logo

Genes within 1Mb (chr1:64433196:CACTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0368 0.0937 0.222 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.38e-01 0.0219 0.107 0.222 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.08e-01 -0.106 0.0658 0.222 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 2.96e-01 -0.115 0.11 0.222 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 1.31e-01 0.127 0.084 0.222 B L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0649 0.0798 0.222 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0103 0.102 0.222 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 4.68e-01 0.0443 0.061 0.222 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0314 0.064 0.222 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00901 0.0919 0.222 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 7.77e-01 0.0284 0.1 0.222 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 8.74e-01 0.0141 0.0885 0.222 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 4.54e-01 0.081 0.108 0.222 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.105 0.222 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 2.66e-01 0.0591 0.053 0.222 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 3.93e-02 -0.172 0.0829 0.222 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0264 0.105 0.222 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.28e-01 0.088 0.111 0.222 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0597 0.0986 0.218 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000413 0.108 0.218 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 6.63e-01 0.0498 0.114 0.218 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 1.17e-01 -0.142 0.0898 0.218 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0514 0.0751 0.218 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 2.40e-01 0.113 0.096 0.218 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00561 0.0993 0.218 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.107 0.218 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 1.29e-01 -0.146 0.0955 0.222 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 9.52e-01 0.00643 0.107 0.222 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.67e-01 0.115 0.103 0.222 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 8.94e-01 0.0131 0.0976 0.222 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0584 0.0695 0.222 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0161 0.069 0.222 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0617 0.0822 0.221 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 1.12e-01 -0.166 0.104 0.221 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.81e-03 -0.304 0.104 0.221 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00113 0.0494 0.221 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 2.98e-01 -0.12 0.115 0.221 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.66e-01 0.00484 0.113 0.221 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0608 0.093 0.222 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0809 0.0731 0.222 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0502 0.071 0.222 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0147 0.103 0.222 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.01e-01 -0.117 0.113 0.222 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0165 0.112 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0978 0.123 0.217 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.74e-01 0.018 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 8.54e-01 0.0208 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 4.95e-02 -0.209 0.106 0.217 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.09e-02 0.229 0.117 0.217 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0527 0.112 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0647 0.11 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0656 0.0949 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0373 0.109 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.82e-01 0.00251 0.111 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00216 0.111 0.22 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 1.07e-01 0.184 0.114 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.29e-02 -0.235 0.0939 0.22 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 9.17e-02 -0.192 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 3.76e-01 0.098 0.111 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00567 0.112 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.26e-01 0.108 0.11 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 6.37e-02 -0.158 0.0847 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0647 0.118 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 2.96e-01 0.116 0.111 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0701 0.111 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 6.20e-02 -0.216 0.115 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00247 0.09 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.50e-01 0.108 0.115 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 7.37e-01 0.0365 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 3.37e-01 -0.109 0.113 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 6.96e-01 0.0455 0.116 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00285 0.0423 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0395 0.104 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0993 0.11 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0989 0.12 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0227 0.0893 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.83e-01 0.0152 0.103 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 3.30e-01 0.0595 0.0609 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0122 0.0623 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.15e-01 -0.103 0.102 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0341 0.101 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0596 0.0931 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.11e-01 0.0263 0.11 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0934 0.087 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 2.18e-01 -0.088 0.0711 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 1.28e-01 0.162 0.106 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 3.85e-01 0.0899 0.103 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0544 0.112 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.83e-01 0.118 0.109 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 8.25e-01 0.015 0.0679 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.84e-01 -0.128 0.0961 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 9.53e-01 0.00673 0.114 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.88e-01 0.0795 0.114 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.67e-01 0.00413 0.101 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0278 0.107 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 6.02e-01 -0.059 0.113 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 9.60e-02 0.0796 0.0476 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.49e-02 -0.179 0.0886 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0353 0.116 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.64e-01 0.0802 0.109 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.37e-01 0.048 0.102 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 9.36e-01 0.00857 0.106 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 9.47e-01 0.00703 0.106 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 7.34e-01 0.025 0.0734 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 2.03e-01 -0.112 0.0879 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.29e-01 0.0975 0.0996 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0511 0.108 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0496 0.116 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0496 0.111 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0379 0.114 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0533 0.0598 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.41e-01 -0.142 0.0959 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0436 0.116 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.16e-01 0.0979 0.12 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.23e-01 0.0114 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 7.14e-01 0.037 0.101 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0375 0.118 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0143 0.0241 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.56e-02 -0.227 0.113 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 9.91e-01 0.00135 0.115 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 1.92e-01 0.153 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0714 0.109 0.223 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 1.87e-01 -0.144 0.109 0.223 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0451 0.0987 0.223 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 7.11e-01 0.039 0.105 0.223 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 8.20e-01 0.0256 0.113 0.223 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0746 0.114 0.223 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 3.24e-01 0.106 0.107 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 3.91e-01 0.0871 0.101 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.76e-01 0.0173 0.11 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0458 0.0696 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 4.51e-01 0.0821 0.109 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0822 0.114 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 3.40e-02 -0.18 0.0844 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 2.57e-02 -0.244 0.109 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.05e-03 -0.332 0.106 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00363 0.0575 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.76e-01 0.0335 0.118 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 2.27e-01 0.14 0.116 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 8.55e-01 0.0212 0.116 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 5.14e-01 0.0629 0.0962 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.87e-02 -0.231 0.111 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0868 0.0747 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 3.95e-01 -0.091 0.107 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0359 0.116 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 1.41e-01 0.137 0.0929 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 1.94e-01 -0.138 0.106 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.67e-01 -0.115 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 6.89e-01 0.0247 0.0616 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 1.36e-02 -0.271 0.109 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0964 0.112 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.70e-01 0.0564 0.132 0.233 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.80e-01 -0.139 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.89e-02 0.226 0.095 0.233 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 8.54e-01 0.0262 0.142 0.233 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.88e-02 0.256 0.134 0.233 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0102 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 1.57e-01 0.129 0.0905 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0117 0.0717 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0637 0.0945 0.22 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.56e-02 -0.187 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.35e-01 0.0693 0.111 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0557 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0726 0.113 0.222 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -36933 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0636 0.0853 0.222 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00255 0.091 0.222 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 7.90e-01 0.0288 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 7.45e-01 0.0385 0.118 0.222 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.55e-03 -0.281 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0794 0.113 0.215 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00841 0.12 0.215 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 1.94e-01 -0.13 0.0997 0.215 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.46e-01 0.0303 0.0934 0.215 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0233 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 2.76e-01 0.105 0.096 0.215 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.57e-02 -0.189 0.113 0.215 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.30e-02 -0.185 0.099 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0694 0.107 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 4.10e-01 0.0865 0.105 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 8.85e-01 0.0143 0.0987 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.31e-01 0.0309 0.0897 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 8.77e-01 0.0113 0.0725 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0304 0.11 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.105 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.99e-01 0.0855 0.101 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0694 0.1 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.01e-02 -0.189 0.0915 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0837 0.0862 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 9.68e-01 0.00494 0.124 0.212 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 7.83e-01 0.0362 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.90e-02 -0.217 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 4.73e-01 0.0835 0.116 0.212 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 4.37e-01 -0.101 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0826 0.139 0.212 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0746 0.111 0.222 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 9.71e-01 0.00376 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0942 0.111 0.222 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 8.60e-02 -0.168 0.0973 0.222 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.19e-01 0.0326 0.0906 0.222 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0873 0.222 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 2.56e-01 0.119 0.104 0.219 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 4.40e-01 0.0827 0.107 0.219 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 1.54e-01 0.133 0.0928 0.219 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0239 0.0754 0.219 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 3.52e-01 0.0996 0.107 0.219 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 3.52e-01 0.115 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 8.37e-01 0.0237 0.115 0.206 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 2.09e-01 0.155 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 3.59e-02 -0.156 0.0737 0.206 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 5.02e-01 -0.067 0.0997 0.206 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -311899 sc-eQTL 2.47e-02 0.251 0.111 0.206 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0654 0.11 0.206 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 5.50e-01 0.0741 0.124 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0408 0.104 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 4.57e-01 0.0786 0.106 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 1.34e-01 -0.125 0.083 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 6.10e-02 -0.206 0.109 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.90e-02 0.176 0.106 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 8.69e-01 -0.018 0.109 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0413 0.113 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.082 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 8.91e-01 0.0156 0.114 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 6.33e-01 0.0497 0.104 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 1.54e-01 -0.145 0.102 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0149 0.105 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 1.63e-01 0.142 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 8.72e-01 0.0162 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0673 0.084 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00888 0.0705 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0679 0.0971 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 5.95e-01 0.0562 0.106 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 8.07e-01 0.0264 0.108 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -714353 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00203 0.0957 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 7.44e-01 0.0211 0.0644 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 4.46e-01 0.0684 0.0897 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 839785 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0883 0.0831 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -987456 sc-eQTL 2.87e-02 -0.234 0.106 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 839475 sc-eQTL 7.29e-04 -0.354 0.103 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -634558 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00596 0.0503 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 909824 sc-eQTL 1.58e-01 -0.165 0.117 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -987391 sc-eQTL 8.48e-01 0.0214 0.111 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 659179 pQTL 0.0431 0.0336 0.0166 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 \N 839475 2.67e-07 1.11e-07 3.54e-08 1.81e-07 9.91e-08 9.9e-08 1.38e-07 5.29e-08 1.41e-07 4.24e-08 1.59e-07 8.03e-08 1.33e-07 6.21e-08 4.89e-08 8.01e-08 5.15e-08 1.14e-07 5.75e-08 2.85e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.34e-07 4.98e-08 1.31e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.49e-08 9.88e-08 1.09e-07 9.58e-08 3.29e-08 2.75e-08 8.25e-08 9.07e-08 4.14e-08 4.85e-08 8.75e-08 8.14e-08 3.74e-08 3.31e-08 1.35e-07 4.36e-08 3.05e-07 1.12e-07 1.72e-08 1.37e-07 4.96e-09 4.72e-08