logo

Genes within 1Mb (chr1:64441868:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0999 0.131 0.91 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.99e-01 -0.101 0.15 0.91 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 5.75e-01 0.0518 0.0923 0.91 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0358 0.154 0.91 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.82e-01 -0.065 0.118 0.91 B L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.23e-01 -0.011 0.113 0.91 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.07e-01 -0.12 0.145 0.91 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 6.50e-01 0.0393 0.0865 0.91 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00513 0.0907 0.91 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 7.75e-01 0.0373 0.13 0.91 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.37e-02 -0.273 0.141 0.91 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 8.97e-01 0.0165 0.127 0.91 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.53e-01 -0.222 0.154 0.91 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.75e-01 0.108 0.151 0.91 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 3.71e-01 0.0683 0.0762 0.91 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 1.47e-01 0.174 0.12 0.91 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 4.39e-01 -0.116 0.15 0.91 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0397 0.159 0.91 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 8.85e-02 0.236 0.138 0.912 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.38e-01 0.224 0.151 0.912 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.44e-01 0.123 0.16 0.912 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 6.56e-01 0.0567 0.127 0.912 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 4.03e-01 0.0885 0.106 0.912 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 3.74e-01 -0.121 0.135 0.912 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.14 0.912 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 6.03e-01 0.0781 0.15 0.912 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 1.98e-01 0.177 0.137 0.91 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 3.79e-01 0.135 0.153 0.91 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 7.46e-02 -0.264 0.147 0.91 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 6.39e-01 0.0657 0.14 0.91 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.90e-01 0.00131 0.0998 0.91 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0779 0.0987 0.91 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.87e-01 0.0809 0.116 0.91 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 2.21e-01 0.181 0.147 0.91 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 5.28e-03 0.415 0.147 0.91 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 1.92e-01 0.0911 0.0696 0.91 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 9.92e-01 0.00156 0.163 0.91 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 2.18e-01 -0.196 0.159 0.91 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 3.98e-01 0.112 0.132 0.91 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.88e-01 0.0724 0.104 0.91 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.07e-01 -0.052 0.101 0.91 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0359 0.147 0.91 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 9.11e-02 0.272 0.16 0.91 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0522 0.159 0.91 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.62e-02 0.373 0.186 0.913 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 8.59e-01 0.0307 0.172 0.913 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 8.10e-01 0.0415 0.172 0.913 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 3.34e-01 0.158 0.163 0.913 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0989 0.18 0.913 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0087 0.157 0.91 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 8.38e-01 0.0316 0.154 0.91 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0107 0.133 0.91 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00758 0.153 0.91 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.08e-01 -0.103 0.156 0.91 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0145 0.154 0.912 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 2.89e-02 -0.348 0.158 0.912 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 2.15e-01 0.165 0.133 0.912 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 1.60e-01 0.223 0.158 0.912 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 6.88e-01 0.0621 0.155 0.912 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0087 0.156 0.91 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.91 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 2.39e-01 0.14 0.119 0.91 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 5.20e-01 -0.106 0.164 0.91 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 4.32e-01 -0.122 0.155 0.91 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0634 0.156 0.912 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0181 0.163 0.912 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.14e-01 0.064 0.127 0.912 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0976 0.162 0.912 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 8.62e-01 0.0265 0.153 0.912 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.10e-01 0.018 0.159 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 1.39e-01 -0.241 0.162 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 2.16e-01 0.0732 0.0589 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 4.92e-01 0.1 0.146 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 1.91e-01 0.202 0.154 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0192 0.168 0.909 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.90e-01 0.00166 0.127 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0607 0.146 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 8.74e-01 0.0138 0.0868 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00225 0.0885 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0351 0.145 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 1.97e-01 -0.185 0.143 0.91 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 7.62e-01 -0.04 0.132 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.36e-01 -0.121 0.155 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 6.71e-01 0.0523 0.123 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 4.16e-01 0.082 0.101 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 6.32e-01 0.0722 0.15 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 2.48e-01 -0.169 0.146 0.91 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 7.01e-01 0.0597 0.155 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0355 0.152 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0942 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.98e-01 0.052 0.134 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.15e-01 0.037 0.158 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00172 0.159 0.91 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.55e-01 -0.106 0.142 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.35e-01 -0.224 0.149 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0108 0.159 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 5.82e-03 -0.184 0.0662 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 8.20e-02 0.218 0.125 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.02e-01 0.0408 0.163 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.90e-01 0.00187 0.154 0.91 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0656 0.145 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 6.39e-01 -0.071 0.151 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 8.65e-01 0.0256 0.151 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 4.67e-01 0.0763 0.105 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.27e-01 0.0116 0.126 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 3.17e-02 -0.305 0.141 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.25e-01 0.0146 0.154 0.91 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 1.89e-01 0.211 0.16 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 6.75e-02 -0.28 0.152 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.77e-01 0.00449 0.158 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 5.34e-01 0.0517 0.0829 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0574 0.133 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 6.86e-01 0.0653 0.161 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.34e-01 0.104 0.166 0.914 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0112 0.17 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 3.14e-01 0.147 0.146 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 6.95e-01 0.0675 0.172 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 6.80e-01 0.0144 0.035 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 5.80e-02 0.313 0.164 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 3.18e-01 -0.167 0.166 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.17e-01 -0.111 0.17 0.918 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 6.60e-01 0.068 0.154 0.909 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0125 0.155 0.909 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 3.93e-01 -0.119 0.14 0.909 