logo

Genes within 1Mb (chr1:64441122:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 3.21e-02 -0.292 0.135 0.098 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 3.83e-01 -0.137 0.156 0.098 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0571 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 3.08e-01 -0.164 0.16 0.098 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 4.59e-01 0.0913 0.123 0.098 B L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00791 0.118 0.098 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 1.54e-01 0.214 0.15 0.098 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 8.18e-02 0.156 0.0892 0.098 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0557 0.0941 0.098 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.62e-01 0.151 0.135 0.098 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.84e-01 0.0029 0.147 0.098 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.68e-01 0.176 0.127 0.098 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 9.02e-01 0.0192 0.156 0.098 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0544 0.151 0.098 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 8.63e-01 0.0132 0.0766 0.098 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 1.33e-01 0.181 0.12 0.098 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 5.39e-01 0.0929 0.151 0.098 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.35e-01 0.19 0.159 0.098 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 2.59e-01 -0.167 0.148 0.101 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 6.27e-01 0.0785 0.161 0.101 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.82e-02 -0.283 0.17 0.101 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 5.58e-01 0.0796 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0863 0.113 0.101 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0446 0.145 0.101 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0453 0.149 0.101 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.27e-01 0.0778 0.16 0.101 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.04e-01 -0.119 0.142 0.098 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 3.08e-01 0.162 0.158 0.098 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 8.90e-01 0.0214 0.154 0.098 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0682 0.145 0.098 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0692 0.103 0.098 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.05e-02 -0.221 0.101 0.098 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0946 0.12 0.099 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 1.62e-01 0.214 0.152 0.099 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 4.57e-01 0.115 0.155 0.099 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 1.00e+00 1.8e-05 0.0722 0.099 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.75e-01 -0.184 0.168 0.099 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.97e-03 -0.422 0.162 0.099 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 6.09e-01 0.0689 0.134 0.098 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0502 0.106 0.098 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 8.07e-01 0.0251 0.103 0.098 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0478 0.149 0.098 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0112 0.163 0.098 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0203 0.161 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.64e-01 -0.144 0.196 0.087 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 1.75e-01 0.244 0.179 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.57e-01 0.134 0.179 0.087 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 3.87e-01 0.147 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.94e-01 0.0491 0.188 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 8.99e-01 0.0207 0.163 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0649 0.16 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0803 0.138 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 5.80e-01 0.0878 0.158 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.54e-01 0.184 0.161 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.29e-01 -0.127 0.16 0.097 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 1.39e-01 -0.246 0.166 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00296 0.138 0.097 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 5.64e-01 0.0955 0.165 0.097 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.54e-01 0.149 0.16 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 2.61e-01 -0.185 0.164 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0691 0.162 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 6.44e-01 0.0578 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.06e-01 -0.218 0.172 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.99e-01 0.0415 0.163 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 3.75e-01 -0.144 0.163 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 4.76e-01 0.122 0.17 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.68e-01 0.0755 0.132 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0483 0.17 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0184 0.159 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 3.81e-01 0.139 0.158 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 5.66e-01 0.093 0.162 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.20e-02 0.147 0.0579 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 3.06e-01 0.149 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0505 0.154 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 5.37e-01 0.103 0.167 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 6.10e-01 0.0676 0.132 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.19e-02 0.284 0.151 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.06e-02 0.23 0.0891 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0525 0.0923 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 8.44e-02 0.261 0.151 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.08e-01 0.0769 0.15 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 6.99e-01 -0.053 0.137 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.25e-01 0.0153 0.162 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.80e-01 -0.172 0.128 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0395 0.105 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0547 0.156 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.24e-01 -0.15 0.152 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 7.50e-01 0.051 0.16 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0049 0.157 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.0965 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 2.11e-01 0.172 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0609 0.163 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 8.96e-01 0.0214 0.164 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.80e-01 0.105 0.148 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0258 0.156 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 3.12e-01 -0.167 0.165 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.07e-01 0.113 0.0698 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.17e-01 0.107 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0831 0.17 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 5.85e-03 0.438 0.157 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00115 0.148 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0825 0.154 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.08e-01 0.0789 0.154 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 3.92e-01 0.0912 0.106 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.128 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.70e-01 0.00551 0.145 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.52e-01 0.146 0.157 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.45e-01 0.243 0.166 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 4.28e-01 -0.127 0.159 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 1.25e-01 -0.252 0.163 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0626 0.0861 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 5.42e-01 0.102 0.167 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0887 0.173 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 5.87e-02 0.305 0.16 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 6.32e-01 0.067 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0824 0.164 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 1.11e-01 0.0531 0.0332 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 1.56e-01 0.223 0.157 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0137 0.159 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 8.35e-01 0.0339 0.163 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.86e-01 0.109 0.156 0.1 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.156 0.1 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 6.70e-02 0.258 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0494 0.15 0.1 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0131 