logo

Genes within 1Mb (chr1:64428063:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0907 0.163 0.06 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.89e-01 -0.246 0.186 0.06 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.38e-01 0.0387 0.115 0.06 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 2.45e-02 -0.429 0.19 0.06 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.61e-01 0.0448 0.147 0.06 B L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.64e-01 0.00621 0.138 0.06 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 2.39e-01 -0.208 0.176 0.06 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 4.05e-01 0.0878 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 8.04e-01 0.0274 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 6.06e-01 0.0818 0.159 0.06 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0336 0.173 0.06 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 8.62e-01 0.027 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 5.72e-01 0.107 0.189 0.06 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 6.19e-01 0.0917 0.184 0.06 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 4.22e-01 0.0749 0.093 0.06 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.39e-01 0.0489 0.147 0.06 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 7.78e-02 -0.323 0.182 0.06 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 1.64e-01 -0.271 0.194 0.06 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0218 0.181 0.056 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 8.80e-01 0.03 0.198 0.056 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 6.37e-01 0.0989 0.21 0.056 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 8.79e-02 -0.283 0.165 0.056 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 5.38e-01 0.0852 0.138 0.056 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 2.73e-01 0.194 0.177 0.056 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 5.27e-01 -0.116 0.182 0.056 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 5.89e-01 0.106 0.196 0.056 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 6.28e-02 -0.31 0.166 0.06 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 5.02e-01 0.125 0.186 0.06 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.05e-01 0.15 0.18 0.06 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 2.51e-01 0.195 0.17 0.06 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 4.05e-01 0.101 0.121 0.06 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 4.90e-01 -0.083 0.12 0.06 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0267 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 4.71e-01 0.13 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 6.66e-02 -0.334 0.181 0.06 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 1.99e-01 0.109 0.0846 0.06 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00876 0.198 0.06 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0394 0.194 0.06 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 4.16e-01 -0.132 0.162 0.06 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0469 0.127 0.06 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0217 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0607 0.179 0.06 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 1.55e-01 -0.279 0.196 0.06 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.86e-02 -0.34 0.192 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 1.28e-01 0.342 0.223 0.059 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.64e-01 -0.286 0.205 0.059 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.40e-01 0.0683 0.206 0.059 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 3.40e-01 -0.186 0.195 0.059 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 5.92e-01 0.115 0.215 0.059 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.25e-01 0.0184 0.196 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.70e-02 -0.454 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.70e-01 0.0483 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 1.60e-01 -0.266 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 3.75e-01 -0.172 0.193 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 3.24e-01 -0.192 0.195 0.06 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.37e-01 -0.157 0.202 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 3.74e-01 -0.149 0.168 0.06 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 9.12e-01 0.0222 0.201 0.06 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 2.01e-01 0.25 0.195 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 6.58e-01 0.0838 0.189 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 5.82e-01 0.102 0.186 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 4.56e-01 0.107 0.144 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 2.70e-01 -0.219 0.198 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0532 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 2.51e-01 -0.218 0.189 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 3.64e-01 -0.18 0.198 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 1.30e-01 0.233 0.153 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 8.59e-01 0.035 0.197 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 2.23e-01 0.226 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 3.58e-01 -0.178 0.193 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.87e-01 -0.138 0.198 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 4.36e-02 0.144 0.0711 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 9.94e-01 0.0013 0.177 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 4.15e-01 0.153 0.188 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 3.99e-01 -0.172 0.203 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.11e-01 0.0174 0.155 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.32e-01 -0.14 0.178 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 4.45e-01 0.0809 0.106 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 5.84e-01 0.0591 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0298 0.177 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.40e-01 0.0582 0.175 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.35e-01 0.0131 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0427 0.189 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 2.67e-01 -0.167 0.15 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 9.88e-01 0.00177 0.123 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 1.64e-01 0.255 0.182 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0964 0.178 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 3.66e-01 0.174 0.192 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 5.06e-01 -0.126 0.188 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0542 0.116 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.18e-01 0.204 0.165 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 6.10e-01 0.0996 0.195 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 2.09e-01 0.247 0.196 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0658 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 6.62e-01 0.0814 0.186 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.47e-01 0.15 0.197 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 5.99e-01 -0.044 0.0836 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 3.80e-01 0.137 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 4.17e-01 -0.164 0.202 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.52e-01 0.0356 0.191 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 8.17e-01 0.0407 0.176 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 2.10e-01 -0.229 0.182 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 7.74e-01 0.0526 0.183 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 8.38e-01 0.0258 0.127 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00761 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 2.80e-01 -0.186 0.172 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 1.27e-01 -0.284 0.186 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 7.12e-01 0.0714 0.193 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000875 0.185 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 6.75e-01 0.0797 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 7.06e-01 0.0376 0.0997 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 4.25e-01 -0.128 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 1.10e-01 -0.309 0.192 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 2.27e-01 -0.242 0.199 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 5.93e-01 0.105 0.195 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 9.72e-01 0.0059 0.168 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 3.34e-02 0.419 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0316 0.0403 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 3.22e-01 0.189 0.19 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0741 0.192 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.09e-01 0.0475 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 4.85e-01 -0.133 0.19 0.058 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0339 0.19 0.058 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 5.00e-01 -0.116 0.172 0.058 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00868 0.183 0.058 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0736 0.196 0.058 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 2.89e-01 -0.21 0.198 0.058 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0731 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 3.76e-01 0.156 0.176 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 5.29e-02 -0.371 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 8.95e-01 0.016 0.121 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 1.10e-01 0.302 0.188 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 3.81e-01 -0.174 0.199 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 2.42e-01 -0.173 0.147 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 9.59e-01 0.00971 0.19 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.01e-01 -0.308 0.187 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 6.14e-01 0.0502 0.0994 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0379 0.204 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 9.24e-01 0.0192 0.201 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 8.17e-01 0.0471 0.204 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 1.28e-01 0.257 0.168 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 5.13e-01 -0.129 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.51e-01 0.0419 0.132 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 3.40e-01 -0.179 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 4.93e-01 0.14 0.204 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 1.36e-01 0.244 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 9.06e-01 0.0221 0.186 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0119 0.182 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0188 0.194 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0596 0.197 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 2.12e-01 -0.265 0.211 0.067 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 8.76e-01 0.0325 0.208 0.067 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.11e-01 0.196 0.156 0.067 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0449 0.228 0.067 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00366 0.22 0.067 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 6.41e-01 -0.082 0.176 0.059 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0466 0.158 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0342 0.124 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 3.12e-01 -0.166 0.164 0.059 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 2.75e-01 -0.2 0.183 0.059 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0311 0.193 0.059 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 2.06e-01 -0.231 0.182 0.06 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.56e-01 -0.272 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -42066 sc-eQTL 7.50e-01 0.0463 0.145 0.06 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.36e-01 0.183 0.154 0.06 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 8.73e-01 0.0295 0.184 0.06 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 3.58e-01 -0.184 0.2 0.06 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 4.46e-01 -0.152 0.199 0.054 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 3.12e-01 0.209 0.206 0.054 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 9.31e-01 0.0189 0.218 0.054 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 1.35e-01 -0.272 0.181 0.054 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 1.93e-01 0.221 0.169 0.054 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 1.73e-01 -0.255 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 7.99e-01 0.0446 0.175 0.054 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0511 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 1.27e-01 -0.263 0.172 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 7.09e-01 0.0694 0.186 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 3.71e-01 0.163 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 3.17e-01 0.171 0.171 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 5.50e-01 0.0932 0.155 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 9.50e-01 0.00785 0.126 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 2.04e-01 -0.244 0.192 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 9.99e-02 0.302 0.183 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 6.64e-01 0.0767 0.176 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 3.61e-01 0.159 0.174 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 7.01e-01 0.0619 0.161 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 1.66e-01 -0.208 0.15 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 5.38e-01 -0.138 0.223 0.052 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0112 0.237 0.052 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.59e-01 -0.268 0.237 0.052 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 5.58e-01 0.123 0.209 0.052 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 6.28e-02 -0.431 0.23 0.052 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 1.30e-01 -0.379 0.249 0.052 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.39e-01 0.015 0.194 0.062 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 4.35e-01 -0.142 0.182 0.062 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 5.68e-01 -0.111 0.194 0.062 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 8.28e-01 0.0373 0.171 0.062 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 9.92e-01 0.00153 0.159 0.062 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 1.34e-01 -0.228 0.152 0.062 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 1.62e-01 -0.252 0.18 0.059 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 5.71e-01 0.106 0.186 0.059 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 3.96e-01 0.162 0.19 0.059 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 3.66e-01 -0.15 0.166 0.059 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 9.17e-01 0.014 0.135 0.059 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 4.89e-02 0.375 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.16e-01 0.0233 0.221 0.054 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 5.19e-01 -0.133 0.205 0.054 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 4.22e-01 0.178 0.221 0.054 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 3.36e-01 -0.129 0.133 0.054 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 3.38e-01 0.171 0.178 0.054 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -317032 sc-eQTL 2.18e-01 0.247 0.2 0.054 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 3.65e-01 -0.178 0.196 0.054 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0854 0.221 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 9.74e-01 0.00595 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 2.22e-02 -0.422 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0229 0.147 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 2.13e-01 -0.241 0.193 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 7.93e-01 0.0493 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 7.05e-01 -0.07 0.185 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 9.72e-01 0.00664 0.192 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.14e-01 0.173 0.139 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 6.00e-01 -0.101 0.193 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 9.38e-01 0.0137 0.176 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 1.07e-01 -0.286 0.177 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 3.23e-01 0.181 0.183 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 3.71e-01 0.158 0.177 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 2.08e-01 0.22 0.174 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 6.05e-01 0.0758 0.146 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 3.73e-01 -0.11 0.123 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0989 0.17 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 4.76e-01 -0.132 0.185 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 8.04e-01 0.047 0.19 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -719486 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0341 0.168 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0613 0.113 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 8.84e-01 0.0229 0.158 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 834652 sc-eQTL 7.34e-01 -0.049 0.144 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -992589 sc-eQTL 8.55e-01 0.0338 0.185 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 834342 sc-eQTL 1.30e-01 -0.277 0.182 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -639691 sc-eQTL 2.91e-01 0.0917 0.0867 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 904691 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0978 0.202 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -992524 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00482 0.192 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116675 DNAJC6 -820156 pQTL 0.0495 0.0699 0.0355 0.0 0.0 0.0361
ENSG00000185483 ROR1 654046 pQTL 0.0324 0.0796 0.0372 0.0 0.0 0.0361
ENSG00000231485 AL357078.1 -639674 eQTL 0.0144 -0.27 0.11 0.00245 0.0 0.0343

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000233877 \N -513916 1.58e-06 2.3e-06 5.92e-07 1.44e-06 4.59e-07 6.4e-07 1.61e-06 3.86e-07 1.77e-06 7.04e-07 1.87e-06 1.32e-06 3.07e-06 1.31e-06 9.33e-07 1.38e-06 1.27e-06 1.89e-06 1.38e-06 7.6e-07 1.37e-06 2.35e-06 2.15e-06 9.8e-07 2.42e-06 8.9e-07 1.21e-06 1.39e-06 1.8e-06 2.56e-06 7.63e-07 3.26e-07 5.36e-07 5.51e-07 7.08e-07 8.53e-07 8.44e-07 3.46e-07 5.35e-07 3.02e-07 3.03e-07 2.13e-06 6.6e-07 1.99e-07 3.06e-07 3.46e-07 4.17e-07 2.23e-07 1.82e-07