logo

Genes within 1Mb (chr1:64350017:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0398 0.0953 0.209 B L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 3.84e-01 0.086 0.0986 0.209 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.109 0.209 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 9.65e-01 0.00296 0.0673 0.209 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 4.59e-01 -0.083 0.112 0.209 B L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0615 0.0813 0.209 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 7.13e-01 0.0331 0.0899 0.209 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0258 0.104 0.209 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 5.31e-01 0.039 0.0622 0.209 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 8.42e-01 0.0131 0.0652 0.209 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0625 0.0935 0.209 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 9.19e-01 0.00914 0.0901 0.209 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.81e-01 0.0409 0.0993 0.209 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0173 0.107 0.209 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 1.50e-01 0.0778 0.0538 0.209 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 9.84e-01 0.00175 0.0852 0.209 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0848 0.106 0.209 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 5.66e-02 -0.191 0.0998 0.209 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.11e-02 0.211 0.103 0.209 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0216 0.116 0.209 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 6.71e-02 -0.168 0.0915 0.209 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 3.16e-01 -0.077 0.0765 0.209 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 2.13e-01 0.122 0.0979 0.209 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 2.14e-01 0.126 0.101 0.209 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 1.61e-01 -0.137 0.0972 0.209 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.61e-01 0.0178 0.102 0.209 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 1.23e-01 0.162 0.105 0.209 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0731 0.0992 0.209 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.86e-01 0.0386 0.0708 0.209 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.03e-01 -0.106 0.0828 0.208 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 5.21e-01 0.0625 0.0974 0.208 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 1.29e-01 -0.163 0.107 0.208 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0235 0.0499 0.208 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0818 0.116 0.208 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 1.41e-02 -0.231 0.0932 0.209 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.07e-01 0.0233 0.095 0.209 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0785 0.0742 0.209 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.26e-01 0.0351 0.0721 0.209 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0191 0.105 0.209 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 2.47e-01 -0.133 0.114 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 8.51e-01 0.0247 0.131 0.202 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0787 0.126 0.202 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.81e-01 0.0181 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0152 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0108 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 1.73e-01 0.154 0.113 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 2.93e-01 0.121 0.115 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.84e-01 0.0162 0.111 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0713 0.0956 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0376 0.11 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0342 0.112 0.209 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 1.61e-01 0.159 0.113 0.209 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 3.94e-01 0.0989 0.116 0.209 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 7.48e-01 -0.031 0.0962 0.209 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 3.26e-01 -0.113 0.115 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.96e-01 -0.118 0.113 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0355 0.114 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0101 0.0861 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00276 0.119 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0884 0.111 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 5.48e-01 0.0694 0.115 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 2.26e-01 -0.14 0.116 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 3.47e-01 0.0846 0.0897 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 6.01e-01 0.0603 0.115 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0699 0.115 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.121 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 2.97e-01 0.122 0.117 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 2.84e-01 0.0457 0.0426 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.54e-01 0.0624 0.105 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.60e-02 -0.185 0.111 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0667 0.091 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000806 0.0989 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0604 0.105 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 5.90e-01 0.0336 0.0622 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.85e-01 0.0444 0.0634 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 6.52e-01 -0.047 0.104 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00866 0.0942 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.32e-01 0.086 0.109 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.44e-01 0.0853 0.111 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0811 0.088 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 3.68e-01 -0.065 0.072 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0714 0.108 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00755 0.113 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.41e-01 0.0529 0.113 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0556 0.11 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 3.56e-01 0.0631 0.0682 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.69e-01 0.0416 0.0972 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 5.92e-01 0.0614 0.114 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0466 0.102 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.57e-01 0.0483 0.109 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0591 0.114 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 9.14e-01 0.00522 0.0485 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0698 0.0904 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0852 0.117 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0244 0.104 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.83e-01 0.0756 0.108 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.29e-01 0.0234 0.108 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 2.32e-01 0.0896 0.0748 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.82e-02 0.164 0.0896 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.18e-01 0.0105 0.102 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.99e-01 0.122 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0951 0.119 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.68e-01 0.0192 0.115 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 9.50e-01 0.00378 0.0606 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.43e-01 0.0593 0.0973 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0148 0.118 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.51e-01 0.0373 0.117 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.27e-01 0.0258 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 1.36e-01 0.176 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 6.20e-01 -0.012 0.0241 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.28e-01 0.0553 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0536 0.115 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.31e-02 -0.246 0.108 0.21 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 2.45e-01 -0.125 0.108 0.21 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0771 0.109 0.21 