logo

Genes within 1Mb (chr1:64424888:CCATACTACATTACTTCAGGACT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0308 0.0784 0.517 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.69e-02 -0.149 0.0893 0.517 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 7.60e-01 0.0169 0.0553 0.517 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0826 0.0919 0.517 B L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0046 0.0707 0.517 B L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 8.78e-01 0.0105 0.0679 0.517 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 8.48e-02 -0.149 0.0863 0.517 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 8.87e-01 0.00737 0.0519 0.517 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 3.14e-01 0.0547 0.0542 0.517 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0571 0.0779 0.517 CD4T L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.59e-01 0.0498 0.0849 0.517 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 1.35e-01 -0.111 0.0741 0.517 CD8T L1
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 3.15e-02 -0.195 0.0899 0.517 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0804 0.0883 0.517 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 7.29e-01 0.0155 0.0447 0.517 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.52e-02 0.17 0.0695 0.517 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0773 0.088 0.517 CD8T L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0679 0.0933 0.517 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.67e-01 0.0363 0.0843 0.516 DC L1
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0735 0.0918 0.516 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0121 0.0976 0.516 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0196 0.0773 0.516 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.06e-01 0.0428 0.0642 0.516 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 7.90e-01 0.0219 0.0824 0.516 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.73e-01 -0.093 0.0847 0.516 DC L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0976 0.0909 0.516 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 3.49e-01 0.076 0.081 0.517 Mono L1
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 3.64e-01 0.0818 0.09 0.517 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.39e-02 -0.168 0.0867 0.517 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0894 0.0823 0.517 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00542 0.0588 0.517 Mono L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 2.20e-01 0.0714 0.058 0.517 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0506 0.0698 0.517 NK L1
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 8.84e-01 0.013 0.0889 0.517 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 4.48e-01 0.0684 0.09 0.517 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 8.86e-01 0.00602 0.042 0.517 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.17e-01 0.121 0.0975 0.517 NK L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.69e-02 0.182 0.095 0.517 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0361 0.0788 0.517 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.19e-01 0.00633 0.0621 0.517 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00715 0.0601 0.517 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0965 0.0871 0.517 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 3.02e-01 0.0988 0.0955 0.517 Other_T L1
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.97e-01 0.0499 0.0944 0.517 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 3.03e-01 -0.108 0.104 0.52 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 1.96e-01 -0.124 0.0954 0.52 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0395 0.0957 0.52 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.92e-01 0.0625 0.0906 0.52 B_Activated L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 8.13e-01 0.0237 0.1 0.52 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0298 0.0936 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 2.24e-01 -0.111 0.0913 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 2.78e-01 0.0857 0.0789 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.32e-01 -0.108 0.0904 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 7.56e-01 0.0289 0.0927 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.32e-01 0.0318 0.0927 0.517 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 1.80e-01 -0.129 0.0957 0.517 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.61e-01 0.112 0.0795 0.517 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0764 0.0953 0.517 B_Memory L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 8.25e-01 0.0206 0.0928 0.517 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 2.38e-01 -0.111 0.0941 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 8.19e-02 -0.161 0.0921 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 4.09e-01 0.0593 0.0717 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0279 0.099 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 2.74e-01 -0.102 0.0934 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.53e-01 0.0419 0.093 0.519 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 2.57e-01 -0.11 0.0971 0.519 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 6.83e-01 0.0309 0.0755 0.519 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 6.56e-01 0.0433 0.0969 0.519 B_Naive2 L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 6.25e-01 0.0445 0.091 0.519 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00852 0.0935 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 8.59e-01 0.017 0.0956 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 9.32e-01 0.00295 0.0348 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.63e-02 -0.163 0.085 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 7.39e-01 0.0303 0.0908 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 1.64e-01 0.137 0.098 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0565 0.0762 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.58e-02 -0.184 0.0871 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0112 0.0521 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 4.75e-01 0.0381 0.0532 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 5.29e-01 0.0551 0.0873 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 4.86e-01 0.0602 0.0862 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 8.83e-01 0.0117 0.0795 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0827 0.0937 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 1.60e-01 0.104 0.074 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 3.00e-01 0.0631 0.0607 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.98e-03 -0.253 0.0892 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 3.85e-01 0.0768 0.0881 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.91e-01 0.064 0.0926 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 1.04e-01 -0.148 0.0905 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0448 0.0562 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 2.96e-01 0.0837 0.0799 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0647 0.0943 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0362 0.0951 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 1.57e-01 -0.121 0.0848 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 3.16e-01 -0.09 0.0895 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.69e-01 0.0542 0.0951 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0312 0.0403 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.19e-01 0.117 0.0749 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0403 0.0974 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0531 0.092 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0459 0.0873 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 2.54e-01 -0.104 0.0906 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0598 0.0908 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 5.47e-01 0.038 0.0629 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.16e-02 0.147 0.0751 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0813 0.0855 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 8.52e-01 0.0174 0.0928 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0948 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0454 0.0905 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00785 0.0931 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 9.35e-01 0.00398 0.0489 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.33e-01 0.118 0.0782 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 9.07e-01 0.0111 0.0949 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.92e-02 -0.185 0.0972 0.519 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0372 0.0968 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0856 0.0832 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.07e-01 -0.1 0.0978 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 8.33e-01 0.00421 0.02 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.73e-01 0.129 0.0939 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00161 0.0951 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 3.94e-01 -0.083 0.0971 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0734 0.0903 0.517 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.76e-01 0.0802 0.0905 0.517 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.35e-01 -0.122 0.0814 0.517 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0644 0.0871 0.517 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 6.25e-01 0.0456 0.0933 0.517 MAIT L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0896 0.0941 0.517 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0521 0.0933 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 1.46e-01 -0.129 0.0883 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 1.49e-01 -0.139 0.096 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 8.83e-01 0.00895 0.0608 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.32e-01 0.114 0.0949 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 9.53e-02 0.166 0.0992 0.522 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 8.15e-01 0.017 0.0726 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 4.74e-01 0.0671 0.0935 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.60e-02 0.176 0.0918 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.96e-01 0.026 0.0489 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 7.93e-01 0.0263 0.1 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 3.64e-01 0.0898 0.0988 0.519 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0705 0.101 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0601 0.0842 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 7.74e-01 0.0282 0.0981 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.96e-02 0.123 0.065 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000375 0.0935 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0163 0.102 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.08e-02 -0.143 0.0788 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 1.88e-01 0.119 0.0897 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0716 0.088 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 4.73e-01 0.0377 0.0524 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 3.09e-02 0.202 0.0928 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 2.70e-02 0.21 0.0942 0.519 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.92e-01 0.0277 0.105 0.515 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0066 0.103 0.515 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 8.65e-03 -0.201 0.0751 0.515 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0769 0.113 0.515 PB L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0367 0.109 0.515 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0525 0.0878 0.522 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0302 0.0787 0.522 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 7.48e-01 -0.02 0.0621 0.522 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0283 0.0819 0.522 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.86e-01 0.0638 0.0914 0.522 Pro_T L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 9.48e-01 0.00628 0.0966 0.522 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 8.77e-01 0.0142 0.0916 0.517 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 8.41e-01 0.0193 0.0961 0.517 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -45241 sc-eQTL 2.42e-01 0.085 0.0724 0.517 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 6.76e-01 0.0324 0.0774 0.517 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00913 0.092 0.517 Treg L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0356 0.1 0.517 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 2.51e-01 0.106 0.0918 0.515 cDC L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0313 0.0954 0.515 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0665 0.101 0.515 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0487 0.0842 0.515 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 4.80e-01 0.0556 0.0785 0.515 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 4.97e-01 0.0587 0.0863 0.515 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.35e-02 -0.183 0.0799 0.515 cDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 6.72e-01 0.0407 0.0958 0.515 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 5.54e-01 0.0508 0.0857 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0917 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 6.35e-02 -0.167 0.0894 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0315 0.0848 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0266 0.0771 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 1.37e-01 0.0925 0.062 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 3.67e-01 0.0858 0.0949 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 7.17e-01 0.0329 0.0908 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00753 0.0872 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0897 0.0859 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 3.54e-01 0.0738 0.0794 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 3.91e-01 0.0638 0.0743 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 7.85e-01 0.0278 0.102 0.512 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 7.60e-01 -0.033 0.108 0.512 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 6.72e-01 0.0459 0.108 0.512 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 1.57e-01 -0.135 0.0946 0.512 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 1.67e-01 0.146 0.105 0.512 gdT L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 1.57e-01 0.161 0.113 0.512 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 2.20e-01 0.117 0.0954 0.511 intMono L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0912 0.0895 0.511 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0618 0.0956 0.511 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 3.73e-02 0.175 0.0836 0.511 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0246 0.0781 0.511 intMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0484 0.0753 0.511 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.50e-01 0.0394 0.0867 0.514 ncMono L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 7.68e-01 0.0265 0.0896 0.514 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 5.28e-03 -0.253 0.0898 0.514 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 1.05e-01 -0.129 0.0794 0.514 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0393 0.0646 0.514 ncMono L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0317 0.0917 0.514 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0726 0.103 0.52 pDC L2
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0499 0.0953 0.52 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000575 0.103 0.52 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 2.10e-01 0.0779 0.0619 0.52 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 8.86e-01 0.012 0.0831 0.52 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -320207 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0662 0.0934 0.52 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0123 0.0913 0.52 pDC L2
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 1.64e-01 -0.143 0.102 0.52 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0425 0.0867 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 8.18e-02 -0.154 0.0878 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 1.90e-01 0.0914 0.0695 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0632 0.092 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0119 0.0896 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0738 0.0913 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 7.07e-02 -0.171 0.0941 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 3.32e-01 0.0667 0.0686 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0142 0.0953 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00215 0.0869 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 3.36e-01 0.0835 0.0865 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 1.92e-01 0.117 0.0889 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 4.14e-02 -0.176 0.0856 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 2.35e-01 -0.101 0.0851 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 8.78e-01 0.011 0.0715 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 1.84e-01 0.0796 0.0597 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 4.94e-01 0.0564 0.0824 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0281 0.0897 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 3.31e-02 -0.195 0.0907 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -722661 sc-eQTL 3.71e-01 0.0727 0.0811 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0487 0.0545 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0355 0.0761 0.517 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 831477 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0309 0.0709 0.519 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116678 LEPR -995764 sc-eQTL 4.36e-01 0.0713 0.0913 0.519 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 831167 sc-eQTL 2.35e-01 0.107 0.09 0.519 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -642866 sc-eQTL 6.45e-01 0.0197 0.0428 0.519 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 901516 sc-eQTL 2.60e-01 0.112 0.0994 0.519 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000213625 LEPROT -995699 sc-eQTL 5.50e-02 0.181 0.0939 0.519 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000226891 LINC01359 -577601 eQTL 0.0179 0.0655 0.0276 0.0 0.0 0.433

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina