logo

Genes within 1Mb (chr1:64360255:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0328 0.0935 0.214 B L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.72e-01 0.0865 0.0967 0.214 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.07e-01 0.0125 0.107 0.214 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 8.30e-01 0.0142 0.066 0.214 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0626 0.11 0.214 B L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0765 0.0797 0.214 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0135 0.0882 0.214 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0414 0.102 0.214 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 2.82e-01 0.0657 0.0609 0.214 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 9.23e-01 0.00615 0.064 0.214 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0693 0.0917 0.214 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0154 0.0886 0.214 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 5.66e-01 0.0561 0.0976 0.214 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0198 0.105 0.214 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 1.58e-01 0.075 0.0529 0.214 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 9.94e-01 0.000582 0.0838 0.214 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 3.33e-01 -0.101 0.105 0.214 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.97e-02 -0.185 0.0975 0.214 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 1.24e-01 0.156 0.101 0.214 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.114 0.214 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 5.67e-02 -0.171 0.0893 0.214 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0755 0.0748 0.214 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 4.26e-01 0.0765 0.0959 0.214 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 3.48e-01 0.0929 0.0989 0.214 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0951 0.214 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.0996 0.214 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 1.16e-01 0.161 0.102 0.214 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0767 0.0969 0.214 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 4.86e-01 0.0482 0.0691 0.214 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.24e-01 -0.125 0.0809 0.212 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 5.88e-01 0.0517 0.0954 0.212 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 1.09e-01 -0.168 0.104 0.212 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0209 0.0489 0.212 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0242 0.114 0.212 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.89e-02 -0.217 0.0915 0.214 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 9.66e-01 0.00398 0.0932 0.214 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0402 0.073 0.214 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.70e-01 0.0302 0.0707 0.214 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0315 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 1.32e-01 -0.17 0.112 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.26e-01 -0.062 0.127 0.207 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.25e-01 -0.12 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0264 0.117 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 9.04e-01 0.014 0.116 0.207 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0267 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.98e-01 0.142 0.11 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.01e-01 0.0274 0.108 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0865 0.0934 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0508 0.107 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0137 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 1.36e-01 0.166 0.111 0.213 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 4.58e-01 0.0843 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0155 0.0943 0.213 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0624 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0951 0.11 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 9.71e-01 0.0041 0.111 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.109 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00171 0.0841 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0157 0.116 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0234 0.108 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.02e-01 0.059 0.113 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 2.13e-01 -0.141 0.113 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 3.11e-01 0.0891 0.0877 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.08e-01 0.0747 0.113 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0591 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.91e-01 -0.102 0.119 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.60e-02 0.22 0.114 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 3.64e-01 0.038 0.0418 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 7.47e-01 0.0333 0.103 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 1.43e-01 -0.16 0.109 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0903 0.0891 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.36e-01 -0.046 0.097 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0801 0.103 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 2.29e-01 0.0734 0.0608 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.10e-01 0.0411 0.0622 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0417 0.102 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0338 0.0927 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 4.70e-01 0.0778 0.108 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 7.81e-01 0.0305 0.11 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0858 0.0866 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0982 0.0707 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00901 0.11 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.73e-01 0.0178 0.111 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0206 0.108 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 3.79e-01 0.0589 0.0668 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.62e-01 0.0552 0.0951 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.35e-01 0.0697 0.112 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0779 0.1 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.57e-01 0.0474 0.107 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0168 0.112 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00205 0.0475 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0418 0.0886 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0533 0.115 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0336 0.102 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.106 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.106 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 2.17e-01 0.0909 0.0734 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 1.23e-01 0.136 0.0882 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0148 0.1 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 2.31e-01 0.138 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0542 0.116 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 7.69e-01 0.0333 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00454 0.0593 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.36e-01 0.0452 0.0954 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0824 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 9.27e-01 0.0105 0.115 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 9.39e-01 0.00885 0.115 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 2.21e-01 0.142 0.116 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0157 0.0236 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 7.53e-01 0.0352 0.112 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0482 0.112 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 2.64e-02 -0.236 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 2.50e-01 -0.121 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0364 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00813 0.0966 0.214 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0406 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0864 0.11 0.214 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0595 0.108 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.67e-01 0.0477 0.111 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.47e-01 0.0216 0.112 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0389 0.0704 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0711 0.11 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.09e-02 -0.157 0.0834 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0334 0.107 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 1.58e-01 -0.151 0.107 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0121 0.0566 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 2.68e-01 0.128 0.116 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0869 0.115 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.59e-01 0.0212 0.12 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0954 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0497 0.0747 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 5.28e-01 0.0673 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 4.34e-01 0.0727 0.0927 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 7.49e-01 0.0336 0.105 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0923 0.103 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.28e-01 0.0387 0.0612 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 2.02e-01 -0.14 0.109 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 3.31e-01 -0.136 0.139 0.233 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.69e-01 0.132 0.146 0.233 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 7.64e-01 0.0411 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.42e-02 0.189 0.101 0.233 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 3.40e-01 -0.143 0.149 0.233 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 2.07e-01 -0.126 0.0992 0.211 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0251 0.101 0.211 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.91e-02 0.147 0.0887 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0378 0.0704 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 9.02e-01 0.0115 0.0929 0.211 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.68e-01 0.0173 0.104 0.211 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.87e-01 0.0576 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 5.52e-01 0.0673 0.113 0.214 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 4.33e-01 0.0873 0.111 0.214 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0605 0.0839 0.214 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 4.99e-01 0.0605 0.0894 0.214 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0317 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.02e-02 -0.207 0.105 0.212 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 5.35e-01 0.0667 0.107 0.212 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 4.48e-01 -0.088 0.116 0.212 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 1.21e-01 -0.15 0.0963 0.212 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 8.18e-01 0.0208 0.0904 0.212 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 9.20e-01 0.00996 0.0994 0.212 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 9.42e-02 0.156 0.0925 0.212 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 2.78e-02 -0.219 0.099 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 7.62e-01 0.0304 0.1 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0129 0.105 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0654 0.0989 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.05e-01 0.0466 0.09 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.37e-01 0.0522 0.11 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 1.75e-01 0.137 0.101 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 2.88e-01 -0.106 0.0998 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 1.09e-01 0.148 0.0918 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0755 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0314 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.65e-01 0.022 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0638 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 9.45e-01 0.00786 0.114 0.209 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 8.77e-01 0.0197 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.68e-01 0.0478 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 2.07e-01 -0.131 0.103 0.211 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.36e-01 -0.069 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0228 0.0983 0.211 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0252 0.0909 0.211 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0597 0.101 0.208 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 4.73e-01 -0.08 0.111 0.208 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 1.50e-01 0.154 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 1.35e-01 -0.139 0.0928 0.208 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0282 0.0755 0.208 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0345 0.117 0.206 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.00e-02 0.245 0.112 0.206 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.17e-01 0.0759 0.117 0.206 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 6.68e-01 0.0303 0.0706 0.206 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 2.58e-01 -0.107 0.0939 0.206 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -384840 sc-eQTL 6.18e-02 0.198 0.105 0.206 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 4.57e-01 0.0772 0.103 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 3.28e-01 0.1 0.103 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 6.18e-02 0.212 0.113 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.48e-01 0.0629 0.105 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0255 0.0827 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0917 0.109 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 7.11e-01 -0.04 0.108 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 9.54e-01 0.00644 0.111 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0743 0.112 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.28e-01 0.0512 0.081 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 6.08e-01 0.0577 0.112 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.32e-01 -0.153 0.101 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 4.02e-01 0.0824 0.0982 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 2.83e-01 0.109 0.101 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0636 0.1 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 3.34e-01 0.081 0.0836 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 6.79e-01 0.0402 0.0968 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 3.08e-01 -0.112 0.11 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 4.42e-01 0.0828 0.108 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -787294 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0997 0.0951 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0357 0.0641 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 766844 sc-eQTL 1.20e-01 -0.128 0.0818 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 992680 sc-eQTL 8.53e-01 0.0184 0.0988 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 766534 sc-eQTL 8.62e-02 -0.179 0.104 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -707499 sc-eQTL 8.09e-01 -0.012 0.0497 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 836883 sc-eQTL 7.95e-01 0.0301 0.116 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000158966 CACHD1 -109874 eQTL 0.00361 -0.108 0.037 0.0 0.0013 0.198
ENSG00000185483 ROR1 586238 pQTL 0.0394 0.0333 0.0161 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231485 \N -707482 3.71e-07 2.4e-07 7.92e-08 2.43e-07 1.03e-07 1.28e-07 3.25e-07 6.72e-08 2.01e-07 1.28e-07 2.62e-07 1.86e-07 3.77e-07 8.26e-08 8.45e-08 1.13e-07 7.3e-08 2.56e-07 9.97e-08 8.52e-08 1.33e-07 2.07e-07 1.89e-07 4.81e-08 3.55e-07 1.76e-07 1.39e-07 1.54e-07 1.47e-07 2.39e-07 1.52e-07 4.51e-08 5.17e-08 9.9e-08 7.44e-08 4.6e-08 5.71e-08 5.8e-08 5.69e-08 7.17e-08 5.94e-08 2.5e-07 3.26e-08 5.8e-09 3.71e-08 1.03e-08 9.07e-08 0.0 5.58e-08