0.161 0.1 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.99e-01 0.000283 0.162 0.1 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 2.33e-02 -0.354 0.155 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 5.75e-02 0.282 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.26e-01 0.079 0.162 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0462 0.102 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.81e-01 0.00386 0.16 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.12e-01 -0.209 0.167 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0696 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 5.94e-01 0.0862 0.161 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.54e-01 0.0717 0.16 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0207 0.0844 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.28e-01 -0.208 0.172 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 1.03e-01 -0.278 0.17 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 3.51e-01 -0.156 0.167 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 2.93e-02 0.302 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 1.65e-01 0.224 0.161 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0593 0.108 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 3.02e-01 -0.159 0.154 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0672 0.168 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 6.23e-02 0.251 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 7.93e-01 0.0402 0.153 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 7.88e-01 0.0403 0.15 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 2.76e-01 0.097 0.0888 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 9.30e-01 0.014 0.159 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.84e-01 -0.174 0.161 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 2.08e-01 -0.247 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.04e-01 0.0232 0.192 0.093 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 3.14e-01 0.146 0.144 0.093 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 3.05e-01 0.216 0.209 0.093 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.66e-01 0.225 0.201 0.093 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 6.66e-01 -0.063 0.146 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 8.39e-01 0.0266 0.131 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 8.96e-01 0.0135 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 2.71e-01 0.15 0.136 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0608 0.152 0.1 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.75e-01 -0.175 0.16 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0566 0.154 0.098 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.26e-01 0.015 0.162 0.098 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -29007 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0962 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0477 0.155 0.098 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.09e-01 0.0632 0.169 0.098 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.41e-01 -0.24 0.162 0.095 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 7.03e-01 0.0645 0.169 0.095 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 8.11e-01 0.0428 0.178 0.095 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0495 0.149 0.095 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 8.03e-01 0.0347 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 1.90e-01 -0.2 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.16e-01 0.177 0.143 0.095 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 4.84e-01 -0.119 0.169 0.095 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 2.31e-01 -0.176 0.147 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 2.85e-01 -0.169 0.158 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 5.50e-01 0.0924 0.154 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0203 0.145 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 7.56e-01 0.0411 0.132 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.28e-02 -0.198 0.106 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.21e-01 -0.251 0.161 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 1.03e-01 0.252 0.154 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0937 0.148 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 7.64e-01 -0.044 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 6.25e-01 -0.062 0.127 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0476 0.172 0.103 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 2.35e-02 -0.412 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.98e-01 -0.097 0.184 0.103 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 1.58e-01 -0.228 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 3.84e-01 -0.157 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 8.03e-01 0.0485 0.194 0.103 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.75e-01 0.118 0.165 0.102 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 4.96e-01 -0.106 0.155 0.102 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0225 0.166 0.102 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 1.49e-01 -0.211 0.145 0.102 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 5.91e-01 0.0728 0.135 0.102 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 2.29e-01 -0.157 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0375 0.148 0.1 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 2.02e-01 0.195 0.152 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 5.66e-01 0.0898 0.156 0.1 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0372 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 1.78e-01 0.148 0.11 0.1 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.07e-01 0.0589 0.157 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0257 0.188 0.088 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 4.32e-01 0.137 0.174 0.088 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 2.74e-01 -0.206 0.188 0.088 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 1.28e-01 0.173 0.113 0.088 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0107 0.152 0.088 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -303973 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0871 0.171 0.088 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 4.47e-01 -0.127 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.81e-01 -0.165 0.188 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.95e-01 -0.103 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 4.56e-01 -0.115 0.154 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 3.39e-01 -0.116 0.121 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 6.48e-01 0.0734 0.16 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 5.57e-02 0.298 0.155 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.02e-01 -0.263 0.16 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 7.51e-01 -0.053 0.167 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 7.73e-01 0.0349 0.121 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 1.98e-01 -0.216 0.167 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0588 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 1.79e-01 -0.202 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 8.60e-01 0.0274 0.155 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 9.53e-01 0.00889 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0365 0.148 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 7.17e-01 -0.045 0.124 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 9.31e-02 -0.174 0.103 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 4.99e-01 0.0968 0.143 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 6.58e-01 0.0691 0.156 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 5.52e-01 0.0949 0.159 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -706427 sc-eQTL 1.50e-01 -0.203 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 3.50e-01 0.0888 0.0947 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0419 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 847711 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0172 0.122 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -979530 sc-eQTL 3.33e-01 0.153 0.157 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 847401 sc-eQTL 6.40e-01 0.0728 0.156 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -626632 sc-eQTL 9.66e-01 0.00317 0.0739 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 917750 sc-eQTL 2.17e-01 -0.212 0.171 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -979465 sc-eQTL 3.36e-02 -0.346 0.162 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162437 \N -303973 1.31e-06 9.28e-07 1.85e-07 3.96e-07 1.18e-07 4.23e-07 8.39e-07 2.74e-07 8.92e-07 3.11e-07 1.25e-06 5.73e-07 1.46e-06 2.57e-07 4.01e-07 5.29e-07 7.79e-07 5.53e-07 3.84e-07 3.93e-07 2.72e-07 6.91e-07 6.26e-07 3.93e-07 1.74e-06 2.4e-07 5.49e-07 4.75e-07 7.61e-07 9.58e-07 5.1e-07 4.44e-08 1.05e-07 3.49e-07 3.84e-07 3.21e-07 1.93e-07 1.12e-07 1.1e-07 1.87e-08 1.14e-07 1.4e-06 6.68e-08 1.62e-08 1.8e-07 7.7e-08 1.47e-07 7.28e-08 5.94e-08