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0157 0.0986 0.21 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00957 0.105 0.21 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0455 0.112 0.21 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0656 0.11 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 3.97e-01 0.096 0.113 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.25e-01 0.0253 0.114 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.79e-01 -0.051 0.0719 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0861 0.112 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 1.58e-01 -0.121 0.0855 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.01e-01 -0.057 0.109 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 1.53e-01 -0.156 0.109 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 6.54e-01 -0.026 0.0578 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.118 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0363 0.118 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 9.35e-01 0.00999 0.122 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0608 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0704 0.0762 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 7.18e-01 0.0392 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.24e-01 0.0758 0.0945 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.92e-01 0.0424 0.107 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0829 0.105 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.39e-01 0.0384 0.0625 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 1.47e-01 -0.162 0.111 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 3.98e-01 -0.122 0.144 0.222 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 3.38e-01 0.145 0.151 0.222 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 5.45e-01 0.0856 0.141 0.222 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 2.08e-01 0.134 0.106 0.222 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 2.16e-01 -0.191 0.154 0.222 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.28e-01 -0.122 0.101 0.207 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.78e-01 0.0159 0.103 0.207 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 9.31e-02 0.153 0.0904 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 3.88e-01 -0.062 0.0717 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0948 0.207 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.207 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 6.85e-01 0.0439 0.108 0.209 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 6.25e-01 0.0564 0.115 0.209 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.71e-01 0.0817 0.113 0.209 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0426 0.0855 0.209 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.85e-01 0.0498 0.0911 0.209 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0536 0.108 0.209 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.94e-02 -0.19 0.108 0.205 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 3.99e-01 0.093 0.11 0.205 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 3.75e-01 -0.106 0.119 0.205 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 1.36e-01 -0.148 0.0987 0.205 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 8.85e-01 0.0135 0.0927 0.205 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 8.58e-01 0.0182 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 9.72e-02 0.158 0.0949 0.205 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.05e-02 -0.237 0.101 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.27e-01 0.0226 0.103 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 8.17e-01 -0.025 0.108 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0827 0.101 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 7.23e-01 0.0328 0.0923 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 5.79e-01 0.0627 0.113 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 3.79e-01 0.101 0.114 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 1.93e-01 0.135 0.103 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0796 0.102 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 2.35e-01 0.112 0.0942 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.57e-01 -0.093 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0478 0.133 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00158 0.132 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0339 0.133 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 9.85e-01 0.00223 0.117 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 5.18e-01 0.0843 0.13 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.18e-01 0.0412 0.114 0.207 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 2.67e-01 -0.118 0.106 0.207 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 6.55e-01 -0.051 0.114 0.207 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0036 0.101 0.207 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0186 0.0931 0.207 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0273 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0381 0.114 0.204 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 7.93e-02 0.192 0.109 0.204 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 1.32e-01 -0.144 0.095 0.204 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0557 0.0772 0.204 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0236 0.121 0.201 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 1.05e-02 0.298 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 5.90e-01 0.0654 0.121 0.201 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0102 0.073 0.201 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 1.66e-01 -0.135 0.0969 0.201 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -395078 sc-eQTL 1.87e-02 0.256 0.108 0.201 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 2.12e-01 0.134 0.107 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.80e-01 0.113 0.104 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 5.40e-02 0.222 0.115 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.93e-01 0.0733 0.107 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0235 0.0843 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0894 0.11 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0131 0.113 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0923 0.114 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 5.77e-01 0.0462 0.0828 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 5.95e-01 0.0612 0.115 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.103 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.25e-01 0.0802 0.1 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 3.20e-01 0.103 0.103 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0562 0.102 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.69e-01 0.0621 0.0856 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 5.98e-01 0.0523 0.0991 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0787 0.112 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 2.98e-01 0.115 0.11 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -797532 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0839 0.0975 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0475 0.0656 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 756606 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0995 0.0838 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 982442 sc-eQTL 8.87e-01 0.0144 0.101 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 756296 sc-eQTL 9.97e-02 -0.176 0.106 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -717737 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0147 0.0508 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 826645 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0179 0.118 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000158966 CACHD1 -120112 eQTL 0.00472 -0.105 0.037 0.0 0.00104 0.197
ENSG00000185483 ROR1 576000 pQTL 0.0222 0.0368 0.0161 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231485 \N -717720 3.62e-07 2.3e-07 8.9e-08 2.58e-07 1.01e-07 1.03e-07 3.11e-07 6.2e-08 1.86e-07 1.05e-07 1.96e-07 1.46e-07 2.45e-07 8.44e-08 9.2e-08 1.14e-07 5.73e-08 2.56e-07 9.69e-08 8.87e-08 1.33e-07 1.9e-07 1.89e-07 4.25e-08 2.74e-07 1.86e-07 1.72e-07 1.46e-07 1.34e-07 1.38e-07 1.26e-07 4.71e-08 4.37e-08 1.02e-07 1.27e-07 4.77e-08 5.96e-08 7.68e-08 4.99e-08 8.61e-08 5.77e-08 1.63e-07 3.19e-08 1.25e-08 8.45e-08 6.68e-09 7.66e-08 0.0 4.52e-08