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 8.87e-01 0.0212 0.149 0.909 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 4.62e-01 0.117 0.159 0.909 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 4.17e-01 0.131 0.161 0.909 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0702 0.149 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 4.35e-01 -0.111 0.142 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.66e-01 -0.112 0.154 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 5.20e-01 0.0626 0.0971 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.54e-01 0.0281 0.152 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 8.14e-01 0.0377 0.16 0.909 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 3.84e-01 0.107 0.122 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 2.25e-01 0.192 0.157 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.64e-03 0.439 0.153 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.10e-01 0.0421 0.0825 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 8.67e-02 -0.289 0.168 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 7.80e-02 -0.294 0.166 0.909 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 3.16e-01 0.161 0.16 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0376 0.133 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.92e-03 0.397 0.153 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0177 0.104 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 7.27e-01 0.0517 0.148 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.09e-01 0.0185 0.161 0.909 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 3.67e-01 -0.118 0.131 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 9.33e-02 0.249 0.148 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 7.27e-02 0.26 0.144 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 3.96e-01 0.0734 0.0863 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 5.82e-02 0.292 0.153 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 9.62e-01 0.00742 0.157 0.909 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 1.74e-01 -0.23 0.168 0.889 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 7.58e-02 0.293 0.163 0.889 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 2.09e-02 -0.286 0.122 0.889 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 5.30e-01 0.114 0.181 0.889 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 2.86e-01 -0.187 0.174 0.889 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 6.42e-02 0.267 0.144 0.913 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0956 0.13 0.913 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.77e-01 0.0029 0.102 0.913 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0893 0.135 0.913 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 7.98e-02 0.264 0.15 0.913 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 1.88e-01 -0.21 0.159 0.913 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 5.16e-01 0.0988 0.152 0.91 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 1.90e-01 -0.209 0.159 0.91 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -28261 sc-eQTL 4.62e-01 0.0887 0.12 0.91 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00719 0.128 0.91 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00472 0.153 0.91 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0841 0.166 0.91 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 7.30e-03 0.4 0.147 0.91 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 8.29e-03 0.407 0.153 0.91 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 2.53e-01 0.188 0.164 0.91 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 7.34e-01 0.0468 0.137 0.91 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 1.42e-01 0.188 0.128 0.91 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0555 0.141 0.91 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0344 0.132 0.91 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 4.78e-01 0.111 0.156 0.91 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 2.29e-01 0.172 0.143 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 5.79e-01 0.0852 0.154 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0145 0.15 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 7.13e-01 0.0521 0.141 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0338 0.129 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0416 0.104 0.91 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.34e-01 0.125 0.159 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.39e-01 0.225 0.152 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 6.11e-02 -0.273 0.145 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 9.51e-02 0.241 0.144 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 7.82e-01 0.037 0.133 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 4.08e-01 -0.103 0.125 0.91 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 5.90e-01 0.0939 0.174 0.906 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0879 0.184 0.906 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 3.69e-01 0.167 0.185 0.906 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 5.01e-01 -0.11 0.163 0.906 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 5.01e-01 0.122 0.181 0.906 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 5.33e-01 0.122 0.195 0.906 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.01e-01 0.133 0.159 0.913 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 2.55e-01 -0.17 0.148 0.913 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 6.63e-01 0.0692 0.159 0.913 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 4.34e-01 0.11 0.14 0.913 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 1.66e-01 -0.18 0.129 0.913 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 1.88e-01 -0.165 0.124 0.913 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 4.53e-01 0.109 0.144 0.912 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.149 0.912 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 2.36e-01 -0.181 0.152 0.912 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 1.41e-01 -0.196 0.132 0.912 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 4.15e-01 0.0878 0.108 0.912 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 8.14e-01 -0.036 0.153 0.912 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 9.81e-01 0.00389 0.167 0.91 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 8.54e-01 0.0285 0.155 0.91 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 3.74e-01 -0.149 0.167 0.91 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 7.83e-01 0.0279 0.101 0.91 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 9.94e-01 -0.001 0.135 0.91 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303227 sc-eQTL 1.52e-01 -0.217 0.151 0.91 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 2.28e-01 -0.178 0.147 0.91 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0571 0.167 0.91 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 8.12e-01 0.0344 0.144 0.91 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 1.90e-01 -0.193 0.147 0.91 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 6.15e-01 0.0585 0.116 0.91 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 3.29e-01 0.15 0.153 0.91 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 3.60e-01 -0.137 0.149 0.91 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 5.17e-01 -0.099 0.153 0.91 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 5.05e-01 -0.106 0.158 0.91 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 3.73e-01 0.102 0.115 0.91 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 4.66e-01 -0.116 0.159 0.91 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 6.70e-01 -0.062 0.145 0.91 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 1.41e-01 0.214 0.145 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.00e-01 0.246 0.149 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 8.44e-02 -0.25 0.144 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 5.86e-01 0.0783 0.143 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0279 0.12 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.1 0.91 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 2.33e-01 0.165 0.138 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 3.47e-01 -0.142 0.15 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0983 0.154 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -705681 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0652 0.136 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0597 0.0917 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 2.54e-01 -0.146 0.128 0.912 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 848457 sc-eQTL 5.02e-01 0.0794 0.118 0.909 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -978784 sc-eQTL 1.29e-01 0.23 0.151 0.909 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 848147 sc-eQTL 9.43e-04 0.491 0.146 0.909 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -625886 sc-eQTL 3.37e-01 0.0685 0.0711 0.909 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 918496 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000355 0.166 0.909 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -978719 sc-eQTL 1.43e-01 -0.23 0.157 0.909 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000226891 LINC01359 -560621 eQTL 0.0066 0.132 0.0486 0.0 0.0 0.0927

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina