logo

Genes within 1Mb (chr1:64426714:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0387 0.0982 0.177 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.68e-01 0.00448 0.113 0.177 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0517 0.0692 0.177 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 7.75e-02 -0.203 0.114 0.177 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.90e-01 0.0353 0.0885 0.177 B L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0868 0.0842 0.177 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0243 0.108 0.177 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00946 0.0645 0.177 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 5.25e-01 -0.043 0.0675 0.177 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.76e-01 0.0544 0.097 0.177 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 9.45e-01 0.00724 0.106 0.177 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0233 0.0937 0.177 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 4.96e-01 0.0779 0.114 0.177 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 6.47e-01 -0.051 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00142 0.0563 0.177 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0967 0.0884 0.177 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0593 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0431 0.117 0.177 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.51e-01 -0.123 0.107 0.171 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0532 0.116 0.171 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0424 0.124 0.171 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0955 0.0977 0.171 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00755 0.0815 0.171 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 7.54e-02 0.185 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 9.75e-01 0.00342 0.108 0.171 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 4.38e-01 0.0896 0.115 0.171 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.38e-02 -0.228 0.1 0.177 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0441 0.113 0.177 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.07e-01 0.176 0.109 0.177 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 6.23e-01 0.0508 0.103 0.177 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 9.32e-01 0.00625 0.0735 0.177 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.37e-01 0.015 0.0728 0.177 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0893 0.0862 0.176 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 6.23e-01 -0.054 0.11 0.176 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 5.32e-03 -0.308 0.109 0.176 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 7.81e-01 0.0145 0.0519 0.176 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.121 0.176 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 4.17e-01 0.0962 0.118 0.176 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0921 0.0982 0.177 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.95e-01 -0.053 0.0774 0.177 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.44e-01 0.0148 0.0751 0.177 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 8.56e-01 0.0198 0.109 0.177 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.67e-02 -0.227 0.119 0.177 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0928 0.118 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0343 0.13 0.176 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 3.16e-01 -0.119 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.65e-01 0.0201 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 1.60e-01 -0.158 0.112 0.176 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 2.50e-01 0.143 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.76e-01 0.0183 0.117 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 2.80e-01 -0.124 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0118 0.0991 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0645 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0432 0.116 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0587 0.115 0.177 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.10e-01 0.19 0.119 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.90e-02 -0.194 0.0982 0.177 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 1.39e-01 -0.175 0.118 0.177 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.46e-01 0.0696 0.115 0.177 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0556 0.116 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 5.66e-01 0.0657 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0878 0.0882 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0855 0.122 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 7.79e-01 0.0324 0.115 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0433 0.115 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0492 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 7.25e-01 0.033 0.0935 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 8.21e-01 0.0271 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.57e-01 0.0502 0.113 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.12 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.81e-01 0.00289 0.123 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 9.15e-01 0.00478 0.0446 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0801 0.11 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0423 0.117 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0801 0.126 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0767 0.0946 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00817 0.109 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00247 0.0647 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 7.28e-01 -0.023 0.066 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 8.25e-01 0.0241 0.108 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0202 0.107 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.71e-01 -0.016 0.0981 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 7.19e-01 0.0417 0.116 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0999 0.0916 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0987 0.0749 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 2.40e-01 0.132 0.112 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.60e-01 0.0479 0.109 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0111 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 8.76e-01 0.0179 0.114 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 3.17e-01 0.0709 0.0706 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 7.95e-01 0.0262 0.101 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0267 0.119 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 3.76e-01 0.106 0.119 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.20e-01 0.0108 0.107 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 3.32e-01 0.109 0.112 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.71e-01 0.00442 0.119 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 1.66e-01 0.0701 0.0504 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 2.54e-01 -0.108 0.0943 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0881 0.122 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.66e-01 0.0195 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0508 0.108 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 1.80e-01 -0.15 0.112 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 7.40e-01 0.0373 0.112 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0316 0.0778 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0915 0.0934 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.99e-01 0.0557 0.106 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0488 0.115 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.122 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 9.47e-01 0.00771 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.83e-01 0.00253 0.119 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0351 0.0627 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0733 0.101 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00566 0.122 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 4.19e-01 -0.102 0.126 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.46e-01 0.0242 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0378 0.108 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 7.13e-01 0.0465 0.126 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0169 0.0257 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0916 0.122 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 6.45e-01 0.0565 0.123 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.15e-01 0.0632 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.37e-01 -0.11 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00383 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.01e-01 0.0263 0.104 0.177 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0116 0.111 0.177 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0396 0.118 0.177 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 3.42e-01 -0.114 0.119 0.177 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.80e-01 0.0467 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 1.84e-01 0.143 0.107 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0463 0.117 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0542 0.0735 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 6.35e-01 0.0548 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 9.79e-01 0.00321 0.121 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.75e-02 -0.154 0.0896 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 2.82e-01 -0.125 0.116 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.35e-03 -0.325 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 6.59e-01 0.0268 0.0608 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 4.42e-01 0.0956 0.124 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 1.88e-01 0.162 0.122 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0688 0.121 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 2.46e-01 0.117 0.101 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.78e-01 -0.158 0.117 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0395 0.0786 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0684 0.112 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.66e-01 0.07 0.122 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0982 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 3.47e-01 -0.105 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 2.47e-01 -0.127 0.109 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 5.29e-01 0.041 0.065 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 2.73e-02 -0.256 0.115 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0166 0.118 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.49e-01 0.00868 0.137 0.189 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0937 0.133 0.189 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 3.00e-03 0.294 0.0969 0.189 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0175 0.147 0.189 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 2.39e-01 0.166 0.14 0.189 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.25e-01 -0.13 0.107 0.176 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 8.02e-02 0.167 0.0952 0.176 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.53e-01 -0.014 0.0756 0.176 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 5.92e-01 0.0536 0.0997 0.176 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 9.01e-02 -0.188 0.111 0.176 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.79e-01 0.0179 0.118 0.176 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.65e-01 -0.125 0.112 0.177 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0536 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -43415 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0822 0.0888 0.177 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 6.16e-01 0.0476 0.0948 0.177 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 7.40e-01 0.0374 0.113 0.177 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0606 0.123 0.177 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.72e-03 -0.301 0.115 0.168 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0758 0.121 0.168 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 3.44e-01 -0.122 0.128 0.168 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.168 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 5.43e-01 0.061 0.1 0.168 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 8.13e-01 0.0261 0.11 0.168 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 3.31e-01 0.1 0.103 0.168 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.62e-01 -0.071 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 5.80e-03 -0.289 0.104 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 2.98e-01 -0.118 0.113 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 5.95e-01 0.059 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 5.60e-01 0.0609 0.104 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 3.41e-01 0.0903 0.0947 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.97e-01 0.0406 0.0766 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0514 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 5.13e-01 0.0736 0.112 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.95e-01 0.14 0.107 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0433 0.107 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0958 0.0981 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0856 0.0918 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0303 0.13 0.173 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.41e-01 -0.106 0.138 0.173 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 7.20e-02 -0.249 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 3.29e-01 0.119 0.122 0.173 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 3.57e-01 -0.125 0.135 0.173 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0792 0.146 0.173 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0688 0.118 0.176 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 7.93e-01 0.0291 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0891 0.118 0.176 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 3.36e-01 -0.101 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 6.96e-01 0.0378 0.0966 0.176 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0146 0.0931 0.176 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.79e-02 -0.178 0.107 0.174 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 6.65e-01 0.0485 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.54e-01 0.163 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 7.59e-01 0.0306 0.0996 0.174 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0436 0.0805 0.174 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 1.52e-01 0.164 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 7.38e-01 0.0435 0.13 0.167 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0405 0.12 0.167 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 2.85e-01 0.139 0.13 0.167 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 4.01e-01 -0.066 0.0783 0.167 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0179 0.105 0.167 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -318381 sc-eQTL 1.72e-02 0.279 0.116 0.167 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0892 0.115 0.167 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 7.46e-01 0.0422 0.13 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00143 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 8.54e-01 0.0205 0.111 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 2.37e-01 -0.104 0.0874 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 7.51e-02 -0.206 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 4.24e-01 0.0902 0.112 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 7.85e-01 -0.031 0.113 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 8.56e-01 0.0214 0.118 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0174 0.0854 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0213 0.118 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00349 0.108 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.00e-02 -0.233 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0862 0.111 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 1.24e-01 0.165 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 5.86e-01 0.0578 0.106 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.24e-01 0.0197 0.0889 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 8.96e-01 0.00971 0.0745 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0925 0.103 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.113 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 4.21e-01 0.0928 0.115 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -720835 sc-eQTL 9.87e-01 0.00171 0.102 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0116 0.0687 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 1.95e-01 0.124 0.0954 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 833303 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0964 0.0878 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -993938 sc-eQTL 2.83e-01 -0.122 0.113 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 832993 sc-eQTL 2.77e-03 -0.332 0.11 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -641040 sc-eQTL 6.87e-01 0.0215 0.0531 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 903342 sc-eQTL 3.47e-01 -0.116 0.123 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -993873 sc-eQTL 3.09e-01 0.12 0.117 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000233877 \N -515265 1.11e-06 9.01e-07 3.08e-07 4.43e-07 1.07e-07 2.67e-07 6.72e-07 9.26e-08 6.71e-07 3.1e-07 1.09e-06 5.51e-07 1.3e-06 2.33e-07 3.56e-07 4.96e-07 8.01e-07 5.31e-07 2.57e-07 2.15e-07 2.57e-07 7.58e-07 5.87e-07 2.19e-07 1.52e-06 2.41e-07 3.26e-07 4.71e-07 6.47e-07 8.5e-07 4.47e-07 2.53e-07 1.48e-07 2.22e-07 3.71e-07 3.59e-07 4.92e-07 1.38e-07 1.41e-07 2.26e-08 2.58e-07 1.3e-06 7.53e-08 1.88e-08 1.26e-07 4.28e-08 1.21e-07 5.39e-08 6.03e-08