 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 4.92e-01 -0.116 0.169 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0225 0.123 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 7.45e-01 0.0516 0.158 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0046 0.157 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 4.87e-01 0.0574 0.0826 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 2.34e-02 -0.381 0.167 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 7.20e-02 -0.3 0.166 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.18e-03 0.493 0.17 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 4.22e-01 -0.116 0.144 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 2.59e-01 -0.19 0.168 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 1.23e-02 -0.28 0.111 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 2.48e-01 0.185 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.10e-02 -0.4 0.172 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.139 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 4.85e-01 -0.11 0.158 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.76e-01 0.00469 0.154 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 9.19e-01 0.00932 0.0918 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0304 0.164 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.33e-01 -0.199 0.166 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.54e-01 0.0591 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.31e-01 -0.115 0.183 0.085 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0929 0.138 0.085 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0865 0.202 0.085 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0911 0.194 0.085 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 1.68e-01 0.199 0.144 0.083 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0282 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 6.16e-01 0.0513 0.102 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 4.07e-01 -0.112 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0512 0.151 0.083 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 1.29e-01 0.241 0.158 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 2.93e-01 -0.161 0.153 0.083 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.083 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -23246 sc-eQTL 6.75e-01 0.0511 0.122 0.083 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 1.54e-01 -0.184 0.129 0.083 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 5.20e-01 0.099 0.154 0.083 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 5.86e-01 0.0916 0.168 0.083 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.53e-01 -0.113 0.15 0.09 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 3.98e-01 -0.131 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 4.44e-01 0.126 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 3.02e-01 -0.141 0.137 0.09 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0786 0.128 0.09 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 9.06e-01 0.0167 0.141 0.09 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0254 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.62e-01 0.175 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 8.06e-02 0.253 0.144 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 3.51e-01 0.145 0.156 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 9.21e-01 0.0152 0.152 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 4.28e-01 -0.114 0.143 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0322 0.13 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 8.94e-01 -0.014 0.105 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 2.88e-01 -0.171 0.16 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 6.45e-01 0.0709 0.153 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 2.71e-01 -0.162 0.147 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0298 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.39e-02 -0.284 0.133 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 3.19e-01 0.125 0.125 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0653 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 8.31e-02 0.323 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 5.82e-02 0.355 0.186 0.082 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 3.08e-01 0.169 0.165 0.082 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 5.86e-01 0.1 0.184 0.082 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0827 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0585 0.159 0.087 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 1.24e-01 0.229 0.148 0.087 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 4.98e-01 0.108 0.159 0.087 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 7.11e-03 -0.375 0.138 0.087 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00509 0.13 0.087 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.17e-01 0.155 0.125 0.087 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 8.91e-01 0.02 0.145 0.086 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 9.24e-01 0.0144 0.15 0.086 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 3.86e-01 0.133 0.153 0.086 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 1.45e-01 0.195 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.086 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0824 0.154 0.086 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 9.51e-01 0.0106 0.174 0.079 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 9.09e-02 0.272 0.16 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0537 0.174 0.079 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0948 0.105 0.079 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 7.22e-02 -0.251 0.139 0.079 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -298212 sc-eQTL 6.93e-01 0.0625 0.158 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 1.84e-01 0.205 0.153 0.079 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.43e-01 0.203 0.173 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 3.84e-01 -0.128 0.147 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 8.62e-01 0.0261 0.15 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 2.63e-01 -0.133 0.118 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.75e-01 0.0657 0.157 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0435 0.152 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 9.11e-01 0.0174 0.156 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 3.50e-01 0.152 0.162 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 9.63e-01 0.0054 0.118 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0985 0.163 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0346 0.149 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.40e-01 0.115 0.149 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 2.49e-01 0.177 0.153 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0788 0.148 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0784 0.146 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 6.00e-01 0.0539 0.103 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0956 0.141 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 2.27e-01 0.185 0.153 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 4.94e-01 0.107 0.156 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -700666 sc-eQTL 9.64e-02 -0.23 0.138 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 4.92e-01 0.0642 0.0932 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 5.92e-01 0.0698 0.13 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 853472 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0113 0.122 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -973769 sc-eQTL 8.30e-01 0.0338 0.157 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 853162 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0924 0.155 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -620871 sc-eQTL 2.90e-01 0.0778 0.0734 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 923511 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0754 0.171 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -973704 sc-eQTL 2.14e-02 -0.372 0.161 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 899801 eQTL 0.0321 0.102 0.0475 0.00137 0.0 0.0726

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina