logo

Genes within 1Mb (chr1:64365370:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0655 0.0917 0.205 B L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 9.41e-02 0.159 0.0945 0.205 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 8.32e-01 0.0224 0.105 0.205 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0316 0.0648 0.205 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 7.90e-01 0.0288 0.108 0.205 B L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0139 0.0788 0.205 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0345 0.0869 0.205 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0237 0.101 0.205 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 7.31e-01 0.0207 0.0602 0.205 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0253 0.0631 0.205 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0174 0.0906 0.205 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00176 0.0886 0.205 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 6.60e-01 0.043 0.0976 0.205 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00548 0.105 0.205 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 1.06e-01 0.0859 0.0529 0.205 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 9.71e-01 0.00306 0.0838 0.205 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0545 0.105 0.205 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 3.93e-01 -0.084 0.0981 0.2 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 8.47e-01 0.0196 0.101 0.2 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0929 0.114 0.2 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 1.10e-01 -0.144 0.0895 0.2 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0783 0.0747 0.2 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 3.05e-01 0.0985 0.0957 0.2 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.26e-01 0.0629 0.0989 0.2 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 2.97e-02 -0.206 0.0943 0.205 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.62e-01 0.112 0.0992 0.205 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 3.63e-01 0.0936 0.103 0.205 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 9.25e-01 0.00917 0.0969 0.205 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.69e-01 0.0501 0.069 0.205 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0856 0.0805 0.204 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.43e-01 -0.11 0.0944 0.204 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.52e-01 -0.033 0.104 0.204 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0328 0.0484 0.204 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0867 0.113 0.204 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 4.45e-02 -0.184 0.0908 0.205 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 4.09e-01 0.0761 0.092 0.205 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.42e-01 0.0336 0.0722 0.205 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0919 0.0697 0.205 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 3.30e-01 0.099 0.101 0.205 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0983 0.111 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0017 0.125 0.199 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 9.06e-01 0.0142 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 3.55e-01 -0.106 0.114 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0397 0.115 0.199 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 1.87e-01 -0.143 0.108 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 7.72e-01 0.0316 0.109 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.91e-01 0.095 0.11 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 3.34e-01 0.103 0.106 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 8.64e-01 0.0157 0.092 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.91e-01 0.0145 0.106 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00267 0.107 0.205 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.84e-01 0.095 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 1.08e-01 0.179 0.111 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.02e-01 -0.151 0.0919 0.205 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.65e-01 0.0636 0.11 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 2.41e-01 -0.127 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.43e-01 0.103 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.05e-01 0.055 0.106 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0646 0.0821 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.95e-01 0.0965 0.113 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.38e-01 0.0083 0.106 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 5.39e-01 0.068 0.11 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.81e-02 -0.202 0.11 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0199 0.086 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 7.78e-01 0.0311 0.11 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00747 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0633 0.118 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 5.46e-01 0.0692 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 4.22e-01 0.0334 0.0415 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.50e-01 -0.147 0.102 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0472 0.109 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0665 0.0879 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.91e-01 -0.101 0.0953 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0326 0.101 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 5.82e-01 0.0331 0.0601 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 9.60e-01 0.00308 0.0614 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0866 0.101 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00669 0.0917 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.78e-01 0.0939 0.106 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0231 0.108 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0537 0.0858 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0965 0.0699 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.95e-01 0.0138 0.105 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 8.69e-01 0.0179 0.109 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 1.86e-01 0.144 0.109 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 3.59e-01 0.0979 0.106 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 9.71e-01 0.00238 0.0659 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000314 0.0937 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 1.54e-01 0.157 0.11 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0443 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 8.48e-01 0.0205 0.107 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0303 0.113 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 4.52e-01 0.0359 0.0477 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.04e-01 -0.145 0.0885 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0478 0.115 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000133 0.1 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.41e-01 0.122 0.104 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 2.84e-01 0.112 0.104 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 2.93e-01 0.076 0.0722 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 3.17e-01 0.0871 0.0868 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 6.24e-01 0.0482 0.0983 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0147 0.114 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.78e-01 -0.125 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 8.01e-01 0.0283 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0954 0.0585 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0259 0.0947 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.26e-01 -0.112 0.114 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 7.38e-01 0.0385 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0431 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0362 0.116 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0133 0.0237 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 2.54e-01 -0.128 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0275 0.113 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 2.72e-01 -0.116 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0666 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 9.93e-01 0.000891 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 3.94e-02 -0.197 0.0948 0.203 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0133 0.102 0.203 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.95e-01 0.0581 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0473 0.106 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0121 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0221 0.109 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 8.84e-02 -0.117 0.0683 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0276 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 1.25e-01 -0.128 0.0831 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.42e-01 -0.124 0.106 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0864 0.107 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0397 0.0563 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.61e-01 0.0202 0.115 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0701 0.115 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0867 0.119 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 5.17e-01 0.0723 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.57e-01 -0.105 0.0741 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 8.74e-01 0.0168 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 3.36e-01 0.0892 0.0924 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0712 0.105 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 9.38e-01 0.00798 0.103 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 8.19e-01 0.014 0.0611 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 9.89e-02 -0.18 0.109 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 3.35e-01 -0.123 0.127 0.215 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.80e-01 0.118 0.133 0.215 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 3.55e-01 0.115 0.124 0.215 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.33e-02 0.23 0.0914 0.215 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.03e-01 -0.141 0.136 0.215 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 8.08e-02 -0.17 0.0968 0.204 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 3.84e-01 0.0863 0.099 0.204 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 1.56e-01 0.124 0.087 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0524 0.0688 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 4.97e-01 0.0618 0.0908 0.204 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0661 0.101 0.204 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 5.17e-01 -0.067 0.103 0.205 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0317 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 5.31e-01 0.0681 0.108 0.205 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0384 0.082 0.205 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0165 0.0874 0.205 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0605 0.104 0.205 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 1.54e-01 -0.151 0.106 0.2 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 1.16e-01 -0.169 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 4.50e-01 -0.088 0.116 0.2 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 2.94e-01 -0.102 0.0969 0.2 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0565 0.0906 0.2 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 5.39e-01 0.0614 0.0996 0.2 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 9.06e-02 0.158 0.0928 0.2 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 1.21e-02 -0.247 0.0974 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0987 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0848 0.104 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 8.28e-01 0.0213 0.0978 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.60e-01 0.0392 0.0889 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 8.13e-01 -0.026 0.11 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 5.12e-01 0.0662 0.101 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 6.09e-01 -0.051 0.0995 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 3.02e-01 0.0949 0.0917 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0808 0.116 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 1.92e-01 0.162 0.123 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 2.25e-02 0.28 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 1.08e-01 -0.199 0.123 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 3.90e-01 0.0939 0.109 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 2.69e-01 -0.134 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 6.40e-01 -0.051 0.109 0.204 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 7.91e-02 -0.178 0.101 0.204 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.12e-01 0.0554 0.109 0.204 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0202 0.0962 0.204 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00261 0.089 0.204 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 5.82e-01 -0.055 0.0998 0.201 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 1.70e-01 0.15 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 1.08e-01 0.169 0.105 0.201 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 4.75e-02 -0.182 0.0911 0.201 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0353 0.0744 0.201 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 5.89e-01 0.0642 0.119 0.192 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 7.97e-02 0.202 0.114 0.192 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.91e-01 0.0473 0.119 0.192 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0574 0.0716 0.192 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0352 0.0957 0.192 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -379725 sc-eQTL 2.42e-01 0.126 0.107 0.192 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 6.48e-01 0.0482 0.105 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 4.42e-01 0.0784 0.102 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 8.87e-02 0.191 0.112 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.104 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0458 0.0819 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0055 0.108 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0889 0.105 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.64e-01 0.121 0.108 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0613 0.109 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0312 0.0792 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 3.64e-01 0.0996 0.11 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 3.76e-02 -0.21 0.1 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.0978 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.69e-01 0.0297 0.101 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 6.26e-01 0.0487 0.0999 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 4.57e-01 0.0622 0.0835 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0377 0.0955 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000671 0.108 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 6.30e-02 0.197 0.105 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -782179 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0811 0.0939 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00562 0.0633 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 771959 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0904 0.0814 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 997795 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.0977 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 771649 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0398 0.104 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -702384 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0235 0.0493 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 841998 sc-eQTL 5.83e-01 -0.063 0.115 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 eQTL 0.00607 -0.1 0.0365 0.0 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000158966 CACHD1 -104759 4.91e-06 5.05e-06 6.2e-07 3.08e-06 1.48e-06 1.56e-06 6.11e-06 1.23e-06 5.05e-06 2.82e-06 6.12e-06 3.17e-06 7.67e-06 1.95e-06 1.04e-06 3.9e-06 1.89e-06 4.02e-06 1.47e-06 1.47e-06 2.69e-06 5.15e-06 4.68e-06 2.01e-06 7.97e-06 2.16e-06 2.28e-06 1.55e-06 4.95e-06 5.18e-06 2.89e-06 5.03e-07 7.22e-07 2.33e-06 2.04e-06 1.33e-06 1.11e-06 4.51e-07 9.82e-07 6.24e-07 8.2e-07 6.25e-06 5.26e-07 1.64e-07 7.63e-07 1.06e-06 1.03e-06 6.82e-07 5.81e-07
ENSG00000162434 \N -601179 5.74e-07 2.67e-07 8.9e-08 2.48e-07 1.05e-07 1.44e-07 3.7e-07 9.26e-08 2.76e-07 1.78e-07 3.25e-07 2.55e-07 4.34e-07 9.15e-08 1.24e-07 1.63e-07 1.35e-07 2.96e-07 1.5e-07 8.25e-08 1.65e-07 2.63e-07 2.48e-07 1.04e-07 3.98e-07 2.2e-07 1.85e-07 1.69e-07 2.11e-07 2.75e-07 1.78e-07 8.25e-08 5.41e-08 1.21e-07 1.39e-07 6.23e-08 7.63e-08 6.2e-08 5.89e-08 7.65e-08 2.84e-08 2.65e-07 1.65e-08 1.07e-08 8.01e-08 1.3e-08 9.83e-08 2.99e-09 5.61e-08