logo

Genes within 1Mb (chr1:64353246:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.26e-02 -0.172 0.0843 0.284 B L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.41e-01 0.0539 0.0881 0.284 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0838 0.0974 0.284 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 2.61e-01 0.0675 0.0599 0.284 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0675 0.0998 0.284 B L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0661 0.0731 0.284 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.63e-01 0.0352 0.0808 0.284 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.32e-02 -0.157 0.0931 0.284 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 6.64e-01 0.0244 0.0559 0.284 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.97e-02 0.12 0.058 0.284 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 7.03e-01 0.0321 0.0841 0.284 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.63e-02 -0.142 0.08 0.284 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0974 0.0886 0.284 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0104 0.0956 0.284 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00384 0.0484 0.284 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 4.62e-02 0.151 0.0755 0.284 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.64e-01 0.0415 0.0953 0.284 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.29e-01 0.0322 0.093 0.277 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 4.13e-01 0.0787 0.0959 0.277 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 1.11e-01 -0.171 0.107 0.277 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 5.70e-01 0.0485 0.0852 0.277 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.34e-01 0.106 0.0705 0.277 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 3.03e-01 0.0936 0.0906 0.277 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0558 0.0936 0.277 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.16e-01 0.0718 0.0881 0.284 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 9.48e-01 0.00596 0.0921 0.284 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 2.51e-02 -0.212 0.094 0.284 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 9.82e-01 0.00201 0.0897 0.284 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.53e-01 0.0201 0.064 0.284 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0919 0.0759 0.283 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.78e-01 0.0253 0.0893 0.283 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0164 0.0982 0.283 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.66e-01 0.0413 0.0456 0.283 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.03e-01 0.013 0.107 0.283 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.40e-01 0.0995 0.0845 0.284 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0675 0.085 0.284 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 1.08e-01 0.107 0.0663 0.284 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 6.17e-01 0.0323 0.0646 0.284 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0715 0.0938 0.284 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.69e-02 -0.225 0.112 0.286 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.79e-01 0.146 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.54e-01 0.00596 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 2.75e-01 0.113 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0164 0.0986 0.286 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0595 0.102 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0359 0.104 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0711 0.1 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.29e-01 0.03 0.0865 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00981 0.0992 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 1.64e-02 -0.239 0.0987 0.284 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.54e-01 -0.145 0.101 0.284 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 1.51e-01 -0.149 0.103 0.284 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 8.55e-02 -0.148 0.0856 0.284 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 7.19e-01 0.0372 0.103 0.284 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 3.81e-01 0.0905 0.103 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 7.61e-01 0.0308 0.101 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.76e-02 0.138 0.0777 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0709 0.108 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 1.36e-01 -0.149 0.1 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.41e-01 0.0489 0.105 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0632 0.105 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 4.44e-01 0.0625 0.0815 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.36e-01 0.00836 0.105 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 8.52e-01 0.0197 0.106 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.13e-01 0.0731 0.112 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0398 0.108 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0143 0.0392 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 8.14e-01 0.0228 0.0968 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 2.04e-02 0.237 0.101 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0676 0.0822 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0392 0.0894 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0728 0.0948 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 9.45e-01 0.00391 0.0562 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.90e-01 0.0752 0.0571 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 4.12e-01 0.0773 0.0941 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0955 0.0855 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.23e-01 0.0353 0.0995 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 2.76e-02 -0.222 0.1 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 1.03e-01 0.131 0.0797 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.44e-02 0.16 0.0647 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.18e-01 -0.049 0.0979 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.73e-01 0.0292 0.101 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.05e-01 0.0526 0.101 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0447 0.0992 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0759 0.0611 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.38e-01 0.129 0.0868 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0372 0.103 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.12e-01 -0.114 0.0912 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.74e-01 -0.132 0.0969 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0313 0.102 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 4.97e-02 0.0848 0.043 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.10e-01 0.0822 0.0808 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 2.26e-01 0.127 0.104 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 1.49e-01 -0.134 0.0928 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 8.83e-02 -0.164 0.0959 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0632 0.097 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0121 0.0673 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 8.35e-01 0.0168 0.0809 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 4.44e-01 -0.07 0.0914 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0439 0.105 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 9.89e-01 0.00147 0.106 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 4.10e-01 0.0848 0.103 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 1.69e-01 0.0742 0.0537 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.75e-01 0.0249 0.0868 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 2.48e-01 -0.121 0.104 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0311 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 9.17e-01 -0.011 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 3.38e-02 -0.225 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 2.18e-01 0.0267 0.0216 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.99e-01 0.131 0.102 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.39e-01 0.00788 0.103 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.12e-01 0.0808 0.0983 0.279 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 8.97e-01 0.0127 0.0975 0.279 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 2.37e-01 0.117 0.0983 0.279 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 4.54e-01 0.0667 0.089 0.279 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 5.68e-02 -0.18 0.0941 0.279 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 5.47e-01 0.0613 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.68e-01 0.0294 0.0997 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0475 0.102 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 6.59e-01 0.0455 0.103 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.52e-01 0.0605 0.0648 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0917 0.101 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0875 0.0796 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.28e-02 0.181 0.101 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 8.59e-01 0.0181 0.102 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 5.94e-01 0.0287 0.0538 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 1.34e-01 -0.165 0.11 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0317 0.106 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0694 0.11 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0507 0.103 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0296 0.0688 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0432 0.098 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 2.04e-01 -0.109 0.0855 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0652 0.0969 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0952 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 9.98e-01 0.000127 0.0567 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.285 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 8.87e-01 0.0185 0.129 0.285 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 4.39e-01 0.0932 0.12 0.285 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 8.11e-01 0.0218 0.0907 0.285 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00982 0.132 0.285 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 6.53e-01 0.0416 0.0923 0.287 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0418 0.0939 0.287 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00215 0.0828 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 5.14e-01 0.0427 0.0652 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 8.68e-01 0.0143 0.0861 0.287 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 5.22e-02 -0.186 0.0953 0.287 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0349 0.0978 0.284 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.92e-01 0.136 0.104 0.284 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 2.08e-02 -0.236 0.101 0.284 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -116883 sc-eQTL 1.59e-03 0.242 0.0758 0.284 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 2.16e-01 0.102 0.0824 0.284 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.81e-01 0.00237 0.0982 0.284 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 6.12e-01 0.0512 0.101 0.285 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.16e-01 0.161 0.102 0.285 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 1.30e-02 -0.272 0.109 0.285 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0167 0.0922 0.285 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 2.81e-01 0.0929 0.0858 0.285 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 5.03e-01 0.0634 0.0945 0.285 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0388 0.0887 0.285 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 9.79e-01 0.00242 0.0925 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.59e-01 0.0284 0.0926 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 2.33e-01 -0.116 0.097 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 5.07e-01 0.0608 0.0914 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0212 0.0832 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.94e-01 0.0698 0.102 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.14e-01 0.0675 0.103 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 4.74e-02 -0.185 0.0928 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 8.84e-01 0.0135 0.0925 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00361 0.0854 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 9.94e-01 0.000874 0.117 0.279 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 5.52e-01 0.074 0.124 0.279 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 8.96e-01 0.0162 0.124 0.279 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 5.80e-01 0.0689 0.124 0.279 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 2.76e-01 0.119 0.109 0.279 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 2.23e-01 -0.148 0.121 0.279 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0505 0.103 0.284 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.16e-01 -0.048 0.0955 0.284 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0957 0.102 0.284 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0472 0.0906 0.284 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.01e-02 0.151 0.0831 0.284 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0118 0.0926 0.287 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.101 0.287 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0643 0.0977 0.287 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0985 0.085 0.287 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 1.58e-01 0.0973 0.0687 0.287 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 9.70e-01 0.0044 0.116 0.28 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0444 0.113 0.28 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0111 0.116 0.28 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 6.57e-01 0.0312 0.07 0.28 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 5.45e-01 0.0567 0.0934 0.28 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -391849 sc-eQTL 5.05e-01 0.0704 0.105 0.28 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0349 0.103 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 4.78e-02 -0.186 0.0935 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0848 0.104 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 1.57e-01 -0.136 0.0958 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0677 0.0758 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 7.46e-01 0.0325 0.1 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 3.94e-02 -0.206 0.0994 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 3.38e-01 0.099 0.103 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 8.40e-01 0.0211 0.104 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 5.04e-02 0.147 0.0748 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0543 0.105 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 3.50e-01 0.0879 0.0938 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 7.11e-01 0.0338 0.091 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 3.44e-02 -0.198 0.0928 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 8.83e-01 0.0136 0.0926 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0238 0.0775 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0479 0.0896 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0909 0.0995 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -794303 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0449 0.0883 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 4.07e-02 0.121 0.0588 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 759835 sc-eQTL 1.92e-01 -0.102 0.0778 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 985671 sc-eQTL 4.24e-01 0.075 0.0937 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 759525 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00182 0.0995 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -714508 sc-eQTL 3.55e-01 0.0436 0.0471 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 829874 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00242 0.11 0.284 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 806164 eQTL 0.0178 0.0625 0.0263 0.00153 0.0 0.352
ENSG00000162434 JAK1 -613303 eQTL 0.0297 0.0325 0.0149 0.0 0.0 0.352
ENSG00000185483 ROR1 579229 pQTL 0.00835 -0.0368 0.0139 0.0 0.0 0.336

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 \N -794303 3.07e-07 1.5e-07 5.91e-08 2.07e-07 9.82e-08 8.33e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.66e-07 8.53e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.29e-07 8.13e-08 5.36e-08 8.71e-08 4.18e-08 1.72e-07 7.18e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.62e-07 3.49e-08 2.09e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.14e-07 3.66e-08 3.21e-08 9.8e-08 3.71e-08 2.68e-08 5.51e-08 8.89e-08 6.39e-08 4.24e-08 4.92e-08 1.59e-07 5.39e-08 1.23e-08 2.64e-08 1.71e-08 8.81e-08 1.91e-09 4.8e-08