logo

Genes within 1Mb (chr1:64439230:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 3.21e-02 -0.292 0.135 0.098 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 3.83e-01 -0.137 0.156 0.098 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0571 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 3.08e-01 -0.164 0.16 0.098 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 4.59e-01 0.0913 0.123 0.098 B L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00791 0.118 0.098 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 1.54e-01 0.214 0.15 0.098 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 8.18e-02 0.156 0.0892 0.098 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0557 0.0941 0.098 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.62e-01 0.151 0.135 0.098 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.84e-01 0.0029 0.147 0.098 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.68e-01 0.176 0.127 0.098 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 9.02e-01 0.0192 0.156 0.098 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0544 0.151 0.098 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 8.63e-01 0.0132 0.0766 0.098 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 1.33e-01 0.181 0.12 0.098 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 5.39e-01 0.0929 0.151 0.098 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.35e-01 0.19 0.159 0.098 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 2.59e-01 -0.167 0.148 0.101 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 6.27e-01 0.0785 0.161 0.101 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.82e-02 -0.283 0.17 0.101 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 5.58e-01 0.0796 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0863 0.113 0.101 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0446 0.145 0.101 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0453 0.149 0.101 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.27e-01 0.0778 0.16 0.101 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.04e-01 -0.119 0.142 0.098 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 3.08e-01 0.162 0.158 0.098 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 8.90e-01 0.0214 0.154 0.098 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0682 0.145 0.098 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0692 0.103 0.098 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.05e-02 -0.221 0.101 0.098 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0946 0.12 0.099 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 1.62e-01 0.214 0.152 0.099 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 4.57e-01 0.115 0.155 0.099 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 1.00e+00 1.8e-05 0.0722 0.099 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.75e-01 -0.184 0.168 0.099 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.97e-03 -0.422 0.162 0.099 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 6.09e-01 0.0689 0.134 0.098 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0502 0.106 0.098 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 8.07e-01 0.0251 0.103 0.098 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0478 0.149 0.098 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0112 0.163 0.098 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0203 0.161 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.64e-01 -0.144 0.196 0.087 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 1.75e-01 0.244 0.179 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.57e-01 0.134 0.179 0.087 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 3.87e-01 0.147 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.94e-01 0.0491 0.188 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 8.99e-01 0.0207 0.163 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0649 0.16 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0803 0.138 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 5.80e-01 0.0878 0.158 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.54e-01 0.184 0.161 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.29e-01 -0.127 0.16 0.097 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 1.39e-01 -0.246 0.166 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00296 0.138 0.097 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 5.64e-01 0.0955 0.165 0.097 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.54e-01 0.149 0.16 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 2.61e-01 -0.185 0.164 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0691 0.162 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 6.44e-01 0.0578 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.06e-01 -0.218 0.172 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.99e-01 0.0415 0.163 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 3.75e-01 -0.144 0.163 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 4.76e-01 0.122 0.17 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.68e-01 0.0755 0.132 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0483 0.17 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0184 0.159 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 3.81e-01 0.139 0.158 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 5.66e-01 0.093 0.162 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.20e-02 0.147 0.0579 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 3.06e-01 0.149 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0505 0.154 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 5.37e-01 0.103 0.167 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 6.10e-01 0.0676 0.132 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.19e-02 0.284 0.151 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.06e-02 0.23 0.0891 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0525 0.0923 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 8.44e-02 0.261 0.151 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.08e-01 0.0769 0.15 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 6.99e-01 -0.053 0.137 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.25e-01 0.0153 0.162 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.80e-01 -0.172 0.128 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0395 0.105 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0547 0.156 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.24e-01 -0.15 0.152 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 7.50e-01 0.051 0.16 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0049 0.157 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.0965 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 2.11e-01 0.172 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0609 0.163 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 8.96e-01 0.0214 0.164 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.80e-01 0.105 0.148 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0258 0.156 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 3.12e-01 -0.167 0.165 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.07e-01 0.113 0.0698 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.17e-01 0.107 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0831 0.17 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 5.85e-03 0.438 0.157 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00115 0.148 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0825 0.154 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.08e-01 0.0789 0.154 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 3.92e-01 0.0912 0.106 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.128 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.70e-01 0.00551 0.145 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.52e-01 0.146 0.157 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.45e-01 0.243 0.166 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 4.28e-01 -0.127 0.159 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 1.25e-01 -0.252 0.163 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0626 0.0861 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 5.42e-01 0.102 0.167 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0887 0.173 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 5.87e-02 0.305 0.16 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 6.32e-01 0.067 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0824 0.164 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 1.11e-01 0.0531 0.0332 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 1.56e-01 0.223 0.157 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0137 0.159 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 8.35e-01 0.0339 0.163 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.86e-01 0.109 0.156 0.1 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.156 0.1 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 6.70e-02 0.258 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0494 0.15 0.1 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0131 0.161 0.1 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.99e-01 0.000283 0.162 0.1 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 2.33e-02 -0.354 0.155 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 5.75e-02 0.282 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.26e-01 0.079 0.162 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0462 0.102 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.81e-01 0.00386 0.16 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.12e-01 -0.209 0.167 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0696 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 5.94e-01 0.0862 0.161 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.54e-01 0.0717 0.16 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0207 0.0844 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.28e-01 -0.208 0.172 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 1.03e-01 -0.278 0.17 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 3.51e-01 -0.156 0.167 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 2.93e-02 0.302 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 1.65e-01 0.224 0.161 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0593 0.108 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 3.02e-01 -0.159 0.154 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0672 0.168 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 6.23e-02 0.251 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 7.93e-01 0.0402 0.153 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 7.88e-01 0.0403 0.15 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 2.76e-01 0.097 0.0888 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 9.30e-01 0.014 0.159 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.84e-01 -0.174 0.161 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 2.08e-01 -0.247 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.04e-01 0.0232 0.192 0.093 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 3.14e-01 0.146 0.144 0.093 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 3.05e-01 0.216 0.209 0.093 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.66e-01 0.225 0.201 0.093 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 6.66e-01 -0.063 0.146 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 8.39e-01 0.0266 0.131 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 8.96e-01 0.0135 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 2.71e-01 0.15 0.136 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0608 0.152 0.1 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.75e-01 -0.175 0.16 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0566 0.154 0.098 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.26e-01 0.015 0.162 0.098 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -30899 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0962 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0477 0.155 0.098 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.09e-01 0.0632 0.169 0.098 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.41e-01 -0.24 0.162 0.095 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 7.03e-01 0.0645 0.169 0.095 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 8.11e-01 0.0428 0.178 0.095 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0495 0.149 0.095 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 8.03e-01 0.0347 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 1.90e-01 -0.2 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.16e-01 0.177 0.143 0.095 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 4.84e-01 -0.119 0.169 0.095 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 2.31e-01 -0.176 0.147 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 2.85e-01 -0.169 0.158 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 5.50e-01 0.0924 0.154 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0203 0.145 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 7.56e-01 0.0411 0.132 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.28e-02 -0.198 0.106 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.21e-01 -0.251 0.161 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 1.03e-01 0.252 0.154 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0937 0.148 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 7.64e-01 -0.044 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 6.25e-01 -0.062 0.127 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0476 0.172 0.103 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 2.35e-02 -0.412 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.98e-01 -0.097 0.184 0.103 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 1.58e-01 -0.228 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 3.84e-01 -0.157 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 8.03e-01 0.0485 0.194 0.103 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.75e-01 0.118 0.165 0.102 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 4.96e-01 -0.106 0.155 0.102 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0225 0.166 0.102 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 1.49e-01 -0.211 0.145 0.102 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 5.91e-01 0.0728 0.135 0.102 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 2.29e-01 -0.157 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0375 0.148 0.1 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 2.02e-01 0.195 0.152 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 5.66e-01 0.0898 0.156 0.1 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0372 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 1.78e-01 0.148 0.11 0.1 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.07e-01 0.0589 0.157 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0257 0.188 0.088 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 4.32e-01 0.137 0.174 0.088 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 2.74e-01 -0.206 0.188 0.088 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 1.28e-01 0.173 0.113 0.088 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0107 0.152 0.088 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0871 0.171 0.088 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 4.47e-01 -0.127 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.81e-01 -0.165 0.188 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.95e-01 -0.103 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 4.56e-01 -0.115 0.154 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 3.39e-01 -0.116 0.121 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 6.48e-01 0.0734 0.16 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 5.57e-02 0.298 0.155 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.02e-01 -0.263 0.16 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 7.51e-01 -0.053 0.167 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 7.73e-01 0.0349 0.121 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 1.98e-01 -0.216 0.167 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0588 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 1.79e-01 -0.202 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 8.60e-01 0.0274 0.155 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 9.53e-01 0.00889 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0365 0.148 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 7.17e-01 -0.045 0.124 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 9.31e-02 -0.174 0.103 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 4.99e-01 0.0968 0.143 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 6.58e-01 0.0691 0.156 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 5.52e-01 0.0949 0.159 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -708319 sc-eQTL 1.50e-01 -0.203 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 3.50e-01 0.0888 0.0947 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0419 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 845819 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0172 0.122 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -981422 sc-eQTL 3.33e-01 0.153 0.157 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 845509 sc-eQTL 6.40e-01 0.0728 0.156 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -628524 sc-eQTL 9.66e-01 0.00317 0.0739 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 915858 sc-eQTL 2.17e-01 -0.212 0.171 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -981357 sc-eQTL 3.36e-02 -0.346 0.162 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 eQTL 0.0241 -0.096 0.0425 0.0 0.0 0.0707

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162437 RAVER2 -305865 1.24e-06 9.88e-07 2.93e-07 1.13e-06 2.66e-07 4.49e-07 1.13e-06 3.02e-07 1.2e-06 3.83e-07 1.36e-06 5.98e-07 1.82e-06 2.96e-07 4.26e-07 6.36e-07 7.7e-07 5.66e-07 4.65e-07 6.61e-07 3.91e-07 1.01e-06 7.16e-07 4.87e-07 1.98e-06 2.48e-07 7.33e-07 6.89e-07 9.32e-07 1.08e-06 5.47e-07 2.06e-07 1.78e-07 6.35e-07 5.65e-07 4.32e-07 4.92e-07 1.7e-07 1.96e-07 1.67e-07 2.37e-07 1.47e-06 5.45e-08 4.2e-08 1.81e-07 1.3e-07 1.7e-07 7.75e-08 6.27e-08